APOBEC1 complementation factor (A1CF) - 9034 nt intron 04 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.30894
gtaggaacttgtgaaatctgctgagactcaccactgaatttgcacagtggtgggaatatt  c.-21+60

         .         .         .         .         .         .  g.30954
ggaggtcctaagatgcaaaatgggaatggtcagttacatagctctttagagaaatgtccc  c.-21+120

         .         .         .         .         .         .  g.31014
tttctaaaagagaaggaaattgcaacatttctgttttgtagatgacactgaatgtaacct  c.-21+180

         .         .         .         .         .         .  g.31074
tctttctactctaggttatcaattcaaccttaacttgtcacagaatcagtgtccacagtt  c.-21+240

         .         .         .         .         .         .  g.31134
atagagactatcccaaaaaggcagctagaatttgccacccaaggctatgaagtagaacca  c.-21+300

         .         .         .         .         .         .  g.31194
cattggtgtttcaggaatcagcagaaaataaactacagcaggaaccaggcttagtttcca  c.-21+360

         .         .         .         .         .         .  g.31254
gagagatcactgcacacctaagacttctagatgtgggatccaaggaatgaactttttgtg  c.-21+420

         .         .         .         .         .         .  g.31314
tctagctgctgcagtttgttctctcagaacacttgctcatccagtctaggatatgtaata  c.-21+480

         .         .         .         .         .         .  g.31374
ctaacttgtctccatgcttagcattttgtaaaaggaaaaaagaaaacaccacaatcttaa  c.-21+540

         .         .         .         .         .         .  g.31434
aactgtctatttatagacactgccttttagaaattatctgtatattattattatctttat  c.-21+600

         .         .         .         .         .         .  g.31494
gatatcttcttttagagaacttatgctgcatttaaaaaaatgtagtgttagatacatata  c.-21+660

         .         .         .         .         .         .  g.31554
ttatcttatttaaagaaaaaaatgttgctgtttttacagtaggacaaagtattttaattt  c.-21+720

         .         .         .         .         .         .  g.31614
ctcagctattttctttcactcacatactttcccaacttaaccaaatcttgaattcaaact  c.-21+780

         .         .         .         .         .         .  g.31674
actatgaattcaaatgtcatgtgtgattagcaataaaatatgcaagagtgtccttccatt  c.-21+840

         .         .         .         .         .         .  g.31734
agatgctcctttgtcagttgcaaaatatacatttattttttaattaattttataaatcat  c.-21+900

         .         .         .         .         .         .  g.31794
ggcatgctttgttagacatagtaatagttattttcttcatcctaatgaagagcgttagtc  c.-21+960

         .         .         .         .         .         .  g.31854
ttttttaagatttcaaaaagtttctattatttcatagttgactttttgaagtttcactta  c.-21+1020

         .         .         .         .         .         .  g.31914
agtccatggagatactgacatattagtttttttaatacttaaaattcaaattattttaga  c.-21+1080

         .         .         .         .         .         .  g.31974
ctcattaaacttttgaaaagagggttttctttctttttgcaatcaacacttccatagatg  c.-21+1140

         .         .         .         .         .         .  g.32034
ttatacaatcaagaatgtttttgaatctttttaaaattttgaacttcttgatattagaaa  c.-21+1200

         .         .         .         .         .         .  g.32094
catttgtgcaaagacagtagaaatagaaagcatttcaaccctttcaaacagcaatctgtt  c.-21+1260

         .         .         .         .         .         .  g.32154
aatatttatatatgagtgttccttttctggaactgtatttctaatgacccataatataag  c.-21+1320

         .         .         .         .         .         .  g.32214
atagaaatatgtataaatctgtcaagggtgacattagctgtaatgcatatcacaaactta  c.-21+1380

         .         .         .         .         .         .  g.32274
aatgtataaatacaagaaaattattaagtaaattatgaatgtataattattatacccaac  c.-21+1440

         .         .         .         .         .         .  g.32334
aagcagaatttatgaaaaataatcctaaaacaatataaattatcaattacatttcattca  c.-21+1500

         .         .         .         .         .         .  g.32394
attctggatactggttcttccttttccccccacatgaaattcaggtaaagtctcataact  c.-21+1560

         .         .         .         .         .         .  g.32454
tttctggtaacgttcaggtaataaaaatccttcatttaaaaaaattgatatttttttcat  c.-21+1620

         .         .         .         .         .         .  g.32514
attgatgttattccaaactagattgtttggaataatagtaaagacataaaatcattcaaa  c.-21+1680

         .         .         .         .         .         .  g.32574
gttgcagttatttccctttctcaagtatgtcagggtggaggataatttcttttctgtttt  c.-21+1740

         .         .         .         .         .         .  g.32634
tctgcactatgttttcctctttcaacaccagtttggtaactacaatttctgactcctgat  c.-21+1800

         .         .         .         .         .         .  g.32694
tgaagcagaagggagaaataaaagcaaagaaaatggtaaaggaaagtttttactgagcta  c.-21+1860

         .         .         .         .         .         .  g.32754
ccttcattgggctctcaggcctgacaggtatcgaagcttgtgagattctttttacgatct  c.-21+1920

         .         .         .         .         .         .  g.32814
tcagacacccagcctcctgctgggttctctttgatatttgaagcagccctcatggagagg  c.-21+1980

         .         .         .         .         .         .  g.32874
atggaagataatcattaatttctacacgtggccaaactctgatccccggaaacacacatt  c.-21+2040

         .         .         .         .         .         .  g.32934
ccctgacccaacaaaatctggaaattgaggtgacacaaagcaaccacttctccttgccaa  c.-21+2100

         .         .         .         .         .         .  g.32994
caacaaagctgcaggccaacccattgttcacagtgagagatttcaggagtgagttagatc  c.-21+2160

         .         .         .         .         .         .  g.33054
caccagcttagtgtgttccccaaacacaaaggcagggaatacacatcaagctgtctaagt  c.-21+2220

         .         .         .         .         .         .  g.33114
ggtttctcctgctttaggcaaaatgacaggcgcctcccaattcctcccacttagggggaa  c.-21+2280

         .         .         .         .         .         .  g.33174
ctaagagtcacaacacaacagcagtcatctccaaatatctttgtgcaaattccaaaaact  c.-21+2340

         .         .         .         .         .         .  g.33234
tctctcaaactctccaatctcttttctaagcttagggtgttgggtgacagttaacaatgg  c.-21+2400

         .         .         .         .         .         .  g.33294
aaaaatagtttcctgctaccttctcatcctgcttggtgctctagtcacttggtttcatac  c.-21+2460

         .         .         .         .         .         .  g.33354
ctaaatcagaggctagagttaatgataatttattacatatttcaaaacagctagaagaga  c.-21+2520

         .         .         .         .         .         .  g.33414
agatttgaaatgttcccaacacaaataaatgtttgaggtgagggatatcctaattaccct  c.-21+2580

         .         .         .         .         .         .  g.33474
gatttgatcattacatattgtacgcgtgtattaaaatatcatacatggactccttaaatg  c.-21+2640

         .         .         .         .         .         .  g.33534
tgtacaattattatgcaccaattttaaaagtccaattccgtcttaaaatcctgtcacaga  c.-21+2700

         .         .         .         .         .         .  g.33594
tgaaatagtattcagtaactaacagtaatcatataaaaaaatctgaaggacaattgtaac  c.-21+2760

         .         .         .         .         .         .  g.33654
acattattgttaaagctatgaagaaacctttcaaataatttttttgaaaagagacccaaa  c.-21+2820

         .         .         .         .         .         .  g.33714
taacaatggagataatcttactccatttaaaaattttgctccattgtaaggtcaaatgtt  c.-21+2880

         .         .         .         .         .         .  g.33774
atgatttaaggacatttatctgatagagaaaataatgatatgtataattgaaaatgttaa  c.-21+2940

         .         .         .         .         .         .  g.33834
catataaaatactcctaaaatatatggccaatctttattttactttgatcttatctatta  c.-21+3000

         .         .         .         .         .         .  g.33894
aatgatattcagaaaatgcttataataaggacctagaccacaagttaattgtaataataa  c.-21+3060

         .         .         .         .         .         .  g.33954
taataacaaaaaatattctatctgctttgtgtatattaactcatctagtccttactatac  c.-21+3120

         .         .         .         .         .         .  g.34014
actgtgtgatagctactatgtttatccccaatttcctgatgaagaaaacaaggcacagac  c.-21+3180

         .         .         .         .         .         .  g.34074
agtttagataacttgtgagattaagattctgttgttattggccaaaatttttggttagac  c.-21+3240

         .         .         .         .         .         .  g.34134
tcagaaaactgagagttgttataatgtgacttttaagattgcaattttagagatcagcat  c.-21+3300

         .         .         .         .         .         .  g.34194
cctagagcatgtgacaaacatttttttggaacctaaactttgtaacatgattcactttaa  c.-21+3360

         .         .         .         .         .         .  g.34254
gtaatattgactagcagcgtgactgttgaatcagaagtgcttcaataatgtagaagctta  c.-21+3420

         .         .         .         .         .         .  g.34314
atgttccaaaagctagttatctatacctaaggcctctaatcaaaatgtaaatacctatat  c.-21+3480

         .         .         .         .         .         .  g.34374
aactcaatcattttgaatgaattaaagaatccctcctgattttggctacagagtgtggaa  c.-21+3540

         .         .         .         .         .         .  g.34434
aattatccaagactttaaatcagaaggcctgtaatctaatctagtccctatgacatatga  c.-21+3600

         .         .         .         .         .         .  g.34494
gttgtatgatctttaaaaagtcccttaacatctccaggccataatctcctggaagatcag  c.-21+3660

         .         .         .         .         .         .  g.34554
gtacgcaatacccaactatttgtccatgatttttgtgattctagtatcttctgaatctag  c.-21+3720

         .         .         .         .         .         .  g.34614
tcactggttagcacactggactatttggtcgaaagggtagcctaaatatgtagaaacaca  c.-21+3780

         .         .         .         .         .         .  g.34674
acttcaaactctttgtaacttagggaaaatcctttagtcttactaatacttcagccttcc  c.-21+3840

         .         .         .         .         .         .  g.34734
tactctggattatacaaaagatcaatatgattatccaaaaagaaagaaagaaaggcaaca  c.-21+3900

         .         .         .         .         .         .  g.34794
ttaagaacatcaagtttactttttaaaaaagtttttgtacaaaaattaagataaagaaac  c.-21+3960

         .         .         .         .         .         .  g.34854
atcctaatacaatccaagcagcatacccataaaatgatagtttagaattttatagattag  c.-21+4020

         .         .         .         .         .         .  g.34914
ggtttgaaggatttacttttgctgtatctttgcagtctctgatattgaatgttgaatatt  c.-21+4080

         .         .         .         .         .         .  g.34974
tacagaacaagaattcaaaaaacagagggtgatgaatttgtgctctcttatcactagcag  c.-21+4140

         .         .         .         .         .         .  g.35034
gacaaatacagctatcaaaaatagaattttgtgagttacttaataacgtgacccaggctt  c.-21+4200

         .         .         .         .         .         .  g.35094
ttatgtagcaactgatgcaataatgcctgcttctaagggtttggaaatatgctttgtgat  c.-21+4260

         .         .         .         .         .         .  g.35154
ctttttaaaataatcaaacatctttggatattgatgactgaagtttttatcaaagtactg  c.-21+4320

         .         .         .         .         .         .  g.35214
tagagaaaaaagagatataatgtagtaccccacatatagtatgtatttaatacatactct  c.-21+4380

         .         .         .         .         .         .  g.35274
tgttgaaaattgtataatattactaagttaaactttaagcttcataattgtattatgcct  c.-21+4440

         .         .         .         .         .         .  g.35334
tataaaaatattttgtaaggaagtgtgctgcagtattaacatgtgaacagtctttgtctc  c.-21+4500

         .         g.35351
tgtgtaatggaattatg  c.-21+4517

--------------------- middle of intron ---------------------
                               g.35352            .           g.35368
                               c.-20-4517  tgtggggattcttttct  c.-20-4501

.         .         .         .         .         .           g.35428
ctacttttttattcttaactgtacttcctgatttcgaaagctagcatatacttctttgat  c.-20-4441

.         .         .         .         .         .           g.35488
agctaaagacaaaaaaaattacattatgatgagtctttcctcaagaatgcattaatgatg  c.-20-4381

.         .         .         .         .         .           g.35548
tgggtcataaactatgatatgtgatgctcctctcacctgaaattttctccttagaactag  c.-20-4321

.         .         .         .         .         .           g.35608
aaaaatatattctcatatgtgagcatattcagaaaaatatacacttccacccaacgtggt  c.-20-4261

.         .         .         .         .         .           g.35668
gtctgttgacatcaagtttaattctattgcaactaaacctaaatatatatttaataaaaa  c.-20-4201

.         .         .         .         .         .           g.35728
tcaccctcaggtagtcttaattttttaaaaatagactcattatatctaatatatataaaa  c.-20-4141

.         .         .         .         .         .           g.35788
tttaaaatgtggtgtgtattagctttgtttatctagttatcctattggtagtctgttttc  c.-20-4081

.         .         .         .         .         .           g.35848
taaaaatcattacagcacaatcaatttttctgaggtgtgatagtccccttgctttcgtaa  c.-20-4021

.         .         .         .         .         .           g.35908
accaatgatcatcctaaataaacatcaatattttttgttttgttttgttttgttcttctg  c.-20-3961

.         .         .         .         .         .           g.35968
ttttgcttccttagtccctattattgagaaaaatgtattagtgctgggtctcgggattat  c.-20-3901

.         .         .         .         .         .           g.36028
agagtataaaaatgcagtgcctgacctaaagttcatataaagtgggtgaaatgaaaaaga  c.-20-3841

.         .         .         .         .         .           g.36088
atgtatctaaaatttacaacaacataaggcagcctcaaatgagcaatacagctgtgggta  c.-20-3781

.         .         .         .         .         .           g.36148
ccaaaaagatcagcattttctatatagagccttaaaattgacaatgctctttgacctgag  c.-20-3721

.         .         .         .         .         .           g.36208
gaatgaggacaaatatttagacataatgatgttattatagtgaaatgtataattttttag  c.-20-3661

.         .         .         .         .         .           g.36268
aaatttaaacttaaacatatcctaaatatccaatgtaatattaatggtcaggcaaattat  c.-20-3601

.         .         .         .         .         .           g.36328
gatcattcttatattttcaaattatacagtaatataaaattatgatttcaaagaattttc  c.-20-3541

.         .         .         .         .         .           g.36388
aaagacatggagaagtattcaattttaacatttagttaaaaatctgaaggctacatataa  c.-20-3481

.         .         .         .         .         .           g.36448
atttgtgaagaatattttaaaaaattattcacatacagtaaagaatattgtaaaataaca  c.-20-3421

.         .         .         .         .         .           g.36508
aagtataatctctaagtttttcttgcctgatgctcttcttcattttctaaattttctata  c.-20-3361

.         .         .         .         .         .           g.36568
ataaatgcagatcgtttttatcacaaggaaaaaatctcataaggtagaaaagatttctaa  c.-20-3301

.         .         .         .         .         .           g.36628
gggtcagtcaggagttaaaaaaaagaaaagaaaaaaatcatggaaaaaaactttattatt  c.-20-3241

.         .         .         .         .         .           g.36688
aaatttgggtgataggtccctaggttcactagactattctttctaattctacatatacat  c.-20-3181

.         .         .         .         .         .           g.36748
gaaatttgtttaatattgatatagtccaatccttttgttctgcagttagaaaataagccc  c.-20-3121

.         .         .         .         .         .           g.36808
cagaattacacaattattaatcaggggtcaacaaactatgccccatgaaccaaatgtggc  c.-20-3061

.         .         .         .         .         .           g.36868
tacagcttgtttatgtagtaattgcaagatatgattttttttttacattttaagcatttt  c.-20-3001

.         .         .         .         .         .           g.36928
ttttaaaaaaaagcctaaaatatcaactatttggccttttacaaaaaaaaaaaaaaattg  c.-20-2941

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ctgactccaactcgattccttagcctactgctctatattagaagcgaatctagtttttaa  c.-20-2881

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agaaaattctttaatttagtatttaatctcccttaaaagaagtaggtgcatcccttcttg  c.-20-2821

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tgctgcccattcacaccacctcaagcactgggccctcactcgttcatgtattaattcatt  c.-20-2761

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tcttgattccaccacaaagagagacatgtttctacctttatgaagattagtctcatagaa  c.-20-2701

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aagatagaaaattaacagataaagaaacaagcaaagtaattacagatcatggtaagtgtc  c.-20-2641

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aagaatgtgataaaccaggctgtgtaaaagtcaaagccaggtgaccttctttaggaaaaa  c.-20-2581

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ttacattgaagctaagacttaccagatgagagcaaacaaactctgcaaggagccaagtat  c.-20-2521

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ccctgggagatggagcacacaggcagtactccttaaacaaaatatttatacagtgcagaa  c.-20-2461

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cacttttgggtagtgaagacattaatgtgtcttactttcaaagatctagtgagattacag  c.-20-2401

.         .         .         .         .         .           g.37528
cagataagtcggtggatttcatctttcccttcctctgttaatcagccatgaacctggtgt  c.-20-2341

.         .         .         .         .         .           g.37588
cctgggaacaatctcctcaaactaggaacaaaatacagtattcaattcccacccctcaca  c.-20-2281

.         .         .         .         .         .           g.37648
ctttcctttatatgcattctctcttgtatggaatttcaatgaaatcacatgttttgattc  c.-20-2221

.         .         .         .         .         .           g.37708
taatttgttcagttcttcagcaaatacaagccatcaggtacaaagaatggagctagatca  c.-20-2161

.         .         .         .         .         .           g.37768
agtctaattagaataccgttcctcttctaagagtgccccaaattaagctaactctccatc  c.-20-2101

.         .         .         .         .         .           g.37828
tttccggtttgagataatgtacttaggtaattttaattgaatgttcctcaaatggcattt  c.-20-2041

.         .         .         .         .         .           g.37888
tttcctataaataatacaataaaaataacctgagggtctcaggtttactaattggcttca  c.-20-1981

.         .         .         .         .         .           g.37948
tctagactggctccgagaggagcagatggaaaaacactgtggcattgacattctttttca  c.-20-1921

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accactgcacaaaaaatcctagggacagaaataggaatttgacttcatggcaaaatatag  c.-20-1861

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ctcctgggtcctactttttcctctattgcctgttttcaccacctgctcacatccctgcta  c.-20-1801

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tccaaggacttaggtcattcaccaagtgcacggataccaattctttaaataggtagcaat  c.-20-1741

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aagcattagaacaggatgggaccagtagattatcacaggctcatgcttccctaagcttat  c.-20-1681

.         .         .         .         .         .           g.38248
caccccagccacccacaggccaactttattttaaagctcagaagcagtcttacttctact  c.-20-1621

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agccagagatgccatagcgtggtgtgaaagactccaaatgaaggagcagttctgtgaatc  c.-20-1561

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cctttgtggagggggtgtgtgcccaacatttgtgggaacttcattatcccaaggaacaca  c.-20-1501

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gatatgttccagaagctattatttccaaatagcaatgaatttctcctcgaatagcctcat  c.-20-1441

.         .         .         .         .         .           g.38488
agggtgttgactatatatgaagtgtttgatataagattcaaaatcttcataaacgacaca  c.-20-1381

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aggtagtgctttcccttaagctagaagcacagactttttctattttatcagcttaaaaat  c.-20-1321

.         .         .         .         .         .           g.38608
tggtgtgacctcatgacccaaatatgcagaagcatgagcaggtcttgtggactttggact  c.-20-1261

.         .         .         .         .         .           g.38668
gcgcacgctgacaaattcacactttttcttaaagtgctattcatttgtgagtactgattg  c.-20-1201

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gcaactaaaattaagtgactcttcatcttcagaacctgaaagcttagcattatgagatgc  c.-20-1141

.         .         .         .         .         .           g.38788
aaaagacagctttcaaacaagctaggcaaagaagaaattattgagatcacagttccttgc  c.-20-1081

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aatcatgaatttgtataggatttcagcagctgtgatcctttgtaacattgttaaagaagt  c.-20-1021

.         .         .         .         .         .           g.38908
gctgagcagggaaccaagatgatgttaaatggcacattgtccacatcattaaataacatc  c.-20-961

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caatcccatatagagagaattattccactttcagttctctctcaggcttccaggtgagga  c.-20-901

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aagttagttgttggaggtatgatttaaacacctcttcaggccctgctaacctttttaagt  c.-20-841

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cccgagagcagaactagagtgcagagcttttagtagacagtgtctatgtagaagttgacc  c.-20-781

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atgatttcccttgtttgcaattgtttttataatcaccgaccatttatgggaaatgatact  c.-20-721

.         .         .         .         .         .           g.39208
gatattccacttataagaacaatatattttctttttgatataagcttatttaagtaacaa  c.-20-661

.         .         .         .         .         .           g.39268
agtgaatcaatgcataaagtcattaggtaattaacagaatagatgtcaattggacatgga  c.-20-601

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attgaagatacactgatttttaaaattacaatatcctcttaaggctccaattgactaact  c.-20-541

.         .         .         .         .         .           g.39388
cacaaaacatcctatgaacattttcctccattaaacatgatatcaaagtcagccttcctt  c.-20-481

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ttacaagcaccctcacacccctacaggactactgcaatcacctagtcaaccctcctactc  c.-20-421

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cttcatagatgaaataattaaagtcagaatagatttagtgccttgccaagtccctcagct  c.-20-361

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tgtcagaaattaaaattcacaagagtgttgtaaggagaagaatgattatacaaaattcct  c.-20-301

.         .         .         .         .         .           g.39628
tacatgcctcaaacccggtgcattggatgggattatgtttggcatatgttgaactaggaa  c.-20-241

.         .         .         .         .         .           g.39688
aagatagaagagcaattacccaaaccaaatgttctttattatgtctttatctgcacatgg  c.-20-181

.         .         .         .         .         .           g.39748
gaagttttgcataacttaatcagatctagcggccataataatagttaattcaaaaaggca  c.-20-121

.         .         .         .         .         .           g.39808
aattgtaagtaaacaaaaaagttagatgggcctattgaataaattacacattctttaagg  c.-20-61

.         .         .         .         .         .           g.39868
ataaaagctccaaacggattaaggaatgactaaagctgtcacctaattacttcttgaaag  c.-20-1


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