collagen, type XI, alpha 1 (COL11A1) - 3896 nt intron 14 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.101144
gtaggttaccccaacaaagataatatatgttaaaattttcaaattagcagttccctgtgc  c.1665+60

         .         .         .         .         .         .  g.101204
aacttcttccagggattgtgcatatctatggttggtgacaatagggtatgttttcatgct  c.1665+120

         .         .         .         .         .         .  g.101264
tgctgttgtttccattaaaaaaatccttctcaattcagttttctgtacattttgatcaaa  c.1665+180

         .         .         .         .         .         .  g.101324
aggtctcagtaaaaaattttaaattgaataaataaaattaaaaatgtaattgagtcatat  c.1665+240

         .         .         .         .         .         .  g.101384
ccaactattaatttcttaaactataagtatcattcatttgcctaatattcagcttccaaa  c.1665+300

         .         .         .         .         .         .  g.101444
attatgttttacattaaatccttgagccttaattttatattaaacaaaatgtttgttaaa  c.1665+360

         .         .         .         .         .         .  g.101504
aaagaaaaatttatttgaggccaatgaaaattatgacacaatcttagggcaagcaagata  c.1665+420

         .         .         .         .         .         .  g.101564
ctttttaaaccgcaggttgcctcagtattccacaaggtgcttcaactattagagagagta  c.1665+480

         .         .         .         .         .         .  g.101624
ttttctcttgtagaaattcttggaaataacaaagtattatttttttctcactagcgtgat  c.1665+540

         .         .         .         .         .         .  g.101684
agcaagctaagatatttcaaatatttttgtctaaaaaatcttcaaatacactagaatata  c.1665+600

         .         .         .         .         .         .  g.101744
ctaatgttaagtggtgtagcagttcacaggattcaaaccaggattctcattaattttaga  c.1665+660

         .         .         .         .         .         .  g.101804
atagatggataaataatttatattttaaatatttgttttttgtataaattttttctgcta  c.1665+720

         .         .         .         .         .         .  g.101864
tttacagaacgtattattctgaaagttaaaatcttatctgtattgtacatagtagacact  c.1665+780

         .         .         .         .         .         .  g.101924
tgcagcaaaactattgtattcaaatttaaatcaagtactttgccttctaattatttagtc  c.1665+840

         .         .         .         .         .         .  g.101984
tgttttactgattatattaggataatagtttttcttcatgtattttatcgaagattttat  c.1665+900

         .         .         .         .         .         .  g.102044
tatgtagatttccttatatttatatttaccataatttagtcataaaattttatatatatt  c.1665+960

         .         .         .         .         .         .  g.102104
ttgcaggaatatacattcaatcatataagctcacggggaacacatattctgatactatgt  c.1665+1020

         .         .         .         .         .         .  g.102164
ttcatagaatttaaattatataatttaacacattattaaatgtttatcatgtattttatc  c.1665+1080

         .         .         .         .         .         .  g.102224
atgctttgcctttccaaaatacagtaatatggcagattctatatcacttaaccaatgaaa  c.1665+1140

         .         .         .         .         .         .  g.102284
tagagttaatttttaattatttgttaatgactcaaatttacataacaggaaagtaagtag  c.1665+1200

         .         .         .         .         .         .  g.102344
tatgttagtgtattatgaaatttggggtcagaagaattaacctaggtattttattaaaaa  c.1665+1260

         .         .         .         .         .         .  g.102404
taaaactttctgggactctgaacttaagactgtaatgttgtagattcaggattggaacca  c.1665+1320

         .         .         .         .         .         .  g.102464
gcgactgtaattttaatacgtgcaccaggttgattcctatggccaaagatatttgagaaa  c.1665+1380

         .         .         .         .         .         .  g.102524
cagtgccatatttgatttaatttacaaatatcaggctgggcgcggtggctcgcacctgta  c.1665+1440

         .         .         .         .         .         .  g.102584
atcccagcactttgggaggccaaggcgggcggatcacctaaggttgggagttcgagacca  c.1665+1500

         .         .         .         .         .         .  g.102644
gcctgaccaacatggagaaaccccgtttctactaaaaatagaaaattcgccgggtgtggt  c.1665+1560

         .         .         .         .         .         .  g.102704
ggcacatgcctgtaatcccagctactcgggaggctgaggcaggagaatggcttgaacccg  c.1665+1620

         .         .         .         .         .         .  g.102764
ggatgtggaggttgctgtgagctgagattgtgccactgcactccagccttggcgacagag  c.1665+1680

         .         .         .         .         .         .  g.102824
ctagactccgtctcaaaaaaaaaaaaaaatttacaaatatcagtcctaggatatctaaaa  c.1665+1740

         .         .         .         .         .         .  g.102884
ctctattattcaaataaatttcatttattatcttgaaaaacacaaggaaatggattcata  c.1665+1800

         .         .         .         .         .         .  g.102944
gaggctaacggcagcaatgagcagaaacaagggaggcacattatattagcagttcttatt  c.1665+1860

         .         .         .         .         .         .  g.103004
ttcattaaacaaccattaagagccagccaattttccagagactgttggcaaagagaaaat  c.1665+1920

         .         .          g.103032
attgacacccataaacacattctcaaag  c.1665+1948

--------------------- middle of intron ---------------------
                   g.103033             .         .           g.103060
                   c.1666-1948  tcataggcaaaattaattaattttatct  c.1666-1921

.         .         .         .         .         .           g.103120
acttatcactttgatatgaaagttttagcttccttaattattgaaggtaggtattgagag  c.1666-1861

.         .         .         .         .         .           g.103180
aaaaaaatcatattgtttctttttaccatttcaaaacatgcaaatttgatgtttgcatca  c.1666-1801

.         .         .         .         .         .           g.103240
aaacattaaattattagtcttccaaatatctcttaattctatagtctaaaaaagtattca  c.1666-1741

.         .         .         .         .         .           g.103300
ctagattaagatttagaaaagaaagtctacatcgatattttgacatctgtacatttttcc  c.1666-1681

.         .         .         .         .         .           g.103360
tatgaaaattattttaaccaattgtttacatctagttatctttatagacaaatggaggac  c.1666-1621

.         .         .         .         .         .           g.103420
tgtatcataaaacattcaggaagtgtagaaaatctgttttttccctattattttatagtc  c.1666-1561

.         .         .         .         .         .           g.103480
aatgactgtgtgacattttttagaataaatgttggagcaaaagaattataatctgttgag  c.1666-1501

.         .         .         .         .         .           g.103540
taggtagtgcttatatacagagaatgtaatacagtcgattaattaaaaatagtccattct  c.1666-1441

.         .         .         .         .         .           g.103600
ataattgcataattgcattcaattcagtgattaataatctgatttaatgtagaaccccag  c.1666-1381

.         .         .         .         .         .           g.103660
tttttttcttgcagaagtttatttgcaataattcttcattggaagcttgaaagtcattat  c.1666-1321

.         .         .         .         .         .           g.103720
tctcttaattttaaagattagaaaattcatgttacttgactttttgtattttgtgggcat  c.1666-1261

.         .         .         .         .         .           g.103780
cgttaatatttcttttactttggagtcaccaggagactataaattgctaccatttttcag  c.1666-1201

.         .         .         .         .         .           g.103840
atttagcataatttaaatctctgtcatactttatacgatgtagtatttaatggaatgtgt  c.1666-1141

.         .         .         .         .         .           g.103900
atggatttaaataaattagaatcttttagaacacacagtatttcagcatgaagtaactat  c.1666-1081

.         .         .         .         .         .           g.103960
aatcaccatgtttatttttaatgttctgaaagtttttggggatatgtgttgcctagtgtt  c.1666-1021

.         .         .         .         .         .           g.104020
taattttaaacctcacaacttgtttataaagcaattttatgttttgtttatttattttag  c.1666-961

.         .         .         .         .         .           g.104080
tacacatgccaggttgttgttacaccttttacattttagttatttttatttatttatttt  c.1666-901

.         .         .         .         .         .           g.104140
ttgagatggagttttgctcttggcacctaggctggaatgcagtggtgctatcttggctct  c.1666-841

.         .         .         .         .         .           g.104200
ctgcaagctctgcctgtccgtttcaagcaattcttctgtctcagcctcctgagtagctgg  c.1666-781

.         .         .         .         .         .           g.104260
gattacaggcacccgatgccatgcccagccaatttttgtatttttagtagagacggagtt  c.1666-721

.         .         .         .         .         .           g.104320
tcactatattggccagtctggtctcgaactcctgacctcaggtgatctacctgccttggc  c.1666-661

.         .         .         .         .         .           g.104380
ctcccaaagtgctgggattacaggcgtgagccaccatgcctggtcaccttcttaattatg  c.1666-601

.         .         .         .         .         .           g.104440
taaatgtatttaagagatgtttgttatacagacttattctcatgggaaaaaacaaaccaa  c.1666-541

.         .         .         .         .         .           g.104500
cctgggaaaaatgtgttaacactatttcacggcaattataatagtatcaataacaccagg  c.1666-481

.         .         .         .         .         .           g.104560
ttcttgccattttattatcatacaattcagagtctaaaaaaatctgaatataaaagcagt  c.1666-421

.         .         .         .         .         .           g.104620
aacattttgtcaagtccttacagtataaatggattacatgtatatctgatttggtaataa  c.1666-361

.         .         .         .         .         .           g.104680
tgggttactctactactacatcacagtgtagtcataaataatgctttgtgtgtcatcata  c.1666-301

.         .         .         .         .         .           g.104740
tgagttctgatagtgcacacacaaaagacaatttcaatgtgatttcatgaggttagcttc  c.1666-241

.         .         .         .         .         .           g.104800
tgtgtagtgctacataaaatatagacctttattgctcacaaattggaatgtaatcaacat  c.1666-181

.         .         .         .         .         .           g.104860
tgagaagagatatatttcaatgcaagtgctggaaaattttactgtgttaattaataagtt  c.1666-121

.         .         .         .         .         .           g.104920
aatgctaatatgattaaatatattttgaataatgtttaattatttcaggtgcaattggca  c.1666-61

.         .         .         .         .         .           g.104980
ggataaaagtagttaggaaattgctaaattaagtgaaatatcttcactttttctctatag  c.1666-1


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