collagen, type XI, alpha 1 (COL11A1) - 4557 nt intron 36 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.138727
gtaagtgtcagagcttctctttctctttcttcatttgatatttttacatttttgagagtc  c.2844+60

         .         .         .         .         .         .  g.138787
acagcttacatttatatatttgttagatataatattgataaaatctctgtaaaattacaa  c.2844+120

         .         .         .         .         .         .  g.138847
ttgatgtcaaagaaagtagacatttttaatttataaggttcatagatcgtttctgaatat  c.2844+180

         .         .         .         .         .         .  g.138907
aatttcaacatctcttattaagtattttttgacagtataccgaagactagaaaaacatga  c.2844+240

         .         .         .         .         .         .  g.138967
atatcattctctcagctgctcctttactgcaatgaatataattgatgacattacaaattg  c.2844+300

         .         .         .         .         .         .  g.139027
ttatcaactcttaaatatttggtatattcgaatttatctttatcttccatcatcaaaata  c.2844+360

         .         .         .         .         .         .  g.139087
accttcttcaaatatcacttcctaaatccctccaacattgtgatattacttaagtcatgc  c.2844+420

         .         .         .         .         .         .  g.139147
taaaatctatttatattaatattatatctgtctctataatcccttctttttagaaaatgt  c.2844+480

         .         .         .         .         .         .  g.139207
aatgagaattctcattaaatcttaacccttttatgaaatgtgtttagagcaacacttgaa  c.2844+540

         .         .         .         .         .         .  g.139267
tgttcatcaagcatcttcataaagttaattgaaatactttgttttcatatttaaatattt  c.2844+600

         .         .         .         .         .         .  g.139327
gtggggacatagaacatactggggtcttttttgtttttgtttgtttgttttgcaacctcc  c.2844+660

         .         .         .         .         .         .  g.139387
tcagtttctttaagagagtgggagtcagcttacccacctgtctaggacagtggttctcaa  c.2844+720

         .         .         .         .         .         .  g.139447
atgtagtccctggcccagcagcatccacagctcttgggatattgttagaaatgttccact  c.2844+780

         .         .         .         .         .         .  g.139507
gaccaaatcacaattctggagaggggcaggggccaagtctatattttaaaacaccctcta  c.2844+840

         .         .         .         .         .         .  g.139567
gacagttctgatgcatgttaaagtgtgtgaacctctgtgctagtccagatgaacaatact  c.2844+900

         .         .         .         .         .         .  g.139627
acccatactttaatgtgcacacaagtcatattggtgaattatttattttgaaataattaa  c.2844+960

         .         .         .         .         .         .  g.139687
acatcaaatattaagacaatccttaactttttacaataatttttagaccctgcttaaatt  c.2844+1020

         .         .         .         .         .         .  g.139747
attatttaccactgaagagttttgcattattactgcaaagatattaggaaagtattgtta  c.2844+1080

         .         .         .         .         .         .  g.139807
tctgtattacaaggttatagaaagatcgatacatatggctagtgttaaatataaagtaac  c.2844+1140

         .         .         .         .         .         .  g.139867
cttggtactacctgcatataatgcttacctactatgtcagttttgctccaaatgtaacat  c.2844+1200

         .         .         .         .         .         .  g.139927
gaagactctgcaaagtttcacagagaaatgaaaacagtttcaaaagtcactgtatgtata  c.2844+1260

         .         .         .         .         .         .  g.139987
tttttataaacattcttataattattttaagctgtatattagattattgtttaggaacat  c.2844+1320

         .         .         .         .         .         .  g.140047
aaagtttagtgacgtatataacctcagtattgtaccatttatgtttgtatgtattgttga  c.2844+1380

         .         .         .         .         .         .  g.140107
gaactgcttggctcatgtaatattgtttcattgtcaaagaaacccatttgactcattttt  c.2844+1440

         .         .         .         .         .         .  g.140167
ttatcagactttttcagcccattgtgttatgtgtctttcaacatgttttgagccattgat  c.2844+1500

         .         .         .         .         .         .  g.140227
cgtgcatgcattttgtctgtaagaggtatcagaagcataataaatgcctacacttgagaa  c.2844+1560

         .         .         .         .         .         .  g.140287
gcatgcattctagtaggagagacaagaaggagtatttctttcactgataaacaaagtgat  c.2844+1620

         .         .         .         .         .         .  g.140347
ttttatactatgtttctctaacaagtgaaacattagagcatgaaataaaaataccccatt  c.2844+1680

         .         .         .         .         .         .  g.140407
tctctagtatgcagttttatgcagtttgggacagaattggcttcatctgtttgatataga  c.2844+1740

         .         .         .         .         .         .  g.140467
aagaagaagttggggtagagagatagaaaaaacctcttcctgtaaattaattggttcatc  c.2844+1800

         .         .         .         .         .         .  g.140527
tccttcatcatagcaggaaaaaattttatatatatatgatgtatattcacacagacatat  c.2844+1860

         .         .         .         .         .         .  g.140587
atatatatggatctaaatattcccttcagattctgttaatatcatgcccatatcggcata  c.2844+1920

         .         .         .         .         .         .  g.140647
ttttgggaatatgcagccatccatttaaaaaacacattaacttgaaatgattaagaatta  c.2844+1980

         .         .         .         .         .         .  g.140707
tagcatgactagtatgagaaacattctatttagaatagaaaaagtcaaaactcagtgcca  c.2844+2040

         .         .         .         .         .         .  g.140767
atgagaagtgagaaaacatccttaaacaattacctacaagttttcacagattttctcgcc  c.2844+2100

         .         .         .         .         .         .  g.140827
aaatctgcataccctcatttagatgaatttgttctctctgtcctgtaccagctagatcaa  c.2844+2160

         .         .         .         .         .         .  g.140887
aggggaagcctgggaagcctattttgatgaaaaaattattacttttacatagataccgtg  c.2844+2220

         .         .         .         .         .           g.140946
aaattatttggtaattagtctgcttatttcattggttaatagtttgtggcctttatatt  c.2844+2279

--------------------- middle of intron ---------------------
          .         .         .         .         .           g.141004
  tatttagggctaattgcttgatattagaagtacatacttaaatcaagaaaaatgataa  c.2845-2221

.         .         .         .         .         .           g.141064
tgacaccaattcttaatgcagtatattaacactactccctcagtctatctaggaaagcca  c.2845-2161

.         .         .         .         .         .           g.141124
ttaaatattatgttgcattcttcccaggatgtgatcgcttagacctaagatcgctatttt  c.2845-2101

.         .         .         .         .         .           g.141184
aaagtattataatattttgcaatgaatgtgttatctatgtcagcaaatatgagatattta  c.2845-2041

.         .         .         .         .         .           g.141244
atcttatatttacagctttgttaaaaaaaagtaagtcttgtattagtggcaaagtacatc  c.2845-1981

.         .         .         .         .         .           g.141304
atttaagaagcactttagtatggtggaaaaaaaagccagacataattgatatccttcagc  c.2845-1921

.         .         .         .         .         .           g.141364
tgtcatcctctctataaaacttttattattgcccagaattgaaagcaagtttattgccaa  c.2845-1861

.         .         .         .         .         .           g.141424
atatatcaaaccagtgataaggcacagaaattgttttatttgctattttgtaaaactgga  c.2845-1801

.         .         .         .         .         .           g.141484
cctcaatgaagtctactaccaatcaactaaatacttatttctgtatgtcacctccaaact  c.2845-1741

.         .         .         .         .         .           g.141544
gagggcaaaactaagtcttagcattagtatacacctagtaaatgatacgtgggtatgtaa  c.2845-1681

.         .         .         .         .         .           g.141604
tatatgttttttaaagaagccatggttaaatgacatccaagaatgttttgggtccttggt  c.2845-1621

.         .         .         .         .         .           g.141664
taaaaacactccagttttgttttttgaagaagaggatggcagtagtagccctggaaaacc  c.2845-1561

.         .         .         .         .         .           g.141724
tgaagaagtcactgagcaagccatgatgttgtgaagtagcataacggattttaattagag  c.2845-1501

.         .         .         .         .         .           g.141784
ttgttaatttacagggcacccaggatgtcaatacacatgacttaagggagcaaagatggt  c.2845-1441

.         .         .         .         .         .           g.141844
tctggcaccaccaagaacctttctcctgaagtaactagccaacctggaaaaagtctccct  c.2845-1381

.         .         .         .         .         .           g.141904
cagttggaagaaagctatttgagaaaataacattttggaacaaagcctgtttttcatact  c.2845-1321

.         .         .         .         .         .           g.141964
cactctataagaacatatattaaaaatagatgttcaaaaacaattttatttaaataatta  c.2845-1261

.         .         .         .         .         .           g.142024
acatacaatgagaggtgtacctgttataatttaaaatattattattaaaagaatcatttc  c.2845-1201

.         .         .         .         .         .           g.142084
tcttcattcatctagaagggtgatagtatttttatctctacccgttgaccatgttttgaa  c.2845-1141

.         .         .         .         .         .           g.142144
atttgaacttgatacgtaatggttactgagtagaatgaataatccataaggcagtctaaa  c.2845-1081

.         .         .         .         .         .           g.142204
gaagcagtttctttctactaagtatttaaaatataggaccctcacagagttgttcacttt  c.2845-1021

.         .         .         .         .         .           g.142264
gtttgtagttaattgcttcatttatttcttaagccatgacaaagacagcatcctttatac  c.2845-961

.         .         .         .         .         .           g.142324
aaagtgatagcagcagatttgctctgtggtacttcacaaacattatgcttccaagaggac  c.2845-901

.         .         .         .         .         .           g.142384
atttaagaaaatctactgggaaaaatttgtcctgatgacttctagaattgagtataacgt  c.2845-841

.         .         .         .         .         .           g.142444
attgtttcctttacttgaaaaaatttgagagataaaatgccattttttatgagtttgtat  c.2845-781

.         .         .         .         .         .           g.142504
ttattttgcattcttggtttttttttgtttgttttgttttgttttttgttttttgagacg  c.2845-721

.         .         .         .         .         .           g.142564
gtctcgctcggagtgcagtggcgccatctcagctcactgcaacctccgcctcccaggttc  c.2845-661

.         .         .         .         .         .           g.142624
aagggattcccctgcctcagcctcccgagtagctgcgactacaggcgtgtgccaccacgc  c.2845-601

.         .         .         .         .         .           g.142684
ccggctacttttttgttttttagtagagacggggtttcagcatgttggtcagaatggtct  c.2845-541

.         .         .         .         .         .           g.142744
tgatcctctgacctcttgatcctcccgcctcgacctcccaaagtgctgggattacaggtg  c.2845-481

.         .         .         .         .         .           g.142804
tcagccaccctgcccggccttcttttgccttcttgtcagttagaagctcggattaccact  c.2845-421

.         .         .         .         .         .           g.142864
agagggcactatttctctctgttatccaagttttgatgcaccgggaattgaattaggaac  c.2845-361

.         .         .         .         .         .           g.142924
aaatcaccaaaaagggggaaatactcatttgtgaagtgctaaagaagtaatatttttcac  c.2845-301

.         .         .         .         .         .           g.142984
aaaaacgaaaatacaaacctttgcaaatattattttacaaatgattgatgcaaatgaaat  c.2845-241

.         .         .         .         .         .           g.143044
atatttaaatgtaaaatattcagaaaagagttcaactattttattttggtttcagctata  c.2845-181

.         .         .         .         .         .           g.143104
gctacagaattatattgaagagatatatgtgcatattatcatatataaaatcaacagaag  c.2845-121

.         .         .         .         .         .           g.143164
agcaaagtaaaatagctaatggaaatataaaaagaaaagaaaattttctaacatgtcaca  c.2845-61

.         .         .         .         .         .           g.143224
tttagactataaaataattaaatatttatgacatgtggtatttaatatttgtaatttcag  c.2845-1


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