APOBEC1 complementation factor (A1CF) - 7778 nt intron 08 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.54662
gttagcaatcccctcctcaaagatgagacttctctgcctatcctgcctgcctccgcaaag  c.628+60

         .         .         .         .         .         .  g.54722
aaaataagcatttttaattttttttggctatctttcattacgctgtattttaaatttttt  c.628+120

         .         .         .         .         .         .  g.54782
atccttcttcactgtctcacagttgattccattccctgaagttttcagactcagttttga  c.628+180

         .         .         .         .         .         .  g.54842
aaaatattcattctgtgcattgaggctaatttacatgcactaaagaaacccagaacttta  c.628+240

         .         .         .         .         .         .  g.54902
agtacagcaatcctttgatgaataaagagtcttcttaaaattaagtatatcaatcacagt  c.628+300

         .         .         .         .         .         .  g.54962
tacttttgtgtatagattttgttaccaggcttattagaattagggtatattctccattac  c.628+360

         .         .         .         .         .         .  g.55022
agtgtagaaataaaaacctcaagtgataccttattccaatgacaactaggtgacatactt  c.628+420

         .         .         .         .         .         .  g.55082
tcattatgactccctgttgtctaataatttctgtctaatttgagagaagagagataaaag  c.628+480

         .         .         .         .         .         .  g.55142
ctctccttagaaagccacctttatttgttagttattacaaccacaggatagatcccattt  c.628+540

         .         .         .         .         .         .  g.55202
ggtgaataactatcaaattctctatccaccccaacactgcctcggtcagatcaacttagg  c.628+600

         .         .         .         .         .         .  g.55262
aaaattttttacagttcttggctcattctaaaacattttctacaacttacacaggttttt  c.628+660

         .         .         .         .         .         .  g.55322
aaatgaatactaaaataagaggatttcaaaaatgacagactggacacactggaatgaact  c.628+720

         .         .         .         .         .         .  g.55382
tttctcatgaaaattatgggagagccaccagaattcaaaacaaaacaaccacaacaaaga  c.628+780

         .         .         .         .         .         .  g.55442
tgtctacatttatgttgcctttgtaaacactcttcaaaacaaaccaatactagatcagcc  c.628+840

         .         .         .         .         .         .  g.55502
ccctagatatcttcaaaactaggagacagtttctggcttggggaagatctttcaataata  c.628+900

         .         .         .         .         .         .  g.55562
tcttcatgaaggcaacttaaagggaaaaaaaatgagacagtcccaaaggttgctgaatct  c.628+960

         .         .         .         .         .         .  g.55622
tttagagaagtagatatttttaatgttgaatctttcattcacaacttcttccctcttcac  c.628+1020

         .         .         .         .         .         .  g.55682
tggccagcatttggtcaagtcatctaaatcacaggtccatagatagactcactaagactc  c.628+1080

         .         .         .         .         .         .  g.55742
ctcatgggggcataccttttggtgacctggacgtaatattttgctatctgcttcaattct  c.628+1140

         .         .         .         .         .         .  g.55802
tctttcttcttcaacatcgacaactgtaccattgaaaagtcttttgtatccatcctgttc  c.628+1200

         .         .         .         .         .         .  g.55862
ttaggccaccactgaagtctaaacacacatattctaaaccttatgtaatttttttcaaga  c.628+1260

         .         .         .         .         .         .  g.55922
tctaattattctcccagctctgctttctcttccatgtgccccaccctccgacttctccat  c.628+1320

         .         .         .         .         .         .  g.55982
cctgaacattaccaccagattaatgtttccaaaatatcctattatcctttcaacaccttc  c.628+1380

         .         .         .         .         .         .  g.56042
ttgcaaatagtaggaattcaatctctatctataggctgaatgatgtctgtcactaactgg  c.628+1440

         .         .         .         .         .         .  g.56102
ccagttcaaaaatattcataactccttgctgtgtgtaagaactaaatatgtgatttcatt  c.628+1500

         .         .         .         .         .         .  g.56162
attcaataccttttattcatttcctggtcttttatgaccatatttgctaccttctatttc  c.628+1560

         .         .         .         .         .         .  g.56222
ccaataaaaactcttccttctatcaggacagacacctcaatgacctagacacttccatgc  c.628+1620

         .         .         .         .         .         .  g.56282
ttatgtctgtctcgtttattcctaatgctatatcctctactaggaatacctgcccctccg  c.628+1680

         .         .         .         .         .         .  g.56342
tcacttgtgacattcaccccagcccagccagcaccttcttgagaaacctacctccagtat  c.628+1740

         .         .         .         .         .         .  g.56402
tccagcccgaattagtcactttcctccctcaatgcaggaagccattcattatctgtaaaa  c.628+1800

         .         .         .         .         .         .  g.56462
acagatatgtgaaataatttggggtgtgggggagtaggacagtgaaagaaggtccaaaac  c.628+1860

         .         .         .         .         .         .  g.56522
aagtgaaagacagtttccagggtcaagacaatccagtaatcccagagaagctccacctcc  c.628+1920

         .         .         .         .         .         .  g.56582
tgaaagcttccctatctcttcagggagaatggcacattggcccaccgaaggaactccttt  c.628+1980

         .         .         .         .         .         .  g.56642
ttctaagtcaagcagactagctagccaggtcctatcagataagcttcagaaattttcaag  c.628+2040

         .         .         .         .         .         .  g.56702
cacttcattaagcttccacccacagtcctgacttttccttgtggattctctgtccaggat  c.628+2100

         .         .         .         .         .         .  g.56762
atgccatagggaggctgcctcccctccccgtccacaactcatattcactatgatccaatg  c.628+2160

         .         .         .         .         .         .  g.56822
caacccccttacctatggccctttgagccagtctcaggtggatttcactcagctggattt  c.628+2220

         .         .         .         .         .         .  g.56882
tagtcagcaactaactcatcagcaaactaacaagatgaggcacagtggtgagtaagccag  c.628+2280

         .         .         .         .         .         .  g.56942
ccagagcaaacttcttcacctctaatgagatctcagaacaaaacctatcacccatttgga  c.628+2340

         .         .         .         .         .         .  g.57002
tcactctacctgttaccccattgcagactcacccacaacaaaggaattctttaattgcca  c.628+2400

         .         .         .         .         .         .  g.57062
accctttgagaacctagtttaaaagaacaaggagactgttgagaaaaatgataagtgaag  c.628+2460

         .         .         .         .         .         .  g.57122
acaacaagaaacttttctttcttaattgacccagacttggagacagagagacaatagttg  c.628+2520

         .         .         .         .         .         .  g.57182
tctaaagggatgtaactgctcctcagtcacttacctcctctctaaacagtggcagttccc  c.628+2580

         .         .         .         .         .         .  g.57242
ccttgagaaatctcacctttattgagctctttacagaacaaagttgctgcatcccactca  c.628+2640

         .         .         .         .         .         .  g.57302
gaaactagaaaggtgttctaagaatgctctgaagaaaagtcctggcagtgattctcaatg  c.628+2700

         .         .         .         .         .         .  g.57362
tcaggctgcatcagcatcacctggagggcttgttatagcacagattgctagatcccaccg  c.628+2760

         .         .         .         .         .         .  g.57422
ccagagttcttgattcagtaggtctggtgtcaggccaggtaattcgcatttacaacaagc  c.628+2820

         .         .         .         .         .         .  g.57482
tcccaggatgctactactcccaggactgcacatttgaaaacccatgatttgaatcaatga  c.628+2880

         .         .         .         .         .         .  g.57542
ttttccatcctaggctgcacattggaattacctgatgttttcaaacaatgtgagtaccca  c.628+2940

         .         .         .         .         .         .  g.57602
tgtcagcctctaatcaattgaatctgcatcactggaatataaagttagggaactggtgtt  c.628+3000

         .         .         .         .         .         .  g.57662
ttaagttttccagatgattctattcttcagtcaaattttgtgattcacagctaaatctat  c.628+3060

         .         .         .         .         .         .  g.57722
cagctaatgatactgggtaatcatcttcatggcatgtaaataggaatacctgggaactgc  c.628+3120

         .         .         .         .         .         .  g.57782
tcagtcagtaaatatttattaagcatctagaacacatattgctcccttctgaatgacatg  c.628+3180

         .         .         .         .         .         .  g.57842
agagattctaaaaataaaaaaaaaaacatagtacctaaccattgcactcaaagagtgcat  c.628+3240

         .         .         .         .         .         .  g.57902
attctgagaaaactatacatacacaaaaacaggaaaaattattaagaggagagtgtattg  c.628+3300

         .         .         .         .         .         .  g.57962
ttaaatcataatttaaaagttattaagtcttctctgcatcatcttttcctgacctcacaa  c.628+3360

         .         .         .         .         .         .  g.58022
caatagtaggttgtagataaggaaactgatgttagaaaggatatgttttctagccaggat  c.628+3420

         .         .         .         .         .         .  g.58082
gattgttctgacatttgaacttgtcttacttctagctcatgctctcaaatcactctgtaa  c.628+3480

         .         .         .         .         .         .  g.58142
cactcactttcaccagaggccttcacaaggatgttggtggaaatcactgcttcccatatt  c.628+3540

         .         .         .         .         .         .  g.58202
tactctcatttctgttcccttagccttatgcagctcttcgtggtcctaggctgagaagac  c.628+3600

         .         .         .         .         .         .  g.58262
taaagctagagcagtagtactcaactgtggctgcattttagaattaactaagctactttt  c.628+3660

         .         .         .         .         .         .  g.58322
aaaactcctgagatccagcccacttatatcagaattgggaagggtaggtagtccagaggt  c.628+3720

         .         .         .         .         .         .  g.58382
cagtaacgagctggtaaatctttaacagccagctcccagaggaaaaaacaaaagccctga  c.628+3780

         .         .         .         .         .         .  g.58442
tttgtagcatttgccagtttccatggtattaacactcccactgtggctgatttcaggcta  c.628+3840

         .         .         .         .           g.58491
ccaatgcgactttaactggctcacaaaattctgatactttctttatcta  c.628+3889

--------------------- middle of intron ---------------------
          g.58492              .         .         .         .           g.58540
          c.629-3889  tttatctgtcaatgaacatttaggttgattccataccatggtaattgtg  c.629-3841

.         .         .         .         .         .           g.58600
aataatgcttcaataaacatgggaatgcaggaatctctttaacataatgatttcatttgg  c.629-3781

.         .         .         .         .         .           g.58660
ggtgaatacatacccagtatggtgattgcgggatcatatggtagctctatttttattttt  c.629-3721

.         .         .         .         .         .           g.58720
ttgaggaacctgcatactgttttccataatggctctaccaacttacattcccatcaacag  c.629-3661

.         .         .         .         .         .           g.58780
tatgcaagtattctcatttctccaaatccttgccaacatcatctttgatctttttgataa  c.629-3601

.         .         .         .         .         .           g.58840
tggccattctaccaggtgtgaggtgataactcattttagttttgatttatatttgcctga  c.629-3541

.         .         .         .         .         .           g.58900
tgattagagatgttaagcattttttcatatacctgttggcgatttatatttcttcttttg  c.629-3481

.         .         .         .         .         .           g.58960
agatatgtctattcaaatccattgccctgtttttgttttttatttttgagacggagtttc  c.629-3421

.         .         .         .         .         .           g.59020
actcttattgcccaggctagagtgcaatggcatgatcttggctcactgcaacctctgcct  c.629-3361

.         .         .         .         .         .           g.59080
cccgggttcaagtgattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacaggcatgtg  c.629-3301

.         .         .         .         .         .           g.59140
ccaccacgcctggctaactttgtatttttagtagagatggggtttctccatgttggtcag  c.629-3241

.         .         .         .         .         .           g.59200
gctggtctcgaactactgacctcagatgatctgccagccttggcctcccaaagtgctggg  c.629-3181

.         .         .         .         .         .           g.59260
attacaggtgtgagccaccacgcccggccttttgcccatttttaattgggttatctgttt  c.629-3121

.         .         .         .         .         .           g.59320
tcctactattgattgtttgagttctctatatatttgggatattaactccttatcaaatgt  c.629-3061

.         .         .         .         .         .           g.59380
atgctttgtaaatatttttttcccattccttaggttatctcttcactccattgattgttt  c.629-3001

.         .         .         .         .         .           g.59440
cctttgctgtgcggaaagtttagtttgatgcaatcccattcatctatttttgcttttgtt  c.629-2941

.         .         .         .         .         .           g.59500
gtctgtgctttgggggttatagccaaaaaataactgcccagaccaatgtcaagaaacttt  c.629-2881

.         .         .         .         .         .           g.59560
cccttatgtttctttctagtagttttactgtttccagtcttacatttaagtctttattcc  c.629-2821

.         .         .         .         .         .           g.59620
attttaacttggcttatgtgtatattgtaagataagggtcccatctcattcttttgcata  c.629-2761

.         .         .         .         .         .           g.59680
tggatatccaattttccttacaccatttgttgaagaggctgttccttctccattgtgtgt  c.629-2701

.         .         .         .         .         .           g.59740
tcttggcacctttgtcaaagatcaattggccataaatgtgtggatttacttctggactct  c.629-2641

.         .         .         .         .         .           g.59800
attttgtttcattggcctaaatgtctgtttttatgccagtatcatactattttgattact  c.629-2581

.         .         .         .         .         .           g.59860
atagctttgcagtatattttgagatcaagtagtgtgatgaccccagctttgttcttttgg  c.629-2521

.         .         .         .         .         .           g.59920
ttcagatttctttggctagggtcttttgtggccccatacaaattttagaattgtattttc  c.629-2461

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tatttctgtgaaaaacatcactggaatttcgatagagactgcattgaatctgtagattgc  c.629-2401

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tctgagtagcgtggactttataacaataataatgcctccaatccatgaacataggatatt  c.629-2341

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tttccatttatttgtttcttctttaattttttatcaatattttacagttttaagtataca  c.629-2281

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catggatgaaactggaggacattatattaagtgaaataagccagacacagaaagacaaat  c.629-1981

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attgcataatctcacttatatgtggaatctaaaaagttgaattcatataagcagagtgta  c.629-1921

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gaatggtggttaccagggctgggggcagaggtatggagagatattggtcaaacgatacaa  c.629-1861

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agtttccattaaaatgaataatttctgcaaatctattgtataatatgactatagttaatg  c.629-1801

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tatttgtatacttgaaaattggtaagagagtagatcttaaatgttatcaccaccaaaaaa  c.629-1741

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ttaaaaagatgggaaggaaaaatgcaaaaatttaatcatctatttttgcaagtagataag  c.629-1561

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ttgagatgatgttgtcctgattcctacataattaatcataatggtgatcattttcaacag  c.629-1


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