collagen, type XVII, alpha 1 (COL17A1) - 5829 nt intron 09 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.20515
gtaagtctgacagcccaggctgccgaggagtgtgagaaacaaacttacccatccaaaccc  c.607+60

         .         .         .         .         .         .  g.20575
aaagagtggactcagagacccagagaacagtgaaagtgagacttgaaattggggcccacc  c.607+120

         .         .         .         .         .         .  g.20635
aaatctcattccagctagcacagggctttccctaatagcaacctgttttagggcatagat  c.607+180

         .         .         .         .         .         .  g.20695
atttgtttgcttgtgacagctgcctttggtttcctaaattcccacaatgtaagactcagc  c.607+240

         .         .         .         .         .         .  g.20755
aggcattgaattttatggtttagggggtagaggttttagttatgttgattattagattga  c.607+300

         .         .         .         .         .         .  g.20815
ttggatattccctactttccacccctagtactgggccctatccaatactcaggtcttctt  c.607+360

         .         .         .         .         .         .  g.20875
ttgtgtgttaggattaatcctaaccatatccacccctaatgaaggggtttgcttatagct  c.607+420

         .         .         .         .         .         .  g.20935
ctcttctaggttttccttagagttagctttaagtgttccttaggtgatttatacacttcc  c.607+480

         .         .         .         .         .         .  g.20995
catttgcccttttcccttccttcttgggtttcttttaccagtcccttgagtgtaatgagt  c.607+540

         .         .         .         .         .         .  g.21055
tcaccctcgtttagctgttcgttgtcacgtttcagtggttaggaccacttgatagggacc  c.607+600

         .         .         .         .         .         .  g.21115
ttggcagcttgggtggggcttatcttcttttcaagtcttaattagcaccgagatgccagg  c.607+660

         .         .         .         .         .         .  g.21175
ctggaagtggtgaactgtgaactcaagaggcggggtttgagttcgaagtccttttaagct  c.607+720

         .         .         .         .         .         .  g.21235
aaaggatgacagggtggaggatatggccagtatatgatttcttaaaaactggtttttggt  c.607+780

         .         .         .         .         .         .  g.21295
ttccatagtaggaagatcagtagtcctatctaaatatgggagtccatatcataacttgta  c.607+840

         .         .         .         .         .         .  g.21355
aggggacagtccaaagtctttgcttggggctgttctaatcctaaggagtgctactgggag  c.607+900

         .         .         .         .         .         .  g.21415
acattcgaggcattttagttgtaaagattagtttagtaatatgctttttgagaatttgac  c.607+960

         .         .         .         .         .         .  g.21475
ttattctttctacttttccagaggaagggggatgccaaggggtatagtaatcccatttaa  c.607+1020

         .         .         .         .         .         .  g.21535
tgtgtaaactttccataattccccttagcacccttgaggtaaagtgatacccattgtccg  c.607+1080

         .         .         .         .         .         .  g.21595
aattaatattttttatcaagacaaatctaggtataatttgttttaagattatttttacca  c.607+1140

         .         .         .         .         .         .  g.21655
cattcctggcggtggcagttgggaggtggaattcctccacccagccggagaggtggttta  c.607+1200

         .         .         .         .         .         .  g.21715
ccattaccagtagatactttagtctccctattttgggcatttctgtaaaatctacttgaa  c.607+1260

         .         .         .         .         .         .  g.21775
tgctttgaaatggccttaacccaggaggtcttcctctggtagtctgttttctaactactt  c.607+1320

         .         .         .         .         .         .  g.21835
ttttgtttattctctggcaggttacacaacacccacacacttgtttagcaagggtataga  c.607+1380

         .         .         .         .         .         .  g.21895
tccctatacacccataattttttagtattgcatcacacatatcctggggaccccagtgaa  c.607+1440

         .         .         .         .         .         .  g.21955
ttcctttatgcagtatggacatcagttttctcattatgggtttgcttatcatttctctcc  c.607+1500

         .         .         .         .         .         .  g.22015
catcagggagcacccacctcccatcctcagtttgagtggcccctatcttgcccagctctt  c.607+1560

         .         .         .         .         .         .  g.22075
cctcctcctttttagaaaatttgggttttaatatcaccttagggatctgtgggattaggc  c.607+1620

         .         .         .         .         .         .  g.22135
taaacaatctaacttcttcctccagggaagcttgcttagcagctttatctgcaagcctgt  c.607+1680

         .         .         .         .         .         .  g.22195
tccccacagcttctatagttttgcctatggctatctctgctagaagcaagaggcttttta  c.607+1740

         .         .         .         .         .         .  g.22255
aaacttgtttgatcagttccccatgtacaaattctttctccctgctatttattaggcccc  c.607+1800

         .         .         .         .         .         .  g.22315
gctctgtccagatctttttaaaggtgtgtactattccacaggcatatttggaattagtat  c.607+1860

         .         .         .         .         .         .  g.22375
atacagtgccttcttggccttctagaagcttgagggcctggttaagagcatgtaatttac  c.607+1920

         .         .         .         .         .         .  g.22435
aggtttgggctgaccaattattggataatctacctttttcacataaggattatttgtttc  c.607+1980

         .         .         .         .         .         .  g.22495
cattaatgacagcatagccattgtgttttttaccatttattacttgggatgacccattta  c.607+2040

         .         .         .         .         .         .  g.22555
caaacagtctcatcccattatgtaatggggtggtttaactttagtttgatattaaggtct  c.607+2100

         .         .         .         .         .         .  g.22615
ggtttaactttagtttgacattctatgatatccagttatgatttgatgcctctttattct  c.607+2160

         .         .         .         .         .         .  g.22675
cctctccttttcataagaagctggctggattcaagaaaatacatgttgtcaagactaaat  c.607+2220

         .         .         .         .         .         .  g.22735
tatctttttgtaataatatggcttcatattttaaaatctgggaattagtttaccatctcc  c.607+2280

         .         .         .         .         .         .  g.22795
caactctttgatttaatatattcctgacctgatgtggggtgctcactaccagggccctgc  c.607+2340

         .         .         .         .         .         .  g.22855
cgaagatcaacttcagactcccctccgccagcagggccatggcagccactgcccacctgc  c.607+2400

         .         .         .         .         .         .  g.22915
acctttgtctccccatctcccgtcttacatggcctctctctctttccctgtctctctctc  c.607+2460

         .         .         .         .         .         .  g.22975
ttcctcttgtactcttttttccttttacattatgtctctccccagtttcaccttctgtgt  c.607+2520

         .         .         .         .         .         .  g.23035
ctttgatctctgtcttttcccgtctctttctctttcgcttattttcttttttcttttttt  c.607+2580

         .         .         .         .         .         .  g.23095
ttaatctctctgtctctgtcatccctgttttctctttcccttacactcagtttcttcttc  c.607+2640

         .         .         .         .         .         .  g.23155
tttctctgggcgccagcgcactcgccatgttaacagcttacttacattagctctctcaca  c.607+2700

         .         .         .         .         .         .  g.23215
ctgtccacctttatctcggctgtttgcttcggctctgcagctcctgccgcccccacacct  c.607+2760

         .         .         .         .         .         .  g.23275
gcagctgcacagccggctcccttgccttcagggtcagcagcttaactctttctctctctg  c.607+2820

         .         .         .         .         .         .  g.23335
agcaccagcgtgagccatgccgtggctcccctctgtccgtctgcaagatggacagctttg  c.607+2880

         .         .         .       g.23370
gctttctctctttctctttttccaattcgtttctt  c.607+2915

--------------------- middle of intron ---------------------
              g.23371         .         .         .           g.23404
              c.608-2914  acttttcgcaaaaaccttctaattccttaattgg  c.608-2881

.         .         .         .         .         .           g.23464
ctttttattccatccatcaacttttttgcagtttcttagtaatatcaggccagcttttag  c.608-2821

.         .         .         .         .         .           g.23524
tcataaaattaacctttaaaaggccttgccctactaggtcctctggatgtaatcctgatt  c.608-2761

.         .         .         .         .         .           g.23584
ttttttttttttttttttttttattcctgagcctctgcagaaatgcagagggagtctcct  c.608-2701

.         .         .         .         .         .           g.23644
cttttacttgttgaagctcgaatgcttttgagacattctgtgtccttgaagtggactctt  c.608-2641

.         .         .         .         .         .           g.23704
taatccctttaattattcgttcccttaggtcctgcatttgggcccgatctttggggttat  c.608-2581

.         .         .         .         .         .           g.23764
tgttattccatctgggatttgcatttaggaatttctgctcagctggcgggactccttgcc  c.608-2521

.         .         .         .         .         .           g.23824
cgagaggatgctgtctttcccaaatggtcatggctgcccttttaattattcccctctctt  c.608-2461

.         .         .         .         .         .           g.23884
cctcaataaacagaatagtcatgattgacatcatcttagcccaagtacaaaaattgggtc  c.608-2401

.         .         .         .         .         .           g.23944
ctaaaaattgatctagctgctttgctacaccgaggagattttccaagagcggccttattt  c.608-2341

.         .         .         .         .         .           g.24004
cctatttaaaattcctaaccttagtacttgttagaggcacacttacatatccaacttctc  c.608-2281

.         .         .         .         .         .           g.24064
cctgtcccatagggacttctctaagagggtacatattagacatctgctgtttagaaggaa  c.608-2221

.         .         .         .         .         .           g.24124
tagggaaattctcaatgtccttcttacattgttctaattctctcctcaagtttggataag  c.608-2161

.         .         .         .         .         .           g.24184
gatttacgggagcattgggtttagcttctttatgatccccagattcctcttcctccagcc  c.608-2101

.         .         .         .         .         .           g.24244
ttcctgttactccctgatctccctgtcctctactttgtgagatgtaaagtggaggcaagc  c.608-2041

.         .         .         .         .         .           g.24304
gtgttatgggattccagagctttttattgggtgagggctttttactatgctctttttttt  c.608-1981

.         .         .         .         .         .           g.24364
cctcttgaagcgggagcatgggggttaattcactaatttaacaaagagcataacccgtct  c.608-1921

.         .         .         .         .         .           g.24424
cctcttgtgaggatggggttttattattcacatagagaattaaagcttggcacacccaat  c.608-1861

.         .         .         .         .         .           g.24484
cctcgtctgagccaaacttaggccaaaagactgaaggctgatgaatgggctctttggccc  c.608-1801

.         .         .         .         .         .           g.24544
agataaaacagcaatactttatcattttttgcttttccttgtccctggttcaagggttag  c.608-1741

.         .         .         .         .         .           g.24604
cccttaaaaacctgcagcattttccttaatggactatttgggagaatgttagagggtgtc  c.608-1681

.         .         .         .         .         .           g.24664
tttttagttccctcttttgttgggcaggggctttaggtgtttgtttagggttgtcttggt  c.608-1621

.         .         .         .         .         .           g.24724
gcattttgttgcagcccacaatgcattgcaatcctagttagcttaggggctcttcaagta  c.608-1561

.         .         .         .         .         .           g.24784
tttgacttatgacctaagtagctgggcaagctgataagaacagacaaaaatgagctattt  c.608-1501

.         .         .         .         .         .           g.24844
tgcagtctagtaaacttttaccttagactaaacttctttggtctgagtgagggaaactaa  c.608-1441

.         .         .         .         .         .           g.24904
gtggggggacctggtggggaaggggagaccaacaagcaggcattagctatccaagcaggg  c.608-1381

.         .         .         .         .         .           g.24964
gcctagtatatcctgtttcttctgtagtttgctgacctaagctgatttaagaaactttgt  c.608-1321

.         .         .         .         .         .           g.25024
cttggaaatggaccactgtatacattatttccttcaggagaaaaggcaacaaggtggcag  c.608-1261

.         .         .         .         .         .           g.25084
atctatcctggcctggggattcaaccacgccttggcaggcctttcaggctttgccagaga  c.608-1201

.         .         .         .         .         .           g.25144
ccttgaaaagcactgagcaccttctcttcaagcagtgaaaaaagtgggctgtacctatcc  c.608-1141

.         .         .         .         .         .           g.25204
tacccctggctggtcacccattccatatgcatagcccagccctaaatcctagagattctc  c.608-1081

.         .         .         .         .         .           g.25264
tcccaggacagtatgttggccagatcccccaaatgaagaatactggggaaatgtgtagag  c.608-1021

.         .         .         .         .         .           g.25324
ttttcgtgtattcattcagtgactatttattaaatgtctcctctatgccaagcaccaggc  c.608-961

.         .         .         .         .         .           g.25384
attgaggaaaagcaatggacaagagagacacagtcactgcccttgtggacagtgggtctc  c.608-901

.         .         .         .         .         .           g.25444
tggaggaagtcagaaaaccaacatgtcccagtcaagtaggatgagcattgttcagctgtt  c.608-841

.         .         .         .         .         .           g.25504
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.         .         .         .         .         .           g.25564
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.         .         .         .         .         .           g.25624
ccattcactactggagaaaagcctagagattgtgatctttcttgtttttcaccctaaaac  c.608-661

.         .         .         .         .         .           g.25684
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.         .         .         .         .         .           g.25744
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.         .         .         .         .         .           g.25804
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.         .         .         .         .         .           g.25864
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.         .         .         .         .         .           g.25924
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.         .         .         .         .         .           g.25984
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.         .         .         .         .         .           g.26044
gcccaccaggagatggggagccaggtttagaaggagaaattgttggaccccaaggcaaaa  c.608-241

.         .         .         .         .         .           g.26104
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.         .         .         .         .         .           g.26164
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.         .         .         .         .         .           g.26224
tgaaatgtggggctttcaatgcccaaaccaggaaatcccagcaaaatgaggtgactagat  c.608-61

.         .         .         .         .         .           g.26284
tccccagcagggagtgttgatttgtctctcactggggtgtgtgcatgtgtctgtttccag  c.608-1


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