alpha thalassemia/mental retardation syndrome X-linked (ATRX) - 6727 nt intron 12 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.127909
gtaagatgttttaattctgaatgtaaagaacatattggaccagacagtggcttatgcctg  c.4120+60

         .         .         .         .         .         .  g.127969
taatcctagcactttgggaagctgaggtgggcagattgcttgagcccaggagtttaagac  c.4120+120

         .         .         .         .         .         .  g.128029
cagcctgggcaacatagggaaacctcatctttatgaaaaatagaagaaatagctgggtgt  c.4120+180

         .         .         .         .         .         .  g.128089
ggtggtgtgcacctgtagtcccagctacttgggaggctgaggtgggaggatcacctgagc  c.4120+240

         .         .         .         .         .         .  g.128149
cccggaggtcaaggctgtagtgagcagcgattgcaccactgcattgcagcctgggcgaca  c.4120+300

         .         .         .         .         .         .  g.128209
gagtgagaccctgtctcaaaaacaaaagcaaaaacaaaaaaaatactggttttgtaaact  c.4120+360

         .         .         .         .         .         .  g.128269
aattatagtaatgaaatttaagtgtatggccaggcacggtggctcatacctgtaatccca  c.4120+420

         .         .         .         .         .         .  g.128329
gcactttgggaggccaagtcgggtggatcacaaggtcaggagattgagaccatcctggct  c.4120+480

         .         .         .         .         .         .  g.128389
aacacggtgaaaccccgtctctactaaaaatataagaaattagctgggtttggtggcacg  c.4120+540

         .         .         .         .         .         .  g.128449
cacctgtagtcccagctactctggaggctgaggcaggagaatcgcttgaacccaggaggc  c.4120+600

         .         .         .         .         .         .  g.128509
ggaggttgcagcagtgagctgagattgcgccattgcagtccaacttgagcggcagagcga  c.4120+660

         .         .         .         .         .         .  g.128569
gactctttctccaagaaaaataaaaaaaaaaaaatttaagcatatctgctcaaacagttg  c.4120+720

         .         .         .         .         .         .  g.128629
accacttatattaagcaaatgtcagtacactggcaacaagtatactatcacatgagatta  c.4120+780

         .         .         .         .         .         .  g.128689
aaattaataatttagagtgggaagataacccagaaactttagatgacacaaagaatattt  c.4120+840

         .         .         .         .         .         .  g.128749
ttaacctttagattataaagagaaataaatatgatttaataaataaaacattatgtagaa  c.4120+900

         .         .         .         .         .         .  g.128809
agtataagattgcatacaactgcagaattagtgctttcctgtagaagggtagaaaatgaa  c.4120+960

         .         .         .         .         .         .  g.128869
attaatttgggtaaatttatgcaagcttatatgcagaacttgactggcatatagtcagag  c.4120+1020

         .         .         .         .         .         .  g.128929
tagatttccatttcattaaaagcctgagtccttttgcattgagggcttacatgtttccag  c.4120+1080

         .         .         .         .         .         .  g.128989
cagtatggtgggcattgaggatacaaaaatgaataaaaatgtatctcagtgattctgata  c.4120+1140

         .         .         .         .         .         .  g.129049
ggtaactaggtttggcagtcactggtttagtaagaattattgacctttgtattataaaaa  c.4120+1200

         .         .         .         .         .         .  g.129109
aattatagcaccatgagggacattttgtgtaacgtaattatataatgtggcacaaagaag  c.4120+1260

         .         .         .         .         .         .  g.129169
ggcttctttagcttcttgaggggtaggagttaccccagagaaggcttcacaaagaaggct  c.4120+1320

         .         .         .         .         .         .  g.129229
tttacccaacagattaaattcaaaatgtgggagcacgtagattgttgtgaagatttacaa  c.4120+1380

         .         .         .         .         .         .  g.129289
cacaagcagggaaaaaaattttaaaacctgtgtaaaatgttggcacatgatggatgggat  c.4120+1440

         .         .         .         .         .         .  g.129349
acaattaatatagtataagctgctctatagataggagtagggaaaggaacaacaggggat  c.4120+1500

         .         .         .         .         .         .  g.129409
gaagctgggcctgtaaaacagagaccagatactggagatctttgtaagcctgtgtttttc  c.4120+1560

         .         .         .         .         .         .  g.129469
acactggagtactgggtggtataccaaggtgtacatctctttggtgtctctatttataat  c.4120+1620

         .         .         .         .         .         .  g.129529
ttgaggtttggggaaggtcattttatgttaaataatatatattgggtaattaaatgtgat  c.4120+1680

         .         .         .         .         .         .  g.129589
atttgcctgcgaattttgggtaacaaaaagttcaaagaatttttttgttgttgctgtggt  c.4120+1740

         .         .         .         .         .         .  g.129649
gggctttttgatgactaggggtaaattttgaagactgttgttagtacccaacccatggat  c.4120+1800

         .         .         .         .         .         .  g.129709
ggcagatgaactcttctttgccaactgggaataggaacgcatttttgcaagtgtttggga  c.4120+1860

         .         .         .         .         .         .  g.129769
aatataataggctctaaaggatgcagagccattgaaaagttttttttttttttcaattac  c.4120+1920

         .         .         .         .         .         .  g.129829
tgtatttatttttgaactctggacctctggttatccacctacctcggcctcccaaagtgc  c.4120+1980

         .         .         .         .         .         .  g.129889
tgggattataggcgtgagccaccgtaccggccttatttttaaattttttgtataacagct  c.4120+2040

         .         .         .         .         .         .  g.129949
atattgagatataactcacaaaccacacagttcaccatttacagtatacaatttagcagt  c.4120+2100

         .         .         .         .         .         .  g.130009
ttttagtataatcatagaggattaccaccactttaaaaaatgttttatttgaaatgtatg  c.4120+2160

         .         .         .         .         .         .  g.130069
tacaaagaagtgcacattatcaataagtagacatcttgatgaaaacgtagggcacccaga  c.4120+2220

         .         .         .         .         .         .  g.130129
tcaaggaacaagatgttgattactaacacccaagaatcacaatctcagcatgaccacttt  c.4120+2280

         .         .         .         .         .         .  g.130189
tttccctattgaaagattttaatcaaagatatcatatgatcagattagttccttactatt  c.4120+2340

         .         .         .         .         .         .  g.130249
cagtgagaatgaaggcactgaatgtttggaaggtattgctgtagttgatgacaaatgggg  c.4120+2400

         .         .         .         .         .         .  g.130309
ttgttggagaagaggaagattgacttgagtcttataggaggttgaattgttaggtcttct  c.4120+2460

         .         .         .         .         .         .  g.130369
taattggtatgaaagggaaaagtctacaatgagtgtcaggtttttagagttgtcatggtg  c.4120+2520

         .         .         .         .         .         .  g.130429
tatgtacaatatcacagaaatagttgaggttattcagtggagttgtaatgttttacaaat  c.4120+2580

         .         .         .         .         .         .  g.130489
ggaaagctaaggacatagtcttggaatcctaaacatttatagggcttttgggcaagagtt  c.4120+2640

         .         .         .         .         .         .  g.130549
attcactaaagatgagggggagaagttcttgccacacacatatacaattaatatgtcatg  c.4120+2700

         .         .         .         .         .         .  g.130609
gacattttaatgttaataaataatagtacatcattttgtgactacttgtcttataaattt  c.4120+2760

         .         .         .         .         .         .  g.130669
cttttttattattattatttttttatttttattatttatttatttatttattttgagtcg  c.4120+2820

         .         .         .         .         .         .  g.130729
gagtcttgctttgtcgcccaggccggagtgcagtggcgcgatctcggctcacactgcaag  c.4120+2880

         .         .         .         .         .         .  g.130789
ctctgcctcccgggttcatgccattctcctgcctcagcttccctagtagctgggactaca  c.4120+2940

         .         .         .         .         .         .  g.130849
ggcgcccaccaccatgcccggctaattttttatatttttagtagaaacagggtttcaccg  c.4120+3000

         .         .         .         .         .         .  g.130909
tgttagccaggatggtctcgatctcctgacctcgtgatccacccgcctcggcctcccaaa  c.4120+3060

         .         .         .         .         .         .  g.130969
agtgctgggattacaggcgtgagccactgcgcccagcttgtcttataaatttctttgcaa  c.4120+3120

         .         .         .         .         .         .  g.131029
tatggctgcaagctcttacagattctataaaggaactgtgtgatttagcatgttatatat  c.4120+3180

         .         .         .         .         .         .  g.131089
cacaacatggattcctgtgcctcttcaacaaaaggggcaatattgattttgcttctgaag  c.4120+3240

         .         .         .         .         .         .  g.131149
cttagttcaatatatagacccttttaatatatatgattacatttgagatttgctttatta  c.4120+3300

         .         .         .         .         .         .  g.131209
aaacctgagttttctgtgatctgtgtttctacagcctgattctgtgggtaatttattacc  c.4120+3360

      g.131213
caag  c.4120+3364

--------------------- middle of intron ---------------------
                                            g.131214          g.131216
                                            c.4121-3363  tgg  c.4121-3361

.         .         .         .         .         .           g.131276
ttttgttgttgttgttttttgtttgtgtaggagagagtaaacttctaaaatctcatcata  c.4121-3301

.         .         .         .         .         .           g.131336
tttgtgtttctaatatggattgtgatcatagtggttgatatatagttgaagttgcatgat  c.4121-3241

.         .         .         .         .         .           g.131396
tttctgagttttgtaaattctaatgttcctatattatttggaaatttgaattgagagatg  c.4121-3181

.         .         .         .         .         .           g.131456
ggaaaaaatcagtagtgaatagtctgcttattaaatctagttgaattaaattgaaatgca  c.4121-3121

.         .         .         .         .         .           g.131516
ttgaagaggtataagaacaaagtgcaacatgtgaactctaattttctcctaaattagaaa  c.4121-3061

.         .         .         .         .         .           g.131576
aatgttacaaaattattttagtgacaatttgaaattgtaaatattgccttcatattagat  c.4121-3001

.         .         .         .         .         .           g.131636
gatagtaatttttttttcagatgtgataatggtatttagttatgtagggcagtatcctta  c.4121-2941

.         .         .         .         .         .           g.131696
tgcttaggggtaaagtgtcatccgcgcttaatatcacatggttcagtgtaagaaaagttg  c.4121-2881

.         .         .         .         .         .           g.131756
tgtctgcctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtagagagaga  c.4121-2821

.         .         .         .         .         .           g.131816
aagaaaaaaagcaaatgtggtaaactgctaacaataagtgaatttaggagaagggataca  c.4121-2761

.         .         .         .         .         .           g.131876
agtgttcattcaataattctttcaaatttttggtagatttcaaaaattttaaaatgctgg  c.4121-2701

.         .         .         .         .         .           g.131936
gtgaacaattaatactaggcttaaaattatacttaattacaggatttttttgtgtcagtg  c.4121-2641

.         .         .         .         .         .           g.131996
tgtgtgtttttggtattctcccagctttccagttgcttagctattctttttttttattat  c.4121-2581

.         .         .         .         .         .           g.132056
tgtggtaaaatatatgtaacataaaatttaccattttacccatttttaagtgtatgattc  c.4121-2521

.         .         .         .         .         .           g.132116
agtgacattaagtacattcacatttttatacaaccataacttctgtctgtccctaaaacg  c.4121-2461

.         .         .         .         .         .           g.132176
tgtcgtcattccaaatggaatctctttaaccattaaacaataactctttgttcccctctc  c.4121-2401

.         .         .         .         .         .           g.132236
ccccgacatttctttatagcatttatgttctcccatttatagcatttctgttagcattta  c.4121-2341

.         .         .         .         .         .           g.132296
tgttctctcattttttaaaaagctggaatagatctttgattctgatctcaggttatgata  c.4121-2281

.         .         .         .         .         .           g.132356
gatttttttaaaaaattattttgaaacaattcttgatttacagaaatgttacacaaatag  c.4121-2221

.         .         .         .         .         .           g.132416
tgcagagttctgtgtatctttcacctagcttccctgatttaataccctatcatagtacca  c.4121-2161

.         .         .         .         .         .           g.132476
tgatcaaaaccaggaaattaatattggtacaatactatcaactaagccgggggtttacaa  c.4121-2101

.         .         .         .         .         .           g.132536
actgcacctgtgggccaaatctgatcctctgcctgtttttataaataagcttttattgaa  c.4121-2041

.         .         .         .         .         .           g.132596
acacagccatattcattaatttactgttttcacatatgtacaatggcaaagttgagtaga  c.4121-1981

.         .         .         .         .         .           g.132656
gatgagtagttgcaacagagaccatacggtccacaagtcaaaaatatttactatcaaact  c.4121-1921

.         .         .         .         .         .           g.132716
ttttacataaaatgttttatgacctctgaagtaaactatagatcttattcagagattagt  c.4121-1861

.         .         .         .         .         .           g.132776
tttcccactaatgttttctttctgctctatgattcaatccaggatctcacattgcatcga  c.4121-1801

.         .         .         .         .         .           g.132836
gttataatgtctccttaatctacttcagcctgtgacaattcctcagtctttactttgatg  c.4121-1741

.         .         .         .         .         .           g.132896
accttgacacttgtggagtgttgattccttattttctcaactgttccttgatatatattt  c.4121-1681

.         .         .         .         .         .           g.132956
gtctaatgttttctcatgatcgaattgagattattatgcattttgacagaataccacaga  c.4121-1621

.         .         .         .         .         .           g.133016
agtgatgttgtgtcttcagtgcatgatatcaagaatagatgatgtcagtatgtctttttt  c.4121-1561

.         .         .         .         .         .           g.133076
tttgagagaagacctcgctctgttgcccaggctggagtacagtggtgcgatcatggctca  c.4121-1501

.         .         .         .         .         .           g.133136
ctgcagactcaacctcctgggctcaagtgatcctctcgtctcagcctcccaagtagctgg  c.4121-1441

.         .         .         .         .         .           g.133196
gaccacaggtgtgtaccatcatgcctggctaatttttaaattttttttgtagagacagaa  c.4121-1381

.         .         .         .         .         .           g.133256
tctccctatgttgcccaggctggtctcaaattcgtgggctcaagtgatcctctcaacttg  c.4121-1321

.         .         .         .         .         .           g.133316
gcctcccaaagggctgggattacaggggtgagccaccatgcccagccgtcaatatgtctt  c.4121-1261

.         .         .         .         .         .           g.133376
attactctcacggttaacttttgttacttgcttaagttggtgtctgctggtatttttcca  c.4121-1201

.         .         .         .         .         .           g.133436
ctgtaaagaagaaaatattatttttctatctatatttagtattttgttgggagatacttt  c.4121-1141

.         .         .         .         .         .           g.133496
gtgaccatgcatatatcctgtttcttatcatacttaagcccactaattttagtatgcatc  c.4121-1081

.         .         .         .         .         .           g.133556
ttgggtgaagcagttagtactgtggtatttgcctagttgtaattttctatttatttcatt  c.4121-1021

.         .         .         .         .         .           g.133616
acttccacatttagtaattgtaagggagatttgttttcccctatttatttattgcattat  c.4121-961

.         .         .         .         .         .           g.133676
ttatatcaatatgacttatagatttttattttaccagttataatcaaatagtatcattta  c.4121-901

.         .         .         .         .         .           g.133736
ttttattgctcaaattgttctagctttggttgttgggagctccttcaagttgaatcttgt  c.4121-841

.         .         .         .         .         .           g.133796
gtcctttcaacatgtgcctgcccatgtttgaacactgctttgttttctggcactataaga  c.4121-781

.         .         .         .         .         .           g.133856
tgttgtaagcttatcttgtatttttttctgccctgcttcctctggccagaaagaggtttt  c.4121-721

.         .         .         .         .         .           g.133916
ctcctggaattttatatgcttccattactgtgttaattgtgagaaaaagaaaattgagga  c.4121-661

.         .         .         .         .         .           g.133976
ttccacatgtagagcctgattttcctggtgttgtggctagaaatagggatttttcttcac  c.4121-601

.         .         .         .         .         .           g.134036
agtcttgttgtcagtaccgtctgcatacctttggaatttagcctgccttctggtcaaaac  c.4121-541

.         .         .         .         .         .           g.134096
caggaaacaaagaaagaaaataaccatacgccctcacagctctctcccctccaccaattg  c.4121-481

.         .         .         .         .         .           g.134156
tagaggggtcattattcaagttttgatttcagtctccaatctgcctattattgtttccct  c.4121-421

.         .         .         .         .         .           g.134216
ttccgagttcttcggttgtgtcatcattggtggagacaatctgtaatcttactccatctt  c.4121-361

.         .         .         .         .         .           g.134276
ggccagcctaccttgcttgttttgaatagccaaacttctttttcattaatttacctttgg  c.4121-301

.         .         .         .         .         .           g.134336
taattacatatattttattgacaggtaatttattcttattctgtcaattcatatacaatt  c.4121-241

.         .         .         .         .         .           g.134396
gaatacttatattttaatgtacaaccacagttttataattacattagaaatacatctgaa  c.4121-181

.         .         .         .         .         .           g.134456
ttttatgtatatcatgtaaagcattaactggtatattctatattatgtattatccattca  c.4121-121

.         .         .         .         .         .           g.134516
catatatacctctgatgttcttacaatgctctgttttaatgtcgagtcagtggtaaatta  c.4121-61

.         .         .         .         .         .           g.134576
agtgaattaggtttctattgaaaaataattaataattttatgtattttttaaaattcaag  c.4121-1


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