collagen, type XI, alpha 1 (COL11A1) - 3495 nt intron 63 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.226750
gtatgtaaataatacatgacaaagcaaatgtaccgagcccctgagtttctgaggtgcatt  c.4894+60

         .         .         .         .         .         .  g.226810
ggcagctcattcattctagttaaatgtttaatacagtctctaaataaaatgaaacagtta  c.4894+120

         .         .         .         .         .         .  g.226870
ttaattatcttctagacagaaaaaatcatttatactgcataaatcaagatttgctttgga  c.4894+180

         .         .         .         .         .         .  g.226930
aaatccttgtctgttaaatgggattttattaaattatgacaagatcatttttggatgatt  c.4894+240

         .         .         .         .         .         .  g.226990
acagctaacacaaatgtactttgcttgtaataactatcacagaatggatactgtgtatac  c.4894+300

         .         .         .         .         .         .  g.227050
acacatgtgtatattgtaatatgattactaacttcatgttaatgtgaatacttacattaa  c.4894+360

         .         .         .         .         .         .  g.227110
tatgattattattttagattaatatgaatatatggatatgtgtaaatagcataactgatg  c.4894+420

         .         .         .         .         .         .  g.227170
tatatttgatctatcagtttggcaatgatttggtgaacagaatattaagaactgggatag  c.4894+480

         .         .         .         .         .         .  g.227230
cttggggcaaaaatgtatctttaattgagccacagatattccaaacagctgtgaatagct  c.4894+540

         .         .         .         .         .         .  g.227290
tacttactaataacaattaggataattcatcataccaactctttgacaaaacctttatat  c.4894+600

         .         .         .         .         .         .  g.227350
acctattggtcagagaaagaaagagtttcaggttgctaagttagttgactaaactcttac  c.4894+660

         .         .         .         .         .         .  g.227410
aattattaaagtagcaaggggcagatcttcatctgatttttaaatttcccactgcatgtt  c.4894+720

         .         .         .         .         .         .  g.227470
gaactattttgtctcccctttactctgtagaaaatattgttttgcactaccaatcatata  c.4894+780

         .         .         .         .         .         .  g.227530
atgtcagttataactgtgatctaagtaactcaatgcagatagaaaagttcagtgtagttc  c.4894+840

         .         .         .         .         .         .  g.227590
agaaacagccagcataaaaaaaaggatgtcacaaaaatcttcttatcttaatcaagcata  c.4894+900

         .         .         .         .         .         .  g.227650
gcctgttaaaggtaaaacacaggtaattattagcgttcctatacaaactggtatctaaca  c.4894+960

         .         .         .         .         .         .  g.227710
tcttcatgtttataatatgtttatctgaaaaatatacatttagtttagtgatttataagg  c.4894+1020

         .         .         .         .         .         .  g.227770
agatttacttttaactggtgttatttaagcaaaagatgtagatgatttagataattcaat  c.4894+1080

         .         .         .         .         .         .  g.227830
gttatatactcctaaaaaccatgtaagatatatcaaaggtttacagtggttatctctact  c.4894+1140

         .         .         .         .         .         .  g.227890
tggtaaaatcttagatgattttttttatttccttgtatttttttcctgggaattctaatt  c.4894+1200

         .         .         .         .         .         .  g.227950
tgtttcagacatgattatattaatggtataatctgaaaaaatatagatgtttttgttaaa  c.4894+1260

         .         .         .         .         .         .  g.228010
gatattaaagttatgcgactattagaatacttttcctgtttatatacaagtagtagcaga  c.4894+1320

         .         .         .         .         .         .  g.228070
agataaagcaggttgatattgcattgtttagagttccagcaccaagataagcaatttgag  c.4894+1380

         .         .         .         .         .         .  g.228130
cttttaaaatattaaaagttcataaccagtggacttatataattcaaatatttcaaatga  c.4894+1440

         .         .         .         .         .         .  g.228190
agtggcagcatgaaaaacagttggaagtataaaggtagaaataattcgattcctttcctt  c.4894+1500

         .         .         .         .         .         .  g.228250
ctcagtataaaggtcaaagctgacacccctataaaaaaaaaggttaacaagagaaaaata  c.4894+1560

         .         .         .         .         .         .  g.228310
ttaaaaatgtatttgattatagttcaacataacataggcgccttcagattcaagctcgaa  c.4894+1620

         .         .         .         .         .         .  g.228370
agatacagaggaagctatctgattttatgcttaggttcgataaggcagggacagctgtgt  c.4894+1680

         .         .         .         .         .         .  g.228430
agaaatgcaatataatattggacaaaaaaagggtatgagctaatgatactaatccgagta  c.4894+1740

          g.228438
gggaaacc  c.4894+1748

--------------------- middle of intron ---------------------
                                        g.228439              g.228445
                                        c.4895-1747  tagtaag  c.4895-1741

.         .         .         .         .         .           g.228505
gccttctgttcagatactccctggcctgtgttgtagtattccatcctcccaggtacgggg  c.4895-1681

.         .         .         .         .         .           g.228565
tagaacccctctggaataagggttttaatttctttatggccagctgttacacagaaaggt  c.4895-1621

.         .         .         .         .         .           g.228625
gggtgaaggttatgttaacagtggcaaatccatatggtatactaagggttataggagtga  c.4895-1561

.         .         .         .         .         .           g.228685
aagtttattaaaaagtttcagaacagaaatgaaagaaagtaaagtacacttggaagaggg  c.4895-1501

.         .         .         .         .         .           g.228745
tcaagcggacgactggagggcttcaagtgcatggtttgacctttgacttggggttttcta  c.4895-1441

.         .         .         .         .         .           g.228805
cattggcatgcttctgaggtttgcatctcttctcgcctgattcctcccttggggtgggct  c.4895-1381

.         .         .         .         .         .           g.228865
gcccacaagtgcagtgggctgccagcacttgggaggggccacacacacattttgtttcct  c.4895-1321

.         .         .         .         .         .           g.228925
ggagctgtgcgcatgctcacttgaggcgtcagtttagtgttcccagaggaaggttattta  c.4895-1261

.         .         .         .         .         .           g.228985
ccagttaaactccaaccatttgcatcttagtgcacatgcttgagcccagtagcccacctc  c.4895-1201

.         .         .         .         .         .           g.229045
ctgagatcgtataaagaagctgctggtcaccagtttcaggtgttttctatgaggaacagg  c.4895-1141

.         .         .         .         .         .           g.229105
aagactgccattccctggcaccagctgcaaccaattgttttagcaagacagtttaacaac  c.4895-1081

.         .         .         .         .         .           g.229165
tgcctgaccttcatctgatggtcgcctgacattcctggtgggattggcagggctctcctg  c.4895-1021

.         .         .         .         .         .           g.229225
ccctgtttatgtctgactacctactataacagttagagtagtatgtttaggttttatagc  c.4895-961

.         .         .         .         .         .           g.229285
tggctttgcaaaaaaggggttctggtttctatgacccactttggggaggagggattctaa  c.4895-901

.         .         .         .         .         .           g.229345
tttccatgacttgcctcgagggagaatgagggatgagagacaggagggcagaggtcagag  c.4895-841

.         .         .         .         .         .           g.229405
aaaaactgcctcagcggctttcactttggggtatcattttctgagtcccaacagaaggaa  c.4895-781

.         .         .         .         .         .           g.229465
gcaaagtaatgtttacatgtatatcacttttggctcctagtaacttttgttaactaaagc  c.4895-721

.         .         .         .         .         .           g.229525
cgtattgtcagttatctaaagaataactttgttactcccactattttccatgcttactca  c.4895-661

.         .         .         .         .         .           g.229585
cataacaccaaatgaatggtgatgattattcacataataaaatgtgttctgcaacatttc  c.4895-601

.         .         .         .         .         .           g.229645
agcaatggcattaatagcaggctgcattaaaatataaagtagtccttcttaggacccccc  c.4895-541

.         .         .         .         .         .           g.229705
ttcaaagagagagtacatttattgcaagaagttttttttttttataaaataaggcagagg  c.4895-481

.         .         .         .         .         .           g.229765
tatgatctctgaggctaagtagatacgatatcacctccactgttacaaatgaataaacta  c.4895-421

.         .         .         .         .         .           g.229825
ggaagaaaatatattgattacactactcagattacttaagtagtaaataatacttatgag  c.4895-361

.         .         .         .         .         .           g.229885
atttggagtcaagtatatcttatttcaatatgcatgcaatttattacacagggataaatg  c.4895-301

.         .         .         .         .         .           g.229945
gaatgttaatatttgaggagatgatatttaagttgaaaccaaaaagtgataggcatgcta  c.4895-241

.         .         .         .         .         .           g.230005
agaattttaaaaaggtattccaggtagaacatatggggcatttgcaaagctttgaggcag  c.4895-181

.         .         .         .         .         .           g.230065
acaagagaaagtatcactctttattaaaaaccgtaccccaatatgcccaaaagcttaaaa  c.4895-121

.         .         .         .         .         .           g.230125
ggcaaaagatctattaatatgtattttccttatttctctttctaacaaaatttgacatct  c.4895-61

.         .         .         .         .         .           g.230185
aatgcattcaacaatgatgtcaatgaatttttatatgacatattttttgctaccttctag  c.4895-1


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