chromosome 5 open reading frame 42 (C5orf42) - 7591 nt intron 15 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.33165
gtatgcttttttttttctttctttgtatttttaaaaagagacagggtctccctatgttgc  c.2746+60

         .         .         .         .         .         .  g.33225
cagcctggcttcaaacccctgagctcaagtaatccttctacctcagccgcctcaagtggc  c.2746+120

         .         .         .         .         .         .  g.33285
taggactacagaatgcagtatgtttacttgttagtttgtatttttagtgtagacatgaaa  c.2746+180

         .         .         .         .         .         .  g.33345
ttgcttatacataaaagttggttgttctacctctctggtgattaagtatattatgttgga  c.2746+240

         .         .         .         .         .         .  g.33405
ttttggactctcagcttcccaatagcagggactatgttgaagttttttgtttgtttgttt  c.2746+300

         .         .         .         .         .         .  g.33465
ttaaatcttagaatccccaggatttaacagtatagtaattgcctgctgagctgatagtat  c.2746+360

         .         .         .         .         .         .  g.33525
gattgctttcttacaaccctatttgttagacataattttaggacccaagtgttttttcct  c.2746+420

         .         .         .         .         .         .  g.33585
tagtatgttaactattgcttacagcagtttagtgaaatcataaaaatcattttccgagaa  c.2746+480

         .         .         .         .         .         .  g.33645
tatttttagtcttttaaaaaatctgggccgggcacagtggctcacgcctgtaatcccagc  c.2746+540

         .         .         .         .         .         .  g.33705
actctgggaggccaaggcaggtggatcacaaggtcaggagatgagacgatcctggctaac  c.2746+600

         .         .         .         .         .         .  g.33765
atggtgaaaccccttctctactaaaaatacaaaaaaatcagccaggcttggtggcgggca  c.2746+660

         .         .         .         .         .         .  g.33825
cctgtaggcccagctctgaggcaggagaatggcatgaacctgggaggtggagcttgcagt  c.2746+720

         .         .         .         .         .         .  g.33885
gagcgagccaaggtagcgccactgcactctagcctgggtgacagagccagactccatctc  c.2746+780

         .         .         .         .         .         .  g.33945
aaattaaaaaaaaaaaaatctgtttaagagattgcagagtatctggattgactttttcaa  c.2746+840

         .         .         .         .         .         .  g.34005
agaggtatatttaaattaggcaataaccagagggaaagatatatatgaatgaacatgtaa  c.2746+900

         .         .         .         .         .         .  g.34065
tatatttataatgcttatagggtggtagactgctagatgtttactgtatatacgaatgtg  c.2746+960

         .         .         .         .         .         .  g.34125
tctgaaaggcccaatgtatttgaaatttctaaacagagttgatagcaatttcattcttga  c.2746+1020

         .         .         .         .         .         .  g.34185
ttgtttcagccactgtttataaatgtcttattttgtgagttttttttttttttgagatat  c.2746+1080

         .         .         .         .         .         .  g.34245
ggtcttattctgttgccgaggctggagtgtggttgagtgatcttagcttatctgacctct  c.2746+1140

         .         .         .         .         .         .  g.34305
ggcgcctgggctcaagccatccttccacctcagcctcgtgagtagctgggactacaggtg  c.2746+1200

         .         .         .         .         .         .  g.34365
tgtgccaccacacccagctaattttgttttttttgtagagatgggatttcaccatgctgc  c.2746+1260

         .         .         .         .         .         .  g.34425
ccaggctgatcttgacttcctgggctcaagcaatccacccaccttggcctcccaaagtgt  c.2746+1320

         .         .         .         .         .         .  g.34485
tgggattataggtgtgagccactgtgcttggcttactttctgatttttatctttttaaat  c.2746+1380

         .         .         .         .         .         .  g.34545
ttttatgttcattaaggaagtaatacgtgttcatattaggcaattttgaaaatacagaaa  c.2746+1440

         .         .         .         .         .         .  g.34605
agtagaaaggaaacaaaatcacttacaagtttagtttttttttgtctagggccttttgac  c.2746+1500

         .         .         .         .         .         .  g.34665
acatgtatatgtatatattaccggagctggatagtcttataaatttaaaattatgatgaa  c.2746+1560

         .         .         .         .         .         .  g.34725
tattttccagtgccaataaacttaaaaaaatctattgaatctttttcccattattgtaca  c.2746+1620

         .         .         .         .         .         .  g.34785
ttttgttgccatgtatttactattttaaataatgctgcagtgtacctaaatatttgtgag  c.2746+1680

         .         .         .         .         .         .  g.34845
cattactaataatttctctaagataaattccgagaaatgagtctgctgggaaatgaggta  c.2746+1740

         .         .         .         .         .         .  g.34905
gctggaaccacaggcatgtgcctcacgcctggctaattttttttttctttttttttgaga  c.2746+1800

         .         .         .         .         .         .  g.34965
tggagtcttgctctgtcacccaggctggagtgtagtggcgtgatcttggcttactgcaac  c.2746+1860

         .         .         .         .         .         .  g.35025
ctttgcctcctgggttcaagcgattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggattaca  c.2746+1920

         .         .         .         .         .         .  g.35085
ggcatgcgccaccatgcctggctgacttttgtatttttagtagagatggggtttcaccat  c.2746+1980

         .         .         .         .         .         .  g.35145
gttggtcaggctggtctcaaactcctgacctcgtgatccacacaccttggcctctcaaag  c.2746+2040

         .         .         .         .         .         .  g.35205
tgctgggattacaggcgtgagccactgtgcccagccatgcgtggctaatttttaaaaatt  c.2746+2100

         .         .         .         .         .         .  g.35265
attttattatttgtagagatgagtcttggtatattgcgcaggctgatctcaaactcctgg  c.2746+2160

         .         .         .         .         .         .  g.35325
gttcaagtgatcttcacacctcagcctctcaaaatgctggggttataggtgtgagccact  c.2746+2220

         .         .         .         .         .         .  g.35385
gtacccagggtgaaagacttctgtatatgactttttaaatgacaggatagtctttattta  c.2746+2280

         .         .         .         .         .         .  g.35445
tttgtttatttttgcaatattgtccttacgtgatttaactttcatgataagttgaacctg  c.2746+2340

         .         .         .         .         .         .  g.35505
tagtaattcatttgttttaatttttttttttttttgagatggagtttcgctcttgtggca  c.2746+2400

         .         .         .         .         .         .  g.35565
caggctagtgtgcaatggcactatctcagctcactgcaaccttcgcctcccagtttcaag  c.2746+2460

         .         .         .         .         .         .  g.35625
cagttttcctgcctcagcctcccgagtagctgggattacaggcgcctgccaccatgccta  c.2746+2520

         .         .         .         .         .         .  g.35685
gctaatttttgtatttttagtagagacggggtttcaccacattggccaggctgttcttga  c.2746+2580

         .         .         .         .         .         .  g.35745
actcccgacctcaggtgatccactcacctcagcctctcaaagtgctgggattacaagcgt  c.2746+2640

         .         .         .         .         .         .  g.35805
gagccaccgcgcccagctcatttgtcttaatttttaatgatgattgcttaaaatatatta  c.2746+2700

         .         .         .         .         .         .  g.35865
agcatatacttactgggttggggaccccaaaattaccccctagatttgatggttcactag  c.2746+2760

         .         .         .         .         .         .  g.35925
gaaaactcagaagatttaacatatagttgtactcatagctatgatttattacagtgaaag  c.2746+2820

         .         .         .         .         .         .  g.35985
aaaacagcaaaatcagcaaagggaaaaggtgcatggtatgaagtttggagaaaaccagga  c.2746+2880

         .         .         .         .         .         .  g.36045
ataagcttctatgaatcctctcccagtagagtcacacaggatgtccctagtttcctcagt  c.2746+2940

         .         .         .         .         .         .  g.36105
gacaagttgtgacaacatgtgagatatagtctaccagggaagttcattagaacctcagtg  c.2746+3000

         .         .         .         .         .         .  g.36165
ctcagggtttttaattggggggctggtcacataaaccccttctgccttagtacaaaccaa  c.2746+3060

         .         .         .         .         .         .  g.36225
aattctacactctcagagggaaaacagatgttcagcgtaaaccacattgtttatacagtt  c.2746+3120

         .         .         .         .         .         .  g.36285
taggttcagtgagctcttcttatcagttagggtggtggaaatcctcccaaaatccaagtt  c.2746+3180

         .         .         .         .         .         .  g.36345
cccagataccagccaaggaccaccttacaagcaagcatttcaagcagtcatgcatgctat  c.2746+3240

         .         .         .         .         .         .  g.36405
ggtagttcctttctgcacacctaccttattaaataattgtctatagttatttaattttta  c.2746+3300

         .         .         .         .         .         .  g.36465
ttaaatagggtttctattatttttatttttatttttatttttttgagatggagtctcgct  c.2746+3360

         .         .         .         .         .         .  g.36525
cttgtcaccaggctggaatgcagaggcacgatctcggctcattgcaacctctgcctcccg  c.2746+3420

         .         .         .         .         .         .  g.36585
ggttcaagcaattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacaggctcctgccac  c.2746+3480

         .         .         .         .         .         .  g.36645
cacacctggctaattttttttctatttttagtagagacagagtttcaccatgttggccag  c.2746+3540

         .         .         .         .         .         .  g.36705
gctggtatcgaactcctgacctcaggtgatcctcccccctcggcctcccaaagtgctagg  c.2746+3600

         .         .         .         .         .         .  g.36765
attacaggcatgagccacttcgcccagccgggtttctgttattaacattagcactgcacc  c.2746+3660

         .         .         .         .         .         .  g.36825
ctatacagaattacactttatttttatttatttatttatttatttatttatttatttgag  c.2746+3720

         .         .         .         .         .         .  g.36885
atggtgtctcgctctgtcgcccaggctggagtgcaatggcgcagtctcggctcactgcaa  c.2746+3780

         .        g.36901
cttcggcctcctgggt  c.2746+3796

--------------------- middle of intron ---------------------
                                g.36902           .           g.36916
                                c.2747-3795  taaagtgattctcct  c.2747-3781

.         .         .         .         .         .           g.36976
gcctcagcctcactagtagctgggattacaagcgtgcaccaccatgcccagctaattttt  c.2747-3721

.         .         .         .         .         .           g.37036
tgtatttttagtagagacggggtttcaccatattggccaggctggtctctaactcctgac  c.2747-3661

.         .         .         .         .         .           g.37096
ctcaggtgatccacctgccttggcctcccaaagtgctgggattacaggcatgagccactg  c.2747-3601

.         .         .         .         .         .           g.37156
cacccggtcgagatttacactttgaaaatttttttaacttctaaattgatacagctttat  c.2747-3541

.         .         .         .         .         .           g.37216
tctgtgacaataacttttatcatcaggtcactccctatttaagaggctgattcctgagtt  c.2747-3481

.         .         .         .         .         .           g.37276
ttgcataaggtttgaatgattaagattactgaaaatcttacctttgtataattcctccat  c.2747-3421

.         .         .         .         .         .           g.37336
aagttttacccaggagaaaaaaatttttacccaggtatctctaactcgaatgtgaagaaa  c.2747-3361

.         .         .         .         .         .           g.37396
tagtgtggtttttccccccaaatattacagtgactaaatgaagactactgcttgaaggct  c.2747-3301

.         .         .         .         .         .           g.37456
aataaaattttctcaattccttttgtttaaaaaaagaaaccaggtaacattaattaacat  c.2747-3241

.         .         .         .         .         .           g.37516
tattttctttattaacaatattcctttgagggcctactatatgagaggagaagtgctagg  c.2747-3181

.         .         .         .         .         .           g.37576
tgctgggacatacagtgaacaagatagaaatccatacacatataaaatgtaatttcccat  c.2747-3121

.         .         .         .         .         .           g.37636
gaatatgtgtcagatcacttctggaaaagaaagatacctttctattgttggagccataca  c.2747-3061

.         .         .         .         .         .           g.37696
cttcataccaactaatgttatcctagtatttatctatacagtatttagtagttttaagct  c.2747-3001

.         .         .         .         .         .           g.37756
aatttattttcaaatttgtgaatgccagcttatattattattgagattctcaagtgggaa  c.2747-2941

.         .         .         .         .         .           g.37816
tgacgcatgtcctctaatcctgctagtgcactttggagttatgccagaaattttgatgtg  c.2747-2881

.         .         .         .         .         .           g.37876
attcttctgtccacctgctatctagccatctcccttcactccacacatttgtgtgcgtgt  c.2747-2821

.         .         .         .         .         .           g.37936
gtttgagatagggcctcactctgtcacctaggctggagtgcagtggcgtgatcacagctc  c.2747-2761

.         .         .         .         .         .           g.37996
actgcagcttcaacctcccaggctcaagtgatcctcctgcctcagcctcctgagtagctg  c.2747-2701

.         .         .         .         .         .           g.38056
ggactataggcacatgccaccacacctggctaatttttgtatttttttgcagtgatgggg  c.2747-2641

.         .         .         .         .         .           g.38116
tttctccatgttgcccaggctggtatcaaactcctggacggactcaagtgatcctccatc  c.2747-2581

.         .         .         .         .         .           g.38176
ctgggcctcccaaagtgtggggattacaggcatgagcctctgtgcctggcccaccccaca  c.2747-2521

.         .         .         .         .         .           g.38236
cgttctttttgctactgcctgccccccaaaatcttatactagtgagctactattactaat  c.2747-2461

.         .         .         .         .         .           g.38296
gggagtatattaagattctcagatctaatggtacagacaaaagcattaagaatcttgggt  c.2747-2401

.         .         .         .         .         .           g.38356
ggtcatggtggctcacacctgtaatcccagcattttgggaggctgaggcggaccgattac  c.2747-2341

.         .         .         .         .         .           g.38416
ttgagctcaggagttcaagaccagcctgtccaacatggcgaaaccccatcttgaccaaaa  c.2747-2281

.         .         .         .         .         .           g.38476
aaatacaaaaaaaattagccggtcaaggtggcgtgtgcctatagtcccagctactcagga  c.2747-2221

.         .         .         .         .         .           g.38536
gactgaggcgggaagatggcctaaaccttggaggcagaggttgcagtgagctgagaatgt  c.2747-2161

.         .         .         .         .         .           g.38596
gccactgcactctagcttgggtgacagagcaggattctttctcaaaaaacaaaaaagaaa  c.2747-2101

.         .         .         .         .         .           g.38656
aaaagaaaaaaatcttatatcagtgctttttagattatttttgtagtaagccctgccccg  c.2747-2041

.         .         .         .         .         .           g.38716
tttatcttcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaggaaagagaaggaaaaacgggaaataa  c.2747-1981

.         .         .         .         .         .           g.38776
ataatgaaattctaagcttgcaaggctgtcgtgcctgggtcattttgtatagatacctcc  c.2747-1921

.         .         .         .         .         .           g.38836
atttaaaaaataaaacttaaagttgtgaacagttcttaggtgtatgtgcacataattact  c.2747-1861

.         .         .         .         .         .           g.38896
aactacagttgaccattgaacatcacaggggttaggagcaccaacaccctcatgctgtca  c.2747-1801

.         .         .         .         .         .           g.38956
aaaattcgtgtataacttgactcccgaaaaacttaaccattaatagcctactgttgacta  c.2747-1741

.         .         .         .         .         .           g.39016
gaagccttactggtaacataaatagttgattaacatatattttatatgttgtatatatta  c.2747-1681

.         .         .         .         .         .           g.39076
tatactgtattcttagaataaagtaagccagagaaaggaaagttgtattaagaaaatcct  c.2747-1621

.         .         .         .         .         .           g.39136
aagaggccaggtacagtggctcatgtctgtaatcccagcactttgggaggccgaggcggg  c.2747-1561

.         .         .         .         .         .           g.39196
cagatcacctgaggtcaagagttcgagaccagtctgaccaacatggagaaaactggtctc  c.2747-1501

.         .         .         .         .         .           g.39256
tactaaaaatacaaaattagccgggcgtggtggcacgtgcctataatcccagctactcag  c.2747-1441

.         .         .         .         .         .           g.39316
gaggctgaggcaggagaatcacttgaacccagaaggcgaggtttgtggtgagctgagatc  c.2747-1381

.         .         .         .         .         .           g.39376
gcaccattgcactccagcctgggcaataaaagtgaaactctgtctcaaaaagagaaaaaa  c.2747-1321

.         .         .         .         .         .           g.39436
aaatcataagggaaaatacatttccagtattgtactgtatttattgataccacaagttta  c.2747-1261

.         .         .         .         .         .           g.39496
tgttatctgtttccaagattaattgtctgaaatggtagacaaccatagctgcagacctca  c.2747-1201

.         .         .         .         .         .           g.39556
atccatggtatgtctcaagtaattcaacttttacttgtaatgtcatgatttttttctgct  c.2747-1141

.         .         .         .         .         .           g.39616
tattcagaacacttccaggatctctggtggcacttcctgtaggtcttatggtgttattca  c.2747-1081

.         .         .         .         .         .           g.39676
aggtttatggtactgcactaaacgtgatgagaactacacaagaattgtgaggttgctttt  c.2747-1021

.         .         .         .         .         .           g.39736
tattgccatgtgcactttactagagagatgaactgctcatgcagagatgattagcatcac  c.2747-961

.         .         .         .         .         .           g.39796
acagtattttaagcaaatacttgcaacacttgaactcctcaaaatagcaacaggaagtag  c.2747-901

.         .         .         .         .         .           g.39856
ctgcaaaattaatacagtagtacagtaggaactacaatgaattttatgcagttatttaat  c.2747-841

.         .         .         .         .         .           g.39916
actttatctttatgtgtgtttacatttctcttgactgtgaacagtgccatatatggcctg  c.2747-781

.         .         .         .         .         .           g.39976
taagtgtttgtgtaaattttgataatttttttttgagtcagggtctatctagctctgttg  c.2747-721

.         .         .         .         .         .           g.40036
cccaggctggagtgcactggcacaatctcagcttactgcagcctccgcctcctagactca  c.2747-661

.         .         .         .         .         .           g.40096
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gattataggtgtaagccactgtacccagccaattttgataaattttaactttttatagtt  c.2747-421

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.         .         .         .         .         .           g.40696
aaatattattacttttggtagttgatcacaatcttcttaggtcattgctgtattccttag  c.2747-1


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