chromosome 5 open reading frame 42 (C5orf42) - 5700 nt intron 42 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.106308
gtttgtaggggctgataggggctggctgaagtcttgctttagttgatctgaaagaatgtg  c.8299+60

         .         .         .         .         .         .  g.106368
cattgttttgtggagtgccagaagtaggagtagttttcattatgtgagctgaagtcataa  c.8299+120

         .         .         .         .         .         .  g.106428
gcttcccagtttttagattaggattatttttttgtaatgtgattagcttccacctcacgg  c.8299+180

         .         .         .         .         .         .  g.106488
cctttttttttttttttttttttttttttgagaaggcagtaacctcctctggattttata  c.8299+240

         .         .         .         .         .         .  g.106548
ctaggatggggcaagtgtggcctggagctcagtttttgtggattccaagccattggcctc  c.8299+300

         .         .         .         .         .         .  g.106608
atagtgctgaggattgcacagagctttgtgctgaggttgctgtttgtctgtgatcatcag  c.8299+360

         .         .         .         .         .         .  g.106668
ctgagctggaatttgaggttctggtaaaatggccaggcagtggtgaggtattaagttttt  c.8299+420

         .         .         .         .         .         .  g.106728
tcattttttattgaaagaatgaaattagaatagttgtttttaccttctgctgtgtctgtg  c.8299+480

         .         .         .         .         .         .  g.106788
gttcatacctgtgttctctttctcattcagtcttgtcagtttagtcttttcaaaaaccag  c.8299+540

         .         .         .         .         .         .  g.106848
tgtttgttaattctctttgtttctcagtttcctttttcattaatctttattatttcttct  c.8299+600

         .         .         .         .         .         .  g.106908
attttgggggcattaacttgttggcttttttctaactttattttttcttattttctaata  c.8299+660

         .         .         .         .         .         .  g.106968
tgtgtaattgaggctgaatatgtttctgcatggacctagacaagaatgttgatactcatc  c.8299+720

         .         .         .         .         .         .  g.107028
atcatctggtggtgttcaggtctacatagtttgtagttcgcattatgatttctttagctt  c.8299+780

         .         .         .         .         .         .  g.107088
gtaaaaggagtttttagcttctaaatattaagcattctaatattgggctatgtttttgtg  c.8299+840

         .         .         .         .         .         .  g.107148
gttgatttccattttcattgcattttgattagctgatgtgtatgatgatatcaatcctta  c.8299+900

         .         .         .         .         .         .  g.107208
gatatttgttaaaatttcccttgtggctgaggatagtcagtttttacattatgttccaca  c.8299+960

         .         .         .         .         .         .  g.107268
tttatttgaagaggccaaacattttctgttggttgtatgtagtgtatgtgtatatatctc  c.8299+1020

         .         .         .         .         .         .  g.107328
cctttggtcaagcttctaaattgtgttgtccagattttttgtattttttctgattagtca  c.8299+1080

         .         .         .         .         .         .  g.107388
gcttgatccgttcatttcttagaaggttgcattaaaaattacccataatgattgtggaat  c.8299+1140

         .         .         .         .         .         .  g.107448
tatttctccttgtaaatctgttacattcatcttaaggctataaggtgaatatagttcagg  c.8299+1200

         .         .         .         .         .         .  g.107508
attgttatatttcttgttggattttgtctcttttatcattaagtaataaccctctttatc  c.8299+1260

         .         .         .         .         .         .  g.107568
cctaataatcctttttgacttatagtcaattttgtttaatatgaacattactacccctgt  c.8299+1320

         .         .         .         .         .         .  g.107628
gttctggtatatctttttgatatgctttattttttaaaattttatgtaaaatttctacac  c.8299+1380

         .         .         .         .         .         .  g.107688
tattttaatagaaggcagaatcatacaattaactttcatatactcaacaacaaactttaa  c.8299+1440

         .         .         .         .         .         .  g.107748
tcattatcaactcatggccaatcccttttttacctatacacccacccactcttcccacct  c.8299+1500

         .         .         .         .         .         .  g.107808
ttttcttgattattttgaaacgaaacccagacagcacattattttatgtataaatatttt  c.8299+1560

         .         .         .         .         .         .  g.107868
gtatgtatctctaaaagatcaggtccatttttaaaacataagcacaataatattgacact  c.8299+1620

         .         .         .         .         .         .  g.107928
cctttaaaaaattcttaatatacttatatatctaatcagagttcaaatgttgccaattgt  c.8299+1680

         .         .         .         .         .         .  g.107988
ctcgtttcaaaaaatagtcttttaggccgggcgtggtggctcacacctgtaatcccagca  c.8299+1740

         .         .         .         .         .         .  g.108048
ctttgggaggctgaggcaggtggatcacaagatcaggagttcgaaaccagcctggccaat  c.8299+1800

         .         .         .         .         .         .  g.108108
atggtgaaaccctgtctctactaaaaatacaaaaattagcctggtgtggtggcgggtgcc  c.8299+1860

         .         .         .         .         .         .  g.108168
tgtagtcccagctacttaggaggctgaggcaggagaattgcttgaactcaggaggcggag  c.8299+1920

         .         .         .         .         .         .  g.108228
cttgcagtgagtcgagatcatgccactgcactccagcctgggcaacagagcgagactccg  c.8299+1980

         .         .         .         .         .         .  g.108288
tctcgaaaaaaaaaaaagctttttaattattacagttggaacccagctaagatctataag  c.8299+2040

         .         .         .         .         .         .  g.108348
tggccattggttgatggcttataagtctcttaacttctgggttccttctctcctttttct  c.8299+2100

         .         .         .         .         .         .  g.108408
tccttgaagttttctttgttgaagaaacaagatagttgttctgaagtgtttttcagagtc  c.8299+2160

         .         .         .         .         .         .  g.108468
tgagttttgctaattgagtctctgtgatgtcatttaatgtgttgttttctcctctgtatt  c.8299+2220

         .         .         .         .         .         .  g.108528
tcttgtaaattagatatccctttactttcaggctgtttgattatgttgtatttgtgtcca  c.8299+2280

         .         .         .         .         .         .  g.108588
gcatgtacctagatttcattcctttaaataattagacagtcttttttaaccagcaagcat  c.8299+2340

         .         .         .         .         .         .  g.108648
aatcactgttcatttattgtatttactgatatatttgtgcttatttctaatatcttattt  c.8299+2400

         .         .         .         .         .         .  g.108708
catggtggtttttttgccatttatttcctttacttttgtccctcttttttgccttttatt  c.8299+2460

         .         .         .         .         .         .  g.108768
ggatggagttttctgtattctctctttcctgctgtattggttcagaaattatacattaga  c.8299+2520

         .         .         .         .         .         .  g.108828
tttttagtttttagtggttattcttgaatttttaacattcataggtgagttaaaatttaa  c.8299+2580

         .         .         .         .         .         .  g.108888
ggtgaatttggacatggtggtgcatacctgtagtcccagctatttgggaggctgaggtgg  c.8299+2640

         .         .         .         .         .         .  g.108948
gaggatcacttgagcccaagaattaaaggttgtagtatgctatcatcacacctgtgaata  c.8299+2700

         .         .         .         .         .         .  g.109008
gccactgcactccagcctgagcaacatagtgagacaccgtctcttaaaatttttttcatt  c.8299+2760

         .         .         .         .         .         .  g.109068
ttaaattaaggtgaatatatctacctcccaaacaatagaaggactttagacctttttagc  c.8299+2820

         .         .         .  g.109098
gctgatttgttccctccatcttctctgata  c.8299+2850

--------------------- middle of intron ---------------------
                 g.109099     .         .         .           g.109128
                 c.8300-2850  ctgtttttttgtttgtttgtttttgagatg  c.8300-2821

.         .         .         .         .         .           g.109188
gagtctcacactgtggcccagtctggagagtgcagtggtgtgatctcagctcactgcaac  c.8300-2761

.         .         .         .         .         .           g.109248
cactgcctcccagattcaagcaattctcctgcctcagccccccaagtaactgggactaca  c.8300-2701

.         .         .         .         .         .           g.109308
ggtgcacaccaccacacccagctaattttttgtatttttagtagagatggggtttcacca  c.8300-2641

.         .         .         .         .         .           g.109368
tgttggccaggatggtctcagtctcttgaccttgtgatctgcctgcctcagccttccaaa  c.8300-2581

.         .         .         .         .         .           g.109428
gtgctgggattacaggcgtgagccaccacgcccggcctctgataactgttttcaaatatt  c.8300-2521

.         .         .         .         .         .           g.109488
ttagatctactctgtttttaaccctcccatttagttccccttgccttttattttttaagt  c.8300-2461

.         .         .         .         .         .           g.109548
cagcacttagttaagatttctcaacgtttggcattttctttgccaacaattacttcattt  c.8300-2401

.         .         .         .         .         .           g.109608
taaaatttctaattttttttttttttttttgagacagagtctcgctctgtcacccaggct  c.8300-2341

.         .         .         .         .         .           g.109668
ggagtgcagtggtgctatcttggctcactgcaaactccgcctcctgggttcatgccattc  c.8300-2281

.         .         .         .         .         .           g.109728
tcctgcctcagtctcctgagtagctgggactacaggtgcccgccaccgcgcccggctaat  c.8300-2221

.         .         .         .         .         .           g.109788
tttttgtatttttagtagagacttggtttccctgtgttagccaggatggtcttgatctcc  c.8300-2161

.         .         .         .         .         .           g.109848
tgacctcgtgatccgcctgcctcggcctcccaaagtgctgggattacaggcatgagccac  c.8300-2101

.         .         .         .         .         .           g.109908
cgtgcccggcctaaaatttctaatttaaataatgtaaatatgtaggcaacaaatgtataa  c.8300-2041

.         .         .         .         .         .           g.109968
aaccaaaacaagtttcatgataccttttattgcctgagatgctctctggtattttctctt  c.8300-1981

.         .         .         .         .         .           g.110028
ctctgctattgttgcccacagttgcttcttgcatccacttcttttttttttttttttttt  c.8300-1921

.         .         .         .         .         .           g.110088
tttagacaaagtctcactctgttggagtgcagtggtgcgatctcggctcactgcagcctc  c.8300-1861

.         .         .         .         .         .           g.110148
ctcctccagggttcaagcaattctctgcctcaccttcctgagtagctgggactacaggca  c.8300-1801

.         .         .         .         .         .           g.110208
cctgccaccatgctgggctaattttttgtatttttagtagagacgggttttcaccgtgtt  c.8300-1741

.         .         .         .         .         .           g.110268
aaccaggatggtctcaatctcctgatctcatgatccgcccaccttggcctcccaaagtgc  c.8300-1681

.         .         .         .         .         .           g.110328
tgggattacaagcgtgagccaccgtgcctgaccgtatttcttttatttaccttatattgg  c.8300-1621

.         .         .         .         .         .           g.110388
agtaggaatgattctttagttttaagatttaactttggggacttttcacccataatattt  c.8300-1561

.         .         .         .         .         .           g.110448
tgaagtactgcttcctccccattttttcttttctctctaaaacacctaatagaggcatgt  c.8300-1501

.         .         .         .         .         .           g.110508
tggacctcctcactctgttccttatatcttttttttttttttttcgagacagagttttgc  c.8300-1441

.         .         .         .         .         .           g.110568
tcttgttgtccaggctggagtgcaatggcacaatcttggctcaccacatcccctgcctcg  c.8300-1381

.         .         .         .         .         .           g.110628
caggttcaagtgattctcctgtctcagccttccaagtagctgtgattacaggcgtgtgcc  c.8300-1321

.         .         .         .         .         .           g.110688
accaccactggcaaattttttgtgtttttagtagagacagggtttctccattttggtcag  c.8300-1261

.         .         .         .         .         .           g.110748
gctgttctcgaactcctgacctcaggtgatcagcccaccttggcctcccaaagtgctggg  c.8300-1201

.         .         .         .         .         .           g.110808
attacaggtgtgaaccactgtgcctggcctccttatctcattcagcctcttctgcataat  c.8300-1141

.         .         .         .         .         .           g.110868
ttcctccctttatcagtggttcactcaggatgatttcctcatatctgtcttctagtttac  c.8300-1081

.         .         .         .         .         .           g.110928
taattctcttttttgctgtgtctttgctgttttagctattcattatgattttaattttgg  c.8300-1021

.         .         .         .         .         .           g.110988
tggctacatttaatatctagaagttgtatttatttctttttcaaatctatctgctctttg  c.8300-961

.         .         .         .         .         .           g.111048
gatgttgtgtcctgtttttttattgctgttcctatgctttatctgtttcataatttcagt  c.8300-901

.         .         .         .         .         .           g.111108
catgttttatgactaaccttttctgattattgtatttcatatgtgcacattatcaattgt  c.8300-841

.         .         .         .         .         .           g.111168
tgaatctgcatactgactgtctttcatggttggttgttcctttgtgtgaattgtaatttt  c.8300-781

.         .         .         .         .         .           g.111228
ttatcatgggcttatcattagtggaagttctgctagattatatgtttgtctttggagtag  c.8300-721

.         .         .         .         .         .           g.111288
ttttgcatttgctttttgctatcgttgaagtaggaaaaaattgaaacaaattttagtata  c.8300-661

.         .         .         .         .         .           g.111348
cgtttcttcacttggggttgctgtactttattgatggtagaaattcagaccctgttcatg  c.8300-601

.         .         .         .         .         .           g.111408
cttgtggcaagtcagggtgttgatttctcaaagttgacttttatttttctctcagctgct  c.8300-541

.         .         .         .         .         .           g.111468
gtccatgcagatagaaaacttatttgctgtttcaccaggggagagattttctttttccta  c.8300-481

.         .         .         .         .         .           g.111528
ttttatggacaaagctgtccttcagtgctctaagatacatgaaggtagctcagtttttcc  c.8300-421

.         .         .         .         .         .           g.111588
ctcattgcagtgtacagaaccacatctcctattcctcagtagactatcccagcatcattg  c.8300-361

.         .         .         .         .         .           g.111648
cccacttactgctccagctatgagttcctttttcttttctggcaccatgggatttctctg  c.8300-301

.         .         .         .         .         .           g.111708
tttagaaagattggtcgtatattaaaatttttttttgtaatttagcatgtctatgttttt  c.8300-241

.         .         .         .         .         .           g.111768
atgaaagggcataggcctatgtacttcagctcagtctaataaatcttgtttatttactgt  c.8300-181

.         .         .         .         .         .           g.111828
gggagagctttaacttcaaattttttattaaattcattatacagtagaaagctattagca  c.8300-121

.         .         .         .         .         .           g.111888
taatatgtgacaaacttctaatatctgggttgccagttggaaatagtggcaattgtcttt  c.8300-61

.         .         .         .         .         .           g.111948
tccatgtgatcttttttcctctactattttattttaattgtaatatatactctggattag  c.8300-1


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