chromosome alignment maintaining phosphoprotein 1 (CHAMP1) - downstream reference sequence

         .         .            .         .         .         . g.17872
aaaagaaaggttttcatgtcagcaaca / tcttcatgtgtgttttcttttgtgtagttttca c.*1080

         .         .         .         .         .         .    g.17932
ttgtatgatatacagatccattatttccatgttttcaacatagttttcttatctggagca    c.*1140

         .         .         .         .         .         .    g.17992
gcattttcttagctgtgttttctccaagttctgtggtcaagtaagttaggggaatgcgtg    c.*1200

         .         .         .         .         .         .    g.18052
tatagggaggactctgtgtcaaaaacctcatcctttcatatgaaaggttttttaattcca    c.*1260

         .         .         .         .         .         .    g.18112
gtggttgcctatcctgcctgcctctaaacagtgtgaggcatttaatctcaaagcattctg    c.*1320

         .         .         .         .         .         .    g.18172
atgtgtagccaggattgagatgctgtactgggtttattttagctattcccagacattttt    c.*1380

         .         .         .         .         .         .    g.18232
ttaacaaggaacagttttgtcctagttccccacccgctggcttccctattaatatgcccg    c.*1440

         .         .         .         .         .         .    g.18292
ttgggatagcttaacaatatttagtaatatggtttggctctgtgtccacactcaaatctc    c.*1500

         .         .         .         .         .         .    g.18352
tctctttttatttttgttttttattttgagaccgatccttgctgtgtcacccaggttgct    c.*1560

         .         .         .         .         .         .    g.18412
gtgccgtggtgtgatcttggctcactgcagtctctgcctttcagattcaagggagtctcg    c.*1620

         .         .         .         .         .         .    g.18472
tgcctcagcctcctgagtagctgggactacatgtgtgtgccaccacatctagctaatttt    c.*1680

         .         .         .         .         .         .    g.18532
tgtagtttaatagagatggggttttgccatgttggccaggctggtctcgaactcttgggc    c.*1740

         .         .         .         .         .         .    g.18592
tcaagtgatccacctgcctcacttgagggagtgctgggattacagctgtgggccaccaca    c.*1800

         .         .         .         .         .         .    g.18652
cctgacccccacccaaatgtcatattgaattgtaatccccagtgttggaggaggggccag    c.*1860

         .         .         .         .         .         .    g.18712
cctggtgagaagtgattggatcatgggggtggacttccccttgctgttctcgtgatagtg    c.*1920

         .         .         .         .         .         .    g.18772
tgtgagttatttaaaagtgtttagcccctccccttcgctctgttcctcctgctccagcca    c.*1980

         .         .         .         .         .         .    g.18832
tgttggatatgccagcttccccttcaccttctgccgtgattgtaagtttccagagccgcc    c.*2040

         .         .         .         .         .         .    g.18892
ctgcctcctgccccagctgtgtttcctctgcagcgtgtggaaccattagctaattaaacc    c.*2100

         .         .         .         .         .         .    g.18952
tcttttgtttatgaattacccggtctcaggtctttgcagcagtgtaagaacagagtaata    c.*2160

         .         .         .         .         .         .    g.19012
catttagataataccaagtaaggtcttagaagcctcagatctgttaacttcggtgaacac    c.*2220

         .         .         .         .         .         .    g.19072
agcactgagtagctgctgctatcaatttacgtggcaccttgagaacgagcttccagatca    c.*2280

         .         .         .         .         .         .    g.19132
ggagttcccttctaggcagtgatgccaacaaataggacaggtaagatatcttggatatac    c.*2340

         .         .         .         .         .         .    g.19192
tagttgtccttttcttgtcgatactgactgactgaagttgtttttgagaaacaaaaaggg    c.*2400

         .         .         .         .         .         .    g.19252
tctgcattacctagaaactctcctggctcctgcagtctcagaccaaccctgttacacaga    c.*2460

         .         .         .         .         .         .    g.19312
ttcttttctaagacttcaccctgtctggtgcaaacctggcagttcatcctagacctttgc    c.*2520

         .         .         .         .         .         .    g.19372
tccaggtggcaccaactaagtcacatgacttgccatctgatttggggttttttataatag    c.*2580

         .         .         .         .         .         .    g.19432
tgccataggataagagttaattgcctgggtaagtggtagtgatgcatgtgtagttttggc    c.*2640

         .         .         .         .         .         .    g.19492
ttttaaggactttatttggctaaacccctgtgttgttggtttaccttactggcttccact    c.*2700

         .         .         .         .         .         .    g.19552
ctttctttttttctgtttttgagactgagttttgctcttgtctcccaggctggagtgcag    c.*2760

         .         .         .         .         .         .    g.19612
tggcgtgatctcagctcaccacaaactctgcctcccgggttcaagcgattctcctgtctc    c.*2820

         .         .         .         .         .         .    g.19672
agcctcccaagtagctgagattacaggcgcctgccaccacacccagctaatttttgtatt    c.*2880

         .         .         .         .         .         .    g.19732
tttagtagagacagggttttactattttggccaggctgttcttgaactcctgacctcagg    c.*2940

         .         .         .         .         .         .    g.19792
tgatccacccaccttggcctcccaaagtggaggatggagacgtatttaaaagcactgagc    c.*3000

         .         .         .         .                        g.19840
acaaaggaggcactcaatccatggtggtaattattattctaaccttat                c.*3048