chromosome 9 open reading frame 72 (C9orf72) - 6544 nt intron 01 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.5218
gtgtgtgtttttgtttttcccaccctctctccccactacttgctctcacagtactcgctg  c.-45+60

         .         .         .         .         .         .  g.5278
agggtgaacaagaaaagacctgataaagattaaccagaagaaaacaaggagggaaacaac  c.-45+120

         .         .         .         .         .         .  g.5338
cgcagcctgtagcaagctctggaactcaggagtcgcgcgctaggggccggggccggggcc  c.-45+180

         .         .         .         .         .         .  g.5398
ggggcgtggtcggggcgggcccgggggcgggcccggggcggggctgcggttgcggtgcct  c.-45+240

         .         .         .         .         .         .  g.5458
gcgcccgcggcggcggaggcgcaggcggtggcgagtgggtgagtgaggaggcggcatcct  c.-45+300

         .         .         .         .         .         .  g.5518
ggcgggtggctgtttggggttcggctgccgggaagaggcgcgggtagaagcgggggctct  c.-45+360

         .         .         .         .         .         .  g.5578
cctcagagctcgacgcatttttactttccctctcatttctctgaccgaagctgggtgtcg  c.-45+420

         .         .         .         .         .         .  g.5638
ggctttcgcctctagcgactggtggaattgcctgcatccgggccccgggcttcccggcgg  c.-45+480

         .         .         .         .         .         .  g.5698
cggcggcggcggcggcggcgcagggacaagggatggggatctggcctcttccttgctttc  c.-45+540

         .         .         .         .         .         .  g.5758
ccgccctcagtacccgagctgtctccttcccggggacccgctgggagcgctgccgctgcg  c.-45+600

         .         .         .         .         .         .  g.5818
ggctcgagaaaagggagcctcgggtactgagaggcctcgcctgggggaaggccggagggt  c.-45+660

         .         .         .         .         .         .  g.5878
gggcggcgcgcggcttctgcggaccaagtcggggttcgctaggaacccgagacggtccct  c.-45+720

         .         .         .         .         .         .  g.5938
gccggcgaggagatcatgcgggatgagatgggggtgtggagacgcctgcacaatttcagc  c.-45+780

         .         .         .         .         .         .  g.5998
ccaagcttctagagagtggtgatgacttgcatatgagggcagcaatgcaagtcggtgtgc  c.-45+840

         .         .         .         .         .         .  g.6058
tccccattctgtgggacatgacctggttgcttcacagctccgagatgacacagacttgct  c.-45+900

         .         .         .         .         .         .  g.6118
taaaggaagtgactattgtgacttgggcatcacttgactgatggtaatcagttgtctaaa  c.-45+960

         .         .         .         .         .         .  g.6178
gaagtgcacagattacatgtccgtgtgctcattgggtctatctggccgcgttgaacacca  c.-45+1020

         .         .         .         .         .         .  g.6238
ccaggctttgtattcagaaacaggagggaggtcctgcactttcccaggaggggtggccct  c.-45+1080

         .         .         .         .         .         .  g.6298
ttcagatgcaatcgagattgttaggctctgggagagtagttgcctggttgtggcagttgg  c.-45+1140

         .         .         .         .         .         .  g.6358
taaatttctattcaaacagttgccatgcaccagttgttcacaacaagggtacgtaatctg  c.-45+1200

         .         .         .         .         .         .  g.6418
tctggcattacttctacttttgtacaaaggatcaaaaaaaaaaaagatactgttaagata  c.-45+1260

         .         .         .         .         .         .  g.6478
tgatttttctcagactttgggaaacttttaacataatctgtgaatatcacagaaacaaga  c.-45+1320

         .         .         .         .         .         .  g.6538
ctatcatataggggatattaataacctggagtcagaatacttgaaatacggtgtcatttg  c.-45+1380

         .         .         .         .         .         .  g.6598
acacgggcattgttgtcaccacctctgccaaggcctgccactttaggaaaaccctgaatc  c.-45+1440

         .         .         .         .         .         .  g.6658
agttggaaactgctacatgctgatagtacatctgaaacaagaacgagagtaattaccaca  c.-45+1500

         .         .         .         .         .         .  g.6718
ttccagattgttcactaagccagcatttacctgctccaggaaaaaattacaagcacctta  c.-45+1560

         .         .         .         .         .         .  g.6778
tgaagttgataaaatattttgtttggctatgttggcactccacaatttgctttcagagaa  c.-45+1620

         .         .         .         .         .         .  g.6838
acaaagtaaaccaaggaggacttctgtttttcaagtctgccctcgggttctattctacgt  c.-45+1680

         .         .         .         .         .         .  g.6898
taattagatagttcccaggaggactaggttagcctacctattgtctgagaaacttggaac  c.-45+1740

         .         .         .         .         .         .  g.6958
tgtgagaaatggccagatagtgatatgaacttcaccttccagtcttccctgatgttgaag  c.-45+1800

         .         .         .         .         .         .  g.7018
attgagaaagtgttgtgaactttctggtactgtaaacagttcactgtccttgaagtggtc  c.-45+1860

         .         .         .         .         .         .  g.7078
ctgggcagctcctgttgtggaaagtggacggtttaggatcctgcttctctttgggctggg  c.-45+1920

         .         .         .         .         .         .  g.7138
agaaaataaacagcatggttacaagtattgagagccaggttggagaaggtggcttacacc  c.-45+1980

         .         .         .         .         .         .  g.7198
tgtaatgccagagctttgggaggcggaggcaagaggatcacttgaagccaggagttcaag  c.-45+2040

         .         .         .         .         .         .  g.7258
ctcaacctgggcaacgtagaccctgtctctacaaaaaattaaaaacttagccgggcgtgg  c.-45+2100

         .         .         .         .         .         .  g.7318
tgatgtgcacctgtagtcctagctacttgggaggctgaggcaggagggtcatttgagccc  c.-45+2160

         .         .         .         .         .         .  g.7378
aagagtttgaagttaccgagagctatgatcctgccagtgcattccagcctggatgacaaa  c.-45+2220

         .         .         .         .         .         .  g.7438
acgagaccctgtctctaaaaaacaagaagtgagggctttatgattgtagaattttcacta  c.-45+2280

         .         .         .         .         .         .  g.7498
caatagcagtggaccaaccacctttctaaataccaatcagggaagagatggttgattttt  c.-45+2340

         .         .         .         .         .         .  g.7558
taacagacgtttaaagaaaaagcaaaacctcaaacttagcactctactaacagttttagc  c.-45+2400

         .         .         .         .         .         .  g.7618
agatgttaattaatgtaatcatgtctgcatgtatgggattatttccagaaagtgtattgg  c.-45+2460

         .         .         .         .         .         .  g.7678
gaaacctctcatgaaccctgtgagcaagccaccgtctcactcaatttgaatcttggcttc  c.-45+2520

         .         .         .         .         .         .  g.7738
cctcaaaagactggctaatgtttggtaactctctggagtagacagcactacatgtacgta  c.-45+2580

         .         .         .         .         .         .  g.7798
agataggtacataaacaactattggttttgagctgatttttttcagctgcatttgcatgt  c.-45+2640

         .         .         .         .         .         .  g.7858
atggatttttctcaccaaagacgatgacttcaagtattagtaaaataattgtacagctct  c.-45+2700

         .         .         .         .         .         .  g.7918
cctgattatacttctctgtgacatttcatttcccaggctatttcttttggtaggatttaa  c.-45+2760

         .         .         .         .         .         .  g.7978
aactaagcaattcagtatgatctttgtccttcattttctttcttattctttttgtttgtt  c.-45+2820

         .         .         .         .         .         .  g.8038
tgtttgtttgtttttttcttgaggcagagtctctctctgtcgcccaggctggagtgcagt  c.-45+2880

         .         .         .         .         .         .  g.8098
ggcgccatctcagctcattgcaacctctgccacctccgggttcaagagattctcctgcct  c.-45+2940

         .         .         .         .         .         .  g.8158
cagcctcccgagtagctgggattacaggtgtccaccaccacacccggctaattttttgta  c.-45+3000

         .         .         .         .         .         .  g.8218
tttttagtagaggtggggtttcaccatgttggccaggctggtcttgagctcctgacctca  c.-45+3060

         .         .         .         .         .         .  g.8278
ggtgatccacctgcctcggcctaccaaagagctgggataacaggtgtgacccaccatgcc  c.-45+3120

         .         .         .         .         .         .  g.8338
cggcccattttttttttcttattctgttaggagtgagagtgtaactagcagtataatagt  c.-45+3180

         .         .         .         .         .         .  g.8398
tcaattttcacaacgtggtaaaagtttccctataattcaatcagattttgctccagggtt  c.-45+3240

         .         .         .    g.8430
cagttctgttttaggaaatacttttattttca  c.-45+3272

--------------------- middle of intron ---------------------
                g.8431        .         .         .           g.8462
                c.-44-3272  gtttaatgatgaaatattagagttgtaatatt  c.-44-3241

.         .         .         .         .         .           g.8522
gcctttatgattatccacctttttaacctaaaagaatgaaagaaaaatatgtttgcaata  c.-44-3181

.         .         .         .         .         .           g.8582
taattttatggttgtatgttaacttaattcattatgttggcctccagtttgctgttgtta  c.-44-3121

.         .         .         .         .         .           g.8642
gttatgacagcagtagtgtcattaccatttcaattcagattacattcctatatttgatca  c.-44-3061

.         .         .         .         .         .           g.8702
ttgtaaactgactgcttacattgtattaaaaacagtggatattttaaagaagctgtacgg  c.-44-3001

.         .         .         .         .         .           g.8762
cttatatctagtgctgtctcttaagactattaaattgatacaacatatttaaaagtaaat  c.-44-2941

.         .         .         .         .         .           g.8822
attacctaaatgaatttttgaaattacaaatacacgtgttaaaactgtcgttgtgttcaa  c.-44-2881

.         .         .         .         .         .           g.8882
ccatttctgtacatacttagagttaactgttttgccaggctctgtatgcctactcataat  c.-44-2821

.         .         .         .         .         .           g.8942
atgataaaagcactcatctaatgctctgtaaatagaagtcagtgctttccatcagactga  c.-44-2761

.         .         .         .         .         .           g.9002
actctcttgacaagatgtggatgaaattctttaagtaaaattgtttactttgtcatacat  c.-44-2701

.         .         .         .         .         .           g.9062
ttacagatcaaatgttagctcccaaagcaatcatatggcaaagataggtatatcatagtt  c.-44-2641

.         .         .         .         .         .           g.9122
tgcctattagctgctttgtattgctattattataaatagacttcacagttttagacttgc  c.-44-2581

.         .         .         .         .         .           g.9182
ttaggtgaaattgcaattctttttactttcagtcttagataacaagtcttcaattatagt  c.-44-2521

.         .         .         .         .         .           g.9242
acaatcacacattgcttaggaatgcatcattaggcgattttgtcattatgcaaacatcat  c.-44-2461

.         .         .         .         .         .           g.9302
agagtgtacttacacaaacctagatagtatagcctttatgtacctaggccgtatggtata  c.-44-2401

.         .         .         .         .         .           g.9362
gtctgttgctcctaggccacaaacctgtacaactgttactgtactgaatactatagacag  c.-44-2341

.         .         .         .         .         .           g.9422
ttgtaacacagtggtaaatatttatctaaatatatgcaaacagagaaaaggtacagtaaa  c.-44-2281

.         .         .         .         .         .           g.9482
agtatggtataaaagataatggtatacctgtgtaggccacttaccacgaatggagcttgc  c.-44-2221

.         .         .         .         .         .           g.9542
aggactagaagttgctctgggtgagtcagtgagtgagtggtgaattaatgtgaaggccta  c.-44-2161

.         .         .         .         .         .           g.9602
gaacactgtacaccactgtagactataaacacagtacgctgaagctacaccaaatttatc  c.-44-2101

.         .         .         .         .         .           g.9662
ttaacagtttttcttcaataaaaaattataactttttaactttgtaaactttttaatttt  c.-44-2041

.         .         .         .         .         .           g.9722
ttaacttttaaaatacttagcttgaaacacaaatacattgtatagctatacaaaaatatt  c.-44-1981

.         .         .         .         .         .           g.9782
ttttctttgtatccttattctagaagcttttttctattttctattttaaatttttttttt  c.-44-1921

.         .         .         .         .         .           g.9842
tacttgttagtcgtttttgttaaaaactaaaacacacacactttcacctaggcatagaca  c.-44-1861

.         .         .         .         .         .           g.9902
ggattaggatcatcagtatcactcccttccacctcactgccttccacctccacatcttgt  c.-44-1801

.         .         .         .         .         .           g.9962
cccactggaaggtttttaggggcaataacacacatgtagctgtcacctatgataacagtg  c.-44-1741

.         .         .         .         .         .           g.10022
ctttctgttgaatacctcctgaaggacttgcctgaggctgttttacatttaacttaaaaa  c.-44-1681

.         .         .         .         .         .           g.10082
aaaaaaaagtagaaggagtgcactctaaaataacaataaaaggcatagtatagtgaatac  c.-44-1621

.         .         .         .         .         .           g.10142
ataaaccagcaatgtagtagtttattatcaagtgttgtacactgtaataattgtatgtgc  c.-44-1561

.         .         .         .         .         .           g.10202
tatactttaaataacttgcaaaatagtactaagaccttatgatggttacagtgtcactaa  c.-44-1501

.         .         .         .         .         .           g.10262
ggcaatagcatattttcaggtccattgtaatctaatgggactaccatcatatatgcagtc  c.-44-1441

.         .         .         .         .         .           g.10322
taccattgactgaaacgttacatggcacataactgtatttgcaagaatgatttgttttac  c.-44-1381

.         .         .         .         .         .           g.10382
attaatatcacataggatgtacctttttagagtggtatgtttatgtggattaagatgtac  c.-44-1321

.         .         .         .         .         .           g.10442
aagttgagcaaggggaccaagagccctgggttctgtcttggatgtgagcgtttatgttct  c.-44-1261

.         .         .         .         .         .           g.10502
tctcctcatgtctgttttctcattaaattcaaaggcttgaacgggccctatttagccctt  c.-44-1201

.         .         .         .         .         .           g.10562
ctgttttctacgtgttctaaataactaaagcttttaaattctagccatttagtgtagaac  c.-44-1141

.         .         .         .         .         .           g.10622
tctctttgcagtgatgaaatgctgtattggtttcttggctagcatattaaatatttttat  c.-44-1081

.         .         .         .         .         .           g.10682
ctttgtcttgatacttcaatgtcgttttaaacatcaggatcgggcttcagtattctcata  c.-44-1021

.         .         .         .         .         .           g.10742
accagagagttcactgaggatacaggactgtttgcccattttttgttatggctccagact  c.-44-961

.         .         .         .         .         .           g.10802
tgtggtatttccatgtctttttttttttttttttttttgaccttttagcggctttaaagt  c.-44-901

.         .         .         .         .         .           g.10862
atttctgttgttaggtgttgtattacttttctaagattacttaacaaagcaccacaaact  c.-44-841

.         .         .         .         .         .           g.10922
gagtggctttaaacaacagcaatttattctctcacaattctagaagctagaagtccgaaa  c.-44-781

.         .         .         .         .         .           g.10982
tcaaagtgttgacaggggcatgatcttcaagagagaagactctttccttgcctcttcctg  c.-44-721

.         .         .         .         .         .           g.11042
gcttctggtggttaccagcaatcctgagtgttcctttcttgccttgtagtttcaacaatc  c.-44-661

.         .         .         .         .         .           g.11102
cagtatctgccttttgtcttcacatggctgtctaccatttgtctctgtgtctccaaatct  c.-44-601

.         .         .         .         .         .           g.11162
ctctccttataaacacagcagttattggattaggccccactctaatccagtatgacccca  c.-44-541

.         .         .         .         .         .           g.11222
ttttaacatgattacacttatttctagataaggtcacattcacgtacaccaagggttagg  c.-44-481

.         .         .         .         .         .           g.11282
aattgaacatatctttttgggggacacaattcaacccacaagtgtcagtctctagctgag  c.-44-421

.         .         .         .         .         .           g.11342
cctttcccttcctgtttttctcctttttagttgctatgggttaggggccaaatctccagt  c.-44-361

.         .         .         .         .         .           g.11402
catactagaattgcacatggactggatatttgggaatactgcgggtctattctatgagct  c.-44-301

.         .         .         .         .         .           g.11462
ttagtatgtaacatttaatatcagtgtaaagaagcccttttttaagttatttctttgaat  c.-44-241

.         .         .         .         .         .           g.11522
ttctaaatgtatgccctgaatataagtaacaagttaccatgtcttgtaaaatgatcatat  c.-44-181

.         .         .         .         .         .           g.11582
caacaaacatttaatgtgcacctactgtgctagttgaatgtctttatcctgataggagat  c.-44-121

.         .         .         .         .         .           g.11642
aacaggattccacatctttgacttaagaggacaaaccaaatatgtctaaatcatttgggg  c.-44-61

.         .         .         .         .         .           g.11702
ttttgatggatatctttaaattgctgaacctaatcattggtttcatatgtcattgtttag  c.-44-1


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