archain 1 (ARCN1) - 8695 nt intron 01 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.5224
gtaagatccgagccaggacccgaactcctggggtccgagcctcaccgtctctccttgtcg  c.3+60

         .         .         .         .         .         .  g.5284
gcgggcctggggcaggggccggaggagccccgccctgagggtctagggcagagtgctttt  c.3+120

         .         .         .         .         .         .  g.5344
gctccgggctcggggagcagtgtggcctcctgtgcccggtctcctggagatccgatggag  c.3+180

         .         .         .         .         .         .  g.5404
ctgactccagtccatctgtcgtcgtgcccgcttccgcaccaccccccaaccagctggact  c.3+240

         .         .         .         .         .         .  g.5464
ccctcgtttgctgggacctgcccctgagacggcccggcgtttttgctctgcgagaacttc  c.3+300

         .         .         .         .         .         .  g.5524
gtggtggtggtgcgggtcccaggctgcggacctcggaactgatgctgtcccgccggttcc  c.3+360

         .         .         .         .         .         .  g.5584
ctggcgcttaggctcagcaggctgggcctgtctccggaggttctggtccttctgttaatc  c.3+420

         .         .         .         .         .         .  g.5644
agagcttgtctcccacccccggtgtttgctaggccgttgataactcgaaatgcaaatcca  c.3+480

         .         .         .         .         .         .  g.5704
ctggtgtccagaaatttttctttttgttcagaagggggaaatggagacacagagcggaaa  c.3+540

         .         .         .         .         .         .  g.5764
ggagtaacttctaacactaatgtataggacccaagtgtctctgaaaccttccactacttc  c.3+600

         .         .         .         .         .         .  g.5824
cgcagaactcacttgtgtccatttgttagtgtgactcggggtacatacactgtgtagacc  c.3+660

         .         .         .         .         .         .  g.5884
actgggaaaatgtgagcaggttccagagaacacagggtttgccttcaaggaacttattgt  c.3+720

         .         .         .         .         .         .  g.5944
ccaggtgaagaaaaatgtgtatgtggcatgtcgtagtcagatgtctcacaggaggtggag  c.3+780

         .         .         .         .         .         .  g.6004
taagagggatgggttagcctccgagaccagttacttgccttcccatgcgttatctttgta  c.3+840

         .         .         .         .         .         .  g.6064
tactcatctgttacaaggatgagaaaggttaatgtggttgaggatggaggaaatcagaac  c.3+900

         .         .         .         .         .         .  g.6124
tgctgacatcactcaatcttcctttatcgctgtgatttgtggatattcatgaagtagtag  c.3+960

         .         .         .         .         .         .  g.6184
acattctttggtttcaaaaaagctagtaatttatttttcagtgcaccttatgtcctttag  c.3+1020

         .         .         .         .         .         .  g.6244
tcttttgaaggatgttctgttctgttcttttttattcttttgtcaatagataacttgatt  c.3+1080

         .         .         .         .         .         .  g.6304
taaaacatcgtccagtgtacctgagagatggcagaatgtaatttggtggcaatcctaata  c.3+1140

         .         .         .         .         .         .  g.6364
agttctattgacaaccctttagataagaacttggataatggggggaattcatgcttggac  c.3+1200

         .         .         .         .         .         .  g.6424
tttaggccactgaacagcttttctcagcctcaggtatataaattgcatcaaacaggtttg  c.3+1260

         .         .         .         .         .         .  g.6484
cctcctaaaatttttgtgttggacacaaaatttccagaaacttgtattttcagtttctcc  c.3+1320

         .         .         .         .         .         .  g.6544
aggaggttctgtatttggttagtgattttgaaactcagttcccgtttacaccctggaatt  c.3+1380

         .         .         .         .         .         .  g.6604
aataatgcattttagagcatatttttattttaatagtaaagttaaggtcttgtattatat  c.3+1440

         .         .         .         .         .         .  g.6664
aaaccagataaaggtaatctttctaaaaatattctttgttaaaaggttcttggaacttag  c.3+1500

         .         .         .         .         .         .  g.6724
tatttttaattcattgataactgagggatggtaaagccctacgtgatatatataaaatat  c.3+1560

         .         .         .         .         .         .  g.6784
aacttttgcatgctattttgacatgtgtacgtatacatagagttgtgtcacatatttctg  c.3+1620

         .         .         .         .         .         .  g.6844
aattatttgggacttaacatgatccagatacccacagatttgtgtactctggagaacaat  c.3+1680

         .         .         .         .         .         .  g.6904
ttatctcagtacattctgctctgtagagtgttaagacattggtatgatttctgtgtaatg  c.3+1740

         .         .         .         .         .         .  g.6964
tttttgggtcctgctcctttacaaacagatccctggacagtagaaatgtccagatagggt  c.3+1800

         .         .         .         .         .         .  g.7024
gaaatttttatctaaaagttgtatcaaaatttccagcgtttattttagctcaacatttca  c.3+1860

         .         .         .         .         .         .  g.7084
ttatgaaattttccaacatctggaaaagttgaaagaactttgtagtgaatacccatataa  c.3+1920

         .         .         .         .         .         .  g.7144
ccaccaactagattctataactaacatttcactatattttatcatgcatctaatcatcca  c.3+1980

         .         .         .         .         .         .  g.7204
tccatccctctctccattaaaaaaaaatatacatttcaaagtaagttgcagatatcagta  c.3+2040

         .         .         .         .         .         .  g.7264
cgtaaacattgattttttaaaaaataaattccctttggctttagttattgaagtgcagaa  c.3+2100

         .         .         .         .         .         .  g.7324
tgtcctagactgcaaagttccaatagataaataagtgaacaaatgcagaaacaaatgctt  c.3+2160

         .         .         .         .         .         .  g.7384
tctcatgacttcatcataaaataaagtacaaagaaaggcatcttttgatttttttttttt  c.3+2220

         .         .         .         .         .         .  g.7444
aaagagacagggtctcactatgttgcccaggctggagggcagtagctattcacaggcgct  c.3+2280

         .         .         .         .         .         .  g.7504
atcatagtgcactgcggcctagaactcctagcctcaagcaatcctcccgcctccatatcc  c.3+2340

         .         .         .         .         .         .  g.7564
caagtagctgggactgtaggcatgcgggccttgatttgatcttttttttgtattctgcaa  c.3+2400

         .         .         .         .         .         .  g.7624
attaatgagaacatgttctgactttttttcttgtttgtttggttttcgagacggattctc  c.3+2460

         .         .         .         .         .         .  g.7684
gctctgtctccaggctggagtgcagtggcacaatctcagctcactgcaacttctgcctcc  c.3+2520

         .         .         .         .         .         .  g.7744
cgggttcaagctatcctcctgcctcagcctcctgagtagctgggactgcaggcgcctgcc  c.3+2580

         .         .         .         .         .         .  g.7804
accacgcccaactacttttttgtatttttagtagatacggggtttcaccatgttagccag  c.3+2640

         .         .         .         .         .         .  g.7864
gatagtctcgatctcctcacctcgtgatctgcccgcctcggcctcccaaagtgctgggat  c.3+2700

         .         .         .         .         .         .  g.7924
tataggtgtgagccatggcgcccggcccctgtattatttatgtatctttttaattgtgtt  c.3+2760

         .         .         .         .         .         .  g.7984
ttgagggacagcaaagaaagaaaatgattctcttgagtttccattgatttgccatctatt  c.3+2820

         .         .         .         .         .         .  g.8044
tatgtcttcatatagaagttcactgcagaaactgataacgggtgtgtgtgtgtgtgtgtg  c.3+2880

         .         .         .         .         .         .  g.8104
tgtgtgttttaattctctgcaagcttttgttttagaatagaaatgtgatggacttaaaac  c.3+2940

         .         .         .         .         .         .  g.8164
cctcactgagtaaattacttttcaagttttaggtttcgtatgtggtctacattttattgt  c.3+3000

         .         .         .         .         .         .  g.8224
aatcttctctctgattttatctataatagcttcatataaatagaaaagacagaacagtcc  c.3+3060

         .         .         .         .         .         .  g.8284
tccctgacaattatagaaactagccttaatatgaccatgaattgtgtgtgcatgtatatg  c.3+3120

         .         .         .         .         .         .  g.8344
tgtataaaatattgcggtgaattacaaaggagaaggtgactataattctggaagtaaggg  c.3+3180

         .         .         .         .         .         .  g.8404
atcctgaagcatttagagattcaagaaagaacttgactttttttgagagagagttgtgca  c.3+3240

         .         .         .         .         .         .  g.8464
tatttatcctgaattattataccacctgttattcttgtatctctcttgcacacacaattt  c.3+3300

         .         .         .         .         .         .  g.8524
gttatggttagacaatttgccttctggcagcctaatgttactataaaatattgttccaaa  c.3+3360

         .         .         .         .         .         .  g.8584
gtggttagaactggagcagtgggtataaaatggaagtattgtacattttctgtcactgta  c.3+3420

         .         .         .         .         .         .  g.8644
gttgtttttttttttttctgttactgtagttttcaaatgcttagacttacagaactttaa  c.3+3480

         .         .         .         .         .         .  g.8704
agacacagagcactttggatttcatgtaaactaacctcctatgttagggatatttcaata  c.3+3540

         .         .         .         .         .         .  g.8764
atcaattaagtgacttatccaaggtcacataattagtggcaaaggcagaacagaaaccta  c.3+3600

         .         .         .         .         .         .  g.8824
attctccaggtttttttacttgaggcacttaacaattcatgtagttaagtctgtgtagga  c.3+3660

         .         .         .         .         .         .  g.8884
gagagttgttatttagtccaaagatagtgtactcaaaccatgtaagaattattaaaagtt  c.3+3720

         .         .         .         .         .         .  g.8944
gtttggcaaagctcaactttatgagggaattttttttttttttaaccgtcctggagagat  c.3+3780

         .         .         .         .         .         .  g.9004
catctaacttatgggccctcagttttcacatctgtaagacaatcaagggctcttgcaagt  c.3+3840

         .         .         .         .         .         .  g.9064
tccttttagatctggaatgttttttccaaaaatgttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaac  c.3+3900

         .         .         .         .         .         .  g.9124
caaaaactttgtaatcatatttattaattcttcctcagagaaaatcagatcaaatttcaa  c.3+3960

         .         .         .         .         .         .  g.9184
tagggaaaattgttaacttaccttttagtatatgctatattttaataattgttaaaccag  c.3+4020

         .         .         .         .         .         .  g.9244
taaacattaatgtaaagaggtttattatttcaagaactttaagaagacaaatgttaattt  c.3+4080

         .         .         .         .         .         .  g.9304
aggataggataaatttatcatgtttagaggtgaccataccttctagccatattagtagct  c.3+4140

         .         .         .         .         .         .  g.9364
gtaacagagagacctgtgtcaactgcctggaacctgtaatttgtggtgtcctgggtgttc  c.3+4200

         .         .         .         .         .         .  g.9424
ggagatttatgctatacttagtatggggaactatggtcctattttggaagccttgttttg  c.3+4260

         .         .         .         .         .         .  g.9484
cttgtatctggataatggaatgactcaaagagagacatatgattttaccctacttctttc  c.3+4320

         .         .          g.9512
ttcatcttgacgtactgaaagcctggaa  c.3+4348

--------------------- middle of intron ---------------------
                       g.9513           .         .           g.9539
                       c.4-4347  ttctggccaggtgtggcggctcatgcc  c.4-4321

.         .         .         .         .         .           g.9599
tgtaatcccagcactttgggaggctcaggcgggcagatcacttgaggttgggagtttgag  c.4-4261

.         .         .         .         .         .           g.9659
accagcctgggcaacatggcaaaaccctgtctctacagaaaaatacaaaaaattagccag  c.4-4201

.         .         .         .         .         .           g.9719
gtgtggtggcctgtgcctgtagtcccagatacttgggaggctgaggtgggagaatcacct  c.4-4141

.         .         .         .         .         .           g.9779
gagcccagaaggttgaggctgcactgagccaagatcacgccactgcactacagcttgggc  c.4-4081

.         .         .         .         .         .           g.9839
aatagagcaagactctgtttcaaaacaaacaaatcctggaattcatcaaagcatgatcta  c.4-4021

.         .         .         .         .         .           g.9899
aattctgtttctttctttctttctttcttttttttttttgaggcagagtctcactttgta  c.4-3961

.         .         .         .         .         .           g.9959
gcccaggctggagtgaagtggtatgatcttggcttactgcaacttccgcctcccaggttc  c.4-3901

.         .         .         .         .         .           g.10019
aagcaatcctcccacctcactctccccgtagctgggactacagacgtgcaccaccagact  c.4-3841

.         .         .         .         .         .           g.10079
tggctaattttttgtattttttggtagagacagggttttcccatgttgaccaggctggtc  c.4-3781

.         .         .         .         .         .           g.10139
tcgaactcctgacctcaggtgatctgcctgccctggctcccaaagtgctggattaaggca  c.4-3721

.         .         .         .         .         .           g.10199
tgagccaccgctcccggcctaaatgctgtttcttctatcaagtcatccctgactgtacca  c.4-3661

.         .         .         .         .         .           g.10259
gctggaagtaatctcttcctctgaatttccacgcactttatcggttactctctcatgtta  c.4-3601

.         .         .         .         .         .           g.10319
cttaacacattctgcctcatattacagttatttgtgtttgtgtcttatccctattaagct  c.4-3541

.         .         .         .         .         .           g.10379
tcttgtaggcagaatgctagcctgtgtcatcttaattctcagaaagcatgttgtatgtat  c.4-3481

.         .         .         .         .         .           g.10439
agtagatgttcgataaataattactcagttaattcttataatatcgcaaaaatggagatt  c.4-3421

.         .         .         .         .         .           g.10499
accagtacctataattagtttttgaacatgctcatcagtaaagtggatgggccaggtgca  c.4-3361

.         .         .         .         .         .           g.10559
gtggctcactcctgtaatcccaacactttggaggccaaggcgcgcagatgacttgaggcc  c.4-3301

.         .         .         .         .         .           g.10619
aggagttggagaccagcctgcccaacatggcaaaaccctgtctctattaaaaatagaaaa  c.4-3241

.         .         .         .         .         .           g.10679
attagccaggcttggtggtgctggcctgtgcctgtagtcccagttactcaggaggctgag  c.4-3181

.         .         .         .         .         .           g.10739
gcatgagaattgcttgaactcaggaggcagagcttgcagtgagccaagatggcaccactg  c.4-3121

.         .         .         .         .         .           g.10799
cactccagcctggactacagagtgagacactctctcaaaaaataaataaataaataaata  c.4-3061

.         .         .         .         .         .           g.10859
aataaataaataaataaataaataaataaagtggatagtaacatacacctttttgttcct  c.4-3001

.         .         .         .         .         .           g.10919
ttttccctctcaagttgcttttgatgtttttacctaaattttacttgtatggtatagagg  c.4-2941

.         .         .         .         .         .           g.10979
tgtttttaactccagttggaaacctaagaactacccttgagcctgtaaacattgtttcta  c.4-2881

.         .         .         .         .         .           g.11039
acaggtttattattagatatggggtttctattaaatgcagcatgtttatataggtctgaa  c.4-2821

.         .         .         .         .         .           g.11099
gttttggtctgagctgtcctttctttaggtgttcatttgatttgtcttatttcttcaaaa  c.4-2761

.         .         .         .         .         .           g.11159
cctcataaaattctaacatagaggaccatgacttcctagagctatgactctcaacctttt  c.4-2701

.         .         .         .         .         .           g.11219
agggataggaggctctacagggattacatttacaatatgctcccatttattaataatatt  c.4-2641

.         .         .         .         .         .           g.11279
tctcatcgcatgaggggattttctatgggccatttgaaataacttctctagaggatcgat  c.4-2581

.         .         .         .         .         .           g.11339
gcattccctgaaactgtatgtaaaattttggggggagagtcaatattcattatttgaata  c.4-2521

.         .         .         .         .         .           g.11399
tcaaaatattgacaaaggcaaaaatccattgccttggccggatgctgtggctcacacttg  c.4-2461

.         .         .         .         .         .           g.11459
taatcccagcactttgggaggctgaggtgtgcggatcactttagcccaggaatttgtagc  c.4-2401

.         .         .         .         .         .           g.11519
ctgggcaacatggcaaaaccccgtctctcttttttttttttttttttttttttttttttt  c.4-2341

.         .         .         .         .         .           g.11579
taataaaaaaagaaaaatccattaccttgaagtggcataaatttttttcatgagatgcat  c.4-2281

.         .         .         .         .         .           g.11639
gtttattattactaatggtgctgttttacatcatgaatatatgtgctacaagttgtatag  c.4-2221

.         .         .         .         .         .           g.11699
cacttctgaagtacagtttcattatagtcatttggccctcataatagcttgtaaggtcat  c.4-2161

.         .         .         .         .         .           g.11759
tagataatgctgcattttataggaaaagaaacgaggttaagagaggttgggtaactgaag  c.4-2101

.         .         .         .         .         .           g.11819
gtcaggcagatagtaaatagaagaacaaaactagaaaatagattttctcactcccagtca  c.4-2041

.         .         .         .         .         .           g.11879
tttagtttttctaatatcagcttggttctttgcaaatttgggacactagttctaagtctt  c.4-1981

.         .         .         .         .         .           g.11939
taggaaaaggagaaaccaatgtgaaatgatcccaaatataagggaattccctacttttct  c.4-1921

.         .         .         .         .         .           g.11999
gatgaaactattaagaaggaaagctttttgccaattgtataaactttttaaaatgcagcc  c.4-1861

.         .         .         .         .         .           g.12059
aaaataggccgggcggtggctcatgcctgtaatctcagcactttgggaggccgaggtggg  c.4-1801

.         .         .         .         .         .           g.12119
cagatcacccgaggtcaggcatttgagaccagcctggccaaccaacatggtgaaacccca  c.4-1741

.         .         .         .         .         .           g.12179
tctctactagaaatacaaaaaaaaaaaaaaaaattagccgggcgtggtggcaggcgcctg  c.4-1681

.         .         .         .         .         .           g.12239
taatcccagctactcgggaggctgagacaggagaatcacttgaacctgggaggtggaggt  c.4-1621

.         .         .         .         .         .           g.12299
ttcagtgagcggagatcttgccattgcactccagcctgggcaacaagagcaaaactccat  c.4-1561

.         .         .         .         .         .           g.12359
cttaaaaaaaaaaaaggtagcaaaaatagtcaaatatgttcttaaaatagttaataattc  c.4-1501

.         .         .         .         .         .           g.12419
acttatatgtatatgttttaaataaataaagtttaatttagaaataattacttttttcca  c.4-1441

.         .         .         .         .         .           g.12479
ttttcatattaataaaacaattttttctagattctttatgaacatcatgtcatcactggg  c.4-1381

.         .         .         .         .         .           g.12539
gccactttttgaatcatcagtttggtatttagcagttttgaatccatgtgtgatatattg  c.4-1321

.         .         .         .         .         .           g.12599
gcagtttgggaaattttatcccaagtcataaaaacccatttatataatattaggatagtt  c.4-1261

.         .         .         .         .         .           g.12659
gcttttaaaaggaatattttgtaactgatattcaacacatgaaattgtgagttctggcta  c.4-1201

.         .         .         .         .         .           g.12719
ggcgtggtgactcatgcttgtaatcccagcactttgggaggccaaggtgggctgatcact  c.4-1141

.         .         .         .         .         .           g.12779
tgagtccagaagttcaagaccagcctgggcaacatggtgaaaccccacttctaccgaaaa  c.4-1081

.         .         .         .         .         .           g.12839
tacaaaaatttgccaggcatgatggcacctgcctatagtcccagctcctttcagggggct  c.4-1021

.         .         .         .         .         .           g.12899
gaggcaggaggattgttcaagcccagaagttgaggctacggtgagccaagattgcaccat  c.4-961

.         .         .         .         .         .           g.12959
tacagtccagcttaggtgacaaagtgagaccctgtctccaaaaaaaaagaaagaaattgt  c.4-901

.         .         .         .         .         .           g.13019
gaattctgatcctcaggataattactaaatccagtgaccttttgttagtactacatgcaa  c.4-841

.         .         .         .         .         .           g.13079
aactagcgtagtttgaagataagatgtatcccagacaattattttagttcaatataaagt  c.4-781

.         .         .         .         .         .           g.13139
cattgagggagcacctttaatatgagagactatggaaggattcaaaactacacaactctt  c.4-721

.         .         .         .         .         .           g.13199
ttttaaaaatatataagtattccttacataaaaatatattaccatgatagcatattttca  c.4-661

.         .         .         .         .         .           g.13259
cacctaaaaaattagcaataatttttaatattatcaattattcagtcactgttcaaattt  c.4-601

.         .         .         .         .         .           g.13319
gatttatacattgtgattgattgacatgtctaagtctcttaatgtgtttgtatttttagt  c.4-541

.         .         .         .         .         .           g.13379
agagatggggtttcaccatgttggtcaggctggtctcgaactcctgacctcaagtaatcc  c.4-481

.         .         .         .         .         .           g.13439
actcgctttggcctcccaaagtgctgagtttacaggtgtgagccactgtgcccgtgaaag  c.4-421

.         .         .         .         .         .           g.13499
tcagtattctattacttgtcatgtcagctggtcgtggtagttcacgcctataatcccagc  c.4-361

.         .         .         .         .         .           g.13559
actttgggaggccaaggcaggaggatcgcttgaacccaggagttcaagaccagcctggga  c.4-301

.         .         .         .         .         .           g.13619
aacatagcgagatactgtctctactaaaagctttttaaaaattagcgaggcttggtggca  c.4-241

.         .         .         .         .         .           g.13679
cacacttgtagtcccagccactcaggatttcttgagcccaggagtttgaggttgtagtga  c.4-181

.         .         .         .         .         .           g.13739
gctgtggtcttgccattgcactccggcatgggtgacagagtgagaccctgtcttaaaaat  c.4-121

.         .         .         .         .         .           g.13799
aatactactactagtcatgtcactaaataaatatgtcattctatggaacatttcctgaga  c.4-61

.         .         .         .         .         .           g.13859
tgctgagaaaacagatgtgaagaaataattagtacttacttatgcatatgttcctggcag  c.4-1


Powered by LOVD v.3.0 Build 30b
©2004-2025 Leiden University Medical Center