breast cancer 2, early onset (BRCA2) - 6868 nt intron 18 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.53114
gtaaattaatttgcactcttggtaaaaatcagtcattgattcagttaaattctagaagtt  c.8331+60

         .         .         .         .         .         .  g.53174
ttacatttaaattttaaatgcttactaaggatgctcaatttcttagatgtactgataatt  c.8331+120

         .         .         .         .         .         .  g.53234
ttagtataaaaagcatattcttcagacagttaaagtttttgtgcagtttttgggaggtcc  c.8331+180

         .         .         .         .         .         .  g.53294
agagatctttcttgagcttaaataatgcatttccaattaaaaagcaaaataaatttgcac  c.8331+240

         .         .         .         .         .         .  g.53354
catttgattttggtatctgtagcttgctgccctcttgttctcatagctttgctttgatca  c.8331+300

         .         .         .         .         .         .  g.53414
gatccctattccactctggattagagaattacattttagtacttttcaaatatgtaatag  c.8331+360

         .         .         .         .         .         .  g.53474
atacactttttatctctatgtagattttaaactacataacaggactctttgtcatattga  c.8331+420

         .         .         .         .         .         .  g.53534
atggtctgcagtattgctatctgaaattaccgataatattgtacattcagattcacttaa  c.8331+480

         .         .         .         .         .         .  g.53594
gaggtaaccttgcagagaatttacttctgtggtattctggatcactctaaagagaatgtt  c.8331+540

         .         .         .         .         .         .  g.53654
ttataaattaaacatttttaaggtaaagatatattttgtttggcattagttccatgttgg  c.8331+600

         .         .         .         .         .         .  g.53714
attgattgctttttactgaaagcattccatcaagctgaaacagtcttttgttttatgttg  c.8331+660

         .         .         .         .         .         .  g.53774
cttagaacatcaagcttgcagtggctttcattttcttgtttttgtttttttttaaatcaa  c.8331+720

         .         .         .         .         .         .  g.53834
atcaatgcatgtgcataatttggaaactcaagtaatataagacatataaccaaaaaaaag  c.8331+780

         .         .         .         .         .         .  g.53894
cagttgctagcacaaccctccccatcctcattcatggtcccaagaggcaatcgtttccag  c.8331+840

         .         .         .         .         .         .  g.53954
tctgtttgactattttttagcttgtactgctgtcttctttctctcttcagtttagacagc  c.8331+900

         .         .         .         .         .         .  g.54014
aaccgttaacttcctgctatggaaaatgaggatttcattgtcttactccaacactgctac  c.8331+960

         .         .         .         .         .         .  g.54074
atatttctctaccctcttccccatcttccctctactaatacagcatgatttttagtgaaa  c.8331+1020

         .         .         .         .         .         .  g.54134
tctgtattcagtgtatacattataatgactgaaaaatattttttgcaatttaatacctaa  c.8331+1080

         .         .         .         .         .         .  g.54194
tcgactgtgatcacatttcctttctttacagcttactgctttccatgaagttattaactg  c.8331+1140

         .         .         .         .         .         .  g.54254
tccttttcatttctcttaattttctgtgtccttacacaggagctataaaaatcctgccca  c.8331+1200

         .         .         .         .         .         .  g.54314
atatgttaaaatttctccattggttccatttctgtttcttggagaacccctggacctctt  c.8331+1260

         .         .         .         .         .         .  g.54374
catatgcttactccattctgaagtgctcattttctatgtgtgccatacagctctcattct  c.8331+1320

         .         .         .         .         .         .  g.54434
gtaaattattcttacctcttttctgtgttagaaaccccatttcctggtttccatgtcatc  c.8331+1380

         .         .         .         .         .         .  g.54494
tttctagagtttttcccccaattttaagggcccacaactctcagaggcttgttgggaaaa  c.8331+1440

         .         .         .         .         .         .  g.54554
ggagcatgcaagctttttgatatcttagggtaaggttggctggatatagaattctaggtt  c.8331+1500

         .         .         .         .         .         .  g.54614
gaaataatttcttcagaatttttaagacatttcatttatcttctttagcatagctcctgc  c.8331+1560

         .         .         .         .         .         .  g.54674
taattgcagtgcattcttttttttttttttttttttttttttttgagacaacgtctcact  c.8331+1620

         .         .         .         .         .         .  g.54734
gtgttacataggctggagtgtttcattttgtacagatgaggtctccctgtgttgcctagg  c.8331+1680

         .         .         .         .         .         .  g.54794
ctggtcttgaacttctgggctcaaacggtcctcacgctttagcctccgagagtgctggga  c.8331+1740

         .         .         .         .         .         .  g.54854
ttacagacatgaaccactgtacctggcctgcggtgctgtttttatcttcagtcattcatt  c.8331+1800

         .         .         .         .         .         .  g.54914
atgtgctctggttttaagaagttaagattgttttgtctttatttttatttatttatttat  c.8331+1860

         .         .         .         .         .         .  g.54974
ttttgagacaaagtctcgctcttgttgcccaggctggagtgcaatggcgtgacctctgct  c.8331+1920

         .         .         .         .         .         .  g.55034
cactgcaacctccgcctctcgggttcaagtgattctcctgtctcagcctcccgagtagct  c.8331+1980

         .         .         .         .         .         .  g.55094
gggattacaggtacctgccaccacacccagccaaattttgtatttttagtagagacaggg  c.8331+2040

         .         .         .         .         .         .  g.55154
tttcaccatattggccaggctggtctcatcctgacctcaggtgatccacctgcctcagcc  c.8331+2100

         .         .         .         .         .         .  g.55214
tcccaaagtgttgggattacgggcatgagccaccacgcccagcctgttttgttgttattt  c.8331+2160

         .         .         .         .         .         .  g.55274
aaatttcacagtaatgtactttggtgtctttttttttttttttttttttaactttttttt  c.8331+2220

         .         .         .         .         .         .  g.55334
ttcctttaattcttggcccagatgcttactggcacttactctagaaacacatagtccttc  c.8331+2280

         .         .         .         .         .         .  g.55394
attgagttctggaaaattttctttaagtggttcttttataatttccctccatttttttct  c.8331+2340

         .         .         .         .         .         .  g.55454
ctagttttttctggaactcctgatgtttggacactaggcctcctatattgttcctataat  c.8331+2400

         .         .         .         .         .         .  g.55514
tttcttgtcttttctcctactttctatttgattgtctttttttattctaacttctgggat  c.8331+2460

         .         .         .         .         .         .  g.55574
ggtttttaatttttttcttctaattctttattaatatgccatgttttatagatttgtctt  c.8331+2520

         .         .         .         .         .         .  g.55634
taaatatttttacataattttgtaacaaaatacaaaaaaagcaattcctaaaaatttaga  c.8331+2580

         .         .         .         .         .         .  g.55694
aagtcaaatgaaagcaaagaacttaagtgtgttttcaattagagcataatcataccaaga  c.8331+2640

         .         .         .         .         .         .  g.55754
aagtatttcaagtaacttaaaaaatgttttatgtccctagtggtatataccccaagaaca  c.8331+2700

         .         .         .         .         .         .  g.55814
acaatagcaacaacaactataaaatgaaacaaaatcttaagctattgttagtaatcatat  c.8331+2760

         .         .         .         .         .         .  g.55874
tgctggtggtagtgttggtattcctattctgaagttatagtggatgtgaagtatgttgta  c.8331+2820

         .         .         .         .         .         .  g.55934
tgtgtatactcttttacgtatatttgttgtatgtgagtaattatatgattatagagaaca  c.8331+2880

         .         .         .         .         .         .  g.55994
gggatctttttatcagagaaaggtgcagatgtgagattgaagtaaaagaaaacttgtggt  c.8331+2940

         .         .         .         .         .         .  g.56054
tctgcatttgtattggaaatatcattatgaactcgagatctatattatctttaaaaaata  c.8331+3000

         .         .         .         .         .         .  g.56114
catgctggctgggcacagtggctcacacctataatcccagcactttgagaggccaaggtg  c.8331+3060

         .         .         .         .         .         .  g.56174
aatggatcacttgaggtcaggagttcaagaccagcctggccaacatggtgaaaccccgtc  c.8331+3120

         .         .         .         .         .         .  g.56234
tctactaaaaatataaaacttagccaggcatgatggcatgctcctgtagtcccagctact  c.8331+3180

         .         .         .         .         .         .  g.56294
gtggaggctgaggtgggagaatcacttgaacctgggacgtagaggttgcagtgagccaag  c.8331+3240

         .         .         .         .         .         .  g.56354
gtcgcaccactgcactccagcctgggcgacaaagtgagaccctgtctcaaagaaaaaaaa  c.8331+3300

         .         .         .         .         .         .  g.56414
aaatatgcttattggtttcatctatcaaaaagaacaaaaaaaaaaaaaaaaggaataatc  c.8331+3360

         .         .         .         .         .         .  g.56474
cagtagtagtgagtaaccctagctctcagactgttttctaagtactgttttctcttaaaa  c.8331+3420

         .      g.56488
ggatgcaaggtgtc  c.8331+3434

--------------------- middle of intron ---------------------
                                 g.56489          .           g.56502
                                 c.8332-3434  ttgaagaaatggct  c.8332-3421

.         .         .         .         .         .           g.56562
gattccagattcagaggaggaaatatatgaatctggaaagtcttgacataccagaaaaaa  c.8332-3361

.         .         .         .         .         .           g.56622
actaagcatcaaacactactagtgtcatgtcaaaaggacttaggagtgtaatagaataga  c.8332-3301

.         .         .         .         .         .           g.56682
ttcttactgatcacagataaaataatttgagcatcagaaaggataataacaggctgggca  c.8332-3241

.         .         .         .         .         .           g.56742
cactggcccacacctgtaatcccaagattttgggaggccgaggcaggcagatcacttggg  c.8332-3181

.         .         .         .         .         .           g.56802
gtcaggagtttgagaccagcctggccaacatggtgaaaccccttctctactaaaaaatac  c.8332-3121

.         .         .         .         .         .           g.56862
aaaaattaggtaggcctgggggcgggtgtctgtaatcccagctatttgggaggctgaggc  c.8332-3061

.         .         .         .         .         .           g.56922
agggagaattgcttgaacccaggaagcggaggttgcagtgagccgagattgtgccactgc  c.8332-3001

.         .         .         .         .         .           g.56982
attctagcctgggtgacagagcgagactccatctcaaagaaaaaaaaaaggataataaca  c.8332-2941

.         .         .         .         .         .           g.57042
gcaaaaaattgaaattcataacaaatgataacttctattctcattgttttaaaaactaaa  c.8332-2881

.         .         .         .         .         .           g.57102
gcccaggcacagtgtctcacgcgtgtaattgcagtactttgggaggctgaggtgggcata  c.8332-2821

.         .         .         .         .         .           g.57162
ctcaggagtatgagaccagcctgggcaacatgacaaaaccccatctctacaaaaaataca  c.8332-2761

.         .         .         .         .         .           g.57222
aaaattaaccaggtgtggtggcatgtgcctatagtcccagctacttgagaggccgtggtg  c.8332-2701

.         .         .         .         .         .           g.57282
ggaggatgacctgagcccaggaggcagaggttgcagcgagttgagatcgtgctactgcac  c.8332-2641

.         .         .         .         .         .           g.57342
ttcagcctgggtgacagagccagagccagacccagcctcagaaaaacaacaaaaactagg  c.8332-2581

.         .         .         .         .         .           g.57402
taaaaggagaaaaaaatcaagcatttatctttcttctcttatatgatctatattttggga  c.8332-2521

.         .         .         .         .         .           g.57462
ccctcaagtagatgaggggaagtttctgtttataaaaatgtttcaacaaataaggaataa  c.8332-2461

.         .         .         .         .         .           g.57522
tagaattaaaatataaccatttcgcaaccctcaaattagggttgtcttttcttctaattc  c.8332-2401

.         .         .         .         .         .           g.57582
ttttttttttttttttttttttttttttttttttttgagatggagtctcgcactgtcgcc  c.8332-2341

.         .         .         .         .         .           g.57642
caggctggagtgcagtggcacgatcttggctcactgcaacctctgcctcctggattcaag  c.8332-2281

.         .         .         .         .         .           g.57702
cgattctcctgcctcagcctcctaagtagctgggattataggcacccaccaccacacctg  c.8332-2221

.         .         .         .         .         .           g.57762
gctaatttttttgtatttttagtagagacagggcttcactatgttggctacgctggtgtt  c.8332-2161

.         .         .         .         .         .           g.57822
gaactcctgacctcgtgatctgcccgccttggcctcccaaagtgctgggattacaggctt  c.8332-2101

.         .         .         .         .         .           g.57882
gagcctgtaaatccagaaaaggattacagcccttttcttctagttcttaaagtgaatttg  c.8332-2041

.         .         .         .         .         .           g.57942
tgtctaccaacataattttcaagagacctttattattccctaaatgtttttctttttttt  c.8332-1981

.         .         .         .         .         .           g.58002
gtgacattcagttcttgtttcatagatacagtatcttctcatctttctaaagctaatgat  c.8332-1921

.         .         .         .         .         .           g.58062
taatgttttattttcattttcgttttttctgctccctgcattttttttttttaatgaaaa  c.8332-1861

.         .         .         .         .         .           g.58122
cctttgtctatttgagtctctctggttagagactttcctcaatggtgatcattcactgat  c.8332-1801

.         .         .         .         .         .           g.58182
ccagaagttgtatgtgaggtgaggcttgtcagctcatagggtagtaatgtagtgatttag  c.8332-1741

.         .         .         .         .         .           g.58242
tttttaactaggagaccctcaaatatcagtgactgttctgagagctgagcagagtaagga  c.8332-1681

.         .         .         .         .         .           g.58302
aattaatagggagactcattgtcagtgtaagaattttatttcagtttgttgtttgttgtt  c.8332-1621

.         .         .         .         .         .           g.58362
tgttttttgtttttttgttttttttttggttttttttgttttttttttagatggagtctt  c.8332-1561

.         .         .         .         .         .           g.58422
gctctgttgcccaggctagagtgcagtggtgcgatctcggctcactgcaacctccacctc  c.8332-1501

.         .         .         .         .         .           g.58482
ccaggttcgaggaattctcctgcctcagcctcccgagtagctgggactacaggcgcctgc  c.8332-1441

.         .         .         .         .         .           g.58542
caccacccctggctaattttttatttttagtagagacggggtttcaccatcttggccagg  c.8332-1381

.         .         .         .         .         .           g.58602
ctggtctccaactcctgaccttgtgatccacccgcctcggcctcccaaagtgttgggatt  c.8332-1321

.         .         .         .         .         .           g.58662
acaggcgtgagccacagcgcccggcccagttttgttttcaataatagcatctcaccccca  c.8332-1261

.         .         .         .         .         .           g.58722
ccctggctgcgtctgctcagtattccagagtccacgatatgtatggttcagccctccaga  c.8332-1201

.         .         .         .         .         .           g.58782
aaataaagtctcctgcatttttttttttaatgctgcagcaagaatagggtcctgggttct  c.8332-1141

.         .         .         .         .         .           g.58842
tttttagtatgagggagagacagccacctggctacttgggataggaaagaaaatctggtg  c.8332-1081

.         .         .         .         .         .           g.58902
tttcaactacgtttgtacaaaatgtcaaccatttcttcctattttcagccccaccatatg  c.8332-1021

.         .         .         .         .         .           g.58962
ctcctgccttcacaggtacctgttgcctccaatttctgagtgttttcctttaattatttt  c.8332-961

.         .         .         .         .         .           g.59022
gtttcatgttaactccttacaacaagtttggtggctgaataaccttgggcaagttgtgta  c.8332-901

.         .         .         .         .         .           g.59082
gtttctcatatactttagttttatcgttgtctgtaaaatggagatgagtcttcagattat  c.8332-841

.         .         .         .         .         .           g.59142
tgtgaagataatttgtttgtttgttttttggagacggaggcacgctctgtcccccaggct  c.8332-781

.         .         .         .         .         .           g.59202
ggagtgcagtggcacaatctcggctcactgcaccctctgcctcccaggttcaagcagttc  c.8332-721

.         .         .         .         .         .           g.59262
tcctgcctcagcctcccgagtagctgggattacaggcgcccaccacctcacctggctact  c.8332-661

.         .         .         .         .         .           g.59322
tttttggtttttagtagagacggggtttcaccatgttggcccgggtggtctcgaactcct  c.8332-601

.         .         .         .         .         .           g.59382
gacctcaggtgatacgcctgcctcggcctcccaaagtgttgggattacaggcatgagcca  c.8332-541

.         .         .         .         .         .           g.59442
ccttgcctggccaaagattaattgttaatatacataaagcgcttaacaccatgccaggta  c.8332-481

.         .         .         .         .         .           g.59502
ccttagtaagtgttcgatgaatatttgctttttgtattagccataatcattctcaggctg  c.8332-421

.         .         .         .         .         .           g.59562
ctttgtcatttacttgttccacaaattcttagcttccaaaattttggtgatacctcattt  c.8332-361

.         .         .         .         .         .           g.59622
cctattctctctagttgcctttgtccatgtagattttttgaggaagcttgggtaaataag  c.8332-301

.         .         .         .         .         .           g.59682
tgtattttaaactattatgtttaaatcgaagttccttttatctgttttctaatagaaaca  c.8332-241

.         .         .         .         .         .           g.59742
tttaaatagcattaagaacttgtagcagtataaacaatatgtttgagaagtactatattg  c.8332-181

.         .         .         .         .         .           g.59802
tgaaaatattttcacttttatacagttttttacttatttactgtcttactaatcttccta  c.8332-121

.         .         .         .         .         .           g.59862
agactttttaaagtgaatatttttaaggcagttctagaagaatgaaaactcttatgatat  c.8332-61

.         .         .         .         .         .           g.59922
ctgtaatagaattgaatacatatttaactactaaatcaatatatttattaatttgtccag  c.8332-1


Powered by LOVD v.3.0 Build 11c
©2004-2014 Leiden University Medical Center