collagen, type XI, alpha 1 (COL11A1) - 6292 nt intron 28 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.117693
gtaaaatttaattgtttagatggtattaatttctgtgtattatgttaacatttaaattta  c.2340+60

         .         .         .         .         .         .  g.117753
ttcaacagacattttatttcttgaatatatgagtgattactacatactacgcaatgctag  c.2340+120

         .         .         .         .         .         .  g.117813
tataattttgtattctttatcctcacaacttaaaaacaatgtcttatatcttgtgataag  c.2340+180

         .         .         .         .         .         .  g.117873
ggttaaataccagaacagaaactaaattatgttacctaagagaattaattctgcatcctt  c.2340+240

         .         .         .         .         .         .  g.117933
tttctttttttttttttacatgtgcttaagttttgttaatcatagggttggccttacgaa  c.2340+300

         .         .         .         .         .         .  g.117993
tggatttgctgcaggatttagatgttatctagttagatgcataacatatgaatatttatt  c.2340+360

         .         .         .         .         .         .  g.118053
ccttttttccctactgaaatccccaaaatgtttaaacaaattcagcacaaaacaggaaag  c.2340+420

         .         .         .         .         .         .  g.118113
ttagaagtacactaaattaattggggaaagaggaagtctttctatatagtattacacaca  c.2340+480

         .         .         .         .         .         .  g.118173
aatcaatagtgttaatgagagagataaaaattacaaccagacagaagtgaatgaaaaaat  c.2340+540

         .         .         .         .         .         .  g.118233
gtacctaaaactatgaatgcatatggcatcttttatagggcatttataggtaattggctt  c.2340+600

         .         .         .         .         .         .  g.118293
ttgctgaagaacatgacattcagatttttttcaaggatacatttagcaggcctgcaaagc  c.2340+660

         .         .         .         .         .         .  g.118353
cccaaatccttcaaagattatgatgaaatgcaaagggaatgacattactcagtgatagag  c.2340+720

         .         .         .         .         .         .  g.118413
tttagctgtatgcccacccaaatctcatcttgaattctaatccaaattgtaattcccacc  c.2340+780

         .         .         .         .         .         .  g.118473
tgtccagggaggcacatggtgggaggtgatgagatcatgggggcggtttccctcatgatg  c.2340+840

         .         .         .         .         .         .  g.118533
ttctcctgatagtgagtgtgttcttaacaagatctggttgtttgataagtgcctggtact  c.2340+900

         .         .         .         .         .         .  g.118593
tcccctttctctctttctttttctcctccaccttgtaaagaaggtacttgtttctccttt  c.2340+960

         .         .         .         .         .         .  g.118653
gccttctaccatgattgtaagtttcttgaggattccccagccatgcagaactgtgagtca  c.2340+1020

         .         .         .         .         .         .  g.118713
attaaacctctttcccttataaattacgcagtctcaggtagtatctttatagcaatgtaa  c.2340+1080

         .         .         .         .         .         .  g.118773
aagcggactaatacactcagaatcagtattgaattaattcttactacaaaatttcataca  c.2340+1140

         .         .         .         .         .         .  g.118833
aagttaaaacaacacatagttgcatagcataaatattggtaggtttggtaagatatacat  c.2340+1200

         .         .         .         .         .         .  g.118893
ggatattaactattgttaatatcatactcataagaacatactctattagactgtccttgc  c.2340+1260

         .         .         .         .         .         .  g.118953
actgctataagaaatacctgagactgggtaatttataaaaaagaggtttaattggcttat  c.2340+1320

         .         .         .         .         .         .  g.119013
ggttgtgcaggctgtacaggaagcatagtggcatctgcttcttggaaggcctcagggagc  c.2340+1380

         .         .         .         .         .         .  g.119073
ttccagtggaaggcaaagagggcacaggcatcctatgtgctgggagcaggagcaggaggg  c.2340+1440

         .         .         .         .         .         .  g.119133
ggtgaagaaggtgccacatgcttttaaacaatcaaatctcctgagaaggcactcactatc  c.2340+1500

         .         .         .         .         .         .  g.119193
aggaggacagcatcaaggagatggtgctaaaccattcaatggaaatccacccccgtgatc  c.2340+1560

         .         .         .         .         .         .  g.119253
ctatcaccccccaccaggtcccactttcaacattggggattacgtttcaacatgagattt  c.2340+1620

         .         .         .         .         .         .  g.119313
gggtgggtaaatatccaaattatatcacatgctaatattttttcaaggacagtcatttat  c.2340+1680

         .         .         .         .         .         .  g.119373
tttcatggttacaatattatcaaaaggcttatgtgtggatttgataccaatagggaatgg  c.2340+1740

         .         .         .         .         .         .  g.119433
ataacaaaaagggatggatttattatatccattatactttatctggaaaaagctactgtt  c.2340+1800

         .         .         .         .         .         .  g.119493
atatactaaaagtaaacaactatgttgtcagatttattacatgaaaaaggccatgcattt  c.2340+1860

         .         .         .         .         .         .  g.119553
cacattagctcacctacttaacggtaatctcagttcatcctgatcacctagatgaacttc  c.2340+1920

         .         .         .         .         .         .  g.119613
agagtaccagttggctctccctatgggttctgcatccatggattcaataaaccatagatc  c.2340+1980

         .         .         .         .         .         .  g.119673
aaagatactagaaaaacaaaaaattaaattaaaaaattataatatgactgggcacagtgg  c.2340+2040

         .         .         .         .         .         .  g.119733
cacatgcctataatcccaacactttgggtggctaaggcagtagaattgtttgagcccagt  c.2340+2100

         .         .         .         .         .         .  g.119793
agttcaagaccagcctgggcaaagtagtgagacgtcatctctacaaaatacttttaaaat  c.2340+2160

         .         .         .         .         .         .  g.119853
tagccaggtactgtgatgcgcacctgtggtcccagctacttgggaggctaaggagggaga  c.2340+2220

         .         .         .         .         .         .  g.119913
gttgcttgagctcaggaggtcaaggctgcaataagccatgactaagctactgtactccag  c.2340+2280

         .         .         .         .         .         .  g.119973
ccagggtgacagactgagaccctgtcaaaaaaagttatagtacaacaatatacaataata  c.2340+2340

         .         .         .         .         .         .  g.120033
caaatgaaaaaataacaactatttatatagcatttagattttcttaggtattatcagtat  c.2340+2400

         .         .         .         .         .         .  g.120093
tctagaggtgatttaaagtataaaggagaaggatgtgggtaggctataaataaatactat  c.2340+2460

         .         .         .         .         .         .  g.120153
agccttttatatcaagaactggagcatccacagattttgatataggaagttgggttgggg  c.2340+2520

         .         .         .         .         .         .  g.120213
tcctggaaccaatcacccctagataccaagagaagactgtatagtgtctcactgaattga  c.2340+2580

         .         .         .         .         .         .  g.120273
caaaggagcacagtggtgagtcaggtagggtttaacatgtaatttgtaggttgcctatac  c.2340+2640

         .         .         .         .         .         .  g.120333
gaaaaataatgtctctgtttagaatttttcttgttaagaaatgtaagtaaaaatgcaaat  c.2340+2700

         .         .         .         .         .         .  g.120393
gtttttctctggaattagtatccatcaaggatttttagaggggctaggcagtgtttaaaa  c.2340+2760

         .         .         .         .         .         .  g.120453
gaaaattgcctgactggggtggggatgttgttaactgctgaaacttgctaggagagttgt  c.2340+2820

         .         .         .         .         .         .  g.120513
aaagtgacagaggcaaataaaattataaatgactagatatatatgaggacaaagccatac  c.2340+2880

         .         .         .         .         .         .  g.120573
aggaaaaaaaaataagatacattttttgtacataggaaagcttattaacaattgctcatt  c.2340+2940

         .         .         .         .         .         .  g.120633
gtttttagggtgtatggtctcagaagatgcaagtatgtatagaggaaaataagtaaaatt  c.2340+3000

         .         .         .         .         .         .  g.120693
ttaaattgggaaccaaaagttctgggttattattctagtttttctagttactttttctga  c.2340+3060

         .         .         .         .         .         .  g.120753
gcctcatttgaagtctgtaaaataaagaaaattccctaaaaaaatttaaaggtatttttc  c.2340+3120

         .         .        g.120779
agctatagcttttattctatctaata  c.2340+3146

--------------------- middle of intron ---------------------
                     g.120780           .         .           g.120805
                     c.2341-3146  taccaatcaagtagtaaattatgttt  c.2341-3121

.         .         .         .         .         .           g.120865
tattatagattacaatttagttttctaaattatagatttagagaaactttgtataaatat  c.2341-3061

.         .         .         .         .         .           g.120925
ttgtagaatttttaatggtaagaattctccatattttcaaactctgtgaaggattaagcc  c.2341-3001

.         .         .         .         .         .           g.120985
ctgatgactttttaatatgccttatttatttcatttttctgagtatgcaagataattgat  c.2341-2941

.         .         .         .         .         .           g.121045
catttatctcttacgagatagaagaaaatggaaaatattttatatataatgatgttaatt  c.2341-2881

.         .         .         .         .         .           g.121105
gttaaccaaaggtgatatagcaagttagtactctaattatgactaaaattctctcttttt  c.2341-2821

.         .         .         .         .         .           g.121165
tagccttagatttgtcgcttaagtctggagcaacacagctcaataaattaggtggcatag  c.2341-2761

.         .         .         .         .         .           g.121225
atgaattccacttttatacatcttctaaaactatgttttcttctttttttctttatctga  c.2341-2701

.         .         .         .         .         .           g.121285
taattttaatactagaaatcttaataacttgatacgtcacttgctaaaaaatgacatttg  c.2341-2641

.         .         .         .         .         .           g.121345
ttataaggaaatacctaattaaatcatctaattgttttttaaacgtgaatatgctgaaaa  c.2341-2581

.         .         .         .         .         .           g.121405
ctaaaacatgagaaaaatagcctccctgtagactgaattctcactttaaaaataatttaa  c.2341-2521

.         .         .         .         .         .           g.121465
aaataaaattctgtctatagtcagagtctataagtgatttttagacatagagtgcagtgt  c.2341-2461

.         .         .         .         .         .           g.121525
tctttaaactaagcatggcagctgtgtaattatgtttttctctagggaggaggtaatgaa  c.2341-2401

.         .         .         .         .         .           g.121585
gacgttgtcaatagcaagttcagtggtcatttacagctcttaagcctctgccattgccca  c.2341-2341

.         .         .         .         .         .           g.121645
atcacattcagtacagagagcatcctgggcaggatggtgaaaatggcatgactttctctt  c.2341-2281

.         .         .         .         .         .           g.121705
gaaaaaaaaaaaaaaaattcctggcatgctagagttctttgagtatgcaagataacagtt  c.2341-2221

.         .         .         .         .         .           g.121765
tgaatctctttccagggttaggtctcatattcacaagtacccagtatttggtattttctg  c.2341-2161

.         .         .         .         .         .           g.121825
gactttaatataccttgctaaactcacactgaggcatttagtaaatgtttattgaacatt  c.2341-2101

.         .         .         .         .         .           g.121885
gtggttactgaaggtccaaaacatgtttgacactggagactcacaggttaattaggcagg  c.2341-2041

.         .         .         .         .         .           g.121945
attcttgtgttcggccatttagcagaaggaaaacaacctatgatctagaaaatgcaggac  c.2341-1981

.         .         .         .         .         .           g.122005
ggcatattgttgcaataataattattcagtgaaggccacaagatggagaggttaatttta  c.2341-1921

.         .         .         .         .         .           g.122065
ggaggagttcaagacaaaagactgaagaagtgaagaagggctagatcacgtggtgaaggg  c.2341-1861

.         .         .         .         .         .           g.122125
aggtgccttatattgattattagcaatttgatacgattaggatattttaaagtaaaaatt  c.2341-1801

.         .         .         .         .         .           g.122185
gatgtgaccagttttgtattttaaagagatcattttggcagcgagatgtggaagcatttg  c.2341-1741

.         .         .         .         .         .           g.122245
tgcctatccttcctagctttgttttcatacacagcccaaaatgttcttttctgaaattat  c.2341-1681

.         .         .         .         .         .           g.122305
caaatcaaattcatttctaccaactgaaataaaaacccctccatcaaaccctccctatta  c.2341-1621

.         .         .         .         .         .           g.122365
acctcctgcctcaccacctcctccacaagcaccatacatcatcatcattatcattatttt  c.2341-1561

.         .         .         .         .         .           g.122425
ggcattcttctccagacaccctttctacttcatctgtaccaaaataactgcaaatgtccc  c.2341-1501

.         .         .         .         .         .           g.122485
actttcagttgtttgtttgttttgttttgttttgtttttgagatggagtctccctctgtt  c.2341-1441

.         .         .         .         .         .           g.122545
gccaagcctggagtgcagcggagtgatcttggttcgctgcaacctctacctcctaggttc  c.2341-1381

.         .         .         .         .         .           g.122605
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.         .         .         .         .         .           g.122665
ctggctaatttttctatttttagtagagacagggtttcaccatgttggccaggctggtct  c.2341-1261

.         .         .         .         .         .           g.122725
cgaactccttacctcagatgatccacctgcctcagcctcccaaactgctgggattacagg  c.2341-1201

.         .         .         .         .         .           g.122785
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.         .         .         .         .         .           g.122845
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.         .         .         .         .         .           g.122905
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.         .         .         .         .         .           g.122965
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.         .         .         .         .         .           g.123025
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.         .         .         .         .         .           g.123085
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.         .         .         .         .         .           g.123145
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.         .         .         .         .         .           g.123205
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.         .         .         .         .         .           g.123265
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.         .         .         .         .         .           g.123325
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.         .         .         .         .         .           g.123385
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.         .         .         .         .         .           g.123445
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.         .         .         .         .         .           g.123505
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.         .         .         .         .         .           g.123565
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.         .         .         .         .         .           g.123625
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.         .         .         .         .         .           g.123685
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.         .         .         .         .         .           g.123745
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.         .         .         .         .         .           g.123805
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