collagen, type XI, alpha 1 (COL11A1) - upstream reference sequence


              g.1             .         .         .             g.38
              c.-5318 aatcagatctatttcaatatttaaccatatttgccggc    c.-5281

.         .         .         .         .         .             g.98
cttaaatcttgtatttggcatttgttgtggaatgtataagactcatataaaaataacaga    c.-5221

.         .         .         .         .         .             g.158
aatattgcatatgtttcagaaaagtatctggtgtgagtcttcagatttttgatgcagatg    c.-5161

.         .         .         .         .         .             g.218
catttggtttcagacttaaatgattaggtgcgaatggtggaggcataaaacaattacata    c.-5101

.         .         .         .         .         .             g.278
cgatcactagaaataatattcacttcaagtcaagaatactgtcaaatggtatcagggtgg    c.-5041

.         .         .         .         .         .             g.338
atcaatctgtgaagaaatgatagaggtgagaaagaggatcctacttattttagaaataat    c.-4981

.         .         .         .         .         .             g.398
gtaatgatgtatttggtatcttgttgccttttgttatttataaagtaatgtcaaaggaaa    c.-4921

.         .         .         .         .         .             g.458
attagtggtacattctcatttaactatgaaaattaaatttaaaaaattatgaaattgtta    c.-4861

.         .         .         .         .         .             g.518
tgaataaattcttaaattatccctttaaagatgctaacatctctaccttcagcaaactta    c.-4801

.         .         .         .         .         .             g.578
ttttgttaggaataaccaatgtggatcaagtcaatactactcaagtgatagttggaacac    c.-4741

.         .         .         .         .         .             g.638
tatagaaagtaaaatatcttggttatacattagtagtgttgtggtacacttcctttagtt    c.-4681

.         .         .         .         .         .             g.698
aaccatttagaaaatggtttactaaaacatgtaaaatccattcttccacatctaataata    c.-4621

.         .         .         .         .         .             g.758
gaggtattcctgctgccctacacaacttggtaaaaagccatgttacattttttgctgaca    c.-4561

.         .         .         .         .         .             g.818
cacattcccaggatgccctaagagcttagtaaatgccaaatgcattcatttgagaaaaaa    c.-4501

.         .         .         .         .         .             g.878
agagatacagagagtaaaggtatgttgacaaaagtccaaaatatatctaagtttttacct    c.-4441

.         .         .         .         .         .             g.938
tgaattactccattctctgtttcttccttctatctttgattggaaaattatgaaaaggaa    c.-4381

.         .         .         .         .         .             g.998
ctctgatagcttcctgtgaatatagctaactaaaatatctttttaacagaaataacatga    c.-4321

.         .         .         .         .         .             g.1058
acatacaaggccatattccttgtttgtttggtgttcatttagatccaattttattttagg    c.-4261

.         .         .         .         .         .             g.1118
tccttttaaacaggatacatctgtcatctctgagatgtctctttcaacactccaacagaa    c.-4201

.         .         .         .         .         .             g.1178
gaaggtaaaaatcttcttcatctgaagatattgttgtataatggaaattgggctaaattt    c.-4141

.         .         .         .         .         .             g.1238
ggattcctctaatgttctataagttatttcagagtaatgttgccaaaaattacccaaccc    c.-4081

.         .         .         .         .         .             g.1298
ttactgtaaggtttttgtgagctaggctagactatggaaataaatttctctgtccctctt    c.-4021

.         .         .         .         .         .             g.1358
ccaccaccacgctacaatacaatggcccatctgtgaggtcagagagactaactttacttt    c.-3961

.         .         .         .         .         .             g.1418
taaacagagactaatttctagccactcatgtattagaaaaactataaaatgaatgtcaga    c.-3901

.         .         .         .         .         .             g.1478
ctgcttagtcatttccttctcaaaataattgacctaaagtttagaaaagggcaagaaagg    c.-3841

.         .         .         .         .         .             g.1538
caaacctttaggcacagtaagagagggattacatgcaaaagcaattttgttttaaacatt    c.-3781

.         .         .         .         .         .             g.1598
ttaagtatttctggtgtgtgcaagagccctcaccccataatttctcattcaacaaatcat    c.-3721

.         .         .         .         .         .             g.1658
atttgatgatataattttaattaaagtaaaatgtttagagaaaatacctaatttatatct    c.-3661

.         .         .         .         .         .             g.1718
atctatctatctatctatctatctatctatatcaaaaatagggggatgaaacatcagtat    c.-3601

.         .         .         .         .         .             g.1778
gagaaaaggggaatacatgccaagtgacttaaaagatgatgcactgtttataaaatcgtg    c.-3541

.         .         .         .         .         .             g.1838
ttacctaatatacttcttctttcccctaattctagctgtagtaatttaaggattgttata    c.-3481

.         .         .         .         .         .             g.1898
gagttctgtcaatattttaatactatttgtattaggggcatccagctattgtcaaggtgt    c.-3421

.         .         .         .         .         .             g.1958
cttcagtctccctttggttgtagaggtcttaatgtttcaaacactggttctgagtccagc    c.-3361

.         .         .         .         .         .             g.2018
tcccctgattcctagagatttgtgaagatgtgaaggatggtttatgagctttttacaatg    c.-3301

.         .         .         .         .         .             g.2078
tttcataaagttctgtgggctctgaagattgtttagaactttaagtttccttactttgac    c.-3241

.         .         .         .         .         .             g.2138
ctcccaatccattgtcgaattattatctcagtttctctgacaagccaatatggacgaatg    c.-3181

.         .         .         .         .         .             g.2198
gttaatttaaaatgctgctacagaaaaattactattttttctctacttttcaaatcctgt    c.-3121

.         .         .         .         .         .             g.2258
ttttgaaaatcttgccaataataactaattctacaaagctgaaaaaataactttaaacat    c.-3061

.         .         .         .         .         .             g.2318
cattatttgtaaatgtgacaaaataggaaaatatcaccgattgtgcttcaaactaaagac    c.-3001

.         .         .         .         .         .             g.2378
ttatgtcaggaaaactgcctgttttattatattttgaatctacacgtaaacaattagcaa    c.-2941

.         .         .         .         .         .             g.2438
ggactggttgaaagatggcccaggaaatgatgccattggaagttcccctgtgtgaagttg    c.-2881

.         .         .         .         .         .             g.2498
aagttagctaaggtgcctctcttctggctttcccctgctcccattgttgtttagtattat    c.-2821

.         .         .         .         .         .             g.2558
cctttctttcactgagttaatctcctgtaaatccatgggctggttcctagggaggctcta    c.-2761

.         .         .         .         .         .             g.2618
gatctggcatctagcaacagactacagggcttagatataattattcctcaccatgaattt    c.-2701

.         .         .         .         .         .             g.2678
gctatgtttccttctagaggcattcattgagacccagattatgcctagctgggcagtggc    c.-2641

.         .         .         .         .         .             g.2738
cagaggaattcagaccacaacgtacagagagcataaggtggtaataactctattcaccca    c.-2581

.         .         .         .         .         .             g.2798
agatgctttgcctgaaaggaccctttcacagcagtgagaaggtctgagttgtgaccagaa    c.-2521

.         .         .         .         .         .             g.2858
agtagggactgctagattgactgcatcatttctcaccttctagaacagtatcaggcccca    c.-2461

.         .         .         .         .         .             g.2918
gaactctcaataaatttgagagctattaagagacaatttggaacaccatttgtacatgtt    c.-2401

.         .         .         .         .         .             g.2978
gctacaagcaccgtaactctctctggctattgaattgatttagaattctggcagcttcac    c.-2341

.         .         .         .         .         .             g.3038
aaatacgtatttctaaacttgcattcatttcactattttacatttgagagaagatgtaaa    c.-2281

.         .         .         .         .         .             g.3098
aagtaatttttaaaatatctgaagagtcgacagaaaaatcagtttgtacacaagtttgga    c.-2221

.         .         .         .         .         .             g.3158
aacagccaatatatacaaattttccatctgtgagacgatgagggataatgaagatggtaa    c.-2161

.         .         .         .         .         .             g.3218
atacatatatttttactgtaagggtcttaatttgtaattgtgcatttcaggttcaaatgc    c.-2101

.         .         .         .         .         .             g.3278
aatatgatattaaattattttaaccaacagtttaaggttgtaatctgaagaactagttga    c.-2041

.         .         .         .         .         .             g.3338
tgatatttctctgcagctgatatgaggcatcccaaacattctgccaacagcattacaaat    c.-1981

.         .         .         .         .         .             g.3398
gtcaagtatttttttacctgtgatctaagagatagcttcttgataaaggagtagttcttt    c.-1921

.         .         .         .         .         .             g.3458
gttatggagagtgatatttatattgaaggtattttctagttgctttcttcagtttatatg    c.-1861

.         .         .         .         .         .             g.3518
tctctgttcatgctgttatacccctataagggctcaatctagtctttgatcacctttctt    c.-1801

.         .         .         .         .         .             g.3578
ccaattttaaactgcatgaagagatttgatgtaatctgatagatcatgaggcatattttg    c.-1741

.         .         .         .         .         .             g.3638
atgactaatagaaaactgagttcctaaagattagtggcagctgtagaattgaacatatgt    c.-1681

.         .         .         .         .         .             g.3698
acccagtaaacttagttgagggcctttaagcatttaaatgacttaaatactcaaagtagg    c.-1621

.         .         .         .         .         .             g.3758
ccctggccaatgcttctagtctttgtcaacagaaaaatgtgttcattcatccaacccatc    c.-1561

.         .         .         .         .         .             g.3818
tctattgagtggctaatgtatgctggcaccctgatgggcactgttccagaaaatctttga    c.-1501

.         .         .         .         .         .             g.3878
gagaaacatcttaggaattattaacgaacaaaaaggagtcaatagaatggaatgatttta    c.-1441

.         .         .         .         .         .             g.3938
acgtggaaaaagtgacttgggaatctatattccaggtgtaagaggattactttgaggatg    c.-1381

.         .         .         .         .         .             g.3998
ggttaagtagagagggaatttagaaacctgccctcttcattactctcactgtggagtgac    c.-1321

.         .         .         .         .         .             g.4058
cacgtttttggctcccgaggctgagggccagggccaggcccttaatgaggagctgtgggc    c.-1261

.         .         .         .         .         .             g.4118
cgagcctcttggagatttctgctagttgctttcctcgccttttctacacactcctcagta    c.-1201

.         .         .         .         .         .             g.4178
ccccctcatccaggatcagaacagaatcagctggaaaattaaattactcaccctcttaat    c.-1141

.         .         .         .         .         .             g.4238
gtcagctcccataaattttttcctccttctccctcagagtacagttcaactcttttaaga    c.-1081

.         .         .         .         .         .             g.4298
ggaaagccactgaatgaacctagtgctgaatttaaacgtttaagagataaacctgtcagt    c.-1021

.         .         .         .         .         .             g.4358
ttcagatctccaaagaggacttccctacatgctctaggttttgacttctagggtccctcc    c.-961

.         .         .         .         .         .             g.4418
attctatcttcattcctttcttctaattattgggttaaaaaaataaaaataaaaacactt    c.-901

.         .         .         .         .         .             g.4478
ttcagagtaggcagcgcaatgagtccactggttccacgtctgccatacgaagcagatttt    c.-841

.         .         .         .         .         .             g.4538
tgcacaaggataaggttaccgctgccagcccaggactccagcggtgtggccgatcaggcg    c.-781

.         .         .         .         .         .             g.4598
ctggcctcctcccctctcccgccgaccagcgagaggctaacagacgggtgcaagtagaca    c.-721

.         .         .         .         .         .             g.4658
agtagctgtttttattgaatacagaagctccttgaaaactccgtgtgctccggggctctc    c.-661

.         .         .         .         .         .             g.4718
ctgcaattcctttcattcccaaagtgctggagccaagcacgcgtcccccgtaactccctc    c.-601

.         .         .         .         .         .             g.4778
ccattttttctcggggatttggtaggcgaggagggaggagaggagtggggagatgggggg    c.-541

.         .         .         .         .         .             g.4838
tggttggtgggctgggcctgctcggagtcctcattcttgggctgagggaggcgggggcgg    c.-481

.         .         .         .         .         .             g.4898
gcttggggccgccccagagtcgtgtgattgggtctgaccctcagcctgcttgtcagtttc    c.-421

.         .         .         .         .         .             g.4958
gccctgggagggggagctgggagcagggaggggagtgggcggaggagggggctgcccgga    c.-361

.         .         .         .         .            .          g.5018
gccactcgtccagcccactgacggcatgaagcctttaggggc \ acacagtactctcagctt c.-301


Powered by LOVD v.3.0 Build 27
©2004-2021 Leiden University Medical Center