collagen, type XVII, alpha 1 (COL17A1) - upstream reference sequence


                                           g.1                  g.9
                                           c.-5169 tatttctac    c.-5161

.         .         .         .         .         .             g.69
acctcatgccttgctcatgatagacactccataggtggtagtccactcactcaacaaata    c.-5101

.         .         .         .         .         .             g.129
tgtatgagttttgaatggaaaaatgagtgaatagatctgaagttgggaatggaagaaaag    c.-5041

.         .         .         .         .         .             g.189
gaaaccagggtgctttgttattataatcaaggcagcaaggaacacaactggcgataattc    c.-4981

.         .         .         .         .         .             g.249
aagaagcccacatgggaagggcaggagttcgtactacttagctatgtccttccaaaagcc    c.-4921

.         .         .         .         .         .             g.309
aaacaattccacacaccatgacatatgatgttgtcataattgtgtatagagaagtcttat    c.-4861

.         .         .         .         .         .             g.369
ctagtagcacatgctaagcaaagaagccaagccggaagatggtcttccagtcttagaaca    c.-4801

.         .         .         .         .         .             g.429
gtagtaggcaactaacaaataattgttgtattatttttatttaatatgtgagaattggtt    c.-4741

.         .         .         .         .         .             g.489
tttttaaaaaaaaatcagtggatttactgtccaacaaaagagctgaatcaacaattgtag    c.-4681

.         .         .         .         .         .             g.549
atactggaattacctcagtaaatttaaaattattttccctcacctccttttcagagaact    c.-4621

.         .         .         .         .         .             g.609
ttatttcttattgtctcttgagaatggagggcaaaatgtgtcccaaagctataagatacc    c.-4561

.         .         .         .         .         .             g.669
tcgtgaaagtatcataagcacatcatggcactatcatgtgatactgtttttatgagaaaa    c.-4501

.         .         .         .         .         .             g.729
gagtcatagaataggtagaaatccacctattgggtacacccctttaaaccaaacacataa    c.-4441

.         .         .         .         .         .             g.789
agaaaatatgcatctacaaagattcataaggtagtgaacagtcacttggcaaaagcactc    c.-4381

.         .         .         .         .         .             g.849
actctggtcaccaaaaacaaatcccttttcagaaacacatcagtcacataaagcagagtc    c.-4321

.         .         .         .         .         .             g.909
cgcctgtactcacgctgctcagagagtgatgcgtctggtcacttggtgccaatctgggcc    c.-4261

.         .         .         .         .         .             g.969
acacgtgaaaagacactctttctccccagcctatttaaaagtcagtagataattttggaa    c.-4201

.         .         .         .         .         .             g.1029
gtataactatttttccaggttgccttttaagggactttctagtccatcaaaaatggatta    c.-4141

.         .         .         .         .         .             g.1089
atgtgactcattaacacagctccaaatgcagtcagagagcaaaaaacacctttccagtgt    c.-4081

.         .         .         .         .         .             g.1149
cttagtcacttctatttcctaaagctgactctttgcttcttcattttggcaagaattttg    c.-4021

.         .         .         .         .         .             g.1209
ttgttttctggctaatttaaaaacatttaaaagacagctcccttactaccaggcatatgg    c.-3961

.         .         .         .         .         .             g.1269
taggaacttgatacataaatgttaaatgaagtttctttcactgtatgtaccatgtcttac    c.-3901

.         .         .         .         .         .             g.1329
tcacagatttgccaagtacaataatctaagaacattgaataactagaatgtgagtacttg    c.-3841

.         .         .         .         .         .             g.1389
aattcttttttcttctcccccaaaatacctaatataggactctgtaaacactactcacac    c.-3781

.         .         .         .         .         .             g.1449
atgcacatctgaatatgtgagaacctgcacatgcacacacagacatgcagtcttattagc    c.-3721

.         .         .         .         .         .             g.1509
tgttgagttagcttagagcatccttgactaattaactttgggggttatctgttatagatc    c.-3661

.         .         .         .         .         .             g.1569
tgactgttctattgtacctggagaataccaatatttttataggaacccaagggtaggaaa    c.-3601

.         .         .         .         .         .             g.1629
ataccatccatgctgattctgatggttgcttagcatgttagctttattttattttttaat    c.-3541

.         .         .         .         .         .             g.1689
ttatttttatttgtagagatgggggtctcactatgttgcccaggctactcttagactcct    c.-3481

.         .         .         .         .         .             g.1749
ggcctcaagagatcctcctgccttggcgtcccagagtgctgggattataggcataagcca    c.-3421

.         .         .         .         .         .             g.1809
caatacctggcctgtgtgtttggttttatatagttgttatagttgaaaaattgattggtc    c.-3361

.         .         .         .         .         .             g.1869
tgtggttgctgagttctataaatagatttctatctaaaactatcaataagttattccaat    c.-3301

.         .         .         .         .         .             g.1929
accatactgctgttaactgaaaacatccccactgttcagatggtttggggttttttttag    c.-3241

.         .         .         .         .         .             g.1989
ttgtaatttgccctcagcctgatctgttctaatattgcctattttctttcagttgaaagc    c.-3181

.         .         .         .         .         .             g.2049
tatgggcagacttaaattttaataatacacaaggcagtgggaaatgaaggtccaagagtc    c.-3121

.         .         .         .         .         .             g.2109
aagtggaatctattagactctgccacttatgagatggaagacccttggcctgttactcag    c.-3061

.         .         .         .         .         .             g.2169
cctctcaaactttacttttctcaggtataaaatgaaggtaataatggtacacacctctcg    c.-3001

.         .         .         .         .         .             g.2229
gagtcgttgtcgggattgtgttagagaatggatgtaaaaaatctggcttacagtagttct    c.-2941

.         .         .         .         .         .             g.2289
agaaagcattagttgcagtcgttcttctttcctgggatcaataatccgaacacccacaca    c.-2881

.         .         .         .         .         .             g.2349
gtgcctgtagggagttgctccttaatgtcaacttaacatttgccacataacccaaaacat    c.-2821

.         .         .         .         .         .             g.2409
gaccctccacagcctgtgaggccctgtgtgatctagtcctgcctcccttgccagcctctc    c.-2761

.         .         .         .         .         .             g.2469
gcccgctgcctgcctcccttcacttgatgcttttgagcaaattggcctcatcactcttcc    c.-2701

.         .         .         .         .         .             g.2529
cccaactcaccgtgcagcttccacctgagagccttctcagagactcttgccccatctaga    c.-2641

.         .         .         .         .         .             g.2589
tagtagaacactctccaccctgcccttcacctgtgtgatctcttttcaaccttcatgtat    c.-2581

.         .         .         .         .         .             g.2649
cacttatatagcaggacttttcctaacacccctctccaagattatgtctcttcttacgct    c.-2521

.         .         .         .         .         .             g.2709
ctcacagtagccagtactctttctttctgatcttgctctgtcacccaggctagagtgcac    c.-2461

.         .         .         .         .         .             g.2769
tggcgccattatagcttactgtaaccttgaactgctaggctcatgcaatcctcctttctc    c.-2401

.         .         .         .         .         .             g.2829
aaccacccgagtaactgggactgcaggtacatgccatcatactcagctattttttttttt    c.-2341

.         .         .         .         .         .             g.2889
ttagtagagacaaggtcttgctatgctgcccaggcttgtcttgaactcctggcctcaagt    c.-2281

.         .         .         .         .         .             g.2949
cagtatgctttctttataatagttatcatattcttgcagttgctcttataatatatatat    c.-2221

.         .         .         .         .         .             g.3009
atatataatctgcaattatatattgtacgtaactgttataggctgaataatgtccctcca    c.-2161

.         .         .         .         .         .             g.3069
aaattcatatgtgaagccctagccattagtacctcagtgaatttatttgaagatagggtc    c.-2101

.         .         .         .         .         .             g.3129
tttaaagaagtagttaaatttaagtaaaaaaggagcccatcagggtggactctaattcaa    c.-2041

.         .         .         .         .         .             g.3189
tctgactgtgtcctttaagaagaggagatgaggacacacagagagagacatcagggatgt    c.-1981

.         .         .         .         .         .             g.3249
gcatgcacagagaaaggccatgtgaggatactgcaagaaggcggccatctgcaagccaag    c.-1921

.         .         .         .         .         .             g.3309
gagaggggggtctcaggagaaatcaaacctcctgacacattgatcttgaacttctggccc    c.-1861

.         .         .         .         .         .             g.3369
acagaactgtgaaaaaataaatttgtgttgtttaagccacccagtccgtcgtattttgtt    c.-1801

.         .         .         .         .         .             g.3429
atgggaaccctcaccgactaatacattatgtaaggcctgtcttcctccattagactgtga    c.-1741

.         .         .         .         .         .             g.3489
actccataagcagagggactatgttcatatttcaccaccaaactcttagcacatagttta    c.-1681

.         .         .         .         .         .             g.3549
atgtctggctccaagcaggagccaatatatttttgtttaattcttgaattcatgaataaa    c.-1621

.         .         .         .         .         .             g.3609
gaaataaatgatgcaggggcatgtctattttatgctgaaagctctgtgtgttctgggttc    c.-1561

.         .         .         .         .         .             g.3669
ttcagtgttcttctactatgaaactgacggaagacatattgagtatttatttggggaagg    c.-1501

.         .         .         .         .         .             g.3729
caagaacatcctacaaagcaagtgtcaaattctgcataattgaaagggttctgaaatgca    c.-1441

.         .         .         .         .         .             g.3789
cgactccagtgtggaatatgggcagcttaggagcaagagccccacagctgttgttgtggt    c.-1381

.         .         .         .         .         .             g.3849
ctgctacccttccatgggatgcagtgcccacaatagcaaggtgcagttgcacatcggtgc    c.-1321

.         .         .         .         .         .             g.3909
tatgctgtaagggccccactgctcccctccagtatcttaggataatgcctcagaactggg    c.-1261

.         .         .         .         .         .             g.3969
aatcccagtgtgatgctgggtcccaggaatgtgctatggcctcaaaggactgcctgagtg    c.-1201

.         .         .         .         .         .             g.4029
agttccaggttcagacttcccattttaccaacaccaagtgtctcaagctagtctttaggc    c.-1141

.         .         .         .         .         .             g.4089
cccctgggaagccagatgctatccaggtattcataagaattatcctgattgatgcaagtt    c.-1081

.         .         .         .         .         .             g.4149
gaccctctagggaaatctaaaggtccccaggatgtacttggagttgcaggacatctggga    c.-1021

.         .         .         .         .         .             g.4209
gcccacacatgtctttaggtgtatggagactatgcggtcacctgatttgaaggacaagaa    c.-961

.         .         .         .         .         .             g.4269
ggtccttatcccttcccaacagcacctctctccattattaggtggctaaatgcctaaaat    c.-901

.         .         .         .         .         .             g.4329
tccatcactaacatgtcactcttttaggtcagcatcactatatctggttgcctcttttgt    c.-841

.         .         .         .         .         .             g.4389
aaaacgaacccctaccccaccaattgctcagtacattcagtcattagcatattatgaatt    c.-781

.         .         .         .         .         .             g.4449
agttcaccaactattttctccagatgggcttgacctggcttgagtcacaagaggggaaag    c.-721

.         .         .         .         .         .             g.4509
aggacaaagacatctataggggaaacaagacaaaggacacaggacacaggaacagaggac    c.-661

.         .         .         .         .         .             g.4569
gaagacatctataggggaaacagatcttgaatataaatcctgccaacttcagtttttcta    c.-601

.         .         .         .         .         .             g.4629
gggctcaggcagtatgaccacaggccatccatgtgcctagaccatgctcatccatgagcc    c.-541

.         .         .         .         .         .             g.4689
catccacgtgcctagactcatgaatcatgcagtgggattccagtacccatggcactgagg    c.-481

.         .         .         .         .         .             g.4749
aagggtactgccacaaagttgtggcagttctccagctgtagaaggtaggcaataaaaaag    c.-421

.         .         .         .         .         .             g.4809
catttcctttatgctggtcctttgtttccttttccccatgggccttataaatagttaatc    c.-361

.         .         .         .         .         .             g.4869
tacctaagctggaaggagaagctttctgcctccagtaaagtttgattcctggaggcagat    c.-301

.         .         .         .         .         .             g.4929
tttttttttaaatccagcaagtgtcagataattggaagggtggagtaacgctgtaaacca    c.-241

.         .         .         .         .         .             g.4989
tgacacacctttgtcaggacatgtttggaagcaaagagttgaaagaaacaaggtggagag    c.-181

.         .            .         .         .         .          g.5049
aaagaaaagtg \ aacatttttgaaagatcactcagctttaacacaccttggctgggtctgg c.-121


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