collagen, type IX, alpha 1 (COL9A1) - 6039 nt intron 10 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.27332
gtgagtaggcgagtgctgggagggcgcccagcctggggtgtgtggtgggtacgagtaagt  c.975+60

         .         .         .         .         .         .  g.27392
gtgtgttttgtggggggggagggagagagagaaagagagagagagaacgcgctgtggctc  c.975+120

         .         .         .         .         .         .  g.27452
taaacttggcctcctgccagcgcctgattgatcgtggaactggcagcttttgcaaaagga  c.975+180

         .         .         .         .         .         .  g.27512
cttgtgaaggtgaggatacctctctctaggaggcgttggcatttcctcctcctagaaaac  c.975+240

         .         .         .         .         .         .  g.27572
agcagcgggtactggcttcctgtctctaaccgtgacctcacagtgcacgctgtgaactct  c.975+300

         .         .         .         .         .         .  g.27632
cagccccactggggccagagggggtacggatggcaatagattgtactggcttcggcttac  c.975+360

         .         .         .         .         .         .  g.27692
ctgctgtgagcccactggcaggctcctggaagctagccttcgcccttgctctttcaccgg  c.975+420

         .         .         .         .         .         .  g.27752
cactccctgcattaatttagaaaaagatcctgcaggtaggcaaagggccagagcactcct  c.975+480

         .         .         .         .         .         .  g.27812
aaatcccaaggaatgtgaaaaagaaagatgcacttgaagtgagtggggatgtgcggggaa  c.975+540

         .         .         .         .         .         .  g.27872
tttagaaattcaaaactagattttcgtctttccatggagtttttctggctggcattactg  c.975+600

         .         .         .         .         .         .  g.27932
gcagaaatgagctggctaggactgtatgaagattgagaaccagcaggctttctccagttt  c.975+660

         .         .         .         .         .         .  g.27992
acccacatctccatcaaatgctgacttatatggtaaacctaacactaaataatacttctt  c.975+720

         .         .         .         .         .         .  g.28052
cagagtaaaatgacttcaggattctcagcttctcctctttccatgcattctaacaatatg  c.975+780

         .         .         .         .         .         .  g.28112
taataatgacccactacagaccagtccttgattttgtccctggaatatgaagtgaagtaa  c.975+840

         .         .         .         .         .         .  g.28172
gaaatggcgtctgttcttagcataccatggtgcatcactcaagttactcttcaagttacc  c.975+900

         .         .         .         .         .         .  g.28232
actttatgtgttttccaaaaactaaagacttttctaaatgaaagaaagcactcgaaaacc  c.975+960

         .         .         .         .         .         .  g.28292
tataattatgatttccaagaatttttgactacagtttaagacatatccttcattttgaaa  c.975+1020

         .         .         .         .         .         .  g.28352
gaaaaataaataactggatttttactgttattaaggtgtgctttctttgtcgggattccc  c.975+1080

         .         .         .         .         .         .  g.28412
ataatgaatgtgtttgtttatactgtgtctatactatttagcgtttttgtatgtgtatgt  c.975+1140

         .         .         .         .         .         .  g.28472
gttttttttttttttttttttttgagacgaagtttcgctcttgttgcccaggctggagtg  c.975+1200

         .         .         .         .         .         .  g.28532
caatggcacgatctcggctcactgcaacctctgcctcccgggttcaagcgattctcctgc  c.975+1260

         .         .         .         .         .         .  g.28592
ctcagcctccagcttcccgagtagctgggattacaggtgccctccaccatgccctgctaa  c.975+1320

         .         .         .         .         .         .  g.28652
gttttgtatttttagtagagatggggtttcacccatagtattttaggaaatagatcttgg  c.975+1380

         .         .         .         .         .         .  g.28712
tttacatttcaaagcccctagtttgaactttctgtgtatgcaaattagcagtacaggagg  c.975+1440

         .         .         .         .         .         .  g.28772
cacctaaggactaatatttagatagtaaaaactgaatctcaaacaagcgtttgtattaat  c.975+1500

         .         .         .         .         .         .  g.28832
gtaatatgaactgaaataatataacttgttggcaatcaaactctttggaacatctataat  c.975+1560

         .         .         .         .         .         .  g.28892
taatcgaaattgtcataccataataaaaagagtctgacaaattcaaggctactgaacaaa  c.975+1620

         .         .         .         .         .         .  g.28952
ctggtagcctaatgtagcttgaatttatttctatattcctttgaaatttcaatcagcctt  c.975+1680

         .         .         .         .         .         .  g.29012
tagttttggatgaaaagaaaatttctgactaaattaaaaaaattattttggtaaataaaa  c.975+1740

         .         .         .         .         .         .  g.29072
tatttattttgtatttcaaaaatttattttggtatttgaagcgtaaatgggtcatctgaa  c.975+1800

         .         .         .         .         .         .  g.29132
tccttgtcttgctattaattaaactgcaatataatgtcagacagaaagctggacttatct  c.975+1860

         .         .         .         .         .         .  g.29192
gtcccccaatttaatagtgcttttgtagcttactcaacaaattcttctctttaccttata  c.975+1920

         .         .         .         .         .         .  g.29252
ccatggtgtcataaagacaatccttggttttgcttataaagtaatttccccactctaaca  c.975+1980

         .         .         .         .         .         .  g.29312
gaaactttggataaacaaatgaaagtgctttgaaatttttagaagtacaacatagaaagc  c.975+2040

         .         .         .         .         .         .  g.29372
aatttcaagtaaatttttctttgtctatatttgcagacccacagtgcagcataaaccaga  c.975+2100

         .         .         .         .         .         .  g.29432
tttcaaatattaaaagacataaaagaataagctgccttaaattattgaactttgacctca  c.975+2160

         .         .         .         .         .         .  g.29492
aggaaaaaatgatgagcacatttagtctgctgagacaggagaggaaagcaaaagagaaag  c.975+2220

         .         .         .         .         .         .  g.29552
agaggaaaggggagaaaaaaggaaatccctgtatctgccagtattttaggcattttctag  c.975+2280

         .         .         .         .         .         .  g.29612
atcttggggaaaaatcaactatactatttgcatttacacagaactttttcctcaagcact  c.975+2340

         .         .         .         .         .         .  g.29672
gccacaaacatttcttttaaccaacaataacctggaaagtagattagtctaatattactt  c.975+2400

         .         .         .         .         .         .  g.29732
tccataaataaggaaacaataattatgaagacaagtggtttcctcagagagctatttagt  c.975+2460

         .         .         .         .         .         .  g.29792
agctaagataacaaaatagtccagatttcttgatttttagactccccaggcaattctgcc  c.975+2520

         .         .         .         .         .         .  g.29852
tcatgcgaatacaagtgacgatcttaatagatgagagagaatagcgagaacagagagaaa  c.975+2580

         .         .         .         .         .         .  g.29912
aagtgatagtgaatttttagtacctaagtcaccgatcaagaagaatgatatggataataa  c.975+2640

         .         .         .         .         .         .  g.29972
cagccatttgtaatagatattttataattacttataaatattggtttgttttatattccc  c.975+2700

         .         .         .         .         .         .  g.30032
tgacttttgaatttaagccacatgaggcatctggaactgtaaagttttcttattccactc  c.975+2760

         .         .         .         .         .         .  g.30092
tttgactgatttgacattaaaaaaatcttttattctaaattgagaatggatatctttgag  c.975+2820

         .         .         .         .         .         .  g.30152
aataatgaaatgcagtaactgggtcagaatttgctgtttgtttgtccttggccatagggg  c.975+2880

         .         .         .         .         .         .  g.30212
agctaagtaagtaggagagcttcaacagtcctttcttggtaggtgaacctgagtgtgctg  c.975+2940

         .         .         .         .         .         .  g.30272
gtaggaccttaaacctcgaatcatttcgtcttctgctctttgggtcattacaaggcttat  c.975+3000

         .         .  g.30292
tttttgataatgttaaaaaa  c.975+3020

--------------------- middle of intron ---------------------
                             g.30293              .           g.30311
                             c.976-3019  tggttaattggatgatggt  c.976-3001

.         .         .         .         .         .           g.30371
tgaaagaatcagaaaggaaccctgttcagtgttcattatcctatgttgaatggatttttg  c.976-2941

.         .         .         .         .         .           g.30431
gcagaaaatgtaaatgagtcatagcagtcatgcttgtagaagtaagccttgagtcctacc  c.976-2881

.         .         .         .         .         .           g.30491
agctgagctgtcagaatactggaaggaaatctccattgaggactggttttctctgccaaa  c.976-2821

.         .         .         .         .         .           g.30551
cagtaacatgaagttcagaacacagtcagcttcaatgttataatgtatagaagtttgtct  c.976-2761

.         .         .         .         .         .           g.30611
gtatgaatattcatatgaaggcacttttttctgctctggtaatgttttcttcttttattt  c.976-2701

.         .         .         .         .         .           g.30671
ctttgaaataagaattaggaggtcttactgcaaactggattttgaaaattatgtatgtat  c.976-2641

.         .         .         .         .         .           g.30731
tatgtgtgtggtctgtatatttcaactcaaatctgcccttttttcaggttaagttgattt  c.976-2581

.         .         .         .         .         .           g.30791
tttttttttggcttatggacatgtaaaattagataagacagaacttggtcctaaccttag  c.976-2521

.         .         .         .         .         .           g.30851
gacaactgtgctgttctcagcaattatattaatagagatatttttatatgtactatttgt  c.976-2461

.         .         .         .         .         .           g.30911
tgtgacatgctcagagagacctttaaaaacagtattttattctttcttataacacccata  c.976-2401

.         .         .         .         .         .           g.30971
tgagataagcagaagaggaattagaataaagtataagaattatagctaaactgtgataat  c.976-2341

.         .         .         .         .         .           g.31031
ttttacaggcagaggttaggtgctatgtattttctgaatgtatacaactattatctgtgg  c.976-2281

.         .         .         .         .         .           g.31091
cagatgctttataactagaattgtgagttattaagaaattattctaaaagatcagtgtag  c.976-2221

.         .         .         .         .         .           g.31151
gtgcaaatattcaggcattgaagaaatgtgatgaggataagaaatacagtgctgtggtta  c.976-2161

.         .         .         .         .         .           g.31211
atacctagatttggtttgtttgtttgtaggaccttttctcaatgaggaacagcgtctaga  c.976-2101

.         .         .         .         .         .           g.31271
acactgtgcagttagggaccttgcccatgattccacagctgctaagtagtaggatcagga  c.976-2041

.         .         .         .         .         .           g.31331
tttgagctgaatataaagatgttgtggaggaacaagtgtaatatcctgccacctggaagg  c.976-1981

.         .         .         .         .         .           g.31391
cctccttaaacttattgtaggcagtaatcacatcttgagtggttagatgccaggacaaca  c.976-1921

.         .         .         .         .         .           g.31451
tgttaggactgtaatggacatatgactcttgtcctcatggagcttacggttttctgcata  c.976-1861

.         .         .         .         .         .           g.31511
gttatttcataacaggtgttactgtaacatctgacaccagaatccattttcaacttagtt  c.976-1801

.         .         .         .         .         .           g.31571
caaagaactttccagtgattgacataatttagcatgtcttatggaggatatttttaatat  c.976-1741

.         .         .         .         .         .           g.31631
gaagtaaccgaaaaacagcttccaggttatccaactatttacttggttctgctttatagt  c.976-1681

.         .         .         .         .         .           g.31691
tactgtcctccaatcttgtcagttattccagtcacaggttgaagagtgttagttgactgt  c.976-1621

.         .         .         .         .         .           g.31751
gtgtatgaaaattgaacagaattggtcttggagggtttatgcattaagtgagaattagag  c.976-1561

.         .         .         .         .         .           g.31811
gatcagttagttaaatatgcccagaggtttataaaatttacatgccatatgtgcatccag  c.976-1501

.         .         .         .         .         .           g.31871
agagtgctcctggatgtatagtttgtttgtgaaatgccaaagcaaacatttcattaccat  c.976-1441

.         .         .         .         .         .           g.31931
aggtgcttagcaactaatcatgttgaggtttgttcccaaattacggtgttgtaattagac  c.976-1381

.         .         .         .         .         .           g.31991
tagggctattgaaaatcaaaggcagtctgtcaaaagttcttttgtgtgtgtttaatattt  c.976-1321

.         .         .         .         .         .           g.32051
ttcttctttggtaaatttccagtaattaacatttcaactcatttttttctatttgattca  c.976-1261

.         .         .         .         .         .           g.32111
ctctgtgacattgttaggaaaattaattaaggtagagaaatgtaaaaatggtggccactg  c.976-1201

.         .         .         .         .         .           g.32171
aactagttttctatatgaattatgtgaaggaattttatggatgtttattcagaccatgac  c.976-1141

.         .         .         .         .         .           g.32231
agactaaatatgaattttggtgatccatttttaagtagggctttcatatttttcaagaga  c.976-1081

.         .         .         .         .         .           g.32291
tccctctgtcaatattgtttgggtcttcttcaaaatcttgataatagaaagggtttataa  c.976-1021

.         .         .         .         .         .           g.32351
gatacttatataggcatgtatgtatatgtacacacatatatatcatatttatctttagga  c.976-961

.         .         .         .         .         .           g.32411
aggtatactttcaagattacattgtaaatgacagcatctgaaagtgtcaaagagcaaaga  c.976-901

.         .         .         .         .         .           g.32471
aaaaaattaaaaatagaaatgtatctttaccaaatatggaaattcttgtatatatgtgat  c.976-841

.         .         .         .         .         .           g.32531
attatcattctttaatacgtgttttatattgaggatgatgataaagtaagtagtagtagg  c.976-781

.         .         .         .         .         .           g.32591
gaaaatgagaatgtttagaatatgtatttaataactgctttagtattaaatatgataatt  c.976-721

.         .         .         .         .         .           g.32651
ataaatgtggtttataataataggcttaaattttacataccgagtggcatacatgaacat  c.976-661

.         .         .         .         .         .           g.32711
atatacttaatcacagctatttttactaagaaaaataatgtagaaacatgcatgctttca  c.976-601

.         .         .         .         .         .           g.32771
aatgtttctactttaagaattaatattctttgataagcaattgtcattgctagaagatgg  c.976-541

.         .         .         .         .         .           g.32831
ctagggggctgttagtggctataaggcaataatgagattgtttgtgtttaattcttattg  c.976-481

.         .         .         .         .         .           g.32891
aggaaatattttattgacttccaagacattgttgtcatgtagaaagagattattgtcctg  c.976-421

.         .         .         .         .         .           g.32951
tagagagatacatagtatttttgtttcataaatgaagtaaaggaggtaaataaacctgag  c.976-361

.         .         .         .         .         .           g.33011
taaatggcagaaccaagacccaccagtcttagctattacaacattgtaattgctatgttg  c.976-301

.         .         .         .         .         .           g.33071
catttttttccaaagcagagacaaaaaacactgaattattgaaccctgtgataaacaatg  c.976-241

.         .         .         .         .         .           g.33131
cagttagcaggaagttaggagtatgatacaacttatcaagaagaaataatcacaacaggc  c.976-181

.         .         .         .         .         .           g.33191
agatcttctgttaatctttacttttgagtaagactatagtaaggtatttctttataaata  c.976-121

.         .         .         .         .         .           g.33251
tttgcatcatacttatgtaaccatcctgtagacaattaataaataaaatgaaagttttct  c.976-61

.         .         .         .         .         .           g.33311
acttagtggtttgcctaaggatgttatgatagttctaacatcattgtcttgctctattag  c.976-1


Powered by LOVD v.3.0 Build 25b
©2004-2020 Leiden University Medical Center