ataxin 1 (ATXN1) - 7206 nt intron 01 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.5253
gtaagtgactatttttttttcctcctccgattctttcccccctcccccattcccttctcc  c.-779+60

         .         .         .         .         .         .  g.5313
ccttatttagattaaaatccctcctcccccgatctcccgagaggggcaaaagcaacaacc  c.-779+120

         .         .         .         .         .         .  g.5373
agcaaacaaacccaaaaccccaatcggctgcacggaaaacagctggaagaggagcgaagg  c.-779+180

         .         .         .         .         .         .  g.5433
aaatcgacgcgtcgtgttctgtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgt  c.-779+240

         .         .         .         .         .         .  g.5493
acatacaaccgtccccggctccaggctcccgggccgacacccccactctgggcgcagggg  c.-779+300

         .         .         .         .         .         .  g.5553
cggccggcgggggggctgtcaggggctgggtgggcgcccgccgggctagggggcgcgccc  c.-779+360

         .         .         .         .         .         .  g.5613
gggcggggggcgcgggcggggagagcggcggcggcgccccgctcccccggctgctggtcc  c.-779+420

         .         .         .         .         .         .  g.5673
ggtcgcaagtgcggagagccatgtcctcctccctccgggtggcgcaggggggaggcggcg  c.-779+480

         .         .         .         .         .         .  g.5733
gctggggttggggggtggtccctttcccggccgccctcttcccattcctcctccccggag  c.-779+540

         .         .         .         .         .         .  g.5793
agggcggtgagagagagggggtctcacggagggctggacttctccgcgggtggtcgcccg  c.-779+600

         .         .         .         .         .         .  g.5853
gcctcggcgccctggggcgggggtctcccctcggagggccggcctcgccgggtgtgcggc  c.-779+660

         .         .         .         .         .         .  g.5913
tgcgggcggggaagggactgctcctgcagccgggacgggactttgcgcgcggccgggtgc  c.-779+720

         .         .         .         .         .         .  g.5973
cgggcggggggcgcagaggggtggcctcggggaccgcgcgggggtagcgggtgtgcgggt  c.-779+780

         .         .         .         .         .         .  g.6033
gcctggagcgcggctggagtggcggtgacggccctggccgccgccgccaccgccgccctg  c.-779+840

         .         .         .         .         .         .  g.6093
ttggtgcggccgcttcctgatcatgtgcagcggcagccgccgcccggagccgggagcccg  c.-779+900

         .         .         .         .         .         .  g.6153
cgagcgccccagtccgggccggcgcccccgccagcacccgcggcaggagacgaggagccg  c.-779+960

         .         .         .         .         .         .  g.6213
cggcaggcgctgccctgagccgggagtgaacggctgcgcggctgctgggagggtgaatga  c.-779+1020

         .         .         .         .         .         .  g.6273
agccaggaggaggggaaggaggaggaggcggcggccgccgcggaggaggcgctgcgggga  c.-779+1080

         .         .         .         .         .         .  g.6333
ttgggatgcgccctggagccccactgctcgttcactctgggccgggccggagactctgcc  c.-779+1140

         .         .         .         .         .         .  g.6393
actcccgggggcgccgccgcctcctcctacgtggttccagtgctgcgcgcaggccggtcc  c.-779+1200

         .         .         .         .         .         .  g.6453
cgcagggggcagggaagggggccggacgggcggagcgagaggtgaggcggtgtcggagcg  c.-779+1260

         .         .         .         .         .         .  g.6513
cggcgtgagtgtgagtgagtgtgtgagtgactgtgtgtgtgtatttgtgcgcgcgcgcgc  c.-779+1320

         .         .         .         .         .         .  g.6573
cgggcggggggcgagggccgtcgcgacgcggagggggcccttccttggctacttggctga  c.-779+1380

         .         .         .         .         .         .  g.6633
ctctgcagcgccccgacccctcttcagccccccgccttcaggctgccttcttaaactccg  c.-779+1440

         .         .         .         .         .         .  g.6693
tggcttgtgctttcattttgtttcagaccacgtagggggctgactgaaagggatgaaaca  c.-779+1500

         .         .         .         .         .         .  g.6753
attcaggttttctagggagattgagcaagaaccttagtgggggtggaagtagggtggtga  c.-779+1560

         .         .         .         .         .         .  g.6813
tcgagactctgccagaaaacaaaacaaaacaaaaaaaaatccgtttctaaggacggcggg  c.-779+1620

         .         .         .         .         .         .  g.6873
gattcggttcgagcccgtggctgctctgttttgttttgctttcttggtatataatcctac  c.-779+1680

         .         .         .         .         .         .  g.6933
agataaaagggtaatataaatatttgagaagagggaaattgctgaagagtagtaagggca  c.-779+1740

         .         .         .         .         .         .  g.6993
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacagtcggaagaagctggttatataatgcgcgat  c.-779+1800

         .         .         .         .         .         .  g.7053
gtggctaacaagaaaggcaagctatttttattttgtttaccgtatgctgtgcagtaggga  c.-779+1860

         .         .         .         .         .         .  g.7113
ctcctccaaactggttctgtccccgaagagattcttagcttccctgcgagatccacagga  c.-779+1920

         .         .         .         .         .         .  g.7173
tacaattagcaaaattagaagaccctattacacccacagaataaaaactaatgccttaca  c.-779+1980

         .         .         .         .         .         .  g.7233
gtggctttctccctgcacatcctgtcgtgcatgcacgggaatgtgtgtatgcaaataagt  c.-779+2040

         .         .         .         .         .         .  g.7293
tctcctttggcaatctagtagtcacatctcaatgacatttgtgttttataatgcaggctg  c.-779+2100

         .         .         .         .         .         .  g.7353
tttttaatatttaaacatcattgttatatattgcacacagcagtgggtagttacttggtt  c.-779+2160

         .         .         .         .         .         .  g.7413
atttttaggcacagctagttactttttcaacagtgttagctgagacatttctgtttgggt  c.-779+2220

         .         .         .         .         .         .  g.7473
tttttaggaggctgcagttcctagaagccccccttaagcccacccttcggtttatttgat  c.-779+2280

         .         .         .         .         .         .  g.7533
gggtaaaggtagtttgatacttgagctttttttggagtgaagcttatgtctgaggaaacc  c.-779+2340

         .         .         .         .         .         .  g.7593
accagagagaagagaaaatcctgcacaggaactcttggaaagggattgcaccataacggc  c.-779+2400

         .         .         .         .         .         .  g.7653
tagcgctgtggcatttaatctcctctgattgccctctcactgtgcatgcatcagtcaata  c.-779+2460

         .         .         .         .         .         .  g.7713
ttttagcagctccgcaaataaatggacttgaatgccatcttctacataaagcagaggttg  c.-779+2520

         .         .         .         .         .         .  g.7773
aagggctcccctgaacctcctggctgcctgtcagtggtgtaggttttcggtgcacttact  c.-779+2580

         .         .         .         .         .         .  g.7833
ccagtcctgatcactcatgtaattagatcaggctgccatggcaacagacagtgttcctcg  c.-779+2640

         .         .         .         .         .         .  g.7893
tccattcaggtgggtttgtcttgtgcctgaactactccaagtgttttatgcacagcattt  c.-779+2700

         .         .         .         .         .         .  g.7953
atgctgcccaagccagacgagagactccactatttcaattgcatcttctttcagtcattt  c.-779+2760

         .         .         .         .         .         .  g.8013
ggatgggagacactgaatgaggcttctagctactcaacttttataaaggagaccaacaag  c.-779+2820

         .         .         .         .         .         .  g.8073
ctgttcttcctaggtgcagtatgtaaatgcatctccccagacagtgaaaggagcctgaca  c.-779+2880

         .         .         .         .         .         .  g.8133
atcctgctggtgtttattgtgaacagatcaacaagtatttggtacttgttagaaaccttt  c.-779+2940

         .         .         .         .         .         .  g.8193
cagagctcactaaagcaacatttcttttgcagtctggtgcctttggccttgcagtcagtc  c.-779+3000

         .         .         .         .         .         .  g.8253
acttaaccctttcaagtgtgaagagcgttcatcatttggaacctccattgcccatagcga  c.-779+3060

         .         .         .         .         .         .  g.8313
tggctggatttctaaagggtttactcaggggaataacttattcggaaaatatattcccat  c.-779+3120

         .         .         .         .         .         .  g.8373
tgtcacattttaaaacttgacagccatcataacaaaaactggtactgacagtaggcagac  c.-779+3180

         .         .         .         .         .         .  g.8433
attctgaatgtattcattcttaatttggatctattggctgtgatttgaatgatctttggt  c.-779+3240

         .         .         .         .         .         .  g.8493
agtaagttaaaaggatttttttttccttagctaagcgagaaacgatagaggcctatagct  c.-779+3300

         .         .         .         .         .         .  g.8553
agaggactgatagtgcatggtgcttttggacaataaacatgtactttattttaggatgta  c.-779+3360

         .         .         .         .         .         .  g.8613
atttagtgagcagttagaaagcagtattctagtctttgcattagggcaccactgataaag  c.-779+3420

         .         .         .         .         .         .  g.8673
ctggctaagcaaagagaaataatattatggcaaaaaggaaaaaaggaaaagttgctttag  c.-779+3480

         .         .         .         .         .         .  g.8733
ttgctgaagctctgtgctgctcaggcaatccaactaagtggggcagggggcgggcggggg  c.-779+3540

         .         .         .         .         .         .  g.8793
ggagtattttcataaccctggtatttgaaagaaaagataattgagaattatgtcttgatt  c.-779+3600

     g.8796
tag  c.-779+3603

--------------------- middle of intron ---------------------
                                            g.8797            g.8799
                                            c.-778-3603  ttg  c.-778-3601

.         .         .         .         .         .           g.8859
tgactgccagtcagtttacaattttatggccaacaaagctaaactggtaaattttttccc  c.-778-3541

.         .         .         .         .         .           g.8919
ccagggctaggattgagagagctactcaactctattcccagggggtttatgagtttttac  c.-778-3481

.         .         .         .         .         .           g.8979
cgttttgtgagtttatgtggttggtaaattcattgtggcctggtcagatgaagcactgct  c.-778-3421

.         .         .         .         .         .           g.9039
gtagttaaaatgagctattatttcttctagctactcaacttttataaggtggtaaataga  c.-778-3361

.         .         .         .         .         .           g.9099
tgggaagcaaggatgtcaatattacacaatgccttggaggtcctggattctattttgcaa  c.-778-3301

.         .         .         .         .         .           g.9159
catatagaaaaatgctttacttgcagtaaaatgtgaacatatatttttcagtgcacaaat  c.-778-3241

.         .         .         .         .         .           g.9219
aaattcatgtgaaaataagtataaaaaaatgtacctggtgggaaccgccaaaggcaatat  c.-778-3181

.         .         .         .         .         .           g.9279
ttttccttgcggatttcgttttaagagggtttggtaaacagaagtgacactttgtcaaaa  c.-778-3121

.         .         .         .         .         .           g.9339
atgttacgactagacttcaggacttctgaattgtcttttacacttagaggaagattaaac  c.-778-3061

.         .         .         .         .         .           g.9399
agaaactctttagccacaagattacatgtcaaatgcctgtaagtttcaacatacctaagt  c.-778-3001

.         .         .         .         .         .           g.9459
cagttgcctaggagtcctgggaaaggccagtgctgagattattgaaatattagtaaacat  c.-778-2941

.         .         .         .         .         .           g.9519
tactatgactcctgtttttgttgtcattatggagtccaaggacgcacatttctttgaata  c.-778-2881

.         .         .         .         .         .           g.9579
atgttgtgcctttattgtttttcattctgaaatgtcaagtggattttacttttttgcaca  c.-778-2821

.         .         .         .         .         .           g.9639
taccttgagtgacagtttctgatgactaacactaacactcattttgtttcctattaaaag  c.-778-2761

.         .         .         .         .         .           g.9699
ttaagcaataaacatattttactaaaattctgaaactcacgtaagtaggtaaatgtggga  c.-778-2701

.         .         .         .         .         .           g.9759
gtgaatgttaattctttaaactgtagttatctgaaaataacacatagattaggatctgaa  c.-778-2641

.         .         .         .         .         .           g.9819
cagcttaaatacttgcatcggtaaagtgacaatagtgaagtaagacaggctattattttt  c.-778-2581

.         .         .         .         .         .           g.9879
aggggagagatagattatttgactttccttgctctgtattttcagagtaattcaatagtt  c.-778-2521

.         .         .         .         .         .           g.9939
cgaatgattagtttctgtgagagatttagatctgtgcagcttaattgcttcaaataacag  c.-778-2461

.         .         .         .         .         .           g.9999
atttagttctggtcatacttccaaggttatcagaagcaggccctccttattttgataaaa  c.-778-2401

.         .         .         .         .         .           g.10059
gcattgaaagcaatacattgtagaaatggtaatagaaataataatttctgttttaggacc  c.-778-2341

.         .         .         .         .         .           g.10119
ttacatatagaacttccttttctaagataagaattttaagtcatcaattatgttcacatt  c.-778-2281

.         .         .         .         .         .           g.10179
ttattttcatgtaatttagtttaataaaataaatgtactcattcaaaatttttttaagaa  c.-778-2221

.         .         .         .         .         .           g.10239
gtgatatacagtgtcagttttacagaattttttaaatgttggctgaaagaacggtaatta  c.-778-2161

.         .         .         .         .         .           g.10299
cattgagatttttaaaaatatataaatgcttaaaattacagaagtaataaaaagaatggt  c.-778-2101

.         .         .         .         .         .           g.10359
tttagacaaatcttatggaaagttttttattttattcttttataattatatttatggata  c.-778-2041

.         .         .         .         .         .           g.10419
tttgtctttattagtgtagtaatatattttataacgctcataatttgaactttcaggcta  c.-778-1981

.         .         .         .         .         .           g.10479
atgtactataaatatttgtattacgcattactaccatcccaaatgtaccaaaacacgttt  c.-778-1921

.         .         .         .         .         .           g.10539
agagagaacaattatggacaaaaaagcaacaagcattatattttgtttgacatatttcat  c.-778-1861

.         .         .         .         .         .           g.10599
gttagcagaaatgtttcattgatttttctgtaacttttaatgcatcccatttgtggagta  c.-778-1801

.         .         .         .         .         .           g.10659
atgaaaatgtaatgataattgccacaatgtaagcaaaaattgtatcctacctgaaaatta  c.-778-1741

.         .         .         .         .         .           g.10719
ctttccagaaaattcatggtagtgtactcagaatttgagactcaagagggcagaggtttc  c.-778-1681

.         .         .         .         .         .           g.10779
cccgattgtgatgttttgatttgggctaagaggaactctttttttttttttttacactta  c.-778-1621

.         .         .         .         .         .           g.10839
ggtgccctttaacatgacaagttttgaatgagttaggtagcagaagtttttcgtgacagt  c.-778-1561

.         .         .         .         .         .           g.10899
tattgtagctactaacctatagcatctatccttctaacgttcaaagaaaatatatttttc  c.-778-1501

.         .         .         .         .         .           g.10959
tgtcactgtgtatggcaaactttattttcttgtgcccttaattttgttcccctttctcac  c.-778-1441

.         .         .         .         .         .           g.11019
attatctcctggtacttactgaccattacctcagttttgtttaggccgtctttcttgtta  c.-778-1381

.         .         .         .         .         .           g.11079
atcttccaatattaatagtattgtattatgttgctctgctgggttttaaaaatattgagt  c.-778-1321

.         .         .         .         .         .           g.11139
attccatttttggtgtatattattgtataaaatgtcctataaattattttctggtatatt  c.-778-1261

.         .         .         .         .         .           g.11199
attttgtaagtttttgcagtgaatacgtgctgccttgcttgtattcttgccttcttccct  c.-778-1201

.         .         .         .         .         .           g.11259
ctgatggaatacaagttatgtaaactctctgtattatcctaactagtgcagcaacacaaa  c.-778-1141

.         .         .         .         .         .           g.11319
tacttttgaaataagaaagcatactcatgcaagagtaaagtaatcttctatggcatttac  c.-778-1081

.         .         .         .         .         .           g.11379
atcatgtttgaccctcctctgcacttcagcaaactaggaggaggttgtaacttggactct  c.-778-1021

.         .         .         .         .         .           g.11439
ataaaaccttatctgccaggtgatatgtaaacaggattgtgtgcacacacattgtcatat  c.-778-961

.         .         .         .         .         .           g.11499
aggcaaacactctcccaactggtgagctcataaaaagcactgtctgtaaatttatggtac  c.-778-901

.         .         .         .         .         .           g.11559
ctgcacctcatttgagaatcaagtattttgatgcttaatttgagatgacatcatgatcct  c.-778-841

.         .         .         .         .         .           g.11619
ccctccctgcttcctcatccttaaagaagtactaagattaaatagaattttgtcaacttc  c.-778-781

.         .         .         .         .         .           g.11679
tacttaacttggccattatttatatttgtaactcaacaggcttcttggtggagggactgt  c.-778-721

.         .         .         .         .         .           g.11739
gccttctaaagatctgaaagaccttatagtgtataacagcttaccttccttctctgtacg  c.-778-661

.         .         .         .         .         .           g.11799
cacagatcacatgtggggaaaccaaggactacaagaattccttcttttgcatatcagtcc  c.-778-601

.         .         .         .         .         .           g.11859
tcggcaggcaatcaatgcttaaataaatgcttggtgaatggattagttagaagtaagaac  c.-778-541

.         .         .         .         .         .           g.11919
attttggctactgttcattactttgaaaagtgctggaaagaagtggaagttattttcctt  c.-778-481

.         .         .         .         .         .           g.11979
tccagctgggctgtgctcttaaaaatagtgagtgtgtatggatgaaaataatcatgagta  c.-778-421

.         .         .         .         .         .           g.12039
ccgagatgtgttgccatgtacccaaggataattggctcacttacctgtttacggattatt  c.-778-361

.         .         .         .         .         .           g.12099
cacattggagatcatattcatagctccagaatagtttctttctgacatccaatataaacc  c.-778-301

.         .         .         .         .         .           g.12159
tgggcctccttcttcctactgttacctggcgtgagcttaggaaacccaaactaagtttaa  c.-778-241

.         .         .         .         .         .           g.12219
aatcagcctaagcaaatgtgcagatcagctccagtaatcaaagactgaaaatcagtccag  c.-778-181

.         .         .         .         .         .           g.12279
cattcactagtttggggatgattttatagtaaccctgctactgattttaaaaaaattttt  c.-778-121

.         .         .         .         .         .           g.12339
ttttctgtttaatgtggataattggtaattaccggtatttaagaatataattttaatgga  c.-778-61

.         .         .         .         .         .           g.12399
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