collagen, type XI, alpha 1 (COL11A1) - 5163 nt intron 05 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.82441
gtgaggagcacaagaccagagaaggtcttcgtatttcagtgatatggacatcgcagtgca  c.780+60

         .         .         .         .         .         .  g.82501
gtttttgaacttatacttatttattccattttaattaagctatgctttgtattttaattg  c.780+120

         .         .         .         .         .         .  g.82561
tgttgtaatatttccaggaaaaagtgacttgaatatatttggtacttgttttcttgctgt  c.780+180

         .         .         .         .         .         .  g.82621
ttaagcatttgattacataaatttattagcaataatggtgcttcacttgtatactgtgta  c.780+240

         .         .         .         .         .         .  g.82681
tatgcacatattccattttggagggggtgagaagaagataatatgtaatagcgatatttc  c.780+300

         .         .         .         .         .         .  g.82741
gaccattagcatttaaataattaacagcctcaagatagaataacatattttctggtgtac  c.780+360

         .         .         .         .         .         .  g.82801
atgccatctccctaggcctttggcaatgcatacaaatgagaaagtgacattagaactatc  c.780+420

         .         .         .         .         .         .  g.82861
ttaaagttttcaggctgtgttgaacaattagagggtttttaaaaaaaattttctcatagg  c.780+480

         .         .         .         .         .         .  g.82921
aaaatttaaaagcatgtgaaatggaaggaatttaagcctcagttgggagcaaaactatat  c.780+540

         .         .         .         .         .         .  g.82981
ttttggattttttttttttggattttgaatttttaagacttagagttttaaaaaggaagt  c.780+600

         .         .         .         .         .         .  g.83041
agaaatttgaaaatatcaaaactgttctaaaaatgaatcaggtagtatttttcttccctt  c.780+660

         .         .         .         .         .         .  g.83101
ttaaatgtactattaggtgccaccatttgagttttactgtttacaatgggtcaaaatctt  c.780+720

         .         .         .         .         .         .  g.83161
ttatcttaattgttagttctgcatgtgaattcaggtcggatttttcactttcaatgctag  c.780+780

         .         .         .         .         .         .  g.83221
aagtatgtttttgacactactttactttttaaggtttaataatgaattctgttgcactga  c.780+840

         .         .         .         .         .         .  g.83281
tattttccatgacttaatgttagtttttgtttaaaaaacagggtaaaattttaagaacct  c.780+900

         .         .         .         .         .         .  g.83341
aacaggaaggcaaatatgagagtgtaaagataaattactgggatattttatttacctgtt  c.780+960

         .         .         .         .         .         .  g.83401
tcacagttatcatgtacttcattctttttattctctcatgattcaccaaatatgttttct  c.780+1020

         .         .         .         .         .         .  g.83461
gtgaattctgaagtgatagataaaataattatcaggtttagtgtttttatatctaagagg  c.780+1080

         .         .         .         .         .         .  g.83521
ttatgtgctgacttaatattaaaatttatagcatttactgtatattttcaaggttgatga  c.780+1140

         .         .         .         .         .         .  g.83581
gatctgttttgctcctttataaagaaagataaggcatattattctttttagcaacagata  c.780+1200

         .         .         .         .         .         .  g.83641
tggctctgatttttggaagaagggaggtttgcattcttaatatatcactttgaggtgttt  c.780+1260

         .         .         .         .         .         .  g.83701
tgttcccatgttgtaatgctattatgtcaggtaagctgttattttatcaaggtaatttgt  c.780+1320

         .         .         .         .         .         .  g.83761
atccatcttcttaagttcatttaaaaatgaacttgccatttactattttagttgttgaca  c.780+1380

         .         .         .         .         .         .  g.83821
tgtatatttaacattctgttgagatgtcaaacttggttttactagaagcatttgatgaga  c.780+1440

         .         .         .         .         .         .  g.83881
aaaacagcacattgttacagtagaaactgcatgacaatcttgttgggtaatgcaataata  c.780+1500

         .         .         .         .         .         .  g.83941
tatagcatttttacctttttttagattgagtaagtcataatgaaaaagttttttctttaa  c.780+1560

         .         .         .         .         .         .  g.84001
gaaagaattagctttcccttttttctctaactctaaattatgttgatccttcaataataa  c.780+1620

         .         .         .         .         .         .  g.84061
gataagcatctataccagcatcaaaaactacttaattgaattagtaagtagtgcttatat  c.780+1680

         .         .         .         .         .         .  g.84121
taattttaaactatatctattaatatgtcattatatgataacgcatataaataattcatc  c.780+1740

         .         .         .         .         .         .  g.84181
ttcagaagttctacctatataaattaataatgcaatgttggttgccaatgaataaagaac  c.780+1800

         .         .         .         .         .         .  g.84241
ataaagtgcaatatggagcatcagccatacatgtactttatattacttacttgttcacta  c.780+1860

         .         .         .         .         .         .  g.84301
ataaacttctggcattgcatgtttattattctaatttggattaataaatatgtcaattta  c.780+1920

         .         .         .         .         .         .  g.84361
ttttataagtcaaccgatatgcttttttcagcttataattttgtctacttagtatcctct  c.780+1980

         .         .         .         .         .         .  g.84421
aagtagcatatcctaatctattcttaagattcacattgttatatgcttgacataacttta  c.780+2040

         .         .         .         .         .         .  g.84481
caaccatcaccatggagaaagagatctataatgtagacagattttaatttaatcataata  c.780+2100

         .         .         .         .         .         .  g.84541
tcatcacattttaattttatttgaacctacacagtgccatttaaataggtgacaagctaa  c.780+2160

         .         .         .         .         .         .  g.84601
tattaaaattatgatggagttgggattttcttatcaagtgaaattatcttcctatcttat  c.780+2220

         .         .         .         .         .         .  g.84661
aaaaaattagatgttaaatctatatgattccttttgatattctttcttaaaaaaggatga  c.780+2280

         .         .         .         .         .         .  g.84721
aaacagaaaatgaagtgacaatcttttataaaggaatttacaaaacaattagcttttcaa  c.780+2340

         .         .         .         .         .         .  g.84781
aatatattatcttttcacttaatatgtatcatacattcattagatgcacaggtttttact  c.780+2400

         .         .         .         .         .         .  g.84841
gatgtcaccagttttcttacaaattatgtaagaacagacattatgacatttctggaagat  c.780+2460

         .         .         .         .         .         .  g.84901
cctttctcctaacctactctaatttctgttagaataccgacaaagttgaaattattccat  c.780+2520

         .         .         .         .         .         .  g.84961
tactgcctgtctttttgcatatatttgtctgattgattataactagttcttttttctcta  c.780+2580

    g.84963
ct  c.780+2582

--------------------- middle of intron ---------------------
                                               g.84964        g.84964
                                               c.781-2581  t  c.781-2581

.         .         .         .         .         .           g.85024
gtctcaagccatccttagaattccataatgaggggagagaattatctccaaaaatatgtt  c.781-2521

.         .         .         .         .         .           g.85084
atgaggctttacgtagcaatgtatatatattgcgaatatactaagcaatgtcttgagtat  c.781-2461

.         .         .         .         .         .           g.85144
attcatgaccaccacacggaggaagctgtgcagataaaggagaaccaggagtgaataagc  c.781-2401

.         .         .         .         .         .           g.85204
tctaaaagaaagatgtgccggctgggcgcagtgactcacgcctgtaatcccaacaatttg  c.781-2341

.         .         .         .         .         .           g.85264
ggaggccgaagcgggcggatcacctgaggtcaggagttcaagagcagcctggccaacttg  c.781-2281

.         .         .         .         .         .           g.85324
gtgaaaccctctctctactaaaaatgtttaaaaaattagccgggcatggtgtcaggcgcc  c.781-2221

.         .         .         .         .         .           g.85384
tgtaatcctagctactcaggaggctgaagcaagagaatcgcttgaacccgggaggtggag  c.781-2161

.         .         .         .         .         .           g.85444
gttgcagtgagccgagatcatgccacttgcactccagcctgggcgacagagcgcgactcc  c.781-2101

.         .         .         .         .         .           g.85504
atctcaaaaacaaaacaaaacaaaacaaaaaacaaacaaacaaaaaacagaaagatgtgc  c.781-2041

.         .         .         .         .         .           g.85564
tgtagtgtctagggcagttaacatgttatttcctccattatttcaaaaccagcctggtta  c.781-1981

.         .         .         .         .         .           g.85624
gtcaacatttggagagtttaaataaaggacagaattatgaaagttagaagataatttgtc  c.781-1921

.         .         .         .         .         .           g.85684
ctataagagaaaaaatgatataaaattgactactttggtacaggtctgtatatatccttg  c.781-1861

.         .         .         .         .         .           g.85744
aatagcagatttcaattaaaatacgtttaagttgtccaggtttaaaattggccctttatg  c.781-1801

.         .         .         .         .         .           g.85804
catttacttattgtttttgtaattcataactcctcttaagctactagagcttattattag  c.781-1741

.         .         .         .         .         .           g.85864
aaggcactgtgatcacaattttctaaaacatttgtggtcaacagttcttttgctggaaga  c.781-1681

.         .         .         .         .         .           g.85924
ttaaaagggaatggttaaaatgcaaagagagatccagttgagacataattggaatcgtat  c.781-1621

.         .         .         .         .         .           g.85984
caaatacactacttaaggaattatgtgtagattgcccctggaaaatatatattaagtata  c.781-1561

.         .         .         .         .         .           g.86044
catattatatgtattatcatatatgtttgccctaggcaattatatataaattgccccggc  c.781-1501

.         .         .         .         .         .           g.86104
atgcatgcatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatattaga  c.781-1441

.         .         .         .         .         .           g.86164
gttttaacttgttgagtttactgctttttatgctacatatgacttagtgtatttagttat  c.781-1381

.         .         .         .         .         .           g.86224
ttttattaaaaactgaatttaacttatgtttaataatatctatatcttgattgaaaatta  c.781-1321

.         .         .         .         .         .           g.86284
aaatttttataaagatattgagctttggatttgagcacactattttgctcattatttaat  c.781-1261

.         .         .         .         .         .           g.86344
atgtacaattgtcttttaactccctctattaagaaacatatctctccttaattaaaatct  c.781-1201

.         .         .         .         .         .           g.86404
tttaatacagaagaaattagtataaaatactatttccagtgtgaatttattataagtatt  c.781-1141

.         .         .         .         .         .           g.86464
ttaagaaagctaagtgttatgccttttttaatagagaaaaaggcagtgattttaaatatt  c.781-1081

.         .         .         .         .         .           g.86524
aaaattatgtattaattataagcacatctaattttgaatcttttaatgtctcacaaggat  c.781-1021

.         .         .         .         .         .           g.86584
tttgtgctctttttgatcttaggaaagtctaaaggaaattaggaatttcttaatacattt  c.781-961

.         .         .         .         .         .           g.86644
tagattttattttcccattggttacagtattttaatacagtatatacttatttcatattc  c.781-901

.         .         .         .         .         .           g.86704
tttgtattccctttccctcctcccctctttcccgtctctcaatagatatgaaaatccttt  c.781-841

.         .         .         .         .         .           g.86764
catacttaggaagactactctctacatttttatttttagatatgtagcttaatttaaaat  c.781-781

.         .         .         .         .         .           g.86824
tcccattgaaattactgtagcgctcttatagagaaacattgcatagcaatttttacaaat  c.781-721

.         .         .         .         .         .           g.86884
caaaattaatgaatatttgacatctatgtccaagtacataattactgtgtttcaattaac  c.781-661

.         .         .         .         .         .           g.86944
attccataattaagagtttgaattattattccaaattttttgttttctcgtgatactaac  c.781-601

.         .         .         .         .         .           g.87004
tactattctgctcataggaaatgtgctttgtcactcctatgttattatactctgtataag  c.781-541

.         .         .         .         .         .           g.87064
acagtataatacttctatgtaatacaaaaataactcatcaataacattaatttcttatct  c.781-481

.         .         .         .         .         .           g.87124
cttaacatttacactatgtaaaagttaagatggttctcactttgtgaatagtattttgcc  c.781-421

.         .         .         .         .         .           g.87184
actaacacaattgcctgatattttttcctttgcaatgtagtatgcaccagaggatataat  c.781-361

.         .         .         .         .         .           g.87244
cgaatatgactatgagtatggggaagcagagtataaagaggctgaaagtgtaacagaggg  c.781-301

.         .         .         .         .         .           g.87304
acccactgtaactgaggagacaatagcacagacggaggtaaaaacaaagcagtgcctgtg  c.781-241

.         .         .         .         .         .           g.87364
tatgtggtgtcctgctgttcgtcatcctgtggttccttatgttgactgttcctcaaactt  c.781-181

.         .         .         .         .         .           g.87424
accataaacctttcattcatcttatttctctgaaccaataactgtgatttttatttgaca  c.781-121

.         .         .         .         .         .           g.87484
gtagccgttttgaagaatgatgtccatttcacttttgcttagccttcctttcatctgtgc  c.781-61

.         .         .         .         .         .           g.87544
tctatatttccctcctcgtttatttatgttttccattccatctttcaccacattttacag  c.781-1


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