collagen, type XI, alpha 1 (COL11A1) - 3441 nt intron 30 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.125924
gttggtaaatgactttaaattcactggtactcttgcagctgatgtttcattatcatttaa  c.2538+60

         .         .         .         .         .         .  g.125984
atttctttcaataactggtgtcagaaattgagttcttactacattaaagataaaatgttt  c.2538+120

         .         .         .         .         .         .  g.126044
cattatcattttaaatttgcaaccattacatttacgtttcagtgtaatattaggcaacat  c.2538+180

         .         .         .         .         .         .  g.126104
taaaatttgcctccagaaagtatttagtgacaccttaaattttctataatgtactgtgaa  c.2538+240

         .         .         .         .         .         .  g.126164
gttaaatttaaaaaaaaaaaagcaagaaatgtctatgacaagtgttatcacattatatac  c.2538+300

         .         .         .         .         .         .  g.126224
actaaagcaaaatataatatcttatggatagaattaaaatgattccttttctttcatata  c.2538+360

         .         .         .         .         .         .  g.126284
catacatatatatatatatcctacatgtatatgtctatattaaatagggaattctgttaa  c.2538+420

         .         .         .         .         .         .  g.126344
attcctattaaatactcctaagaggtataattatgagatgaacacttcttttgtcacttc  c.2538+480

         .         .         .         .         .         .  g.126404
tccttattttctagtcttctatgccctcctcggccatgtggaatcagctactcttagagt  c.2538+540

         .         .         .         .         .         .  g.126464
tcttccacattagatgttgagaattaaaggatgtgtgattaaaggatgaaagaatcaatg  c.2538+600

         .         .         .         .         .         .  g.126524
aaagaggttctacttaaggttttacaccaagtagaatcatcttttattttttccacttaa  c.2538+660

         .         .         .         .         .         .  g.126584
acatgcatttcacataataagtctattaaaaaatactggtattcaggcccaacttcaaga  c.2538+720

         .         .         .         .         .         .  g.126644
gattttaattttaatctgggcttgacacaatatcaatatgttttaaaacatccccagata  c.2538+780

         .         .         .         .         .         .  g.126704
attatcatattcattgtttgagagacacggggcattatgtgttgcgtcaaaaagatttgc  c.2538+840

         .         .         .         .         .         .  g.126764
aaccattacatttatatttcaatataatattaggcaacattgaaatttgacttcatgtta  c.2538+900

         .         .         .         .         .         .  g.126824
taatgtaataacatttgtctatgatgacaagcaagaactgtctatgacaagtgttattac  c.2538+960

         .         .         .         .         .         .  g.126884
attatatacactaaagcaaaatatcagtaatctcttgctggtataattcaaatgtttcct  c.2538+1020

         .         .         .         .         .         .  g.126944
tttctatatgtatatgtctatattttctacaacaaacattccataatttctttattttat  c.2538+1080

         .         .         .         .         .         .  g.127004
tttttactatactttaatgcacaacgtgcaggttagttacatatgtatacatgtgccatg  c.2538+1140

         .         .         .         .         .         .  g.127064
ttggtgtgctgcacccattaactcttcatttacattaggtatatctcctaatgctatccc  c.2538+1200

         .         .         .         .         .         .  g.127124
tcccccctccccccaccccacaacaggccctggtgtgtgacgttccccttcctgtgtcca  c.2538+1260

         .         .         .         .         .         .  g.127184
tgtgttctcattgttcaattcccacctgtgagtgagaacatgcggtgcttggttttttgt  c.2538+1320

         .         .         .         .         .         .  g.127244
ccttgcgatagtttgctgagaaggatggtttccagcttcatccatgtccctacaaaggac  c.2538+1380

         .         .         .         .         .         .  g.127304
atgaactcatcatttttatggctgcatagtattccatggtgtatatgtgccacattttct  c.2538+1440

         .         .         .         .         .         .  g.127364
taatccagtctatcattgttgaacatttgggttggttccaagtctttgctattgtgaata  c.2538+1500

         .         .         .         .         .         .  g.127424
gtgccgcaataatgctatttaagaaaattacaaatagaagcccccaccgttctatctcag  c.2538+1560

         .         .         .         .         .         .  g.127484
aaagaaaatatatgatataggtattagatagagagtgtgaatagtcaaaaagaaaattcc  c.2538+1620

         .         .         .         .         .         .  g.127544
tcatgtccttatgaatcatctaatgtgacagttcttatcgggtttcatactttgcaactt  c.2538+1680

         .         .         .         .   g.127585
ctacagtttcacactttgaaaaaacattgctaattgtaaat  c.2538+1721

--------------------- middle of intron ---------------------
       g.127586     .         .         .         .           g.127625
       c.2539-1720  taatgagcaatgttatagtgatttggcagcaaaagaaaaa  c.2539-1681

.         .         .         .         .         .           g.127685
gatcaggggaaaacaaggccttatggggcgtttaaaccctttcccttaaaatgctcaagg  c.2539-1621

.         .         .         .         .         .           g.127745
ccagtggttaaaagggtatcctgggaccttcctgtcttcttaggctctatcatgtgtaaa  c.2539-1561

.         .         .         .         .         .           g.127805
cagtcacacaagctattgtgataaatcaggagcttaaactaccccacagttcttttcttc  c.2539-1501

.         .         .         .         .         .           g.127865
tttaacatttcattagtatatgttagtttattgaagttgcctatcatcctgttgaaaata  c.2539-1441

.         .         .         .         .         .           g.127925
caaactttctgccagaatttattttaaaatgactctaaaatgaattagagtatatacata  c.2539-1381

.         .         .         .         .         .           g.127985
cattctaatgtggtaattaccaaagaaaacaaatagcttgtgatcagaattagataattt  c.2539-1321

.         .         .         .         .         .           g.128045
tacttatcctgaaattgatggtgtaaaacaagctgtgataacttaatatatccaagggaa  c.2539-1261

.         .         .         .         .         .           g.128105
catcattataagtatgcttcttagggtttgtttgatattttccatctgaagactacttat  c.2539-1201

.         .         .         .         .         .           g.128165
ctatgtaatgctgatcatgacttggacaactctttagttcaatctgtactaacaaggtca  c.2539-1141

.         .         .         .         .         .           g.128225
taaaccatgttcttaattttttgccttatttcatccagtaaaatacttatttttatttat  c.2539-1081

.         .         .         .         .         .           g.128285
aagcttctgttcatcttttatcaatgcacatacaaatttgaacttgtgtttgttttccat  c.2539-1021

.         .         .         .         .         .           g.128345
ttttagttgttcaatgtacattgaaaataatgatacattatgctttctaatgtttaagac  c.2539-961

.         .         .         .         .         .           g.128405
attagtaaataatattttataaatgaagtgtgcttttgtaagtatcttattaggtaaatg  c.2539-901

.         .         .         .         .         .           g.128465
gatgcacagtaaaattccacatacatattttattcaattctttttttatctttttacctg  c.2539-841

.         .         .         .         .         .           g.128525
tgtttttttttaattaatgttttgttcagatagaaatcatagggaagtaaattgtttagg  c.2539-781

.         .         .         .         .         .           g.128585
ataatatttgaaaccatctggtatttgttacacattgttggacttcattataacttaaat  c.2539-721

.         .         .         .         .         .           g.128645
tttgttttagcactttcagattgaaaggtaaccttattgcactggaacaaaatagtatat  c.2539-661

.         .         .         .         .         .           g.128705
tcagttccctgcttggaggaataaacactccacaaaaaccatcattattagctaaagctc  c.2539-601

.         .         .         .         .         .           g.128765
tcaacacatattatatttattagtccagatatttcagcatgttagagtgaaagaagaaat  c.2539-541

.         .         .         .         .         .           g.128825
ttgtcttaaaatttaattctgaatttctttgcatatctaggtttacttactcattgagaa  c.2539-481

.         .         .         .         .         .           g.128885
aagttaagtaactcatgatcccttgttttatatttagactggggtaaatgaaataactgt  c.2539-421

.         .         .         .         .         .           g.128945
atcaaaaagatttactctggttgaagggataaaatctaaatattgtgccagttacatcac  c.2539-361

.         .         .         .         .         .           g.129005
taatttaaaatagtatttaatgttgaaaaagcttagaagtatttttaaccatgctttaga  c.2539-301

.         .         .         .         .         .           g.129065
attcacaaagaagtgcagagttctctttaaaacctcagggttcatgtacctaaagaaggc  c.2539-241

.         .         .         .         .         .           g.129125
actaccacttatataataaaggttaagttaggcaacattataacattagaaatatgttca  c.2539-181

.         .         .         .         .         .           g.129185
aagcaacaattttcttattcacgtgaagaaatataatgaaggtaaataatgacaaaaatc  c.2539-121

.         .         .         .         .         .           g.129245
tgcaaatcttccttttgagtgtacaatatgtgattctaatatttaaaaaaaattgaaatc  c.2539-61

.         .         .         .         .         .           g.129305
attatttaagcttaattcaacttaaaatattactttgattattatatattttaactgtag  c.2539-1


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