collagen, type XI, alpha 1 (COL11A1) - 4626 nt intron 49 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.193246
gtaaatatgttagtgacacacagtttgaaacagcatgaattaagaactgtaataatattg  c.3762+60

         .         .         .         .         .         .  g.193306
ggtagtagtttaagtgcttctagtatgtgtgtttctaagccttttacatagttatatgat  c.3762+120

         .         .         .         .         .         .  g.193366
tcacatgtcatctagtagttgcaaaaattaaagttaaaatgattttgcaatattgtgttt  c.3762+180

         .         .         .         .         .         .  g.193426
tggttgccaattattatattgaatgagtgcaggcattatgttctttaagcaggaacctca  c.3762+240

         .         .         .         .         .         .  g.193486
caattacggtgtccttaatatccacatttataagctgagaaagctgagccctagaggatt  c.3762+300

         .         .         .         .         .         .  g.193546
cctgtaatttcatcaaagattttccttagaaagtgactaagctaggatacactgcagtcc  c.3762+360

         .         .         .         .         .         .  g.193606
atgaatgtctagtaatagtactcaaaatagaagagattggttgatgtaactgacttaaag  c.3762+420

         .         .         .         .         .         .  g.193666
ggaaaaaggaatcctgcaagccacaaaggaatgaatcattcattttgttatattttgagt  c.3762+480

         .         .         .         .         .         .  g.193726
tatattttcattacgaatactctgacctatccttgtcacttgtcaaaatatttggcatga  c.3762+540

         .         .         .         .         .         .  g.193786
accacaatatctgggctcagaatagctttttttttcttgtgaacatgatttcatttaaag  c.3762+600

         .         .         .         .         .         .  g.193846
gtctgctcttccttttataaaaatgtcaaaatgattcattgatttcttatttatgcattc  c.3762+660

         .         .         .         .         .         .  g.193906
atgctcacttcttaatagaattttcaagaaaattatcatggatatttgcgtgctttaaaa  c.3762+720

         .         .         .         .         .         .  g.193966
aataaactaccaattttcagaaagggaagaattatatttataacatcatatattatgcag  c.3762+780

         .         .         .         .         .         .  g.194026
tgaaaacactaaaaaattccttaatatgctacttgttaaaggatatctgcagtgtagact  c.3762+840

         .         .         .         .         .         .  g.194086
tactctattcttaaaaatgatttcctttcttggtctcaagttttttgtgtattttatatt  c.3762+900

         .         .         .         .         .         .  g.194146
atatttaaatttatttcttttaattaaagcatttaattctcagaaaaatgtaataagatt  c.3762+960

         .         .         .         .         .         .  g.194206
agattgttattatattttgatatctacttcagcttgacacctgtattctagtattttgat  c.3762+1020

         .         .         .         .         .         .  g.194266
tataatcattatttgattaagataatttttaactcattagataaatcttactgcattctt  c.3762+1080

         .         .         .         .         .         .  g.194326
tgattgactgccttttttaatatattcttaaatttaaagttgtgtgttgaaactgttcca  c.3762+1140

         .         .         .         .         .         .  g.194386
gtagttggtgttgaaactgaaaacacacttttcattccattcagttgtcctagaaaacat  c.3762+1200

         .         .         .         .         .         .  g.194446
ttttcatcttgcttagtctcctatgggagagcacttgtctctgaggatatcatcagatta  c.3762+1260

         .         .         .         .         .         .  g.194506
gacaaaaggcaccaaggcacacaccttttcctcttctctttgcatcatctccttttggct  c.3762+1320

         .         .         .         .         .         .  g.194566
ctaatgctgactcaattgttgtgggagctagtctctaggattattagcttttatcggctt  c.3762+1380

         .         .         .         .         .         .  g.194626
atcttgtttcctaaagaatttgaatgcagagggaaagttgtcattatttcagtgctactc  c.3762+1440

         .         .         .         .         .         .  g.194686
ttgaaaataggcatgaatgccaggtgtttagttctgagaaacttccttccacattgtttc  c.3762+1500

         .         .         .         .         .         .  g.194746
catttaatttaaagcctatgtatattatagtaacactttgccaactttgactcttatgag  c.3762+1560

         .         .         .         .         .         .  g.194806
aataattcagtcaatctgaatcattttgaatcaatcccagtcaaaatgagttacactaaa  c.3762+1620

         .         .         .         .         .         .  g.194866
aaacacagttttaattttgctcctttcttttgatttttttttatgtgacagcacgataga  c.3762+1680

         .         .         .         .         .         .  g.194926
agcagaattctaaccttcatttttttgtttgtttgtttgttttttgttgttgttgatgtt  c.3762+1740

         .         .         .         .         .         .  g.194986
ttttaatcaagaatagtataatttctaatagattacaaatttctaacatcagctttgatt  c.3762+1800

         .         .         .         .         .         .  g.195046
ctggctgaatgtatacccatttctaattggaaaatttatttccagtcactgacaatgaag  c.3762+1860

         .         .         .         .         .         .  g.195106
aataaaaaaaccagtatcttttagtcacattgcattttgtctaaatatatttaacctgtt  c.3762+1920

         .         .         .         .         .         .  g.195166
cttcatgtactgtaaaattgctataaataacttttgcacttcactaattttgtcaatact  c.3762+1980

         .         .         .         .         .         .  g.195226
tggaaatatgtcaggatattttcttaagatttatacatattttataactttgtacataca  c.3762+2040

         .         .         .         .         .         .  g.195286
gagtaatttgttgttctttctgaaaaaatatgtacctaaacaagtgctttatataatgag  c.3762+2100

         .         .         .         .         .         .  g.195346
gtaaatagttacacgataagtgatgaagacttcataatctaacatctccttcatatatca  c.3762+2160

         .         .         .         .         .         .  g.195406
gtgctctatcataaaacatattaattattattcttcagaatgaatagtttgtagcatttt  c.3762+2220

         .         .         .         .         .         .  g.195466
ggtattagaaatatagacttaatttatataacattagtcttgttgcaatgatttattgat  c.3762+2280

         .         .         .     g.195499
ttgtgattttgtcccacctttcttttaaatgaa  c.3762+2313

--------------------- middle of intron ---------------------
              g.195500        .         .         .           g.195532
              c.3763-2313  acattttagataaattttaaatttcattttagc  c.3763-2281

.         .         .         .         .         .           g.195592
taattgtcattttacattgtgcacacttggatctaacatactaaatggtagttttcatat  c.3763-2221

.         .         .         .         .         .           g.195652
attttggacaaatgaatattaatatattattctaaaaatgaaactttgtagtaaaaagct  c.3763-2161

.         .         .         .         .         .           g.195712
catactttttttgaagcagaatatattttaaattttttatcacctcaagcatttatcatt  c.3763-2101

.         .         .         .         .         .           g.195772
agaaagcacatacataaattctaagattatttaaacctatctttttaccacatatcattt  c.3763-2041

.         .         .         .         .         .           g.195832
cactcatttaataaaaagaaaataatcttttcacaatatccataaatttaactttatagt  c.3763-1981

.         .         .         .         .         .           g.195892
tgataagaacgaaaagagaacaacaaaacatatagagggttactacgaaatatttcaact  c.3763-1921

.         .         .         .         .         .           g.195952
atttcttctgcatttctaactttctgtgatgttaccatgaattaatgtggtacataagaa  c.3763-1861

.         .         .         .         .         .           g.196012
aacattttggttatttcttttgctgtgcagaagctttttagtttaattaaatctcatttg  c.3763-1801

.         .         .         .         .         .           g.196072
tctagttgggggtttcttttgcctgtgcttttgaggtcttagtcatgaattatttgccta  c.3763-1741

.         .         .         .         .         .           g.196132
gaccaatgtccagaagagttttccctatgttttcttttagtatttttatagtttcaggtc  c.3763-1681

.         .         .         .         .         .           g.196192
ttatgtttaaattcttgaatccttcttgagttgatttttgtatatggtaagagataggag  c.3763-1621

.         .         .         .         .         .           g.196252
tctagtttaattcttctgcttaaggcaaatcagatttctcagcaccatttattgaaaaga  c.3763-1561

.         .         .         .         .         .           g.196312
ggatcttttcctttttgtttttgtcaactttgtcaaagattagtttgctgtaaatatgct  c.3763-1501

.         .         .         .         .         .           g.196372
tttttagttactacagccttgtagttgaatttgaagtcaggtagtgtgatgcctccagtt  c.3763-1441

.         .         .         .         .         .           g.196432
ttgttctttttgcttaagattgctttggcaataagactctttttttggtttcctgtgaat  c.3763-1381

.         .         .         .         .         .           g.196492
tttaggttttttttctaattatatgaaaaatggcatgttcaatgtacatgctcaatagac  c.3763-1321

.         .         .         .         .         .           g.196552
ttatcatatttctaaataaatattttaacatggacattttacaattgatttcaatgccaa  c.3763-1261

.         .         .         .         .         .           g.196612
actacttgtttcatttttaagatatgaatatcagcccttggaaacatcactaacatcatt  c.3763-1201

.         .         .         .         .         .           g.196672
acattctactgagatgaatgatacctctctttataaataatataaatgcaattttttttt  c.3763-1141

.         .         .         .         .         .           g.196732
gtaagagttatccaaaaattctggaagtatttgctgttcatcttgagagatgaaataatt  c.3763-1081

.         .         .         .         .         .           g.196792
tacacatcacactacttataataaactctggaaaagtacttgatgtctccaccattaagt  c.3763-1021

.         .         .         .         .         .           g.196852
gggtaatttaagaatttaaaatatttgtgtattctcacagtaagaaactatgtacacaaa  c.3763-961

.         .         .         .         .         .           g.196912
atagtctctgccctgaaattatgtttgtatgtaatatgacacatttatttaagagcagtg  c.3763-901

.         .         .         .         .         .           g.196972
gatttgtgtcaggaatattggaaatattagagttaaaaagtaagggaaatttaggcctca  c.3763-841

.         .         .         .         .         .           g.197032
cttctttttcaatttaaaagaacaatttccacctcacaattgctgagaccactagtgtga  c.3763-781

.         .         .         .         .         .           g.197092
ctgattttgagtggaaacatggtaaatgaatgtattgttttacttaaatgattacttgaa  c.3763-721

.         .         .         .         .         .           g.197152
caagatgttatatttttgtgcattttgaattgtggggcattagcaacagactttcatagc  c.3763-661

.         .         .         .         .         .           g.197212
taaaccctactagttacagagatttatttattagtccactgggctagaaaaaaagccatt  c.3763-601

.         .         .         .         .         .           g.197272
catatgtaaacagggagataataaaggctatcacatttatgtgtatactcaaatggagca  c.3763-541

.         .         .         .         .         .           g.197332
attttaattaacgtctaagtacctttacatatattataattattgtctttcctctaagtt  c.3763-481

.         .         .         .         .         .           g.197392
ctttagattcctactaaacaaatcctataaaatatcaacatatgtaccagcaagtcatct  c.3763-421

.         .         .         .         .         .           g.197452
gttgatttgttgtagttaagataaataaatttacattttagcaaacaacaatttgaaagt  c.3763-361

.         .         .         .         .         .           g.197512
gttcactcaataaactttattgtaatatgaatattgacacagtgcaaatacacaatattt  c.3763-301

.         .         .         .         .         .           g.197572
taggaaacatgcatatgtctgttatgatggttttgtggtaatctggattaatatgccaac  c.3763-241

.         .         .         .         .         .           g.197632
tattaaccaaccagtgacaactacagcatcaagcctgcatatttctgtctactcacctga  c.3763-181

.         .         .         .         .         .           g.197692
gaaataaaagcactggagtcactgatagaaaaatttatttttgttattaaagtttttcaa  c.3763-121

.         .         .         .         .         .           g.197752
tgccttttaaataatataaaaaaataagggctaatctaaaatgatatgataacatttgaa  c.3763-61

.         .         .         .         .         .           g.197812
ttttataaatgtaaaagatcatctctgtattctaatactaatttgatcttctctatatag  c.3763-1


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