calcium/calmodulin-dependent serine protein kinase (MAGUK family) (CASK) - 5975 nt intron 06 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.256667
gtaagactgctttaaaaaaaaaaaattcttcaaaacctggtcacttgcgactggtataaa  c.532+60

         .         .         .         .         .         .  g.256727
actttcaagctacatattagcccaacctcagtgtttcatacctcattccaccccacccca  c.532+120

         .         .         .         .         .         .  g.256787
actcccaaaaagcatcatcagatagtttttaatttaataactctgtagtcataactagaa  c.532+180

         .         .         .         .         .         .  g.256847
tcttagtcccttaagaatagactcttttttctctttgtacctccagtacttaagagactg  c.532+240

         .         .         .         .         .         .  g.256907
tacaagattaaaacagtgttcagagaaaataagtttgaggcatagtgccttttaaagttg  c.532+300

         .         .         .         .         .         .  g.256967
aactggccaaatgaagtcaaatctaaaatgtgtagattagccacttcctggtttacactg  c.532+360

         .         .         .         .         .         .  g.257027
atggctaatttttaatttcatactgtttgcctttttccatttatcaaagaatcctgctca  c.532+420

         .         .         .         .         .         .  g.257087
agccatcagcctgtatattagcaaagaataagcagatgtgaatgcaggctgattttatta  c.532+480

         .         .         .         .         .         .  g.257147
ttagccaaagcaaaacataatttttaaattcccatgtcagaataaaaagaaaaaagttac  c.532+540

         .         .         .         .         .         .  g.257207
aaattatataatcttgcacagcacatttcatataactcaattccttatagctagaacatc  c.532+600

         .         .         .         .         .         .  g.257267
aagcagtaacaacatagaccatcttcagaaaaatgagccataggtcatagttgtaatttt  c.532+660

         .         .         .         .         .         .  g.257327
tttttttttctttcagacaatgtcttgctctgtcacccaggctggagcgcacagtggcac  c.532+720

         .         .         .         .         .         .  g.257387
gatcatggcacactgcactgcacccttgaccttccaggctcaagtgatcctcccacctca  c.532+780

         .         .         .         .         .         .  g.257447
acctcccaagtagctaggatcataggcgtgtgccaccatacctagcaaactttttttatt  c.532+840

         .         .         .         .         .         .  g.257507
tttagtagaggcaaggtctcactacattgcccaggctggtctcaaactcctgggcctaag  c.532+900

         .         .         .         .         .         .  g.257567
cagtcctcctgcctcagcctcccaaagtgctgggattacaggtgtaagccactgcaccca  c.532+960

         .         .         .         .         .         .  g.257627
gccaatagttgtattctttaaataattttttcaccacagtgccctctaaaattaaattac  c.532+1020

         .         .         .         .         .         .  g.257687
attcaaattttcttttagtttcacattcttttccagttaatcatttccaataatatgcaa  c.532+1080

         .         .         .         .         .         .  g.257747
aactgcaagctgagtatagtttcaaagaatgctaattttttcccctaatttaaaactttc  c.532+1140

         .         .         .         .         .         .  g.257807
tgttagtgattggaagactgaccaaagggtcaggtagtaaagcacagtttaatcatagaa  c.532+1200

         .         .         .         .         .         .  g.257867
tctcaggactccaaagggccttaacttctccagtcttgtaactaatgattgaattcttcc  c.532+1260

         .         .         .         .         .         .  g.257927
ataatattcccaagaaaagattgagttctggtattaaacctcagagagcaaagtagtcac  c.532+1320

         .         .         .         .         .         .  g.257987
tacatcccaagacagttcatttcatttttggataactccttaagtattaaaaagctcatc  c.532+1380

         .         .         .         .         .         .  g.258047
tttgcatctttctgtaacttctacccagtcatcctaatcctgacttttgaaaccactctg  c.532+1440

         .         .         .         .         .         .  g.258107
aacaattttcatccttccgtatgataaccgttcatctgtttgtagacaactaccatgtcc  c.532+1500

         .         .         .         .         .         .  g.258167
ccctaggtcttatccaagttaacttccctagggtgatttggccattcttcatataaactg  c.532+1560

         .         .         .         .         .         .  g.258227
gttcaaaatctcttcagtatccacaaagtacagggcctgaactgaacactctaactacag  c.532+1620

         .         .         .         .         .         .  g.258287
gtagtacagtacagccgatccagtgcacagtagcattgggctatcacttttttgtgttct  c.532+1680

         .         .         .         .         .         .  g.258347
gggccttaaatttccctcgagttccccaaattgcattagctttttggacaactacatagc  c.532+1740

         .         .         .         .         .         .  g.258407
actgatggttcatactgatcttgtaatcaagtgaaaatcctaaattattttttaaacaaa  c.532+1800

         .         .         .         .         .         .  g.258467
tgtcactgttaagctaactctctcaattctggtacttatacagatcatttctatgttaag  c.532+1860

         .         .         .         .         .         .  g.258527
actacgtaattataacaaataatttctgatgattatattaccaaggttaatgggatgaaa  c.532+1920

         .         .         .         .         .         .  g.258587
tgaaatgaatttattttatatgttatatactggccatatataatgactttgtttctgttg  c.532+1980

         .         .         .         .         .         .  g.258647
ctctggatctatatcctgttggtatttagaatgtcatgttcttcgtattttattgtacat  c.532+2040

         .         .         .         .         .         .  g.258707
cttgactgggggggaaaatagatgcattatgtttacctggacattttctccatattaatc  c.532+2100

         .         .         .         .         .         .  g.258767
tttttctaaagtccatgaacctttcacctaaattgtttatttttaaagctaattttgaac  c.532+2160

         .         .         .         .         .         .  g.258827
tcccccccaccgcccaccgctggtatgtcagtattcaaaatgtatttttctccatgcttc  c.532+2220

         .         .         .         .         .         .  g.258887
tagaattaaaatacttcctgatggtcaaaatattgtcatttcttagcacacctttttttg  c.532+2280

         .         .         .         .         .         .  g.258947
tattcttgaaataactgaatgttacgttttaaaaaatagaatatgaataaattagagata  c.532+2340

         .         .         .         .         .         .  g.259007
aattatttctcttagaaaaagcttttctgctgtttaaggtacttttgaaattttggtaat  c.532+2400

         .         .         .         .         .         .  g.259067
taaggttgggcacggtggctcatgcctctaattccagcactttgggaggctgaggcgggc  c.532+2460

         .         .         .         .         .         .  g.259127
agattgagcccaggagttcaagaccagcctgggcaacatggcgaaaccccatttctccaa  c.532+2520

         .         .         .         .         .         .  g.259187
aaagatgcaaaaattagccaggcatggtgacaagagcctgtattcccagctacatgggag  c.532+2580

         .         .         .         .         .         .  g.259247
gatcgcttgaacccgggaggcagaggctgcagtgagctgagatcgcaccactgccctcca  c.532+2640

         .         .         .         .         .         .  g.259307
gcctgagcaacagagcaagaccctatctcaaaaaaaaaaagaaagaaattccgtcaatca  c.532+2700

         .         .         .         .         .         .  g.259367
tttaattatttatcaactttaaagcagaaagccattttcctgtcagtttgaaatcccagt  c.532+2760

         .         .         .         .         .         .  g.259427
ccctagtcctccaaatagaaaggaattcatttctttatatgttgcatatagtaaaaatca  c.532+2820

         .         .         .         .         .         .  g.259487
tttaaacatatttacactccccctacctgaaactcagctatttaggaaacttacttatcc  c.532+2880

         .         .         .         .         .         .  g.259547
agaatacaactagaaacctagaaaataactacaatagcagcaaaattattcctaccctta  c.532+2940

         .         .         .         .          g.259595
aaaatccactcatgctcctcacaattgagcatctaaagacactctcta  c.532+2988

--------------------- middle of intron ---------------------
 g.259596           .         .         .         .           g.259642
 c.533-2987  aggctgacttgctcccatgttttaaaaagttgtatagattcgtgttc  c.533-2941

.         .         .         .         .         .           g.259702
cttcataccttgcacatgctattccttctagttggagtgccttttgttattttatctatc  c.533-2881

.         .         .         .         .         .           g.259762
tggttaactcctactgttctggaaggctgagctaacaattatctcctctttaaagcaggc  c.533-2821

.         .         .         .         .         .           g.259822
ttaccttcaccatcccgagttggatagccctattccttctctctatattcccataactat  c.533-2761

.         .         .         .         .         .           g.259882
ctgggctacatacctccatgtagcattggatgcagggacttacatcaaagactgtgattt  c.533-2701

.         .         .         .         .         .           g.259942
gtaagagtaagggggaccatggctgagggtatctaggacctagcaagcacttaggaaatt  c.533-2641

.         .         .         .         .         .           g.260002
gctattaaatgaaataaactggttgctagtcaggttctagttaatagcagattataaaag  c.533-2581

.         .         .         .         .         .           g.260062
caacaaattaggagaacgcagaactaaagcatagtgagagaaaagaaataaaagcctgac  c.533-2521

.         .         .         .         .         .           g.260122
aaaaatatatatgatatatactgagcagacaccaaaacttggaaagcgcaacagcctttc  c.533-2461

.         .         .         .         .         .           g.260182
aatatgaaagaaatcaactcttgcatacctctgaagttcctgagggtgctttctgttcta  c.533-2401

.         .         .         .         .         .           g.260242
cagcctaggtctttaatcagtatctacaatgacaactctgagtcatcaagaaaaggttaa  c.533-2341

.         .         .         .         .         .           g.260302
attatgagcagcattctgtgtaaaagaagtcaggaaattgtagaaagccatacaaaatta  c.533-2281

.         .         .         .         .         .           g.260362
tttaactaaggtgggcactgtgactcacacctgtaatcccagctacttgagaggccaagg  c.533-2221

.         .         .         .         .         .           g.260422
cagaaggatcgcttgagcccaggagtttgagactagcctggggaaaatagtgagactctg  c.533-2161

.         .         .         .         .         .           g.260482
caaaaaaattattaaaacaaaaaggattgtgcgcataaagattcaaatcacaatgtattt  c.533-2101

.         .         .         .         .         .           g.260542
aaaaatgtagctattcagaacaattctccccctgagattctggtaggaaggttttattgt  c.533-2041

.         .         .         .         .         .           g.260602
attatcaaaatatataatatttaaatatttgtccaaaatatctcaaactgccatttaatt  c.533-1981

.         .         .         .         .         .           g.260662
tagtttgctaatttgtttccttttcttaaaattttgtggtcaaagtcctaaaagtcaaga  c.533-1921

.         .         .         .         .         .           g.260722
agaagtatcagcaaaaacaaggatttttaggaagttggtgtatattaaagattaactcca  c.533-1861

.         .         .         .         .         .           g.260782
gtcctttttaccttctactgatttacatgaaataaaagagccttcctctacattctttct  c.533-1801

.         .         .         .         .         .           g.260842
accatggtttttcccctatcatctgtgagcaaattattgaaccaaacaacaggcatcttc  c.533-1741

.         .         .         .         .         .           g.260902
ccgaagattgaacactaattctccagaattgggtagtcttcgtctagctaaatggagaga  c.533-1681

.         .         .         .         .         .           g.260962
accttctcaggatggctgggactggccatggtcgctctgattattcccaagttaaggccc  c.533-1621

.         .         .         .         .         .           g.261022
ccattttgagtggcttggcccaggaagtggtaggagtcaagttgagtttcaaagcatcat  c.533-1561

.         .         .         .         .         .           g.261082
ccaaactgtcagcaggtacctaactggtaccctggtaccaattgaatgatactggtttcc  c.533-1501

.         .         .         .         .         .           g.261142
cctactcctgctagctcctgtccatcagaacaaggctaattctccagtggcccctccctg  c.533-1441

.         .         .         .         .         .           g.261202
tccaggctattaatgaagtatggaaggcttagttcccatccctgcagcttcttcgtgtta  c.533-1381

.         .         .         .         .         .           g.261262
cttgaggaagcaaaatggggcaatacagaaataaaagtatttctctagccaggtccttct  c.533-1321

.         .         .         .         .         .           g.261322
agtcaatagttttcactgatctatcgtacattttaaatgaaaatattttcactactggaa  c.533-1261

.         .         .         .         .         .           g.261382
ccctgaacttaagcttttctattatggggggaggaagggaaaccatatgatctgcagcaa  c.533-1201

.         .         .         .         .         .           g.261442
aggtacatcctgatacacaagctaagagctcttttatctttctgcatcccaactgagttt  c.533-1141

.         .         .         .         .         .           g.261502
cataatcatgaacagaacttgatatattctctctagctgaaccagaagatctctaaggtc  c.533-1081

.         .         .         .         .         .           g.261562
ttttaaaaccacagttctgagttctagataaagtattgcacaatcttcaaactaaaaatt  c.533-1021

.         .         .         .         .         .           g.261622
atcttgaactcagtatgatgaaagagagagacagagggaggaagggaggtggctgggctt  c.533-961

.         .         .         .         .         .           g.261682
gcatatatctagaagagctgccaagtctagtgggcagtgccccatcccacagtgatcttc  c.533-901

.         .         .         .         .         .           g.261742
ctgccgggtacaagcctttcattccacaatagaagacttcttttgggatactgagttaaa  c.533-841

.         .         .         .         .         .           g.261802
gatagttatgaatgtgcaaacagctagtatcagattccttacagaaagctaatttttgat  c.533-781

.         .         .         .         .         .           g.261862
agagaaacaaaagaaaactctttaaagaagatgaaagtcaaagaggattgaatgggagga  c.533-721

.         .         .         .         .         .           g.261922
gcttcataattttgcttttgtttatgccatatatttgctctcattctcttcatatgttaa  c.533-661

.         .         .         .         .         .           g.261982
tgttaggaggaagctaaaaactcctactataacaaaatattactaactattgttaattgc  c.533-601

.         .         .         .         .         .           g.262042
tataattaacccataaaatcaactgaacaggatttcagagtcaaattcatatttcaaata  c.533-541

.         .         .         .         .         .           g.262102
acagttctcagcatttggtttcattggggaatttccatttggcagtcaagtcatcttttt  c.533-481

.         .         .         .         .         .           g.262162
tccaccgatttttttctcatgacttcctgccccctcctctcctttcccctgcctctgcct  c.533-421

.         .         .         .         .         .           g.262222
ctgcccagggtaggcctcccaactctttcctggacagctacaggctctgcctgttgactc  c.533-361

.         .         .         .         .         .           g.262282
tttcacctgcctctgctctatatatttggtgactttcaaccatgtgaaaattagaaaatt  c.533-301

.         .         .         .         .         .           g.262342
taaacttcttcatgaggtaagaaccacataaatacctactacgtagcatgcagaattcaa  c.533-241

.         .         .         .         .         .           g.262402
tagggagtgccagtgtacaagacagaatacctattctgggctcaatgttttcaggaagca  c.533-181

.         .         .         .         .         .           g.262462
attagataagtaatttttttcacctatgtgaacttgattttatggagaggtggaggagtg  c.533-121

.         .         .         .         .         .           g.262522
gtgagagtatatgtattggtaaactttttatttggattgttattgttctattatttttag  c.533-61

.         .         .         .         .         .           g.262582
ttttcaagtgaaaatcccattttatgtaaacatttttccttaatgttgttttaaatgtag  c.533-1


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