APOBEC1 complementation factor (A1CF) - 7481 nt intron 09 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.62605
gtaggacatatatacaagattagtttttcaaaacattctttgtcctggtttagtcttggg  c.793+60

         .         .         .         .         .         .  g.62665
agggtgtatgtgtcgaggaatttgtccatttcttctagatttctagtttatttgcataga  c.793+120

         .         .         .         .         .         .  g.62725
ggtgtttatagtattctctgacggtagtttgtatttctgtgggatcggtggcgatatccc  c.793+180

         .         .         .         .         .         .  g.62785
ctttatcattttttattgtgcttatttgattcttctctcttttcttctttattagtcttg  c.793+240

         .         .         .         .         .         .  g.62845
ctagtggtctatcaattttgttgatcttttaaaaaaaacagctcctggattcactgattt  c.793+300

         .         .         .         .         .         .  g.62905
ttttgaaggatttttgtgcctctatctcattcagttctgctctgatcttagttatttctt  c.793+360

         .         .         .         .         .         .  g.62965
gccttctgctagcttttgaatgtgtttgctcttgcttctctagttcttttaattgtgatg  c.793+420

         .         .         .         .         .         .  g.63025
ttagggtgtcaattttagatctttcctgctttctcttgtgggcatttagtgctataaatt  c.793+480

         .         .         .         .         .         .  g.63085
tccctctacacattgctttaaatgtgttccagagattctggtatgttatgtatgtctttg  c.793+540

         .         .         .         .         .         .  g.63145
ttctcatcggtttcaaagaacatctttatttccaccttcatttcgttgtgtactcagtag  c.793+600

         .         .         .         .         .         .  g.63205
tcattcaggagcaggctgttcagtttccttgtagttgagtggtttggggtgagtttctta  c.793+660

         .         .         .         .         .         .  g.63265
atcctgagttctagtttgattgcactgtggtctgagagacagtttgttataatttctgtt  c.793+720

         .         .         .         .         .         .  g.63325
cttttacatttgctgaggagtgctttacttccaactatgtggtcaattttggaataagtg  c.793+780

         .         .         .         .         .         .  g.63385
tgatgtggagctgagaagaatgtatattctgttgatttggggtggagaattctgtagatg  c.793+840

         .         .         .         .         .         .  g.63445
tctattaggtccgcttggtgcagagctgagttcaattcctgaatatccttgttaactttc  c.793+900

         .         .         .         .         .         .  g.63505
tgtctcgttgatctgtctaatgttgacagtggggtgttaaagtctcccattattattgtg  c.793+960

         .         .         .         .         .         .  g.63565
tgggagtctaagtctctttgtaggtctctaaggacttgctttatgactctgggtactcct  c.793+1020

         .         .         .         .         .         .  g.63625
gtattgggtgcatatatatttaggatagttagctcgtcttgttgaattgattcctttacc  c.793+1080

         .         .         .         .         .         .  g.63685
attatgtaatggccttctttgtctcttttgatctttgttggtttaaagtctcttttatca  c.793+1140

         .         .         .         .         .         .  g.63745
gagactaggattgcaacccctgcctttttttgttttccatttgcttggtagatcttcctc  c.793+1200

         .         .         .         .         .         .  g.63805
catccatttactttgagcctatgtgtgtctctgcatgtgagatgggtttcctgaatacag  c.793+1260

         .         .         .         .         .         .  g.63865
cgcactgatgagtcttgactctttatccaatttgccagtctgtgtcttttaattggagca  c.793+1320

         .         .         .         .         .         .  g.63925
tttagcccacttaccttttaaggttaatattgttatgtgtaaatttgatcctgtcattat  c.793+1380

         .         .         .         .         .         .  g.63985
gatgttagctggttattttgctcattagttgatgcagtttcttcctagcctggatggtct  c.793+1440

         .         .         .         .         .         .  g.64045
ttacaatttggcatgtttttgcagtcgctggtactggttattcctttccatgtttagcgc  c.793+1500

         .         .         .         .         .         .  g.64105
ttccttcaggagttcttgtagggcaggcctggtagtgacaaaatctctcagaatttgctt  c.793+1560

         .         .         .         .         .         .  g.64165
gtctgtaaagtattttatttctcctttgcttatgaagcttagtttggctggatatgaaat  c.793+1620

         .         .         .         .         .         .  g.64225
tctgggttgaaaattattttctttaagaatgttgaatattggcccccactctctcctggc  c.793+1680

         .         .         .         .         .         .  g.64285
ttgtcgagtttctgccgagagatcaaaacattctttaaaagcacctatgcttgagatgac  c.793+1740

         .         .         .         .         .         .  g.64345
ttcccataactttaaatagaaatgcttttatttagttcatctcataattccatgcagacc  c.793+1800

         .         .         .         .         .         .  g.64405
tctcaaactatgttcctaactttggattagaaaatcaagccatgtggtcctacaacattt  c.793+1860

         .         .         .         .         .         .  g.64465
atcaatattataattgcatacttatctatgtgattatttaatgaatatctattttcttca  c.793+1920

         .         .         .         .         .         .  g.64525
ctaaactataaatttcatgagtttttcccctcttattgtttcctccatcttcagacattt  c.793+1980

         .         .         .         .         .         .  g.64585
aatctctgggcctggggtacaatgattgctcaataaatatttactgtaatgaagaatgca  c.793+2040

         .         .         .         .         .         .  g.64645
tgccataaccataggtctgatgcagggtttctcagcctcaccactattgatattttggaa  c.793+2100

         .         .         .         .         .         .  g.64705
cagatcattcttggctgtgggggtctgtccagtggattgtaggatgtttagcagcatccc  c.793+2160

         .         .         .         .         .         .  g.64765
aggcctgtctctgttagataccagtagcaacctccaagatgtgacaacgaaaaatgcctt  c.793+2220

         .         .         .         .         .         .  g.64825
cagacattgcaaaatatactctacgggtgggcaaaattgcccccagttgagaaccactgg  c.793+2280

         .         .         .         .         .         .  g.64885
cctaatggaatacacttgtgacataagtaaaaaggtgacaatcctaggaaactgatttga  c.793+2340

         .         .         .         .         .         .  g.64945
gtgaagaggaagggaaaggaatagagggaaggtggaaggggatagttagttgctactcat  c.793+2400

         .         .         .         .         .         .  g.65005
cttgtcaatacttttcagtatcaattctaagccatcagattgactccccatctctttctt  c.793+2460

         .         .         .         .         .         .  g.65065
ctccatataggagctacaacactgagagaggtagagcatttcaggaaacaatatccaaat  c.793+2520

         .         .         .         .         .         .  g.65125
taccatttcccaaaaacagttcagaacattaattctacaatcttttggtggatgttgctg  c.793+2580

         .         .         .         .         .         .  g.65185
ataaaagggctccatggtcaaataagcttgtaaacaccagattctgcaaaattaaatgaa  c.793+2640

         .         .         .         .         .         .  g.65245
tttcttcattatggaacttatcaaagtcttttgccttctaacatgctttgaaattctcca  c.793+2700

         .         .         .         .         .         .  g.65305
agaagcgatgcagaaatcttcatttttcaagtttctgaaacatgactgctcttttttgcc  c.793+2760

         .         .         .         .         .         .  g.65365
atatcattttgtgggattactgtgtctttaaacacactctgggcagtagtggcttagggt  c.793+2820

         .         .         .         .         .         .  g.65425
tatcatagtagtaatatcctttcataactgagaatttcccagtctcctggcaaattatct  c.793+2880

         .         .         .         .         .         .  g.65485
aggttgttaataagggtgggccatggtgctgtcatgttaaagctgcctaagaatattcac  c.793+2940

         .         .         .         .         .         .  g.65545
ttgcacatactcacatcgtctgtttccaactctgggtgctacttcagatagaacagaatg  c.793+3000

         .         .         .         .         .         .  g.65605
ataagctgatgatttgctctgaaggacattcaggaaggatgtcactgctccattttgaaa  c.793+3060

         .         .         .         .         .         .  g.65665
gattcaccaaagatctttctccagcctcagggactctgccttccctgaaatattagtgtg  c.793+3120

         .         .         .         .         .         .  g.65725
agggtgtggctccacaccaacagctgtgaatccatgactaagctagaatctgcaaatgat  c.793+3180

         .         .         .         .         .         .  g.65785
ggaccaccttactgtgtgccaagcattgcagtgggcactttcacagcatgtgtcatttat  c.793+3240

         .         .         .         .         .         .  g.65845
tcatcacaaccctataatacaggttgctttattcattccattactttctagataagaaaa  c.793+3300

         .         .         .         .         .         .  g.65905
acaggacccagagtagttaagtagtttgcccaggttcacacagctagcaggtcgcagatc  c.793+3360

         .         .         .         .         .         .  g.65965
ctggatttgaactcaggtctggtaaagggcatgttcttaaaaactttaatactctcatgc  c.793+3420

         .         .         .         .         .         .  g.66025
cgcctccttattccattcactcactcattcattcaactgtctttccttcagtagctccta  c.793+3480

         .         .         .         .         .         .  g.66085
catgccaggcactgtggaaggaacaaacaagtatgatgtgtgcatggaaaaagtttaaga  c.793+3540

         .         .         .         .         .         .  g.66145
aattccagaaaaatacagctttgacagactactcttggagtgcagagaagacttgtgttt  c.793+3600

         .         .         .         .         .         .  g.66205
tgaagcgacatctaagctgagatctgaatgttgatgcagttgtaggcataggaacattat  c.793+3660

         .         .         .         .         .         .  g.66265
gtgtgtataaatattgcccactattctcccctcattccatgttgactttctaccttccca  c.793+3720

         .         .   g.66286
gagtgaataatacttcttatt  c.793+3741

--------------------- middle of intron ---------------------
                            g.66287     .         .           g.66306
                            c.794-3740  tttatctaattaaaacagca  c.794-3721

.         .         .         .         .         .           g.66366
cctttttttgccaagggctagaatgagaaactactaaaaggctgcttcctttcctagtcc  c.794-3661

.         .         .         .         .         .           g.66426
ctgattatcagctttcccagtctgcgtattggcatatattaaagagacatgtgtgcccgg  c.794-3601

.         .         .         .         .         .           g.66486
atcctactaattatcatgaaaataatgaacatcacatatctctctcttgctcactctctc  c.794-3541

.         .         .         .         .         .           g.66546
actttctctttcttcttgggactaaagtgtgtccagcgatttcagggcacagtctgcagc  c.794-3481

.         .         .         .         .         .           g.66606
tggtggcacaactctcagggctatataatgatgtatggcttgttcttcgtggccctctgc  c.794-3421

.         .         .         .         .         .           g.66666
aaaaaaaaatatgaatttcagaacgtgaacaactagcagacatctgctgcattaagaggg  c.794-3361

.         .         .         .         .         .           g.66726
aaaagtcagagctaactagtttatcttggaaagtatgtactgtgccaaggctatacttat  c.794-3301

.         .         .         .         .         .           g.66786
ctagaaaaatttctggaaacaaacagaaaaatgactctaaaaattccatttaaagtttag  c.794-3241

.         .         .         .         .         .           g.66846
gtccctcagaggaacctacatattacctcaaaatatttgaccacgtatcagtttaaccat  c.794-3181

.         .         .         .         .         .           g.66906
gatgaacttgaataatattatattgccactgagagacacaaaagataattagaacaaaaa  c.794-3121

.         .         .         .         .         .           g.66966
ttgagacctgaagatggtttgttcttccccactgtagcctaagggtatctgctgaatttc  c.794-3061

.         .         .         .         .         .           g.67026
caattatagtcattctacaaaatctgatcttcctacaagagtttagcagtattagaatca  c.794-3001

.         .         .         .         .         .           g.67086
cctgaagggcatgttaaatcactgattgcttggcccatcatgggtgggttcaagcatttc  c.794-2941

.         .         .         .         .         .           g.67146
catttctattaagtttccaggcaaagtggattctgctggtcagggcaccacacttcggga  c.794-2881

.         .         .         .         .         .           g.67206
accatgaccctctgataaccttccctttggcatgcaggtgtgtttctcctcaggtttatg  c.794-2821

.         .         .         .         .         .           g.67266
tgttgctgacaagttgataagaaacacagcaataattttccaattccttgcatcatgatt  c.794-2761

.         .         .         .         .         .           g.67326
tcagaggatctttttcttctttgctaatggatgattgagtaataatgatcactcatattc  c.794-2701

.         .         .         .         .         .           g.67386
tatggactcaccctctgccaaatgaggatcaattattaaacaaactcctatgcactaaag  c.794-2641

.         .         .         .         .         .           g.67446
aagaaacataataaaataagccatgtggtgaatactattgtagagaaaaccaacttttat  c.794-2581

.         .         .         .         .         .           g.67506
gacacagactctaactttttaacttgtctgttttatgaggctaagtttttaaatatcaaa  c.794-2521

.         .         .         .         .         .           g.67566
ttttccaaaaccagatgcatctggaagttatcgtccaacagtgtaagataatttcagata  c.794-2461

.         .         .         .         .         .           g.67626
tctgcaaacagaatttcagaaaatctaaattcattatcatctcaaatgccactaactggt  c.794-2401

.         .         .         .         .         .           g.67686
gtaaatgacagaagttgggatgtgaattaactgataatattcccttattccatgtgtatt  c.794-2341

.         .         .         .         .         .           g.67746
tatagagtagctcctgtgtccaaggcagtaggcaggaaccaggtgaagatgataccaaga  c.794-2281

.         .         .         .         .         .           g.67806
agtctctgaagagggtcctgttctcagggagataacagaccagtgagcctaggtggagaa  c.794-2221

.         .         .         .         .         .           g.67866
tgacattgaaatatgaaccaagcaaagactggaaaggtgaaggtcatcattggccaacgt  c.794-2161

.         .         .         .         .         .           g.67926
cttccttctcagttactaaaacaagtcatgggattaagtcatgatcatcaccccatgtga  c.794-2101

.         .         .         .         .         .           g.67986
cactgaaaggaatgaagagactatattggatattcagttaattatatgtctcatgcttca  c.794-2041

.         .         .         .         .         .           g.68046
tggtctcagagagctttatttatccttagcctggccagataattttgctctgtataacca  c.794-1981

.         .         .         .         .         .           g.68106
ttgccataagaagtcaagggtcgactgttgaagggagtgaaaagagaagtatcacaatgt  c.794-1921

.         .         .         .         .         .           g.68166
ctttaaattgtccttatgttacaggccgactatcattccaaaggaagataattcttagtc  c.794-1861

.         .         .         .         .         .           g.68226
attgaaccacgtgggagagtaaaaactctaattacctttgttaccttgaatctaagaaga  c.794-1801

.         .         .         .         .         .           g.68286
taatgaaactttgataaggacagaaaggacttccccctcttcttttccctggcataatgt  c.794-1741

.         .         .         .         .         .           g.68346
ctcatcctatgttgtctcccggcactctcaaggtacacccaagtgagtgtagggattaaa  c.794-1681

.         .         .         .         .         .           g.68406
gaagataattggcatgctaaactaatagtggttaaacaaatttccaccttaccttcactc  c.794-1621

.         .         .         .         .         .           g.68466
taagcaaaaggtctatttttaaaattgagtaaggaaaaacattttaaaaatataacatcc  c.794-1561

.         .         .         .         .         .           g.68526
aactatctcggtacaactatctttttcatttttatatgttgccatcatgttcagcagttc  c.794-1501

.         .         .         .         .         .           g.68586
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ctttgcaaatatttgtaaaataccaaatatatcaattaaaatatgaaaacctccttcatt  c.794-1381

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cttcccaacttttctccccattcctgaagtaacctctgttaagagtttggtctctatctt  c.794-1321

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ttcagttcactttctgtatgagtgtatttatatttgtgtgcacatatatatggttttgga  c.794-1261

.         .         .         .         .         .           g.68826
ttattaaaaacacaaatgctgtaatattgtacttactattttataactttttaaaaatta  c.794-1201

.         .         .         .         .         .           g.68886
acaataggtcttgggccaggcacggtggctcatgcctgtaatctcaacattttggcaggc  c.794-1141

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cgaggtaggcagatcacctgaggtcgggagttcgagaccagcctgaccaacatggtgaaa  c.794-1081

.         .         .         .         .         .           g.69006
ctccttctctactaaaaatacaaaattagccaggcacatggtgatgcatgcctgtaatcc  c.794-1021

.         .         .         .         .         .           g.69066
cagctactcgggaggctgaggcagaagaatcgcttgaaccagggaggggtgggttgcggt  c.794-961

.         .         .         .         .         .           g.69126
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.         .         .         .         .         .           g.69186
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.         .         .         .         .         .           g.69306
gttttatttttgctctttcaacagtagtgtaattgatatccttatgcatgatccttgtac  c.794-721

.         .         .         .         .         .           g.69366
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.         .         .         .         .         .           g.69426
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.         .         .         .         .         .           g.69486
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.         .         .         .         .         .           g.69906
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.         .         .         .         .         .           g.69966
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.         .         .         .         .         .           g.70026
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