collagen, type XII, alpha 1 (COL12A1) - 9258 nt intron 13 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.35930
gtaattaccatcatattttctgaaaatccaggaacttgtttgtggtgctgcctctaggaa  c.2710+60

         .         .         .         .         .         .  g.35990
gcttaaaatgtcttcagacaatgaatctagaagtgtgcaatcctttctcttaaaaagaat  c.2710+120

         .         .         .         .         .         .  g.36050
ccatattgaaaaacaaataaccataaagctctctgttattcagagatgtagaatgtaagc  c.2710+180

         .         .         .         .         .         .  g.36110
aactgaaaaaattaaacttgattcagaagtgccttggggagctggatgcataataagacc  c.2710+240

         .         .         .         .         .         .  g.36170
aaagagatgtgtttatagttccatgggttggttgaaaggagaataggtgtatgacattca  c.2710+300

         .         .         .         .         .         .  g.36230
gagcgagaagggaccttgggaaacatctatgaaaaaaggtttggattgcccaagtttatg  c.2710+360

         .         .         .         .         .         .  g.36290
cagctagttctatctttcagatccagataagagccattttctgacttccattcaagtgct  c.2710+420

         .         .         .         .         .         .  g.36350
ctttccatttaccatgcataaaagctcaagaaatataagaatccaagtttcttttttttt  c.2710+480

         .         .         .         .         .         .  g.36410
gtgagacagagtctcgctctttcgcccaggctggactgcagtggcgctatctcggctcac  c.2710+540

         .         .         .         .         .         .  g.36470
tgcaagctctgcctctatggttcacgccagtctcctgcctcagcatcccaagtagctggg  c.2710+600

         .         .         .         .         .         .  g.36530
actacaggcgcccgccaccacgcctggctaattttttgtatttttagtagggacggggtt  c.2710+660

         .         .         .         .         .         .  g.36590
tcaccatgttagccaggatgatctcgatctcctgacctcgtgatccgcccgcctcggcca  c.2710+720

         .         .         .         .         .         .  g.36650
ccaaaatgctgggattacaggcctgagccaccgcgcctggccaagaatccaagtttctat  c.2710+780

         .         .         .         .         .         .  g.36710
ttgttttctaagtgatttctgaaattccgttctgtattaaattttcaaagtgattgcgat  c.2710+840

         .         .         .         .         .         .  g.36770
aaagtacttagtaagaaacatcagcaagactggagcagtttccttggttctttagagtta  c.2710+900

         .         .         .         .         .         .  g.36830
attgtcagaggcctttatattttttaggatttttgagatataatcacagcttaggtttaa  c.2710+960

         .         .         .         .         .         .  g.36890
ctcaccacagctactaagtgaataatgcaagggagagaaaatacaaatttaattgcaccg  c.2710+1020

         .         .         .         .         .         .  g.36950
caatgagaatggattgcaatgctaaaaatcccatgatgttgactcagtcctataactggg  c.2710+1080

         .         .         .         .         .         .  g.37010
ggcctacatggactatcagcaatagctttccttctcctatcattatattttatatgattt  c.2710+1140

         .         .         .         .         .         .  g.37070
attttaaatgattataggaagaaaatgaatctgaagtatcttctaatatgaaatcacagt  c.2710+1200

         .         .         .         .         .         .  g.37130
gactaagcaaaatatccatcaaagttgatggctccaggagcttggaaggttgtagatatt  c.2710+1260

         .         .         .         .         .         .  g.37190
gtaattaatgagacaggacatacaataggcagttcttagaaacttcaagggttaagaatg  c.2710+1320

         .         .         .         .         .         .  g.37250
aaaaacaaataaataaaaaatactaatttaaatagtagtgatcgggcaggcgtggtggct  c.2710+1380

         .         .         .         .         .         .  g.37310
cacgcctgtaatcccagcactttgcgagaccaaggcaggtggatcacctgaggtcaggaa  c.2710+1440

         .         .         .         .         .         .  g.37370
ttcgagatcagcctggccaacatggtaaaaccctgtctctactaaatacaaaaattagct  c.2710+1500

         .         .         .         .         .         .  g.37430
gtgcgtggtggcgcatgcctgtaatcccagctacttgggaagctgaggcaggagaatcac  c.2710+1560

         .         .         .         .         .         .  g.37490
ttgaactcgagaggcggaggttgcagtgagccgagattgcaccattgcactccaggctgg  c.2710+1620

         .         .         .         .         .         .  g.37550
gcaacaagaatgaaactccatctcaaaaaaaaaaaataataataatagtgatcaagagtt  c.2710+1680

         .         .         .         .         .         .  g.37610
aaatttccatagtccatgaaatctgtttctagaaaaagatttaaatgaaagattaaatac  c.2710+1740

         .         .         .         .         .         .  g.37670
cagtgtttaaagtacttacaactagaagagtcccagttgtactgcttagctgtgtgacct  c.2710+1800

         .         .         .         .         .         .  g.37730
ggagtaaacctttaacccctctgggccttagtttattcatctataaagaagggatgatta  c.2710+1860

         .         .         .         .         .         .  g.37790
tcctccctctttcttcccagagttattgttgagatcaaatgggagaatgtaagtgaaatt  c.2710+1920

         .         .         .         .         .         .  g.37850
cattggaaactgtaaaatactctatgtctacaaaattcatcaagaggacatagcttatta  c.2710+1980

         .         .         .         .         .         .  g.37910
actttagatctgatatctaaaagcctcttggtatactcagggttgggggctgcagattgg  c.2710+2040

         .         .         .         .         .         .  g.37970
ttccaagacgcctgcatataccaaaatcccctgcatataccaaagtcctcttatactcaa  c.2710+2100

         .         .         .         .         .         .  g.38030
gtccggcagtcggccctagggaacctgtatatgtgaaaagttggcccccggatataggtg  c.2710+2160

         .         .         .         .         .         .  g.38090
gctttcgcatcctgtgaatactgtatttttcgtctgcgttttgttgaaataaatctgcat  c.2710+2220

         .         .         .         .         .         .  g.38150
ataagtggaccttcacagtgcaaacccatgctgtcaactgtatagctttagtatttcaaa  c.2710+2280

         .         .         .         .         .         .  g.38210
tataattggtaacacaaaaagttttgaaaaaaatagtagaaacagaaattgccttaaata  c.2710+2340

         .         .         .         .         .         .  g.38270
cacagacataatccaaacaaaaaaagcttgtgatctttacaatctggggcaacatccaga  c.2710+2400

         .         .         .         .         .         .  g.38330
attttggagaaatttgtccttttctttggaccttttgaagttctgtttctccatatgctt  c.2710+2460

         .         .         .         .         .         .  g.38390
tccacaatcttttagcataggttgttcataagatttttttagaggacaaactttcactct  c.2710+2520

         .         .         .         .         .         .  g.38450
ttattttttacaggatagatgtagattgtatttgtgaacatttcttctttataaggagta  c.2710+2580

         .         .         .         .         .         .  g.38510
tcttggaaataatttaatagtttttcttctggttgtgccttttagccttctggtattcat  c.2710+2640

         .         .         .         .         .         .  g.38570
ttgtgctttcttgcttttaaaaatatatttatgctcagtaaaaatcttctcgattctaaa  c.2710+2700

         .         .         .         .         .         .  g.38630
aattaaggcatttttgccaagaataatatattacaaattgtatttaacaaaatgtacttt  c.2710+2760

         .         .         .         .         .         .  g.38690
ttaattttacaggaagcacattctactaggctgtgatttttgtaagccagatgtattgct  c.2710+2820

         .         .         .         .         .         .  g.38750
caattgtttataatattatagctcttcacaagtggtatcaaaaacctatcaacttgtacg  c.2710+2880

         .         .         .         .         .         .  g.38810
catgtgtgagtatacacacacgcacgtgtctttgataagaaacaatctctaagggaaaca  c.2710+2940

         .         .         .         .         .         .  g.38870
catagctagtaaaataaattttaaaagctattgttttctatttcctgagaagaaggaaag  c.2710+3000

         .         .         .         .         .         .  g.38930
ctagataatttgcaagtttgcttaaaaaaatacagttaattcctaactaaattgtagtaa  c.2710+3060

         .         .         .         .         .         .  g.38990
tttacaatggacattttgttcatttatgctaaagtgctttactgcagtgaaggattaccg  c.2710+3120

         .         .         .         .         .         .  g.39050
aagggcctccagcctgattttgttaacatatttatcccattgcattatgtgtggtaaact  c.2710+3180

         .         .         .         .         .         .  g.39110
tgacaaatatgtgaaagcatagttgtgactaaatgaaaataatagaagatttttgcccct  c.2710+3240

         .         .         .         .         .         .  g.39170
ggttattccatttcattttattgtattaactcagccaaatccacataccatatacaggaa  c.2710+3300

         .         .         .         .         .         .  g.39230
taggatatgatggtaaatgcagggagtggaaagcccagaaacagagccaggcaactgctt  c.2710+3360

         .         .         .         .         .         .  g.39290
ttgagggctgctgtttttctaatttgtttttctcttgggagaggaggtggtaagagcaga  c.2710+3420

         .         .         .         .         .         .  g.39350
acttgaaggaatgtttcctttatccagaggcatggtgtcagccggcaggagcattctgta  c.2710+3480

         .         .         .         .         .         .  g.39410
ggttggacatcttatagattacctcaaatgcattatggctttcaattcaaaaggaaataa  c.2710+3540

         .         .         .         .         .         .  g.39470
agttgttgttgttttgtattttgaaaaaatgtgtagtgtggtctacaaccatccctaact  c.2710+3600

         .         .         .         .         .         .  g.39530
tgaatctatttcctagtactttttttgaaatgcagccaatgatcagaaaattcccttgtt  c.2710+3660

         .         .         .         .         .         .  g.39590
gctggaagagagatttattagcactggcattggggaagttcatggttggctgtagtactg  c.2710+3720

         .         .         .         .         .         .  g.39650
tatgcaatagaatcacaaaggcagagtttattactatttcagatccaaacttcagaggaa  c.2710+3780

         .         .         .         .         .         .  g.39710
tgtgagcatacatcattaggtttgatttacattgtttttttcccctgttgttgttagagc  c.2710+3840

         .         .         .         .         .         .  g.39770
agttagacaatgtaattacaacaaccctactgtatatgtaattgaacttcaagtcttgaa  c.2710+3900

         .         .         .         .         .         .  g.39830
agaacctttaattgctgctgttagtgcttggaggaaaatctgtttttataaacctctcaa  c.2710+3960

         .         .         .         .         .         .  g.39890
taaatactgcccattttaattcagcgattgaccacaaatgaaggagaatttcaatttgaa  c.2710+4020

         .         .         .         .         .         .  g.39950
gaataatatgttttcttgttaaatttttgagtgttgttttttggctatggaaaatatgac  c.2710+4080

         .         .         .         .         .         .  g.40010
tttttagaatttcctttgtttcagttgctatagcaacctgctaatgtcctggatatgaat  c.2710+4140

         .         .         .         .         .         .  g.40070
ggcttcctacagatcaaaccaagtgtattcagttgacattttgttacaatgaggttttta  c.2710+4200

         .         .         .         .         .         .  g.40130
gcacatctcaggaattctgcatgatgttgagtaacatgggccccttaaagatggactaaa  c.2710+4260

         .         .         .         .         .         .  g.40190
caaggcctctgtgttttccctgatttactgctgtctcataatttgaaaaatcatacattc  c.2710+4320

         .         .         .         .         .         .  g.40250
tgggtataataactctgacgttgccagggaactttagcacagtcaccaaacaataatttc  c.2710+4380

         .         .         .         .         .         .  g.40310
tatttcctttttctgtgaattaattgcttgtcagataaaaattgaagtcaatgtggagag  c.2710+4440

         .         .         .         .         .         .  g.40370
gtgataattacggaagaaacacttttttgctcaagccgactttgaagttgaatggtaatt  c.2710+4500

         .         .         .         .         .         .  g.40430
taattgttaagttgtttttaagaactgtgcatagcttaaagtaactgagttaacttatca  c.2710+4560

         .         .         .         .         .         .  g.40490
atagtgaactttgtcctttggaatggtggctctaattcattggttgtaaatcaaatgtat  c.2710+4620

           g.40499
ttccacatg  c.2710+4629

--------------------- middle of intron ---------------------
                                      g.40500                 g.40508
                                      c.2711-4629  aatgttatc  c.2711-4621

.         .         .         .         .         .           g.40568
cacaagcagatcttctgtattgctgtggaaagttggatgacttttgagctgagctctaat  c.2711-4561

.         .         .         .         .         .           g.40628
ggaaaagacaaattgatttagaagagagtttacgttacattttcaatttaacttctattt  c.2711-4501

.         .         .         .         .         .           g.40688
ttgaaagtggtatatgaaactcaatgaaagctggctggaacaatctataagatgaaatgc  c.2711-4441

.         .         .         .         .         .           g.40748
agttttatttcatgatgattaatttttcatttatcattggctaatttgtgttataattat  c.2711-4381

.         .         .         .         .         .           g.40808
atttgaattggatgataatttgcttttcagaaagaaaatggaaaaggggtaaggaaacat  c.2711-4321

.         .         .         .         .         .           g.40868
aggaaagttacttaaatgaggcattagttctttggcttggtatgtggaaaaaagcagtgt  c.2711-4261

.         .         .         .         .         .           g.40928
aggaatcaatcccttcaggatgttcagatcatgagaagtagacctgtctgaattacttcc  c.2711-4201

.         .         .         .         .         .           g.40988
cacagcagcagcacagagacacatgcaagcacacactagaaaaatggcttttgaatagat  c.2711-4141

.         .         .         .         .         .           g.41048
gtaactatgttttataataaggacagaaatgctgagtagccagatttcaaaacctgatag  c.2711-4081

.         .         .         .         .         .           g.41108
agttttatacctttaaacttatgacatttatacctatactggtactatactaggaagaat  c.2711-4021

.         .         .         .         .         .           g.41168
aaagtgtaagggaaaattgtcaagatagaatcaaaggaatggtaataaaggaatatcatc  c.2711-3961

.         .         .         .         .         .           g.41228
attgtagatgatgacttgtttgaaatgattgccagaatttctattaccagagataaaatt  c.2711-3901

.         .         .         .         .         .           g.41288
aatagagagaacacaggcatatatccagaacagaagagagcaagtactatgagactaaac  c.2711-3841

.         .         .         .         .         .           g.41348
attattcaaaaaaaaccctaaacaaaccccagcaccataagacacatatttgtaaatctt  c.2711-3781

.         .         .         .         .         .           g.41408
ggggaacagaagaaagaggaggacctcagaagggagggagcctctgctagagcaaaagta  c.2711-3721

.         .         .         .         .         .           g.41468
gatctaggttcagggaaaggtagtgactacatggcaaaaagtctactagggttgctttct  c.2711-3661

.         .         .         .         .         .           g.41528
gttcactgccactgtttctatgccttccccttttgaggagcagtaacctctcctagagat  c.2711-3601

.         .         .         .         .         .           g.41588
agcctacagactggtcttctggcatctttacgttcttctccctctctctttcctagtccc  c.2711-3541

.         .         .         .         .         .           g.41648
tcttaggtactctaaaaagggactcttgcataaacccaatataatgaaactaaaccaaag  c.2711-3481

.         .         .         .         .         .           g.41708
caagtcggataatttcttcctgtagttactgatgtctggagctcctcagattcaggacaa  c.2711-3421

.         .         .         .         .         .           g.41768
aaatgacaatgtattgaaccaagtaaatgccttgctaggtaacacttagaacttcattaa  c.2711-3361

.         .         .         .         .         .           g.41828
tgtgaaaatgtgctcagctcttcaataagaggcatgcgtgtgttcagagccatttcctgt  c.2711-3301

.         .         .         .         .         .           g.41888
cgagacaagatggaggggagaagagagcagtgaacatcccacatgtgtccatggagatgt  c.2711-3241

.         .         .         .         .         .           g.41948
gatgaaaagcttaaatcatctcctctgttctctgagggtcagccttgagattattttgcc  c.2711-3181

.         .         .         .         .         .           g.42008
gcctaaagcagtgattttctgtacatggcaatataaccacacaaaatacaagccacccag  c.2711-3121

.         .         .         .         .         .           g.42068
cagtcctacagagcatcatgtgtgtaatgattttgaccagtttaccttcaccatacctgt  c.2711-3061

.         .         .         .         .         .           g.42128
ctttattttgaaggagcaccatttctatgtgaaagcagatttgaggttccttcccacact  c.2711-3001

.         .         .         .         .         .           g.42188
gacccagcacacctcccgaataaatgcttctctagacctcagagaggagaagtagaaaga  c.2711-2941

.         .         .         .         .         .           g.42248
agagcaaaaaggggaaagaataaagaattgtagaggttttggaatcacagggcagattta  c.2711-2881

.         .         .         .         .         .           g.42308
aaagatatttagaaggcaccagtacttaggtgcatccccaaatattccaatttaattgat  c.2711-2821

.         .         .         .         .         .           g.42368
ttgggtagggtccagcctttgttttttcaggcaattctgtttatcggttcaagtccagtc  c.2711-2761

.         .         .         .         .         .           g.42428
cagttattttgctgctgagggccccaaggccccaggaggtgacatagcctgttgttgacc  c.2711-2701

.         .         .         .         .         .           g.42488
tgctcagatggttgcatacctggccccaagaccagttcagccacttgccagcttccatcc  c.2711-2641

.         .         .         .         .         .           g.42548
tgccaactgtaccacagggcgcaatccacttgcttcattttttggtaatctaatgtttgg  c.2711-2581

.         .         .         .         .         .           g.42608
ccaaaccaagatctcattttttaaaaattcaagggctatacatttacttgtcatgagtac  c.2711-2521

.         .         .         .         .         .           g.42668
aacttattctcaaaattcctggttgtaatgtaacagaatattcagccctcctccctaaaa  c.2711-2461

.         .         .         .         .         .           g.42728
aaaattatcaatgtgtttggggagcaggatggatttaatatttaggaatattcttatcaa  c.2711-2401

.         .         .         .         .         .           g.42788
actgactgattgacatgtaagaaacccatatgaagcagtttatcttctcaattgtggtgt  c.2711-2341

.         .         .         .         .         .           g.42848
ctcgattgaactatctttctcctttctttggagtctatgttgctatgtcactaacatgga  c.2711-2281

.         .         .         .         .         .           g.42908
atgttgtagtgacagtgcctgcctttacataccacaggcagaactacaatttttagtgag  c.2711-2221

.         .         .         .         .         .           g.42968
tttttttctgagattgagaacttactcagtgttcactcaaaatagtgttgtcatgccatt  c.2711-2161

.         .         .         .         .         .           g.43028
aattagagcttaaaaatattttttagttgatttttaatttgcatcttaaaaagtgctgtt  c.2711-2101

.         .         .         .         .         .           g.43088
gtagattattttcaggatatcgataaaccttgggaaaggtcttcattgcattttactagt  c.2711-2041

.         .         .         .         .         .           g.43148
attttgttctagctttacaagtcttgagagtgttaaaatagttgattaaaatccatagga  c.2711-1981

.         .         .         .         .         .           g.43208
agacatgtcttgtgatcttaaatccttttgttttaagcccagaaatatctttgtgaatgt  c.2711-1921

.         .         .         .         .         .           g.43268
atttttgcttcaaccacaattctcttcctattatttttctcacagtgaaatcattagcct  c.2711-1861

.         .         .         .         .         .           g.43328
gtgtttatgagattgatgtctgttgtcatggaaataaacaatgtcacaaatttagtgctg  c.2711-1801

.         .         .         .         .         .           g.43388
tagaaagaaaaataggttgagaagcaaaacctttgggaaaaataaaagctgaaattgttt  c.2711-1741

.         .         .         .         .         .           g.43448
taaaattaccccggtgttaatttgaaagataatttccacattctagttaaccttatttgt  c.2711-1681

.         .         .         .         .         .           g.43508
ctgatacttttttgaaacgtcgttaatgcagctcatttaaattcaaaattgctttcaagc  c.2711-1621

.         .         .         .         .         .           g.43568
aaggtcatttcacaacagctgttcctgactgcaatctaggaaatttagaggaaaaggcac  c.2711-1561

.         .         .         .         .         .           g.43628
atattgaaaattgtatatatcaagcaaaggaaaaacgtgctgtacatttaaaacttagag  c.2711-1501

.         .         .         .         .         .           g.43688
actagttgttgggatatcgattatcaaaacaaataaaaaacaaaacaaagaagcccacag  c.2711-1441

.         .         .         .         .         .           g.43748
ccaaaccaaataaaacaaacagttttaaattgtacttttatattccaagtagagaaaata  c.2711-1381

.         .         .         .         .         .           g.43808
gaaaggtgtatgaccatttacatagtaaagacagctaaagaagactttcaaatgggaatt  c.2711-1321

.         .         .         .         .         .           g.43868
aacctcaagagctgagggtaaaaattcaatgtgctcttaaaaataagtattctttgttcc  c.2711-1261

.         .         .         .         .         .           g.43928
agtgaaatatgtaactaatttccttccagggatgagatgtgctgtcagcagttaaagtta  c.2711-1201

.         .         .         .         .         .           g.43988
tttataatggagttagaattttccatttgggcttggggtctggtaggctgcccagcttct  c.2711-1141

.         .         .         .         .         .           g.44048
gtttcatttattttttccctctaaatcgaccatatatgataggtttttgtccacctagat  c.2711-1081

.         .         .         .         .         .           g.44108
ttctttttcattcattgttacctttactttttgtgttgaaatataattgttaaattatga  c.2711-1021

.         .         .         .         .         .           g.44168
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.         .         .         .         .         .           g.44228
cttgtaagagcattatatatcatttgcatgaatatacaacaattactggtaaaatgtatg  c.2711-901

.         .         .         .         .         .           g.44288
ctgggaagcagatagatttgtatttatgtcatactgtggcataaaccctagtaaaggtag  c.2711-841

.         .         .         .         .         .           g.44348
acaatataaagtgacctgtatatttatcttacatttaaaatatggagagtgagggtttta  c.2711-781

.         .         .         .         .         .           g.44408
ttgaaagacatttgtgcctcctgttaagttgaggtttccatatttttccacttgggttgt  c.2711-721

.         .         .         .         .         .           g.44468
atgttttttgaatgaaagagccaaaatttagtagcagacgtttttgatcagctagaacaa  c.2711-661

.         .         .         .         .         .           g.44528
gtggtatgttttattttggtgactaatcacttttaagttttccagaagaattggttgttt  c.2711-601

.         .         .         .         .         .           g.44588
tcaattttgttagggttaagctatattgaaagtttgcactgctacgttttaaactgcatg  c.2711-541

.         .         .         .         .         .           g.44648
agcaaataaaagtttcaccaataaactgttgttggcattaagttttgtaagtgatatgag  c.2711-481

.         .         .         .         .         .           g.44708
attgttgcagttgttgtaaatcatgcattgaaactgagtttatttaaattagatcagaga  c.2711-421

.         .         .         .         .         .           g.44768
ggaaaagatcatggtaaggaaataaagatctttgtgaacaatgggccatgtcacaaggca  c.2711-361

.         .         .         .         .         .           g.44828
gacaaaaatgtgataaaattctgggacttagatacattttttttcctttggaattttttt  c.2711-301

.         .         .         .         .         .           g.44888
ttaaagacaaatactccttcaaatttggatgtcaatcttgtcctgaaggacaagattatc  c.2711-241

.         .         .         .         .         .           g.44948
tgactaggcatatgagggcaaagttaagaggtaggaatcaaatagaattctaaagtttta  c.2711-181

.         .         .         .         .         .           g.45008
ttgcatctatctattccacagacagaataggatggacaactcaaaaagaagaaatgggca  c.2711-121

.         .         .         .         .         .           g.45068
attttagacaaattgagtgtgagtccagcaagtcagaatctctaccaggatcaatgaata  c.2711-61

.         .         .         .         .         .           g.45128
taatacttaaatacctactagacatttttaaaaaagattcccttttaatttctgttctag  c.2711-1


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