collagen, type XI, alpha 1 (COL11A1) - 3933 nt intron 02 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.30752
gtatattcactttattattattattgttattattactaaaagttattacacttttgttac  c.274+60

         .         .         .         .         .         .  g.30812
tactaaaactacttttagtatttctttactaattagtatttttatcaggttagataatgt  c.274+120

         .         .         .         .         .         .  g.30872
gcaattatatggtaaaatgcaattctttcttatatcagacaccaaataccttgtggtcac  c.274+180

         .         .         .         .         .         .  g.30932
caaagtaatgtaatgaaaataacaaaaaatttgataattgccagtcttaattcaacacaa  c.274+240

         .         .         .         .         .         .  g.30992
tcacatttctgtgaaaatattcttatttgaacatttagtacttcattatttgtacataat  c.274+300

         .         .         .         .         .         .  g.31052
atatggagacaacattttatatctagcctatttctacttgtaattaggtagagcttattc  c.274+360

         .         .         .         .         .         .  g.31112
atcgtgactggggtataggagggaatctttccccttaatgactttctaagttaatttaat  c.274+420

         .         .         .         .         .         .  g.31172
gggcatttgaatgtaaacatacttagtgcatgttttcctaacattaaggtaaatgtttct  c.274+480

         .         .         .         .         .         .  g.31232
gttgaaagagatactttttctttgcaaataattttgcattattttttcatgccgctctta  c.274+540

         .         .         .         .         .         .  g.31292
tctaaaatataagaaaagttagtcacatctcacagttatccctcctgaaactagagattt  c.274+600

         .         .         .         .         .         .  g.31352
ttttaaaatatcagctggcagtttttcataatggtactgaaaagtacttgctgaatattt  c.274+660

         .         .         .         .         .         .  g.31412
gtttttccttccatgagagcactaattgacctaataacactaattatctagaaatcatga  c.274+720

         .         .         .         .         .         .  g.31472
taatgtggagaaagggaattgagtggtgaaatgacaattttcgagcctcatattttcaaa  c.274+780

         .         .         .         .         .         .  g.31532
gcaggtaacttgttaactgtgcttgcctccatttgatacataccagttatctattgattg  c.274+840

         .         .         .         .         .         .  g.31592
gtcagttgatgggtgttctcatccttatttaacagaggaggaaactgaatttcacagagg  c.274+900

         .         .         .         .         .         .  g.31652
ctctctgacttgaccaagttatgtgcagtcaatatttaatctaggtctgttctgctctat  c.274+960

         .         .         .         .         .         .  g.31712
atattttatatgtcatcaaatggtcctttctggcactttgggatcttctcagcagcaatt  c.274+1020

         .         .         .         .         .         .  g.31772
tatcatttaaattcttcatattatcctatattatctctgcttgaggaaatttgagtttcc  c.274+1080

         .         .         .         .         .         .  g.31832
tatcttcatatgaaactgttttctaacaagagaaaacaagtataaatcaagggattaaaa  c.274+1140

         .         .         .         .         .         .  g.31892
cattacaaaacagcacagtacacttttcatagaaggacattttaaaatatattgaaatac  c.274+1200

         .         .         .         .         .         .  g.31952
atttattttgattgttcactgattcttccaatatattttctgttttgcaatactttgtgg  c.274+1260

         .         .         .         .         .         .  g.32012
tgaacaagaacaaactgaaaatataaagaataaaatgaactttttttctgactttgaaaa  c.274+1320

         .         .         .         .         .         .  g.32072
taaaaaagttaaagtgattattaaatccataaaacattttaaaaatagatttaaaaaaat  c.274+1380

         .         .         .         .         .         .  g.32132
taaaagtaaaaaggtaagctgctttttctatttatgtgcactctgctgcatttcctaaag  c.274+1440

         .         .         .         .         .         .  g.32192
catccttaatagaaaaagggatgggaattttgaagagagtaaaacaaagaaaaatatacc  c.274+1500

         .         .         .         .         .         .  g.32252
aattaaaaacctttagaactactcagattacaggttacaatttttatactttagctcatt  c.274+1560

         .         .         .         .         .         .  g.32312
atctcagggtcagtgtgttctgcattccaatgtggtagttacttaaaatcattaatttta  c.274+1620

         .         .         .         .         .         .  g.32372
tataactaattttaaatactatatatttaagtgataagagccatataatcaacattatct  c.274+1680

         .         .         .         .         .         .  g.32432
gactgctttctttatgatacagtctcatataatttccacaatagttccatgggacagatt  c.274+1740

         .         .         .         .         .         .  g.32492
aaattattagcccagccaatggatgggaagggcaagtaggattttatttgccaagaacac  c.274+1800

         .         .         .         .         .         .  g.32552
atagctaggagatggtgggttgattccatatattggctattatgaataatattgcaataa  c.274+1860

         .         .         .         .         .         .  g.32612
atattggactgcagatatcccttcaacatcctgatgtcatttacttgggacatataccca  c.274+1920

         .         .         .         .         g.32659
gtagtagggttgatggataatataacataggagtgcaggtatctctt  c.274+1967

--------------------- middle of intron ---------------------
  g.32660           .         .         .         .           g.32705
  c.275-1966  tgacatactgattgcatttcctttgtatgtatactcagtagtgcga  c.275-1921

.         .         .         .         .         .           g.32765
ttgatggcactagctctaattttttgaggaaattttttactattttctatatggctgtat  c.275-1861

.         .         .         .         .         .           g.32825
taatttacattttcaccaatagtatgaaacagttcctttttctctacatctgcaccaaca  c.275-1801

.         .         .         .         .         .           g.32885
cttatcttttgactttttgatagttgccattcatactggagtggggtaatagctcattgc  c.275-1741

.         .         .         .         .         .           g.32945
agttttgatttacatattcctaatgattaacgatgttgagcatttttttcatatacccgt  c.275-1681

.         .         .         .         .         .           g.33005
tagccatttgtatgtcttcttcaagatatgtttattcagacatcttgtccatttttaatt  c.275-1621

.         .         .         .         .         .           g.33065
ggattacttgtttttttctattgagttgtttgagttccttacatgtttttaatattaacc  c.275-1561

.         .         .         .         .         .           g.33125
ccttatcagatgtatagtttgcaaatattttctcctgttctaaaggttgtctcttcactt  c.275-1501

.         .         .         .         .         .           g.33185
tgttaattttttcttttgctttgtaaatactttttagttaaatgtaatcctatttggatg  c.275-1441

.         .         .         .         .         .           g.33245
tggtagggctgggatttgagccaaatgatctgacaagattcagaactttcaattgagata  c.275-1381

.         .         .         .         .         .           g.33305
ctgtactgtcttccacttaactagtctatgcatacatttatagcataaaaatgtattcat  c.275-1321

.         .         .         .         .         .           g.33365
gcctcttgctgttttttcttttgtaatatgttttaataatttccacttcataaaacatct  c.275-1261

.         .         .         .         .         .           g.33425
ttctgctacattaagtggctgcatacgattctattacataccatacatatttgtatttta  c.275-1201

.         .         .         .         .         .           g.33485
tttaatcagtttcaatcattgcagcttattataaaattttattattataaatagtacttt  c.275-1141

.         .         .         .         .         .           g.33545
ggtgatttgaaagtacaatacatttacacataagcatcctctccccatacattcttagaa  c.275-1081

.         .         .         .         .         .           g.33605
gtagaattgctgatctcctacaattgtttgaacttgaatccaagccagacataatcatat  c.275-1021

.         .         .         .         .         .           g.33665
ttcttttatagatttatactactgcctgtaatagaatttggaatgaatggattgaaaaag  c.275-961

.         .         .         .         .         .           g.33725
gaaggccttgatattaggctagatattgttgattacacatgcacatacacaatggttttg  c.275-901

.         .         .         .         .         .           g.33785
caaaaagacaacttttcaactaaaggcatctcatttctcaaataataatgcttgctttat  c.275-841

.         .         .         .         .         .           g.33845
ttatatgccagagtagtaagaggctcaaataagatatatttgtaaaactattttgaaaaa  c.275-781

.         .         .         .         .         .           g.33905
taaaacccgcaacttaatatacattgttttataaaaatataagtactcattacttaatta  c.275-721

.         .         .         .         .         .           g.33965
tttgagatatacttagggtaattgtttaactgatatatttatataacagatgcttagtaa  c.275-661

.         .         .         .         .         .           g.34025
ggaccaatgtagatcagactgtatgctagatatttggcatatgattgagagagagaagaa  c.275-601

.         .         .         .         .         .           g.34085
aagaaaaagagtctgccttcttgaatttaaaatcaagttagccaattacctaatagttct  c.275-541

.         .         .         .         .         .           g.34145
ggctcataatgacatatgcttctttaataagaagcaatatacagtgaaactgcattgttt  c.275-481

.         .         .         .         .         .           g.34205
gatattaagaactaatcgaaaactcttaagcttttaaagaaacaacagaaagaatacgtt  c.275-421

.         .         .         .         .         .           g.34265
tgtaaattgggtcattacaatgcctctttaaagtgggcatgtatggctacggactagaca  c.275-361

.         .         .         .         .         .           g.34325
aagacaaaaaatacaaactttaggccaaaattagcacttaaataaatgttttaagagtgg  c.275-301

.         .         .         .         .         .           g.34385
tggttatgtgtttgatatttactggtatcataatcctgttgcctaaaccaaatttaattt  c.275-241

.         .         .         .         .         .           g.34445
cacataaacattgtgctttaagtactttaagtgagtgtctttaaagtttgactatagctt  c.275-181

.         .         .         .         .         .           g.34505
ggataaaaattgaagagaaaccttaatggaggacccctatttatttattaatctgtttac  c.275-121

.         .         .         .         .         .           g.34565
tattcaaagttagttgatttataaaggccatgtagaaatttcaaaaataccacagtgatc  c.275-61

.         .         .         .         .         .           g.34625
taggaataaagtagaaattggaaattggaaatttctaactctttggccttttcttctcag  c.275-1


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