beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2 (B3GALNT2) - 9302 nt intron 01 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.5401
gtgaggtcctggggccgggcgggttggcggccgccgggggggtgggaggcccggcttggt  c.112+60

         .         .         .         .         .         .  g.5461
gccgcggggcttcgccgggaattgttggaggcgggggaagggccaaacgcgacggtcccc  c.112+120

         .         .         .         .         .         .  g.5521
agacgaaacaaacggctcttttcatccttggagcgttaacatcgggcaaacttgagggag  c.112+180

         .         .         .         .         .         .  g.5581
cttttctcttttcgtgtccccgccgcttctcacttccccgtttgccttaacgcccgcaga  c.112+240

         .         .         .         .         .         .  g.5641
gccggcgcccgcagctgcaagtccttcgcccgtccccaggcctggttagtgatgtccgac  c.112+300

         .         .         .         .         .         .  g.5701
gccgcccgttcgcccgggagcggaacctcgtgtgcccttcagccgccagcgctttctgct  c.112+360

         .         .         .         .         .         .  g.5761
ttgggagctctggctctgaagttgttttcttcccccccaagttgttggtctttctcggtc  c.112+420

         .         .         .         .         .         .  g.5821
aagactggggttttagtgccgtggataatgtgtgtgcgtgttttcaaaggtggctcggtt  c.112+480

         .         .         .         .         .         .  g.5881
ttgcttttaaggaataactttgctgtaagaatatactgtagttcgtattcttggattatg  c.112+540

         .         .         .         .         .         .  g.5941
atgtaagtcggttaaacaaatctagacatgaaatagggcatggccgagagttggagttgt  c.112+600

         .         .         .         .         .         .  g.6001
tcctgtgagtttggatcgcataacctgctaatgcagtttacatggaaatatcaaattctt  c.112+660

         .         .         .         .         .         .  g.6061
taacgatcgtgtccatttgctctaaaacttaatctctcgtaggaatgaaacctttgttct  c.112+720

         .         .         .         .         .         .  g.6121
tgtttcgcgtcacagcctaatagaatgctttacttacggtgcccagcggattgttttgtt  c.112+780

         .         .         .         .         .         .  g.6181
agtgggttccaccaccctgaacactactttagctttccctgtatctcttgtcttcttctt  c.112+840

         .         .         .         .         .         .  g.6241
taagggcttgccctagaacatgaaagaaacctagaaagctcttttaaatattatgtaata  c.112+900

         .         .         .         .         .         .  g.6301
cttaattttgtaactatactggcacttttttcccttaccatctctccccaaaacagctgt  c.112+960

         .         .         .         .         .         .  g.6361
tttctaatccaaaagttcttaaaattagaattgagtgtttgcagttcagcactctatgcc  c.112+1020

         .         .         .         .         .         .  g.6421
ttataagtagaaagtattcggcaatcctcaaaacagtctcagttatatgaaattatgttg  c.112+1080

         .         .         .         .         .         .  g.6481
aggttattttggtaacaatctcttttcctattagatcactagctctttgaaaaggatttg  c.112+1140

         .         .         .         .         .         .  g.6541
tgtgacctgaatagaattaaacactatttaagtgatttaatgaaagtacagtgttgctat  c.112+1200

         .         .         .         .         .         .  g.6601
gcacttaaccagttgatggggtcagggttttgctcagtgttttttaggtttttgtgaagt  c.112+1260

         .         .         .         .         .         .  g.6661
gaactaagaagagaacgccatttataaaaaatgctttgtaacagctgcttgtgtgttaca  c.112+1320

         .         .         .         .         .         .  g.6721
ggtttctctcttttgttatgagtgagccctgctggaatctccttgtagagcgtcattaag  c.112+1380

         .         .         .         .         .         .  g.6781
tctgtttatggccttaatggttgtttagggttcagtaaaacaaacaaaaactgaaatgtt  c.112+1440

         .         .         .         .         .         .  g.6841
agtagacttcaaactgaaatcttagtagacttgctaggcagttttctagtttgagacaag  c.112+1500

         .         .         .         .         .         .  g.6901
tttttcctactcccttactgcacttgaaggatgatgcctttatctgccatccagtagtta  c.112+1560

         .         .         .         .         .         .  g.6961
gaccaggctagattaaggaaatgaagaagtagaccatagaaaggaacagggtaataacgt  c.112+1620

         .         .         .         .         .         .  g.7021
aggtaagaagatcaatactagttatgttaattaactttggctttgaatgagtactgtata  c.112+1680

         .         .         .         .         .         .  g.7081
tctggtcagataataaatgggatttttttttaagttccgggatacgtgtgcaggacgtgc  c.112+1740

         .         .         .         .         .         .  g.7141
aagtttgttacataggtaaacgtgtgccatggtggtttgctgcagctgtcaaccatcgat  c.112+1800

         .         .         .         .         .         .  g.7201
attttaataatctaagttaaacatgactggcccggcgcggtgcctcacgcctgtaatccc  c.112+1860

         .         .         .         .         .         .  g.7261
aacactttgggaggccgtggtgggtggatcacctgaggtcaggagttcaagaccagcctg  c.112+1920

         .         .         .         .         .         .  g.7321
gccaacatggcgaaaccccgtctctactaaaaatacaaaaattagccgggcatagtggtg  c.112+1980

         .         .         .         .         .         .  g.7381
catgcctgtaatcccagctactaaggaggctgaggcaggagaatcacttgaacctcggag  c.112+2040

         .         .         .         .         .         .  g.7441
gcggaggttgcagtgagacgagattgcgccactgcactccagcctgggtgacaagagcga  c.112+2100

         .         .         .         .         .         .  g.7501
aagtccatctcaaaataattaattaattaattaaacaagactgactcctacctttccttt  c.112+2160

         .         .         .         .         .         .  g.7561
tttccttttggtactttcaaagctaaaagcagtggaagcatcttaaatgctaaaatttcc  c.112+2220

         .         .         .         .         .         .  g.7621
cataattcctttaccattgtgctgtcaccatgttgaaactaaaatagttgggtgttttta  c.112+2280

         .         .         .         .         .         .  g.7681
cattttaacccttgtactttaagcctaacaggagaaaaaaaaacccaagattttgctaag  c.112+2340

         .         .         .         .         .         .  g.7741
tattcttttcttgaattaacatttttaaatgtattttttttcctcttctgctgctttgtc  c.112+2400

         .         .         .         .         .         .  g.7801
tgtcttcagtctcattaagtaatggcagtttctttgttttttttgaaagagcgatttacc  c.112+2460

         .         .         .         .         .         .  g.7861
ttccctgaatattaaaaaaggttctttggctcgcagttgattcagcaaatatttgagagc  c.112+2520

         .         .         .         .         .         .  g.7921
ctactctgtgccagctcctatcgtaggtgtggaattacagcagtaatcaagctaaacttc  c.112+2580

         .         .         .         .         .         .  g.7981
ctgccctcatgtagtttacaatttagaagggaagacagagcatcaggaaataattataaa  c.112+2640

         .         .         .         .         .         .  g.8041
tatcacagcggtagtgataagtatagggaaaaaagataaagcagtgttaagagattaaag  c.112+2700

         .         .         .         .         .         .  g.8101
agatggttttaaataggtcagggaagtccattccattctgaagaggtaacagttgagcag  c.112+2760

         .         .         .         .         .         .  g.8161
ggaccagaatgaagtaagtgagtcaccttagtaccagaatcagcaacttttttaatgtga  c.112+2820

         .         .         .         .         .         .  g.8221
taggttcccttaaaccagtcagggaaagcaactggtaaagaggaagtgaaatccagtaca  c.112+2880

         .         .         .         .         .         .  g.8281
cctgagggtgacagaggaaaatgcaggtggagataaccatcggactaaggaatctaaaca  c.112+2940

         .         .         .         .         .         .  g.8341
taggatatcttgattacaaaatgctcgttttgggtaatgccttaagtaggaattatttaa  c.112+3000

         .         .         .         .         .         .  g.8401
cggttaatttagaaaaatgatgtgacaaaagaaggcttcgctttctagggtatctggaaa  c.112+3060

         .         .         .         .         .         .  g.8461
gaaagaaaccaaaacaaaggagcatattcactcaacaagtacttgagtgttagattctgt  c.112+3120

         .         .         .         .         .         .  g.8521
gctggatgcctagtcccttctcccaaggtgctcacagtatctaatggaaacagatgtaga  c.112+3180

         .         .         .         .         .         .  g.8581
gcaagtagaaggtcagaaaacaaattgagcttgctttgtaattttgcctggggtgagttc  c.112+3240

         .         .         .         .         .         .  g.8641
ttccaaaattatccctatatgctaattgtgtctctgtgcttcagtttccttatttataag  c.112+3300

         .         .         .         .         .         .  g.8701
atgatgatctcatagacttattgtgaagattcaattaatgaaacacccgcaacagtgcct  c.112+3360

         .         .         .         .         .         .  g.8761
gtttcatagtaaacactccatgagtttgagagaggagtggtagtctggtggccgctgatg  c.112+3420

         .         .         .         .         .         .  g.8821
cctgtgctagtgtggtgttttgggaggtgtctttggtagtgtgtatgatgattgtcttta  c.112+3480

         .         .         .         .         .         .  g.8881
tcattagatctgtgacaggctcacatgttttcttcattttcaagatttgtatctatttgt  c.112+3540

         .         .         .         .         .         .  g.8941
gactcttccaagagcatgcatatcagagtggaattttggtctgatttttaagactcttgg  c.112+3600

         .         .         .         .         .         .  g.9001
gcttattttgagcaatcaattttgatgtcaaccttctttagacttttttgattattattt  c.112+3660

         .         .         .         .         .         .  g.9061
tgaggcacagtttcactctgtcgcccaggctggagtgcagtggcaccatcttgactaact  c.112+3720

         .         .         .         .         .         .  g.9121
gcaacctctgcctccgggttgaagccattctcctgcctcagcctctgttacatgtgtgtg  c.112+3780

         .         .         .         .         .         .  g.9181
ccaccacgcccagctaatttttgtattattagtagagactgcgttttgccatgttggcca  c.112+3840

         .         .         .         .         .         .  g.9241
ggctggtctcgaactcctgacctcaagcgattcattcacctcggcctcccaaagtgctag  c.112+3900

         .         .         .         .         .         .  g.9301
gattacaggcatgagccactgcgccaggccctcccttagactttaatatacctttggatg  c.112+3960

         .         .         .         .         .         .  g.9361
tccactcacagtgcagggttgagcaggttgccagactctcaggatatattacatattaag  c.112+4020

         .         .         .         .         .         .  g.9421
aaaagaaatagttcttactgtagggtctcagaagaaaacaataccccaaaataaggcctc  c.112+4080

         .         .         .         .         .         .  g.9481
agaagcagctgtctctgacctgctgctgctgtcctctctctggccttgcattctcacctg  c.112+4140

         .         .         .         .         .         .  g.9541
aggctagctgtagaaactaaaatccctcttccccaaagccagccataaaacctaaacata  c.112+4200

         .         .         .         .         .         .  g.9601
ttactctaactagcccccaccaccacctttctatataaaaattacctaacttaccttctt  c.112+4260

         .         .         .         .         .         .  g.9661
ttattacaggtcataagaacctcataccagagagggtcctatcccatacccagtaggaaa  c.112+4320

         .         .         .         .         .         .  g.9721
gaatgtatactcagagaggacaagaagaatctagacaggccttgctgggttttccaactc  c.112+4380

         .         .         .         .         .         .  g.9781
catctgttaacattagatcctaccctttctgtccaatcttaattccacatagctatctat  c.112+4440

         .         .         .         .         .         .  g.9841
actttgttaaacctaagcacagaaatgggcactttctcctgtatctttactgatcaaata  c.112+4500

         .         .         .         .         .         .  g.9901
aatttatatgccttttctcctgtccatctcttgtcagtgattttcaccgaaccttcagag  c.112+4560

         .         .         .         .         .         .  g.9961
ggaaaactttcccttggcccttacgttgccctcagggagcttgcttgggattgtgattta  c.112+4620

         .         .         .   g.9992
gtcctgacattatgaagattttgtttactgc  c.112+4651

--------------------- middle of intron ---------------------
                 g.9993       .         .         .           g.10023
                 c.113-4651  tgtatctgtgccatctagaacaatgagcata  c.113-4621

.         .         .         .         .         .           g.10083
ggagatgctctgtcatttgagtgaataaatcaagagaataaaactggcgcagtttgatgt  c.113-4561

.         .         .         .         .         .           g.10143
attttcacaaattgaacacacccaactaatcaccacccagatttaaaaaaagaaaactat  c.113-4501

.         .         .         .         .         .           g.10203
cagtgcttcagaagttcccttcatgctctgttttgtcactaccagggatagtaaccagtg  c.113-4441

.         .         .         .         .         .           g.10263
gcagaaatttggctacttttgtactttatataaacagaaccgtctagtatctacatagtt  c.113-4381

.         .         .         .         .         .           g.10323
cctatcgcctgtttatcttaatatgatgtattaatagaataatgtttaatgatatgatta  c.113-4321

.         .         .         .         .         .           g.10383
acatgtaattttaatggctgcatagtattctgtcatatagctacaccataatttatttaa  c.113-4261

.         .         .         .         .         .           g.10443
tgagtcctttatgtgtttatgtagcttgcagtttttcgctattaataggtgacactatga  c.113-4201

.         .         .         .         .         .           g.10503
ttaataaagatcttctgagtgtatcactgattatttctttagaatgagttcttagaattg  c.113-4141

.         .         .         .         .         .           g.10563
ctggacaaagttacaccattctaaattatttgacacattgccaaattgccctgcagaaga  c.113-4081

.         .         .         .         .         .           g.10623
ctgtaccaaattacattccttcccgcaatgaaaaagagtagccttttttttttttttttt  c.113-4021

.         .         .         .         .         .           g.10683
tttttgagaaggagtctagctctgtcacccagactggagagcagtggcgggatcttggct  c.113-3961

.         .         .         .         .         .           g.10743
gactgcaacctctgcctcccaggttcaagcaagtctcctgactcagcctcccgagtagct  c.113-3901

.         .         .         .         .         .           g.10803
gggattacaggcatgcaccaccacacctagctaatttttgttgtatttttaatagagatg  c.113-3841

.         .         .         .         .         .           g.10863
aggtttcaccatattggccaggctggtctcgaacttctgaccttgtgatctgccctcctc  c.113-3781

.         .         .         .         .         .           g.10923
ggcctcccaaaattgaagctgggattataggcatgagccaccgtgcccggcggagagtag  c.113-3721

.         .         .         .         .         .           g.10983
ccactttgttgaaatcactaacaacatttccttgaagtaccatcatttagttacaatcat  c.113-3661

.         .         .         .         .         .           g.11043
ttaagaagacatttgtcagtttgaatgtaggagaaaactggtgtctcattgctctaattc  c.113-3601

.         .         .         .         .         .           g.11103
aaacttgattcttattgaagttgaacatgttttcataggcttgctatttgccttttttct  c.113-3541

.         .         .         .         .         .           g.11163
tttctgaattatctttatgtccttctgtatcatgtttacttcttaccactttcttttttt  c.113-3481

.         .         .         .         .         .           g.11223
ccctctgtttctagacactggagtcaactaggtaccctgttcttgtaacataaaaggtga  c.113-3421

.         .         .         .         .         .           g.11283
taagagtttagagctagattggtaaagggagctagaaatttgagcaacattcttacatag  c.113-3361

.         .         .         .         .         .           g.11343
gtattttattatgcatctgctttgggttttgtactgtgtaacacagtactcaggagtcta  c.113-3301

.         .         .         .         .         .           g.11403
ttggactaatttacattaatggtatgtggttaaaaaacctatttttctgacatttgactt  c.113-3241

.         .         .         .         .         .           g.11463
caatatatcttgaagtagttctctaaaagaccacgatatgccgtgttactttccctctgc  c.113-3181

.         .         .         .         .         .           g.11523
aagaaaaagagaaatgcatgtaaagtaaagcagttgaacagaagcagcttagacatggat  c.113-3121

.         .         .         .         .         .           g.11583
tagaagcaggggggattgagagtggcagagaggtggaataagatcaaaaagaggtttcca  c.113-3061

.         .         .         .         .         .           g.11643
tccataatccatgggattttcacatgtcacatggttatctttgtatttctttattatttt  c.113-3001

.         .         .         .         .         .           g.11703
tagaaaaatcttgtttgacaattatatggagaagtcaggtaaaaaccagttaggatgccc  c.113-2941

.         .         .         .         .         .           g.11763
tcgtactggtccaggtgaaaaaacagaccgaactgagcagcagctagaattaatgacaag  c.113-2881

.         .         .         .         .         .           g.11823
aaagggatagatttgagaaattttcatgaagattttgagacatcaagaaaagattaaatt  c.113-2821

.         .         .         .         .         .           g.11883
atgttctatgtaatctatttctaaaagatttgctttgattagccatcaaaaataaggtag  c.113-2761

.         .         .         .         .         .           g.11943
taaattattggaattaaaagtgatgtttcaaatattttgaaagtttgcttttgtgcagca  c.113-2701

.         .         .         .         .         .           g.12003
tccttattttctgatgatgtcagataaatgaggcatttagattaaatgtgatttttgccc  c.113-2641

.         .         .         .         .         .           g.12063
tacagcttttaatcttttgagatgagactttgaaacaaatgaaatagaatatccaaaatt  c.113-2581

.         .         .         .         .         .           g.12123
ttttttgtatcagttttctctaattaagaagttgaagcacagggatttaaataatttctt  c.113-2521

.         .         .         .         .         .           g.12183
actaacgtaatgcaaaatcttggctgtggaatcaatgtcagaactggctggtcactacct  c.113-2461

.         .         .         .         .         .           g.12243
ttgttttgcctccttcctgacactagaatgtacatatttctctgtgaaaaaggtggggag  c.113-2401

.         .         .         .         .         .           g.12303
gcatattgtcagttttacatagtcatttaaattagtctctgaattcagacactcatttag  c.113-2341

.         .         .         .         .         .           g.12363
agtgagttccagcactaggtacaacttccatcatatagttatgtatctgagaaaaaatgt  c.113-2281

.         .         .         .         .         .           g.12423
tctgagctatgagttaaaaaaaattgatgtgttacccagcgtattcaatgatccgcttat  c.113-2221

.         .         .         .         .         .           g.12483
tgctaattcagttgaactggtattgtggattaaaagatcagaatttagactcagataagc  c.113-2161

.         .         .         .         .         .           g.12543
tatattaagctgtatagctttagaatagaacagtgataaagaatggtgttagattgcctg  c.113-2101

.         .         .         .         .         .           g.12603
ggattaaatcttagcccagccatttccaagctgtttgacttaagttactgaattctttgg  c.113-2041

.         .         .         .         .         .           g.12663
gtgtttcatttgttcaacaagtactgggccaggcacggtggatcacgcctgtaatcccag  c.113-1981

.         .         .         .         .         .           g.12723
cactttgggaggccgaggcggtggatcacaaggtcaagagttcaacaccagcctggccaa  c.113-1921

.         .         .         .         .         .           g.12783
gatggtgaaactccatctctactaaaactacaaaaattagccaggcacagtgacaggcgc  c.113-1861

.         .         .         .         .         .           g.12843
ctataatcccagctactcaggaggctgaggcaggagaatcacttgaacccgggcggcaga  c.113-1801

.         .         .         .         .         .           g.12903
ggttgcagtgagccgagagcgccgccactgcactccagactgggccacagagtgggactc  c.113-1741

.         .         .         .         .         .           g.12963
cgtcaaaaaaaaaaaaaaaaagaaacaagtacctacctcatagggttgtgaacattaaat  c.113-1681

.         .         .         .         .         .           g.13023
gatactctatatgtagtgcttttcacagattaactgttcaataaatatggcctattaata  c.113-1621

.         .         .         .         .         .           g.13083
agcttaatccatgaaaatttgaatttatttaaaaataaattgtctttataaaagaattcg  c.113-1561

.         .         .         .         .         .           g.13143
ttttagtacatgactcattgtagagtgaaataataaatacctctattccatttggaatgg  c.113-1501

.         .         .         .         .         .           g.13203
aacttttttttttttttcaggtggagtctcactcttgttgcccaggctggagtgcaatgg  c.113-1441

.         .         .         .         .         .           g.13263
cgcggtctcggctcaccccaacctccacctcccgggttcaagagattctcctgcctcagc  c.113-1381

.         .         .         .         .         .           g.13323
ctcccaagtagctgggataacaggcaagcaccaccacacccggctaattttgtattttta  c.113-1321

.         .         .         .         .         .           g.13383
gtagagacagggtttctccatgttggtcaggctggtcttgaactcccgacctcaggtgat  c.113-1261

.         .         .         .         .         .           g.13443
ccgcccacctcggccttccaaagtgctgggattacaggcatgagccaccgtgcctggccc  c.113-1201

.         .         .         .         .         .           g.13503
agaatgaaacattttaagaaatatatctattgtggaaaataaggtatctacacaaaaatt  c.113-1141

.         .         .         .         .         .           g.13563
tctgtattatatccttaaaactatcctagtagaaagatctgtttttattattttaattgg  c.113-1081

.         .         .         .         .         .           g.13623
gcctttgaagaaaatatcaacctggttttgttgtcttttagactgaatacctagatccca  c.113-1021

.         .         .         .         .         .           g.13683
tggtatataaaaacattgcatttaatatagtaaagagtctgggcttcaataatttatttt  c.113-961

.         .         .         .         .         .           g.13743
tggaaacgttttggatcagttcccaccactggagaaagagatgaaatggatacctcatca  c.113-901

.         .         .         .         .         .           g.13803
gagctatatataagcttgtagctctcaagccttaaaactggtgatgaaaaacaaggacaa  c.113-841

.         .         .         .         .         .           g.13863
agtatatctttctcttctgtcttctaaggacaagttttacatggaaatgtaaccctgccc  c.113-781

.         .         .         .         .         .           g.13923
attagaccttctgacagtaaaaaatgagccgttcagaatgacttactttattattattat  c.113-721

.         .         .         .         .         .           g.13983
tttttttttttactaaaagtgttgctttcccgtcattcttcagaatattttgtaggtagt  c.113-661

.         .         .         .         .         .           g.14043
gaaaggtttactggctatagaattcattgatataaataagggttgcattactttccggta  c.113-601

.         .         .         .         .         .           g.14103
tggaagtccttcagcgtcatccgccaaacttaataactaacattaatgtaggacctcact  c.113-541

.         .         .         .         .         .           g.14163
tttcaaagcacattttttttagttgccattgaatgcctcatatatgcctaataccaaacc  c.113-481

.         .         .         .         .         .           g.14223
aagagctttatacatgttatctcatttaatttttacaacagctttatgagaagtattatt  c.113-421

.         .         .         .         .         .           g.14283
atacccattttgtagttgaggaaactgaggctcaagaagctaaataacttatagttaata  c.113-361

.         .         .         .         .         .           g.14343
tatgatagagcctggattctaactgtggcctaattgactcttaatgcctactattttttt  c.113-301

.         .         .         .         .         .           g.14403
atgctacgttgccttttgaaacagattcttaccacatcttgtttgttttgaagaattagt  c.113-241

.         .         .         .         .         .           g.14463
atacttacgtgagcatgaatacatacatatatacgtgaaagacaaaaatactctaaacca  c.113-181

.         .         .         .         .         .           g.14523
aaatgttattagtggttgtctctggatagtgggttcatatgtgatttaaaaattcttttc  c.113-121

.         .         .         .         .         .           g.14583
tttgtgtttatctgaatttcctacaaacataagcttattttgtaataaacttatgataca  c.113-61

.         .         .         .         .         .           g.14643
tattgaacttcatagtaattgatacatgacttatttctcatgtattgttcttatttctag  c.113-1


Powered by LOVD v.3.0 Build 14c
©2004-2016 Leiden University Medical Center