Abelson helper integration site 1 (AHI1) - 5411 nt intron 08 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)
         .         .         .         .         .         .  g.39701
gtttgctatacaaattaaatgaaaaattgtgtatgttggtagaaataacttgattctagg  c.931+60

         .         .         .         .         .         .  g.39761
aattttagccctttaaaactgatgggtatacttgaaaataattcaatataggatatttgg  c.931+120

         .         .         .         .         .         .  g.39821
tacttgttcttgaattcatctagattaaagcacacatgtatttgtagctgtaggtctctg  c.931+180

         .         .         .         .         .         .  g.39881
atgagtttgtatcacttgagtcttctctgattttttttatttttgagatggtgtcttact  c.931+240

         .         .         .         .         .         .  g.39941
ctgtctcccaggctggaatgcagtggcacgatctcggctcattgcaacctccacctcccg  c.931+300

         .         .         .         .         .         .  g.40001
ggttaaagcgattctcctgcctcggcctcctgagtagctgggattgcagatgcatgccac  c.931+360

         .         .         .         .         .         .  g.40061
catacccggctaatttttgtattgttagtagagacggggtttcaccatgttggccaagct  c.931+420

         .         .         .         .         .         .  g.40121
ggtctcgaactcatgacctcaagtgatccacctgcctcagcctcccaaaatgctggggtt  c.931+480

         .         .         .         .         .         .  g.40181
acaggcatgagccaccatgcctgaccttctctgattcttgtcatactttaaattcaactc  c.931+540

         .         .         .         .         .         .  g.40241
taaaatgatactgactttgtagttgctattgggtcatagaggatttcttctttaaaccat  c.931+600

         .         .         .         .         .         .  g.40301
tgagtttacatcctctaaatggttaggactcagttgttgaaagctataaatggtcagcag  c.931+660

         .         .         .         .         .         .  g.40361
ccaataaacatttctgatgttaaggctgcatcctgtccaacatggtatcctcccaattcg  c.931+720

         .         .         .         .         .         .  g.40421
tcagcctaataccacttctttcctttctcaacttttctctttgccttgttgatttctgtc  c.931+780

         .         .         .         .         .         .  g.40481
ttcttcttttcttgtttgttttctcttatttttctttacatgttcttttctactcataca  c.931+840

         .         .         .         .         .         .  g.40541
tccttttttagtctttcagtttccatttgattggccaaaaattgggattaaaatgggcaa  c.931+900

         .         .         .         .         .         .  g.40601
ttttagattttatagtacttattcattagaagatgtaagtgatgatgttttgtggtttct  c.931+960

         .         .         .         .         .         .  g.40661
ataattaaaattttaaaatcttttgttgaagcataatgtgtatatagatatatatagaaa  c.931+1020

         .         .         .         .         .         .  g.40721
agcactaagcagtatacttgttttatgtgtttctatatatataaagcactaagcagtata  c.931+1080

         .         .         .         .         .         .  g.40781
ctcatatacatatttttaaagtttttttcacaaactgaacatacctataaaatcattacc  c.931+1140

         .         .         .         .         .         .  g.40841
taaatttggaaacagaacatcattagcacccagaaaaatcaccttcccgttagttgccct  c.931+1200

         .         .         .         .         .         .  g.40901
gtgggagtaaccactacctggacatctaacagagtttatttttgcttatttttatacttt  c.931+1260

         .         .         .         .         .         .  g.40961
aatatgaatagaatgataaatactgtgctccttgtgcctgactttttttactcaatgtta  c.931+1320

         .         .         .         .         .         .  g.41021
attttgtaagatttatactactgttgcttgcatacagttgagcttattcattcttaattc  c.931+1380

         .         .         .         .         .         .  g.41081
tgtttttgtattatttagatatccattgtgtgaatataccacagttaatttgcctatttt  c.931+1440

         .         .         .         .         .         .  g.41141
attgatggtcatttgagttgtttctagttttaggcaattataagtaaagcggtaattcac  c.931+1500

         .         .         .         .         .         .  g.41201
attgcagtcacgtatttggtaagcacatgcatacctttatcttgggcatattgttaggag  c.931+1560

         .         .         .         .         .         .  g.41261
tagaattgctgtcatagattatgtatattttttgctttaataattacttccagttttcca  c.931+1620

         .         .         .         .         .         .  g.41321
aagttggtttaccagttgacactagcagtgtttgagagttccagtcactccacatcttta  c.931+1680

         .         .         .         .         .         .  g.41381
ccaacatgtaatactgttttttaacgttttagtcattcttaggagtgactaaattttcct  c.931+1740

         .         .         .         .         .         .  g.41441
cattcttcaggaatgtatagtgatattcattttggttttaattttatttccatggtaact  c.931+1800

         .         .         .         .         .         .  g.41501
attgaagttgagtgttttcatgtttattaactacttagattttgacatttgtaaatatat  c.931+1860

         .         .         .         .         .         .  g.41561
tcaagttgtctgcattttttaaaacacagaattgtctttttctaattgatttgtagtgat  c.931+1920

         .         .         .         .         .         .  g.41621
aggtttatatacctcaatatgagattattctcagatataaatacctacccacatttatat  c.931+1980

         .         .         .         .         .         .  g.41681
cgcaaatgtcgtcctactctggtttgattatttctctctcattggtgtcttttgaaaaac  c.931+2040

         .         .         .         .         .         .  g.41741
agaaatttttgtattgtccagtttatccatttttttcctttgatggtaagtgctgtgatt  c.931+2100

         .         .         .         .         .         .  g.41801
taagaaatctttcctaagttctgaagatatttttctaaaagttttattctaaaagtttta  c.931+2160

         .         .         .         .         .         .  g.41861
ctgtttctgttttactttcacatttagatatgcagttcatcaggaattggtttatgttta  c.931+2220

         .         .         .         .         .         .  g.41921
tgataggaagcagtgatcaagatatccatgtgaatatatattatgattgacccagtacca  c.931+2280

         .         .         .         .         .         .  g.41981
tttactgaagagagtgtctttttccctctgtgttgcagtgtcacttttcccataaataac  c.931+2340

         .         .         .         .         .         .  g.42041
atgactgtgttacatgtggatcagtttttgtagtctctattcttttaaattagacagttt  c.931+2400

         .         .         .         .         .         .  g.42101
gtaccaacactaccatgtctaaatactgtagctttttaataggtcttgctatttagtatt  c.931+2460

         .         .         .         .         .         .  g.42161
atactctaggtttttccttcttcatctgcattgtctaggctattctttactttgcatttc  c.931+2520

         .         .         .         .         .         .  g.42221
tgtatggattttagaagagcttctccattctccctcttcctttttaccctcattctgtct  c.931+2580

         .         .         .         .         .         .  g.42281
tgcaagctgtgattttgatctagactgggtgaatctaaagagtcacagcataacaactct  c.931+2640

         .         .         .         .         .         .  g.42341
ctaaagagacttgacatttttacacagtattgattctcaggctatgaatttggtatgcac  c.931+2700

        g.42347
ttccat  c.931+2706

--------------------- middle of intron ---------------------
                                           g.42348            g.42352
                                           c.932-2705  ttatt  c.932-2701

.         .         .         .         .         .           g.42412
tgcatcttatttaatatatcccagcaatatacatttcagcagaatctctccttagattta  c.932-2641

.         .         .         .         .         .           g.42472
ttcctgggatttgatgtttcttaatgatattataaatggcatttaaaaaatttttgtttt  c.932-2581

.         .         .         .         .         .           g.42532
gtatttgttgctggtacatatatgtagaaatgtatttaaaattttttaacattgtgtcca  c.932-2521

.         .         .         .         .         .           g.42592
ttgatttgctaaattcacttattgcaagagtttatttatttatttatttttgagacaggg  c.932-2461

.         .         .         .         .         .           g.42652
tcttgccctgtcactcaggctggagtgcagtggcgtgatctcagctcactgcaacttata  c.932-2401

.         .         .         .         .         .           g.42712
cttcccaggttcaagcgatcttcccacctcagtcttccaagtagctgggactacaggcat  c.932-2341

.         .         .         .         .         .           g.42772
gcaccaccattcttggctaatttttgtagagacaaggtctcactacattttccaggctag  c.932-2281

.         .         .         .         .         .           g.42832
tctcaaactcctgggctcaagcagttctcccacctcagtctcccagagtgctgggattac  c.932-2221

.         .         .         .         .         .           g.42892
agatgtgagctatcgcggcccacagagtttattcttacattgtttggatttttctacata  c.932-2161

.         .         .         .         .         .           g.42952
tgcaatcatgtaatacgttaataacgatagttttatcgcttctttttcagtccttatgcc  c.932-2101

.         .         .         .         .         .           g.43012
ttatcattttgcttgccttgatacaaatcaagatttaatctctttattatcaatcttttt  c.932-2041

.         .         .         .         .         .           g.43072
tttttttttttttacttctgtcagctatttgatatactgtagtttttgagggatgtgtct  c.932-1981

.         .         .         .         .         .           g.43132
atttcatccaaattttgcatttctatagcatctgaaaggctgtcccatgttttcattcat  c.932-1921

.         .         .         .         .         .           g.43192
ggtattggcagtttgttttctctcaatttcttgatcagccttaggattttaaatttatga  c.932-1861

.         .         .         .         .         .           g.43252
gtcttttcaaaaaccaacctttagctttgattttctctgttgtacatttatgtactattt  c.932-1801

.         .         .         .         .         .           g.43312
tagtgattttttttcttgtaactgtattttccttctttgtacttatttgggtttgatttg  c.932-1741

.         .         .         .         .         .           g.43372
ctacttatttctagctttaaaattgggttttataagaaagatttcagtcttcttttatat  c.932-1681

.         .         .         .         .         .           g.43432
gcatttaagactaaattcccatttaagtactactttacctgcatctccaaaatttttaat  c.932-1621

.         .         .         .         .         .           g.43492
attgtgtgtttttattatttaacacaaaatattttctaatttccattttaattgatcatt  c.932-1561

.         .         .         .         .         .           g.43552
atttagaagtatgttgcttagtttcaggcagcagatgcttttctagttatcttttattgg  c.932-1501

.         .         .         .         .         .           g.43612
tttctgtcttccattgttgtcagataacatattatgaatgatttcaatcctctgagttta  c.932-1441

.         .         .         .         .         .           g.43672
ttgaggcctttttaatgaccattttatggtcagatttggtaaatattccatgctcatttg  c.932-1381

.         .         .         .         .         .           g.43732
aaaagaatgcaatttctaatgttgagtgcagtgtcctatgtatgtcagttaggtcaagtt  c.932-1321

.         .         .         .         .         .           g.43792
taattgtgctcagttcttcttattaatttttttggtctacttattctgtcagctgttgag  c.932-1261

.         .         .         .         .         .           g.43852
agaggtattaacatttccattccgattttcagtttatttttcttgtatctcttgtcaagt  c.932-1201

.         .         .         .         .         .           g.43912
tatcacttttatcataatgcagcgcccttctttatctctaataattcatagccctaaata  c.932-1141

.         .         .         .         .         .           g.43972
cgatgggagatccagttttgcccttcagtgcttttccacttagccatttagtcttctgtc  c.932-1081

.         .         .         .         .         .           g.44032
tcatgctgcttcaaaatttggcaaattctttgagcaggagactggctatatgttagacat  c.932-1021

.         .         .         .         .         .           g.44092
ccttcaggtatccatttttgtcactgtagcccccaagcatgccaaaatatccgctggttt  c.932-961

.         .         .         .         .         .           g.44152
ctctgtccctcagtagcaaccttctgccagaaatcacacctggattatcaacctagaact  c.932-901

.         .         .         .         .         .           g.44212
gtgaccagaattggtagatgaccccagatgaaaagttgctcttggtccttagtgtaaatt  c.932-841

.         .         .         .         .         .           g.44272
gaccacaccctccagggcttcacctttgcctattttgttttggtccccttcccctggcag  c.932-781

.         .         .         .         .         .           g.44332
atcatggtctgctagcaccacaagcctgggagatttcactacctctctagcttctctgta  c.932-721

.         .         .         .         .         .           g.44392
gcatcagaattcagttttgtgagaagaattggtcatgtgtttgaggcttctcaaatctcc  c.932-661

.         .         .         .         .         .           g.44452
agttttatcattttagtcctgtggaatcactaaaagttttgcttatttctcattctcctg  c.932-601

.         .         .         .         .         .           g.44512
gcagtgactttctgcctaagccaaactctcatcttcagctcacaccctgaatcagcaaat  c.932-541

.         .         .         .         .         .           g.44572
gtccccagagacaaaaacagctgccagtccatcagctgacctctgactgattctcccttt  c.932-481

.         .         .         .         .         .           g.44632
ctggaattttaatctgtctactatatcttctttctgtacttttctgatgcctttaaaatt  c.932-421

.         .         .         .         .         .           g.44692
taaaataagatatttgtaatttatttggctctttccagttgttacccaaagtgtttacct  c.932-361

.         .         .         .         .         .           g.44752
gctgcatcctactgcatcccacccagaattagaaattctagttgtcatatatattctact  c.932-301

.         .         .         .         .         .           g.44812
tagaaaatacctggataaagttacttttctgactttgactctcttttttttctttttgtg  c.932-241

.         .         .         .         .         .           g.44872
tttctcctacttattaggaaaaatataaacaaggatttttcaccttatttgtaatgtatt  c.932-181

.         .         .         .         .         .           g.44932
agcaaatgtagtattttactttcacactatggtttgctgttgtctggctttttctttctt  c.932-121

.         .         .         .         .         .           g.44992
tccccctgaagttcctttgaacacagtgagatcatcacagatcttaaagattaggttata  c.932-61

.         .         .         .         .         .           g.45052
tgtaaatactactatgggaacaactaattataacattgatttttttttccatgcgtgtag  c.932-1