collagen, type XI, alpha 1 (COL11A1) - 4702 nt intron 31 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.129419
gtaaaacagcttgatatttatagtttattaacatttcgtgaagataatattaatcactta  c.2556+60

         .         .         .         .         .         .  g.129479
tgattaccttacaatttgtaacatctctatattatcatgagtacttaaaaataatttcac  c.2556+120

         .         .         .         .         .         .  g.129539
aaggaaaatcatagagtgtgtggacgcctggagtgcagggagctcaaagagcttaggtga  c.2556+180

         .         .         .         .         .         .  g.129599
ttatggattgcagtattttaggagaaggaatcatgaaacgaaggcataatcggtaattct  c.2556+240

         .         .         .         .         .         .  g.129659
ttgtaattggaacaagaaatatcctagtatatctggaagttttaacatggaagacatttg  c.2556+300

         .         .         .         .         .         .  g.129719
atgcataacggcttttgatttcctttctattatcctaagggtttaaattaccacttgagt  c.2556+360

         .         .         .         .         .         .  g.129779
ttttaaaattaatacacctttcacactattaccctcatttccatgagtattttttttcca  c.2556+420

         .         .         .         .         .         .  g.129839
gggttgctatgacaaatctccacaaacgtattaacttaaaacaacagaaattcactgcct  c.2556+480

         .         .         .         .         .         .  g.129899
tacagttctggaggacagaagtatgaaatcatggtgtcatagggccatgctccctccaga  c.2556+540

         .         .         .         .         .         .  g.129959
gtttctagtaaagaatctgtccttgcctctcccagcttctggtggccccaggcattcctt  c.2556+600

         .         .         .         .         .         .  g.130019
ggcttgtgacttcatgactccaatctctgttcccttcttaactggccttttttctgtgtg  c.2556+660

         .         .         .         .         .         .  g.130079
tcttattctcttctgtctcttgtaagaacactcgccattggatttagggaccacctaggc  c.2556+720

         .         .         .         .         .         .  g.130139
aatccaggtggatcccatttccttaatttaatagcatttggcaagacttttttttctttt  c.2556+780

         .         .         .         .         .         .  g.130199
ccaagtaaggtaacattcacagattccatagatttgtatatggatataaattttcaggag  c.2556+840

         .         .         .         .         .         .  g.130259
ccaccattcaattcgctgcatcactcaaatctcatttttggctatttgaaatatacatgt  c.2556+900

         .         .         .         .         .         .  g.130319
tttaagcataaaaaatatggttttcaaaatgcatatttacctcggtgtactaatttttct  c.2556+960

         .         .         .         .         .         .  g.130379
caaacctatcataaaactttgttaaggatgcacttgatgcattcagtagttaagtgaatg  c.2556+1020

         .         .         .         .         .         .  g.130439
cacttgatgcattcagtagttaagcctgttaagtgaattaatatataaatgttgattatt  c.2556+1080

         .         .         .         .         .         .  g.130499
aattacagaatggttatgatacaggagggagacagagaagtgcgggatagtttcagtttt  c.2556+1140

         .         .         .         .         .         .  g.130559
atcattcttttagttatatgtacatgagattatatcaatctatcagtttattgagtttga  c.2556+1200

         .         .         .         .         .         .  g.130619
cccattcaggcataacagaaacaataggtatggcaaatcctgtttctgtaacattcttaa  c.2556+1260

         .         .         .         .         .         .  g.130679
acgtgtgtctattcataagtttcacatgtaattatgggagacaaaaatatccttctccct  c.2556+1320

         .         .         .         .         .         .  g.130739
gaatatgtaaactgcatgtcattgtgttccctcattgccacgtgataacactgtcttagg  c.2556+1380

         .         .         .         .         .         .  g.130799
cttgctatacagctttgtcttacaattttttcattgagtttccccaaaaatacttccttg  c.2556+1440

         .         .         .         .         .         .  g.130859
agtagcaggggataaatataatgcttttgaacccttctaaaataagatttacggcatctg  c.2556+1500

         .         .         .         .         .         .  g.130919
tgatttaaaaataatacaggcataatttaaatattttctggctgtactcaggacactgat  c.2556+1560

         .         .         .         .         .         .  g.130979
taatactttttatcatttaaatattatctctaatatactgctctgtctcccagttagctt  c.2556+1620

         .         .         .         .         .         .  g.131039
cctttcaaatgtcaagcattttcacaaatattatcagtaaaagaagccattcactgcata  c.2556+1680

         .         .         .         .         .         .  g.131099
atccaggacctcaagctatccttacatcacttcatgcattcttgatctatttattaagtt  c.2556+1740

         .         .         .         .         .         .  g.131159
aaattgcaattgttttgttttgatttaaaaatataggaatctgtcacaatattacatgaa  c.2556+1800

         .         .         .         .         .         .  g.131219
tgagtagaattttattttatgaatttatttaaaatcccgttttttccctaagttctctga  c.2556+1860

         .         .         .         .         .         .  g.131279
tcaataatctttgaattgtttttattaacaaaatgcaacagaataacaacagaaatgttt  c.2556+1920

         .         .         .         .         .         .  g.131339
cctcctagaggtatccaacattttttaatccttttactgaaatgtctggaattttattct  c.2556+1980

         .         .         .         .         .         .  g.131399
ttatttcttcatattgcttctcttcataactcatttattatttctatgatcaaaaagctt  c.2556+2040

         .         .         .         .         .         .  g.131459
taaagtttctctgttctaaaatgaaaaactgggacatcaaaaatgaaaaactgggacatc  c.2556+2100

         .         .         .         .         .         .  g.131519
caaaatgaaagatagcttcgtattttttcctatgtgtaagctgatgaattttgaataaat  c.2556+2160

         .         .         .         .         .         .  g.131579
ttaaattttttttttactaaaatgaaatgcctttaccagtctctttcaagcagattaagg  c.2556+2220

         .         .         .         .         .         .  g.131639
cctgtaatttgacatcttattaattgcttagtagcaatataaaccataaaggtattaaaa  c.2556+2280

         .         .         .         .         .         .  g.131699
agatgtagcaccacatgtgctataaaatgatagctgtttctaaaataaaatctattttaa  c.2556+2340

         .   g.131710
ggtaggatacc  c.2556+2351

--------------------- middle of intron ---------------------
                                    g.131711      .           g.131721
                                    c.2557-2351  tttatatttca  c.2557-2341

.         .         .         .         .         .           g.131781
gacagcattttaaaaatttcacatttttagtttcacatttattgactgagccaatttcac  c.2557-2281

.         .         .         .         .         .           g.131841
aattaatctttgactttatggcctttgtgtgtttccatataaaaacgggtaatactgttt  c.2557-2221

.         .         .         .         .         .           g.131901
catagaaattatatattttggtgataattccttatatgggaagcaaaaaataacatttcc  c.2557-2161

.         .         .         .         .         .           g.131961
atatattcaactgattaattgggtaggttggtcatttttctgtgttttctatcaatttcc  c.2557-2101

.         .         .         .         .         .           g.132021
tagagtagaaactctacgtaagtatatacatttatgaaaaacaaaattggtgcataatat  c.2557-2041

.         .         .         .         .         .           g.132081
ctctttgcttaaatgaagtatctataaatatgctgttacctcttctagtcaggacagaac  c.2557-1981

.         .         .         .         .         .           g.132141
tgaatatttgtcccccccctcaaaatttttattttcatactgtattataatcatttgtcc  c.2557-1921

.         .         .         .         .         .           g.132201
aattcctgtaatagtcacatagtaatactgtgctagacgtagctaactgattctgtgtag  c.2557-1861

.         .         .         .         .         .           g.132261
agaaagaaaagagattttgaaagctcttcaaaatgtaatgtgcagagatttttttcccca  c.2557-1801

.         .         .         .         .         .           g.132321
gtacgtgaatattacacatcctaataattgttctcaggttgatcacaagttagctgtata  c.2557-1741

.         .         .         .         .         .           g.132381
ggcatgtattgaaacatacaggaaaacatgttataaaaaacagcttagcagtgcatcctt  c.2557-1681

.         .         .         .         .         .           g.132441
caggttattattttgactatcagctgccatagggcatcacatacaattttattgacctgc  c.2557-1621

.         .         .         .         .         .           g.132501
tttaatagcatcatgtaggaaatacaaattgctagcatcttaccttcctgataagtgtgt  c.2557-1561

.         .         .         .         .         .           g.132561
aatattcactgctttcaaattgggaatagggccaaatagttacctcctgtgagtaggtaa  c.2557-1501

.         .         .         .         .         .           g.132621
tactctacacctggctattccaactgtacatgcctgagaatacagcttcaagacttctaa  c.2557-1441

.         .         .         .         .         .           g.132681
gatttcacagtacatgtgaccccgagaggttggtaaaaattcagattcctggacctcact  c.2557-1381

.         .         .         .         .         .           g.132741
gccagagagtctgtttcagtttcagtagatgtggagtgtgccttagcaatccatattttt  c.2557-1321

.         .         .         .         .         .           g.132801
agcaactactctagattattctgatacagaggagccatgtatcacttggagaaacattat  c.2557-1261

.         .         .         .         .         .           g.132861
ttttaggggtatttcaatgcaagtgagtggattaaaaaaagaaaggtgtattcaagtcaa  c.2557-1201

.         .         .         .         .         .           g.132921
acaaggctttgttatatttcccttaatatatggggaagtttgtaaaatttgatgtctagt  c.2557-1141

.         .         .         .         .         .           g.132981
attctcacagaggctagacattttacgtattattgcacttaatccatacagtgatctaaa  c.2557-1081

.         .         .         .         .         .           g.133041
caggaaaactctccacttcttccttttcagggtctcataattaacaagttgagcagcaag  c.2557-1021

.         .         .         .         .         .           g.133101
gatgtgaacactaatcttctctattttatgatacagtgatgagggaagctaatcacaatc  c.2557-961

.         .         .         .         .         .           g.133161
atgatcaactaaatgagaagataaaaatttagatatatgtgcaagatcatatgggaaatt  c.2557-901

.         .         .         .         .         .           g.133221
tggttattggggattatattgtattccatctgtaaaatgtggccatttgtaaatgaaata  c.2557-841

.         .         .         .         .         .           g.133281
gtgtttttataaacatttcattttaaaataattattaattatacattattattattttta  c.2557-781

.         .         .         .         .         .           g.133341
taccaagcattctttttttcagtcccacaaatttcaaattacctgtaaggtgtgtattac  c.2557-721

.         .         .         .         .         .           g.133401
tgccctcactttgcagaagaaaaatctatacttgatgcgcataagtaatgtaccaaactt  c.2557-661

.         .         .         .         .         .           g.133461
acttagctgatacatttagctgatgcataactaacataaatctcaaaattatgtcttcag  c.2557-601

.         .         .         .         .         .           g.133521
aattctaaaaaacagagttttaatgcttgggtgcctgaaatagactttcagctagatata  c.2557-541

.         .         .         .         .         .           g.133581
gttgtattcaaataccaaatcgaaaaagtggaggaaggtttttagtctatgaattgatcc  c.2557-481

.         .         .         .         .         .           g.133641
agttttaaaagtgtaaaaatactcaactcaaaagtggtaactatagacatatgataatat  c.2557-421

.         .         .         .         .         .           g.133701
taattcaggaaaaacattttctaaaattcctattttaatatttgactattcctgtttgtg  c.2557-361

.         .         .         .         .         .           g.133761
aaaataggatttttctttagagttgaagcaaatacaaagaattttacattgcaatacatt  c.2557-301

.         .         .         .         .         .           g.133821
ttctataaaatgtcctataattactgttttataacaagagatgaaataatacttgattaa  c.2557-241

.         .         .         .         .         .           g.133881
ttcatttactcagaaggttaaaaactaaaatgttttatcaatttgtgctttcaatgcttc  c.2557-181

.         .         .         .         .         .           g.133941
caggatttcagatgtcattgtaagttcattttcaattacttcgatgatatcttaaaattt  c.2557-121

.         .         .         .         .         .           g.134001
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