collagen, type XI, alpha 1 (COL11A1) - 7620 nt intron 57 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.215432
gtgagtaagatcttttcagtcatttaaaaagtgagaatttctaaaacaaaattgtttatt  c.4302+60

         .         .         .         .         .         .  g.215492
agctagaatttttgacattttagtttataaataggtttgtattttttctaatagtccaag  c.4302+120

         .         .         .         .         .         .  g.215552
aagtatattattttgtcttagaggaaagtaatcctaactgataggtatatggaaaataaa  c.4302+180

         .         .         .         .         .         .  g.215612
ccacttgatcagaagatttgtttctttcttatgcactttggatgaaaaaatatttccact  c.4302+240

         .         .         .         .         .         .  g.215672
ctgaatgaaatgccactaatgatccagccagtgtttttcctagtctggatagttccctaa  c.4302+300

         .         .         .         .         .         .  g.215732
aacgtttgcagttacacttattttcctggcatttcactttaaaaagtatgctggcaccag  c.4302+360

         .         .         .         .         .         .  g.215792
catagagtgattctttgacgaaacaaattgttctcttcgtgagtcatacaggctgaaaca  c.4302+420

         .         .         .         .         .         .  g.215852
taaaacagtaaaactcagtgaaaaaagatatggctactgtaacactgaagcttggtcact  c.4302+480

         .         .         .         .         .         .  g.215912
atcattaaatctgtgtgcaaacaacatgcttgagaaatgcaataaagtattttgttgact  c.4302+540

         .         .         .         .         .         .  g.215972
gggatactattcataggtggagtttattataggatctgaggctatacttgatacaaattt  c.4302+600

         .         .         .         .         .         .  g.216032
gggcaaaaagtgagaataaaagacttgccctttaaaataattccttactaggtgacttag  c.4302+660

         .         .         .         .         .         .  g.216092
ttgctttatatatatatatatttttttttcttatggtagagatttttgagtgtcattatc  c.4302+720

         .         .         .         .         .         .  g.216152
cagtaatagttaagtgtggagtgattaatcaaaatggcaaatcatacatatagcactcgt  c.4302+780

         .         .         .         .         .         .  g.216212
atgtgtggtgagtattagttaagtcctgctatatggtattttaaaatttattcaaatgcc  c.4302+840

         .         .         .         .         .         .  g.216272
ttttatcataaatatattaattatctcagagatagaaacatacgcacaaagccatcacaa  c.4302+900

         .         .         .         .         .         .  g.216332
ctgggattcacagttcattcaggaaaaattttggttattccttttaacaaagatgccaca  c.4302+960

         .         .         .         .         .         .  g.216392
gcatctttggtatgcaaagcatacctaccaaatatttcataagttttaaagagattattt  c.4302+1020

         .         .         .         .         .         .  g.216452
aaactttcactgaagaatttaaagatcacttatttagtaactagataaaagttatcaaat  c.4302+1080

         .         .         .         .         .         .  g.216512
tttggtagatttcaagcaggagatgatcagttctgcccattatctcatcagcttaggaaa  c.4302+1140

         .         .         .         .         .         .  g.216572
agggccccggttgaagcaggatcagctccacatctgtaccattacttatgaatattctcc  c.4302+1200

         .         .         .         .         .         .  g.216632
ttagatatgataaactcataactgcccagagtcagagcctggaaggaaaaaataccttgc  c.4302+1260

         .         .         .         .         .         .  g.216692
cttaatgtcactctaaaatttgccagagattttttcttgttatttcagattttccggtaa  c.4302+1320

         .         .         .         .         .         .  g.216752
atattttgacctttctgcagatgaaataaaaagcaccatgctggagatttccttcagcta  c.4302+1380

         .         .         .         .         .         .  g.216812
atattaaaaataaaaccttctgacataccacctgatttggcatacaaacttttgtatttt  c.4302+1440

         .         .         .         .         .         .  g.216872
tgtcttttaaataaatgtgagtttacagcgcaagaggacagaataatttccaaatccttt  c.4302+1500

         .         .         .         .         .         .  g.216932
aggtaaagcggaatgataaacatcagaagtgggctgcatgggcacattccattctgactg  c.4302+1560

         .         .         .         .         .         .  g.216992
cttgttttatggcgagtacttacgatgtgaatataatgtgtagttttttcatagctttaa  c.4302+1620

         .         .         .         .         .         .  g.217052
ttagtcttgacttgtgatatgtaatctcaatgaaaatgctacttggtcttcatgaggtga  c.4302+1680

         .         .         .         .         .         .  g.217112
ggatgggcagataaatcatcttcaaaatgccatttatggcaatttaatgagcctttcaac  c.4302+1740

         .         .         .         .         .         .  g.217172
tcaactaagaaagatctattttagtaggtaatttttaaatcagaatgagaagtaacttat  c.4302+1800

         .         .         .         .         .         .  g.217232
tatggttactagttaaggttatcgactctagagccaaactcctgggttcagaaacaatca  c.4302+1860

         .         .         .         .         .         .  g.217292
ctaccacttacttggtggatgactttaggaacattaccttttttttttttttggctttaa  c.4302+1920

         .         .         .         .         .         .  g.217352
gttcttcatttataaaatgggaatattgctagcctctatccagtgatatttctaaagttt  c.4302+1980

         .         .         .         .         .         .  g.217412
aagtgagttcaattgggatatggatatcttctaccccatggggttcttaagttaattaaa  c.4302+2040

         .         .         .         .         .         .  g.217472
tgaattgcttgtaaatcacttttatatcaacaattagcactagtagcaccaaatcaagaa  c.4302+2100

         .         .         .         .         .         .  g.217532
tcattaaatgaatgaaataatgataaatatgttgaaaaccaatcaattttatattcttag  c.4302+2160

         .         .         .         .         .         .  g.217592
tggaaagtaactaaatttgacctcattcatgcatgtgtgtcatcaataaaccttatgcaa  c.4302+2220

         .         .         .         .         .         .  g.217652
gttgttgactattaaagcaaatggaagagatcaacaagtacaattatacttagaaaagtt  c.4302+2280

         .         .         .         .         .         .  g.217712
agagtgttaacatgttaagtactatgatagactcaagcagaggatactagatatacacag  c.4302+2340

         .         .         .         .         .         .  g.217772
agttggaccatttaaatgtaatttcctctagggacccttccctgtttagaaatatgatac  c.4302+2400

         .         .         .         .         .         .  g.217832
gattattaaagaaggaacagagaggtgtaagtgtggataacacagtggctgtgagattaa  c.4302+2460

         .         .         .         .         .         .  g.217892
cgagatttggaaattcatagaggtttctattaatctctgaaattaatctgtgtgaaagct  c.4302+2520

         .         .         .         .         .         .  g.217952
ataataataatactttctccatgatgaattttttcctcattataacatatattcacatcc  c.4302+2580

         .         .         .         .         .         .  g.218012
atatccaaatctacacaggcttcaatttgcttatcattggagttccacaagtacctattg  c.4302+2640

         .         .         .         .         .         .  g.218072
ggtctcttttccccttctagaagctgcctgtaactacctactgtattgtttctactggtg  c.4302+2700

         .         .         .         .         .         .  g.218132
agataaagctaccaagacattccccttttccccaccttttaaatacaacctagctgttca  c.4302+2760

         .         .         .         .         .         .  g.218192
gtaagtacaacttacctactttcatctctccagattggcagctacctatttagacaattg  c.4302+2820

         .         .         .         .         .         .  g.218252
aaatatctaacagagcatccattagacacatagataagtttaacaattttataggaagtt  c.4302+2880

         .         .         .         .         .         .  g.218312
tctggatatgaaattctttggggtagagtaaaacaaactgattttttaaactcttaaaat  c.4302+2940

         .         .         .         .         .         .  g.218372
gatttctgcttggtgtctgcccacactatgttatcagctctactagagtcagatgtgata  c.4302+3000

         .         .         .         .         .         .  g.218432
tagtatttattttttacttgaaaaagtacatatttcacatggtaaaaaacttgtttataa  c.4302+3060

         .         .         .         .         .         .  g.218492
acatgaattcaacatatatttacatttgtatatgtgtataggtgtacacacacacactca  c.4302+3120

         .         .         .         .         .         .  g.218552
cacacactacaaatgtgtacttagatcaccgtatggaactgaagattgacaaatagcaca  c.4302+3180

         .         .         .         .         .         .  g.218612
taagggttgggcatggtggctcacgcctgtaatcccagctactcgggaggctgaggtggg  c.4302+3240

         .         .         .         .         .         .  g.218672
agaatagcttgaacctgggaggcggaggtttcagtaagccaagatcacaccattgcactc  c.4302+3300

         .         .         .         .         .         .  g.218732
cagcctgggtgactgagcgagactctgtttcaaaaataaaaaagataaatagcacatatg  c.4302+3360

         .         .         .         .         .         .  g.218792
gaagctaatcaaaagctaaggatgatgatcagcctatataaataactctattggagtttg  c.4302+3420

         .         .         .         .         .         .  g.218852
tttttttaagtgggactctgctagagtcggtataatataattttattagggtttcttaaa  c.4302+3480

         .         .         .         .         .         .  g.218912
ggatttttaaaattttcattagaattttgtattggttgaattatactactattttagtag  c.4302+3540

         .         .         .         .         .         .  g.218972
tcaaccaacattaaatgggaataagactgaatgtttcagtatttatttattgagacagag  c.4302+3600

         .         .         .         .         .         .  g.219032
tctcactctatcaccggggctggagtgcagtggcacaatcacgagtcactacaaccttgt  c.4302+3660

         .         .         .         .         .         .  g.219092
ccttctaggcttaggtgatcctcccgcctcagcctctcggttagctggggctgcaggttt  c.4302+3720

         .         .         .         .         .         .  g.219152
gtgccactgcaccaggctaatttttgtcatttttagtacagataggtttttgacagttgc  c.4302+3780

         .         .         .  g.219182
ccaggctgctcttggactccagggctcaag  c.4302+3810

--------------------- middle of intron ---------------------
                 g.219183     .         .         .           g.219212
                 c.4303-3810  cgatccatccacctctgtctcccaaagtgc  c.4303-3781

.         .         .         .         .         .           g.219272
tgggattacaggcgtgagccaccaagcctggccaattgagtgttttaaagagaagaatga  c.4303-3721

.         .         .         .         .         .           g.219332
agatgtctaaattctaccctctgatacaaagtcaaaattaaaatgatttagtcactttta  c.4303-3661

.         .         .         .         .         .           g.219392
aaactaaaatgtatttgattttttgaagtcagaattaacatctgtcttagctttaaggtt  c.4303-3601

.         .         .         .         .         .           g.219452
ttattttgttttgttttgtattcttttaagactctatttgttttaatgcagctgaaaaat  c.4303-3541

.         .         .         .         .         .           g.219512
tattcagcatttatgttcaaaaaagattatttagtattatcacacatttctgcttttgat  c.4303-3481

.         .         .         .         .         .           g.219572
aacaaaatgttaaataaaatatctgatagcattattttttaaacaataaaaacttaaaag  c.4303-3421

.         .         .         .         .         .           g.219632
ataggatgggatactgaattagagtttatttctttaatcctacatttaagttatctgtag  c.4303-3361

.         .         .         .         .         .           g.219692
acaagggtgatatgggtagcattccacaatgattaaaaaggtttaaataaaaaagcattt  c.4303-3301

.         .         .         .         .         .           g.219752
gcttttcaccagattaaatattattccacaattttatattttaaataaagtgtaggatct  c.4303-3241

.         .         .         .         .         .           g.219812
gcagtttctttaaatttcaatgaactagagttttgaaatgcagatcaaagcaaatattcc  c.4303-3181

.         .         .         .         .         .           g.219872
agaaagtataatactgcaggggaaaatgtttgcttgtgtattctagacacttaagaatgt  c.4303-3121

.         .         .         .         .         .           g.219932
atcatccctgttttccttttcactttattacttatgaattatgtatttccctgggggttt  c.4303-3061

.         .         .         .         .         .           g.219992
tcaatttacaatatccgaaagagaaaaatagaaaatatgtatagttagaataacattttt  c.4303-3001

.         .         .         .         .         .           g.220052
atatgcagagttgatgtttttgatctgtttcaggttcaaagggttatttataactgctct  c.4303-2941

.         .         .         .         .         .           g.220112
cgatatcataccaatttctatttccagctgatgaaaataaaaactgattttgtttggcaa  c.4303-2881

.         .         .         .         .         .           g.220172
actcatctttagatgtagtttataatgttaagagagattattagcttagataaattaata  c.4303-2821

.         .         .         .         .         .           g.220232
ttcattatctttaacttcatgaataatatttatggaaaggatttttaatgcatttaaaac  c.4303-2761

.         .         .         .         .         .           g.220292
acaaataatgtctaatatatttttcactaagcttgagcaattagaatcactagtagttct  c.4303-2701

.         .         .         .         .         .           g.220352
tttcttgccattttagctttttctattagaatgggatgagaaagttgacaggtatttatc  c.4303-2641

.         .         .         .         .         .           g.220412
tgtagcatatctaaaactaatgataataattcaaatttatattatgcttcactgtttata  c.4303-2581

.         .         .         .         .         .           g.220472
caatttttactatggagagcaaagccccagtaatggggagataactatatacttgaaagt  c.4303-2521

.         .         .         .         .         .           g.220532
gaatttgacaatttcattgtggtctttttgtctgagatttaacagggcaggatgattgtt  c.4303-2461

.         .         .         .         .         .           g.220592
tattcttatacaaaagagaatgtaactaaattcatataaatttgactctgaggattagta  c.4303-2401

.         .         .         .         .         .           g.220652
attttctccttattagaagattattattaagcatatctacacttaaaactgcatgtgctt  c.4303-2341

.         .         .         .         .         .           g.220712
gtatgaaaataacttttgtctgttgttaattgaataatatagggaaattgtccactttaa  c.4303-2281

.         .         .         .         .         .           g.220772
tacttagagaattccaaattcagttatgaattaaaaaacataagtatacctaataatagt  c.4303-2221

.         .         .         .         .         .           g.220832
ctaaaataccattgttacacaagggctaatttatattaacactattcttgctctttcctg  c.4303-2161

.         .         .         .         .         .           g.220892
atattcacagttttggtttgagaagcaggcttcagaaactaaagaatagggagggcccat  c.4303-2101

.         .         .         .         .         .           g.220952
cctcattcatgcagcagctctatgagataggaattgtagtccccagcttgtagatgagaa  c.4303-2041

.         .         .         .         .         .           g.221012
aactgaagctctatttgtccaattaatttaagtagctaagaagagagtttggtatctatg  c.4303-1981

.         .         .         .         .         .           g.221072
ccagaccttatctattctgaacccatacttttcctagtacatcatactgcttggatcaga  c.4303-1921

.         .         .         .         .         .           g.221132
tccatagttcttaaggctttaaattcacaaaaattatggaccaggatataatgtgctgtt  c.4303-1861

.         .         .         .         .         .           g.221192
ttacactgaagaaatagtgtttccagatagaggaaaatattactcatggtagccttgtag  c.4303-1801

.         .         .         .         .         .           g.221252
aagatacaatagtggtgactcatgatgtactttggtaaaaagttaaaacaatttgctgtc  c.4303-1741

.         .         .         .         .         .           g.221312
atagagccatgatgaaaattattactgaaattataattgagctaattgaattctatcaaa  c.4303-1681

.         .         .         .         .         .           g.221372
ataattctaattcatagagaaaccatatgaacagtttgcttttgttgctgggtgccttag  c.4303-1621

.         .         .         .         .         .           g.221432
gacttgcggcaagcagtagtgacatagtgacatatctaggttatcgtggccctaatttca  c.4303-1561

.         .         .         .         .         .           g.221492
taagtcacatataaatcatttttttagcatcagtttcacttccaacagcatctgttgcct  c.4303-1501

.         .         .         .         .         .           g.221552
gcgtagtttcacttgtataatttcacaaggactgtattttgtgttgtcttcaaaattgta  c.4303-1441

.         .         .         .         .         .           g.221612
gtacaacaatttggcttgttagtgtggtgtgtttttgtgttttgttttgtttactttctc  c.4303-1381

.         .         .         .         .         .           g.221672
tagcgacagggtgttcctctgtcacccatgcaggagtgcagtggtgtgatcttagctcac  c.4303-1321

.         .         .         .         .         .           g.221732
cgaagcctcaaactcatgggttcaagtgaccctcctcccttagcctctcaagtagctggg  c.4303-1261

.         .         .         .         .         .           g.221792
acagcaggtgcacaccaccaattattctagtttttgcttttttttttttttttgtagaca  c.4303-1201

.         .         .         .         .         .           g.221852
aaatgtctcactgtgttacccaggctggttgcaaattcctaggttcaagcggtcctccca  c.4303-1141

.         .         .         .         .         .           g.221912
cctcaggctctcaaattgctaggattacaggtgtgagccattgtgcctggcctagagtac  c.4303-1081

.         .         .         .         .         .           g.221972
aacaatttatagataaaacagtttgttcgaaagtcatcagtatgaaaatttccttgggcg  c.4303-1021

.         .         .         .         .         .           g.222032
ggggggcaggacagagttggttgctaaagtcatgccataattttcatagaatgtaagtta  c.4303-961

.         .         .         .         .         .           g.222092
aaaggataaatgtcttagtctgggactattaaaaacgttaaattattgaaatagaagtat  c.4303-901

.         .         .         .         .         .           g.222152
atttatataaaaaataaatttctttattaatttcataaatcatttagatatgaggtgcaa  c.4303-841

.         .         .         .         .         .           g.222212
tttagaaattacagctgaaagtaccatcttgatgtagtttgtaacgtcttatactttagc  c.4303-781

.         .         .         .         .         .           g.222272
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.         .         .         .         .         .           g.222332
tattgggattattaagtattcgtagtatatgtctctctccagtaatcatagtgaaggaca  c.4303-661

.         .         .         .         .         .           g.222392
tctgatttcaagagaacaaagaataagaattgagatcagaattcagaaaattggccatgg  c.4303-601

.         .         .         .         .         .           g.222452
cctagaagaattacagagttccatgttttaatttagtatatataggaattatcttcttat  c.4303-541

.         .         .         .         .         .           g.222512
tctatagaatattattaggcaaccattctaacatatacaaatagaggttgttatttaaat  c.4303-481

.         .         .         .         .         .           g.222572
acaaaccaaacagtgtattaaaattttgtctattttttttcctgtggttatcaaagatct  c.4303-421

.         .         .         .         .         .           g.222632
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.         .         .         .         .         .           g.222692
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.         .         .         .         .         .           g.222752
ccaaaactagtgtacttaaaaattgacactttattcttaactgaaaagccatataaccat  c.4303-241

.         .         .         .         .         .           g.222812
gttctatttctaactttacattcatttaatcaaaattatcaatattatggttacaaatta  c.4303-181

.         .         .         .         .         .           g.222872
aaccatagtgttttaaatatataaatttacttagaagccttaaaaataaagcaacattaa  c.4303-121

.         .         .         .         .         .           g.222932
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.         .         .         .         .         .           g.222992
attctctaattcatacctactctgtttttgttttggggttttttttttgttattatttag  c.4303-1


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