collagen, type XI, alpha 1 (COL11A1) - 3824 nt intron 35 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.134849
gtacgtatgatacagccacataatataaaatgaaaattagtatttctgcaagtatttaga  c.2790+60

         .         .         .         .         .         .  g.134909
tttcagagaaaagatatatgtctgctaatacatgtgcatgtctatccacaaaatctagtc  c.2790+120

         .         .         .         .         .         .  g.134969
tgaatttaaaaacgcttattttttaatttattcctcttcaccaataaaaaagcttaatca  c.2790+180

         .         .         .         .         .         .  g.135029
atatgttctactaattttgttatagaaatgagaaaaatgtgtgtaactggactaagatat  c.2790+240

         .         .         .         .         .         .  g.135089
cactcttatagtcaagacaaaaatagatattttttaaattttaaatacacttgaaacatc  c.2790+300

         .         .         .         .         .         .  g.135149
tttgccctcttctccaatcagcttgctttccatattgatactcattttgttcacagagct  c.2790+360

         .         .         .         .         .         .  g.135209
ggcagcaaaattatgctggtaaaaaacaagctactagtagccattaagccagaatcaata  c.2790+420

         .         .         .         .         .         .  g.135269
tacattcaactcaagataaaacatctattccagtaaatagaatagctatttagtaaattg  c.2790+480

         .         .         .         .         .         .  g.135329
atttttaattgatgtaagatgtagccaaatacatatgaacaagcatgccctttgtttgga  c.2790+540

         .         .         .         .         .         .  g.135389
ttttttggcaaaatataacatttttgtagccagatttttaaaaaagctatcctcctgata  c.2790+600

         .         .         .         .         .         .  g.135449
taagtttaagtattataatctgtattcctttaaaaaattagaatcatttcttcatattct  c.2790+660

         .         .         .         .         .         .  g.135509
ataataattttcagtattatggagtcaggttaatatatttttgtatattatgatttgaaa  c.2790+720

         .         .         .         .         .         .  g.135569
tgtataataggcattttacacaagacagaaataccttgcaatgcataacctaaaattgaa  c.2790+780

         .         .         .         .         .         .  g.135629
aatgaataatttttatttgagtaggagcaatgagcaaaacttgagtttttatttgtgacg  c.2790+840

         .         .         .         .         .         .  g.135689
aaaatgggagtagataacacacaagaataaacatttaattagagttgtgttaagtctttg  c.2790+900

         .         .         .         .         .         .  g.135749
gctcatatttaattaattttccgctaaatgtttctcactctcgatgaactgttcccaaat  c.2790+960

         .         .         .         .         .         .  g.135809
taagtctatcctgtaatttttgagctcataaataatacattcatttgaagtattttatgg  c.2790+1020

         .         .         .         .         .         .  g.135869
tcagtcattttaataagggacatttaaattaattaaaaaggctaaataattaaatggagt  c.2790+1080

         .         .         .         .         .         .  g.135929
agaacaatttaacaaaaattagcacaactgtgagttttgtttttagagcaccactgattc  c.2790+1140

         .         .         .         .         .         .  g.135989
tctcatgcatttggttttgtcttccaaaatgttatgatcaataatatttccttacaagtg  c.2790+1200

         .         .         .         .         .         .  g.136049
aatatgcttttgctgatactgcattttaatttgaaaaacagcaatactgtcatccaacag  c.2790+1260

         .         .         .         .         .         .  g.136109
tatgattacttttaaaaacactttgagagtgagacaagtacctcttgggaatttttgttt  c.2790+1320

         .         .         .         .         .         .  g.136169
tgttttgttgttttagtaatctaggtggattcattttcaataactattcatatatgtttt  c.2790+1380

         .         .         .         .         .         .  g.136229
caatgtctatacaggaagaacatatttcctatgttccttgtggttgatgagacatttcat  c.2790+1440

         .         .         .         .         .         .  g.136289
cccaagtatgccttcattttctgccaagaatttttaattatcttaaactatttagttcac  c.2790+1500

         .         .         .         .         .         .  g.136349
gtcttgagcacacagttgaaaaatggcaaaagtaatgccataaaatattttcctcaaaat  c.2790+1560

         .         .         .         .         .         .  g.136409
atatgagttggggaaagttcagggaattagttctgtagtaccattggattagaaaatgaa  c.2790+1620

         .         .         .         .         .         .  g.136469
ataactatttttgcccatttcaaaggactctctcatgatcattatatttatatttaacta  c.2790+1680

         .         .         .         .         .         .  g.136529
tacagttatacatggcatgcatatatatatgtatacataaacttttattaaagtattcta  c.2790+1740

         .         .         .         .         .         .  g.136589
caaattaaatgtaatccctcataatcataatttgcagatcatggatgctggttattaaag  c.2790+1800

         .         .         .         .         .         .  g.136649
gttaaatatatcttttagttaggtctaaggttaccaaattaagtgaaaacaaaacaaaaa  c.2790+1860

         .         .         .         .         .    g.136701
tggaacaacagaaccaagacacctggataaatttgaattttatataaagaat  c.2790+1912

--------------------- middle of intron ---------------------
          .         .         .         .         .           g.136753
        aagtcatttttgtcacaactatgtctcatgatatttaggacatattaaaatt  c.2791-1861

.         .         .         .         .         .           g.136813
attcattatttatttaaagctcaaatttaggcactggatattttatctagtcatctggtt  c.2791-1801

.         .         .         .         .         .           g.136873
tcaacaccatctgtacactgagtcattatggatttcttaaaatcccacctggaaactatt  c.2791-1741

.         .         .         .         .         .           g.136933
ttgattattaggaaaagaatacgccagccaggcgcgatggctcacacctgtaatcccagc  c.2791-1681

.         .         .         .         .         .           g.136993
actttgggaggcagaggtgggcagattacctgaggtcaggagttcgagaccagcctggcc  c.2791-1621

.         .         .         .         .         .           g.137053
aacatggtgaaaccctgcctctactaaaagcacaaaaattagctgggcatggtggtgggt  c.2791-1561

.         .         .         .         .         .           g.137113
gcctgtaatcccagctactcaggaggctgaagcaggagaattgcttgaacccaggaggcg  c.2791-1501

.         .         .         .         .         .           g.137173
gaggttgcagtgagccaagatcgtgccaccgcactccagcctgggcaacagagcaagact  c.2791-1441

.         .         .         .         .         .           g.137233
ctgtctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagccaacgttttctgtgaaattttata  c.2791-1381

.         .         .         .         .         .           g.137293
aagactcaatttttcatttttattttaaagtaatgatttttggaatgtttctttcttaaa  c.2791-1321

.         .         .         .         .         .           g.137353
agattttaaattcaaattgcatttgaaaggcagcaaaattttaggaagcaaaaacatgac  c.2791-1261

.         .         .         .         .         .           g.137413
attttaataaatcaggaaaatagtttgctacataaccaaaagaatactatttttaaaaat  c.2791-1201

.         .         .         .         .         .           g.137473
ttgtacttaaaatggatttttatttaggaatcatagtgtcatagtttaataagagtttaa  c.2791-1141

.         .         .         .         .         .           g.137533
aattttgtaagttcctaagatttgcccagtagttttggtagtttcatgtgaaatctattt  c.2791-1081

.         .         .         .         .         .           g.137593
ttgttaactttatatataactttgaagttactttttaaatataagatgctggtaataata  c.2791-1021

.         .         .         .         .         .           g.137653
aaaacttgtgatgatttctgaactaacattggcttatgaatggtaatgagatttttcttg  c.2791-961

.         .         .         .         .         .           g.137713
ggaaggctagattgataaatagaaagagtaaattctattgaaggccaacttcagtaaact  c.2791-901

.         .         .         .         .         .           g.137773
ctatttttgattagaaaaatacataaatcctaccctaaatgtattacttaagacatttta  c.2791-841

.         .         .         .         .         .           g.137833
cttatgttatctttcataaatcttcttaaataaatgtaactattacgttctgggcatata  c.2791-781

.         .         .         .         .         .           g.137893
gaggattatctcttaccaattactttttctgccaacaatggagtcactgtaatgggactt  c.2791-721

.         .         .         .         .         .           g.137953
tatgcactttttaaaaataggtaaatttgagagatgaataatatagttaattaaaaatca  c.2791-661

.         .         .         .         .         .           g.138013
agccaagaatgatattataatttttatttggactgaacgttaataactacacaataaagt  c.2791-601

.         .         .         .         .         .           g.138073
tatttttaccttatctacaaaagaaatttatacatgagtaaaaaatatattgacatcatc  c.2791-541

.         .         .         .         .         .           g.138133
caaaataaatatattttagatatggagaataaaggcatcttctgtggtctttttgagata  c.2791-481

.         .         .         .         .         .           g.138193
gtcacatactttctcttttagttttggaatatacggctagatacagaacagggatagaag  c.2791-421

.         .         .         .         .         .           g.138253
atagaataagttttaaaacagtttttttttttttttttaagcggggctgtggaattgaat  c.2791-361

.         .         .         .         .         .           g.138313
tgaatcaaaatatcttccttgtatgaatgtttctagccaatgttaaaagtaaagacactg  c.2791-301

.         .         .         .         .         .           g.138373
cagaacttctcaatacttacatgttctattcacttttaattgatatgaattctaaatatt  c.2791-241

.         .         .         .         .         .           g.138433
tacagtgttcctgaggtaacattgatgtgatgtgtagttttgagtagaaatagtgtgaaa  c.2791-181

.         .         .         .         .         .           g.138493
atgtatccattttacttttagattagcacttactatcgtgttgtattaccatagttctgt  c.2791-121

.         .         .         .         .         .           g.138553
cactgtgatgaagaagctgtatgatacattgtattttgtctatgtaaataaacctcaaag  c.2791-61

.         .         .         .         .         .           g.138613
tataaagatgcatcttctaaggcatattgttaacttctccccactgctttttatttccag  c.2791-1


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