APOBEC1 complementation factor (A1CF) - upstream reference sequence


                                                    g.1     .         .         .         .         .         .             g.0
                                                    c.-5400     c.-5401

.         .         .         .         .         .             g.60
agctcataagtcatagtgtcttgggattgaagtgctaaggtcccaactcctggatcagag    c.-5341

.         .         .         .         .         .             g.120
tactttctagtcaataggcaaggaaagagaaggaggcttttgcactactcagtgtgcctg    c.-5281

.         .         .         .         .         .             g.180
atgtggcccttcaattctttgaaatgctcccttccagtgaattaaacaaccccacccaca    c.-5221

.         .         .         .         .         .             g.240
cacccaccaaacactcaaaaatagaatgttgaattccaaggacactgaaatcaatgaaga    c.-5161

.         .         .         .         .         .             g.300
gatttttttttttttgagatggagtcttgctctgttgtccaggctagggtgcagtggtgc    c.-5101

.         .         .         .         .         .             g.360
gatcttggctcactgcaacctccacctcccaggttcaggtgattctcctgcctcagcctc    c.-5041

.         .         .         .         .         .             g.420
ccgtgtagctgggattacaggcaccagccaccatgcctggttaatttttgtatttttagt    c.-4981

.         .         .         .         .         .             g.480
agagacagggttttgctatcttggccaggctggtctcgaactcctgacctcatgatccac    c.-4921

.         .         .         .         .         .             g.540
ctgcaagagatatttttattgagccagggcagggaggatggtggcagggaaggaagcttc    c.-4861

.         .         .         .         .         .             g.600
ttattcttggtaatctttgacttttagttatattttgttttttttttaagctttacgttt    c.-4801

.         .         .         .         .         .             g.660
tgccttcaccagcaaaaattaatgatttttacctaaatgtactctgatagtgaaagcaag    c.-4741

.         .         .         .         .         .             g.720
attcgttaaaatccataagccaaatatttcatgtatgaatgattgatcattgcaaccacc    c.-4681

.         .         .         .         .         .             g.780
gaatgagtacttactatggacctggtatagcctatttttgtaagtctcttcttttttgag    c.-4621

.         .         .         .         .         .             g.840
cattctcatttcagcaaatagtatcaccatccagccaatggctgcattcagtaatttgag    c.-4561

.         .         .         .         .         .             g.900
acttgtcctttagatgtcatgccctgctcagttcccatatcctcttgatgatttacctcc    c.-4501

.         .         .         .         .         .             g.960
tacacatttcatggaccttgtctacttttctcttttcccagagccaccaccctaatctta    c.-4441

.         .         .         .         .         .             g.1020
actaccatcacctgccacctcccctcttactggtctcttttagatgctttgcctccttca    c.-4381

.         .         .         .         .         .             g.1080
agttcaaatcaccaacttacttgaatatgtacaagagtaaaattattctaagacaacaaa    c.-4321

.         .         .         .         .         .             g.1140
aaaaaaaaaaaaaaaaggagagaagcaggcagtgttatcccatggcaatttattctccac    c.-4261

.         .         .         .         .         .             g.1200
tctacacccagaatctacacaaatagtccaagtggctccccttcttcagatgcttccgtg    c.-4201

.         .         .         .         .         .             g.1260
acttccttcccattggccctggataatgctgggaatctagtgatggccctttatgaatcg    c.-4141

.         .         .         .         .         .             g.1320
tctgacttggctacctactccagtcaatttccccatcattttccctcttgcccttcacaa    c.-4081

.         .         .         .         .         .             g.1380
ccgaccttctaccagttttttgaatgtgcctaactcatgcgaactcagggcatccctatg    c.-4021

.         .         .         .         .         .             g.1440
agctatttccactcactagaatgcccacctcccatccacacatccttcaggtctcagctt    c.-3961

.         .         .         .         .         .             g.1500
aaatgtcttgtgttctggaaggctttcctcaagtacctcccaacccacccagccctacac    c.-3901

.         .         .         .         .         .             g.1560
aaggttaggtccctatgttttatgttctgtttagcattctgtacttctccttcataacac    c.-3841

.         .         .         .         .         .             g.1620
ttattacaactataattagttaatcattggggtatatgcttaatgtgtgtaccttccatc    c.-3781

.         .         .         .         .         .             g.1680
tggtctgttaaccactgaatcccttaagactagcacagtattttccaaacgcttaaaatt    c.-3721

.         .         .         .         .         .             g.1740
gtgatccacaataaaaaataaagtttacttcataaccaatacacacagatagatacataa    c.-3661

.         .         .         .         .         .             g.1800
ttagaaaaaaagtttcataaatagtattacccctttcttttttgttttttggtttttttg    c.-3601

.         .         .         .         .         .             g.1860
tttgtattttttttgagacagtgtctcgctctgtcacccaggttggagtgcagtggcccg    c.-3541

.         .         .         .         .         .             g.1920
atctctgctcactgcaagctccgcctcccaggttcgcgccattctcctgcctcagcctcc    c.-3481

.         .         .         .         .         .             g.1980
cgagtagctgggattacaggcacccaccaccacgcccagctaattttttgtatttttagt    c.-3421

.         .         .         .         .         .             g.2040
agagacaaggtttcaccgtgttagccaggatggtcttgatctcctgacctggtgatccgc    c.-3361

.         .         .         .         .         .             g.2100
ctgcctcggcctcccaaagtgctgggattacaggcatgagccaccgcgcctggccagtat    c.-3301

.         .         .         .         .         .             g.2160
taccctttctagatgcaattcacttgatattttctgttctattttaatatgttagataca    c.-3241

.         .         .         .         .         .             g.2220
acccactttattgattttatagcctactaatagactcaaatctcattttaagtaatcacc    c.-3181

.         .         .         .         .         .             g.2280
tttctaatgcaacacttagcagagagaagtttctcagtaattgtttgtagaataaagtaa    c.-3121

.         .         .         .         .         .             g.2340
tagaaaattcacatttaccagccactatctaaactggtttatttttacaaagtaaaggca    c.-3061

.         .         .         .         .         .             g.2400
aatcttgccatcctgggtacagttagctctcttgattagactgatgagatcaaggtcata    c.-3001

.         .         .         .         .         .             g.2460
aatttgatctcattctgatggattggtttctctgtcccagggccagagactttctctcta    c.-2941

.         .         .         .         .         .             g.2520
agtacccctcagaaaaagaaaggctgatccattgtttttatttttattcctgatcagtgt    c.-2881

.         .         .         .         .         .             g.2580
attcctatccttgtaacaaaatggtttaaaaaacaaaagcaataaaaatagaaagcaata    c.-2821

.         .         .         .         .         .             g.2640
acctaataattcattactaccaaattcattactaccactggctgttaggagtaatatatg    c.-2761

.         .         .         .         .         .             g.2700
aattgtcctacggaaatcatcagattttgggttaatgcgattgtagtcctgccctgttga    c.-2701

.         .         .         .         .         .             g.2760
atgccaggatccatcaaataagcaactgacatgtttttaataactggttacaatagactg    c.-2641

.         .         .         .         .         .             g.2820
aatgtttgtgtttctcctaaaattaatatgttgaaaccctaacccccaatgtgatggtat    c.-2581

.         .         .         .         .         .             g.2880
ttggaaataggtccttttggaagtaattatggttagagtaggtcatgaggctaggtccct    c.-2521

.         .         .         .         .         .             g.2940
catgaccctcaggacctaggtccctcattttaaaaataggtgcccttatttttaaaaagg    c.-2461

.         .         .         .         .         .             g.3000
agaagacatgagatctctctttctgcatgcatgcaccaaggaaggccatgtaaggacata    c.-2401

.         .         .         .         .         .             g.3060
accaaaaagagggtcctgctggcaccctgattttggatttccagcctccagaacgatgag    c.-2341

.         .         .         .         .         .             g.3120
aaacaagtgtttgttgttgaagctacccactgtatggttttctttttgttttcttttgtt    c.-2281

.         .         .         .         .         .             g.3180
ttgtttttagatgaagtctcactctgttgcccaggctggagtgcagtggcatgatcttgg    c.-2221

.         .         .         .         .         .             g.3240
ctcactgcgaactccacctcccgggttcaagtgattcccctgcctccgcctcccaagtag    c.-2161

.         .         .         .         .         .             g.3300
ctgagaccacaggtgtgcaccaccatgcccagctaatttttttgtattttagtagggatg    c.-2101

.         .         .         .         .         .             g.3360
gggtttcgccatgttggacaggatggtctcaatctccttaccttgtgatccacctgcctc    c.-2041

.         .         .         .         .         .             g.3420
agcctcccaaagtgctgggattacaggcatgagccaccacacccagccttgtatggtatt    c.-1981

.         .         .         .         .         .             g.3480
ttattatagtaacctgaatggactgagactctagttaatatcgttccttttacctgttgt    c.-1921

.         .         .         .         .         .             g.3540
gttttggtgtttccatcagatgcctaaaaatcctagctttcctttcttcatctccactta    c.-1861

.         .         .         .         .         .             g.3600
tcaccatctaagcccctatcacaaaaaacaataaaagaaaccctctcaaaactgtccatc    c.-1801

.         .         .         .         .         .             g.3660
ttacaacatcaacagttctttattggactgggcaaactcaaagaattccccactcaattg    c.-1741

.         .         .         .         .         .             g.3720
ggaaccatgcaaccccagactgagctttcactaggaaaccatcagggctactttgtgagg    c.-1681

.         .         .         .         .         .             g.3780
gaatcccttcccaagaaggaagtagagggatgtgtccctcattcagctatctagctgggt    c.-1621

.         .         .         .         .         .             g.3840
ggggcataaatgctttctctaggtctaacatcaggggagcaattctggggtaaaacaatt    c.-1561

.         .         .         .         .         .             g.3900
gttcctggggtgtttttgttaaactctatcatccattgctatgggaaaatggtaaatcat    c.-1501

.         .         .         .         .         .             g.3960
ttcatgtttgagaactgaaataattccatgtttgagaactaaaaactgtaagcagaacta    c.-1441

.         .         .         .         .         .             g.4020
gcattccaacagtatcttttatctcttctcttacatattcatagatgtgcttaattgatg    c.-1381

.         .         .         .         .         .             g.4080
gatcttcctttgcgtctatattatagaaggattgcttgttttgtgcttttctatagacaa    c.-1321

.         .         .         .         .         .             g.4140
aaatgctctcttaatagttggttcctagaaaattagactccttttactagaactaaaggc    c.-1261

.         .         .         .         .         .             g.4200
aagtaggggtatcctctaattctagttttggaatgtgtggtttccaagctcttaaaccaa    c.-1201

.         .         .         .         .         .             g.4260
aatttactcaaaattaggaaggttttggttcttcttccttttttaaatgtgggctttatt    c.-1141

.         .         .         .         .         .             g.4320
acccttagggatttcttctgtagactacagctcttaccagagaactcagagtataatgtt    c.-1081

.         .         .         .         .         .             g.4380
tgtatttctgaaagcaccatttctctatttttcaagaaactcagttaccactgagatttc    c.-1021

.         .         .         .         .         .             g.4440
aggcaatgaacaatagcatcagctatcatataaccccagtatgtagctgattattgtgct    c.-961

.         .         .         .         .         .             g.4500
tctcacacagtggcctcctcttaaaatctaaatgagcagcttgtatacaaagaagtatgc    c.-901

.         .         .         .         .         .             g.4560
tttccccaacctgatctggcctaaatctatctactttgttatataaatgctttgtgtatt    c.-841

.         .         .         .         .         .             g.4620
ttctgtttgtaagccagcatttatctacgtacttgacctaaaactccacactttactcca    c.-781

.         .         .         .         .         .             g.4680
tgtaatatagtgatataaaaagtgtaaaacaaagaaatattctcctaaattaccttagct    c.-721

.         .         .         .         .         .             g.4740
ataatatcactttgacatagtaaaaaacaaaggaagtaacataaaggaaagcttaggtat    c.-661

.         .         .         .         .         .             g.4800
ccaattgcagtgagtttttactttttaaatatatcgtataagccaataaaatatcttcaa    c.-601

.         .         .         .         .         .             g.4860
aataatatttaccccaacatttttacaacatttattttaattttataaacaaataacaaa    c.-541

.         .         .         .         .         .             g.4920
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.         .         .         .         .         .             g.4980
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.         .            .         .         .         .          g.5040
aagccactgaacctttggag \ tttgatatgacgattagagcataacccgagtgacacgttg c.-361


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