collagen, type IX, alpha 1 (COL9A1) - 4313 nt intron 33 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.68890
gtaagtatggtgaatagtaatggtataaaaaaattaaaaacattaataaagctgtagaat  c.2112+60

         .         .         .         .         .         .  g.68950
atataatattctgctttatgaaatcattatgtaacattcaattctttttttttttgagat  c.2112+120

         .         .         .         .         .         .  g.69010
ggagtctcactctgtcgcccaggcgtgaatgcagtggtgcaatcttggctcactgcaacc  c.2112+180

         .         .         .         .         .         .  g.69070
tctgcctcctgggttcaagcaattctcctgccttagcctcccaagtagctgggattacag  c.2112+240

         .         .         .         .         .         .  g.69130
gcatgcaccaccatgcccggctaatttttgtatttttagtagagatggggtttcaccatg  c.2112+300

         .         .         .         .         .         .  g.69190
ttggtcagactggtctcgaattccttacctcaggtgatctgcccacctcagcctcccaaa  c.2112+360

         .         .         .         .         .         .  g.69250
gtgctgggtttacaggtgtgagccaccacacccggccaacactcaactcttaaaggactt  c.2112+420

         .         .         .         .         .         .  g.69310
actttcatggaaataaatgtctaaatttgtactttaggcaatggattaatccaatagaaa  c.2112+480

         .         .         .         .         .         .  g.69370
aatacctcaccactgtgtaaatggatttaccttttgaactaaccactggaaaggaagtgt  c.2112+540

         .         .         .         .         .         .  g.69430
tttttttctttcatattgtaaatgactcaatgagtgttacatggtaatactctaatgtcc  c.2112+600

         .         .         .         .         .         .  g.69490
tctccaaatgggtcatttttaaagaactgacttgtgttttttgttgtcaacagtataact  c.2112+660

         .         .         .         .         .         .  g.69550
aaatttcattggcagttataccattgaaaaatatttcagtaattgtcttaatctctgatg  c.2112+720

         .         .         .         .         .         .  g.69610
tgttctagttggggaagtaagatagaggaataatgcataagaaaatataatagcaaatta  c.2112+780

         .         .         .         .         .         .  g.69670
ttagaagtagaaaacgatcttgttcatttttgtcatttttatagaaactaaactggtgtc  c.2112+840

         .         .         .         .         .         .  g.69730
cttagagattagatgtattcagaattatagaatcacttagtaggaaacctgagatgactt  c.2112+900

         .         .         .         .         .         .  g.69790
gctaattggaaaggaattcacatctaaaacaattaggaatttaagaaaggttgaggagaa  c.2112+960

         .         .         .         .         .         .  g.69850
aagatgaagctcagacctcaatctcaaatgccactactgccagcttccataagtttccaa  c.2112+1020

         .         .         .         .         .         .  g.69910
gtccttcctgtttccggaatctcctcaacccttctctgtccctgtccagcatattatcct  c.2112+1080

         .         .         .         .         .         .  g.69970
catggcagccaatgtcatctagattttttaaaaaaataaaacccactgtgtatccctcct  c.2112+1140

         .         .         .         .         .         .  g.70030
ctgtttaaaactctttaagaataaaatcagattcttagcgaggtaaacaaagcctttgat  c.2112+1200

         .         .         .         .         .         .  g.70090
gaagtgttctttgctccacgaacctcatctcctacatacctagaacttcatccatttgca  c.2112+1260

         .         .         .         .         .         .  g.70150
gtttcttttacatgctgtttaacaccttgttctggtctcctcttcctctttccttggaat  c.2112+1320

         .         .         .         .         .         .  g.70210
agctacttcctacttaagcatttcgatctatcctcagcttcactttctccaggaggaccc  c.2112+1380

         .         .         .         .         .         .  g.70270
agtcagacttggttacaatgcctagccttgggctctttgcaaaccgcagagatgaatatt  c.2112+1440

         .         .         .         .         .         .  g.70330
attacatcgtattaacttacctgcctctaaacactatgtctcaagtttcaagtaacattt  c.2112+1500

         .         .         .         .         .         .  g.70390
ttatgcctaagaatttttaacagaaatggttgaggattgagaaaaatttagagtaaacct  c.2112+1560

         .         .         .         .         .         .  g.70450
tgattgagtttggtaatagaaatcctacttcactatctagaaatagtaatgttcaataga  c.2112+1620

         .         .         .         .         .         .  g.70510
aagaattcaagctgtaacaaaagaaaagttaatgaaccatgcagtgacaagaataagtta  c.2112+1680

         .         .         .         .         .         .  g.70570
attgcattcaaatttgcatatagtattaggaattagctcttgattcatctccttccccac  c.2112+1740

         .         .         .         .         .         .  g.70630
aagtgtcttacctgacactgcccaggtaatatgagtgaaattgaagtctactgtcccaca  c.2112+1800

         .         .         .         .         .         .  g.70690
atcaggggaaattgttactaacacaaagacttacactttcttcattgatttcagcataga  c.2112+1860

         .         .         .         .         .         .  g.70750
caaagttgtgaagtaggcgatgtctgtaacctgatttctgtttcagtataccactcctca  c.2112+1920

         .         .         .         .         .         .  g.70810
gttgaggaattttttcccagagacccagggtcctggccatattggcccttaatctcttca  c.2112+1980

         .         .         .         .         .         .  g.70870
ttaggaagttcccagctcttactgtagcagtatttcagtcattatcagcaggattataca  c.2112+2040

         .         .         .         .         .         .  g.70930
ctctgtcgtggtctcctttgttttctgtcagttcttcagtatatttctgagttcattttg  c.2112+2100

         .         .         .         .         .         g.70987
tcttctcttctgggttcttttagaagttgttggcagggcaaggtggctcatgcctgt  c.2112+2157

--------------------- middle of intron ---------------------
          .         .         .         .         .           g.71043
    aatcccagcactttgggaggccgaggtgggcagatcatccaaggtcaggagtttga  c.2113-2101

.         .         .         .         .         .           g.71103
gaccagcctgaccaacatggagaaacctcatctttactaaaaatacaaaaagttagccag  c.2113-2041

.         .         .         .         .         .           g.71163
gtgtcatggcgcacgcctgtaatcctagctactctggaggctgaggcaggagaatcgctt  c.2113-1981

.         .         .         .         .         .           g.71223
gaacctgggaggtggaggttgtggtgagccgagatcacgccattgcactccagcctgggc  c.2113-1921

.         .         .         .         .         .           g.71283
aacaagagcaaaactccatctcaaaaaaaaaaaaaaagaagttgttacagttttgcaccc  c.2113-1861

.         .         .         .         .         .           g.71343
taggcacctgacaatgttgcagccttctatgtaggataccttttccttgtcctgctgaca  c.2113-1801

.         .         .         .         .         .           g.71403
gtctttcaggaagtctttaaaccataatttcttcatagaagcaattttggcaagttgact  c.2113-1741

.         .         .         .         .         .           g.71463
tagatgaatatcaatttcttttgcataaagcgaaattggaaaagcacatttgctgagctt  c.2113-1681

.         .         .         .         .         .           g.71523
tatttggatgtatctagtaaaagcattgcttcatcgccttcttcagtttaaagtatttgt  c.2113-1621

.         .         .         .         .         .           g.71583
ttgaaagagccagctttttctagataaatgatgcatatgaaaaagaagcaggattaaatt  c.2113-1561

.         .         .         .         .         .           g.71643
gctttataaacattcatatcttgaacactagcattcccttgctgcctcgtgttcttttat  c.2113-1501

.         .         .         .         .         .           g.71703
cttctcattcttattctgaacagcagcagtacattggagctattctgccacaaattttac  c.2113-1441

.         .         .         .         .         .           g.71763
cagaggaatttaacaaatttttagtttaacaaaaagtgaattaatttggtctctttttaa  c.2113-1381

.         .         .         .         .         .           g.71823
aacatttatcttagatgattcttttaaatgcttttagtggtctgctttcagctaaaaaaa  c.2113-1321

.         .         .         .         .         .           g.71883
aatctaacttgtatttgcttttatgctaaggaaacacatggtttacttttaacttcttca  c.2113-1261

.         .         .         .         .         .           g.71943
atatttagattttttaacttccttcatacttaagtaagttgtaactttctttggtcaagt  c.2113-1201

.         .         .         .         .         .           g.72003
ttttttttttttttttttttttttttttgagatggagtctcgctctgtcacccaggctgg  c.2113-1141

.         .         .         .         .         .           g.72063
agtgcagtggtgcgatctcggctggctgcaaactctgcctcctgggttcatggctttctc  c.2113-1081

.         .         .         .         .         .           g.72123
ctgcctcagcctcctgagtagctgggactacaggcatccaccactacgccggctaatttt  c.2113-1021

.         .         .         .         .         .           g.72183
tggtatttttagtagagaaggggtttcaccgtgttagccaggatggtctcgatctcctga  c.2113-961

.         .         .         .         .         .           g.72243
cctcgtgatccgcccacctgggcctcccaaagtgctgggattacaggcgtgagccaccgc  c.2113-901

.         .         .         .         .         .           g.72303
acctggcctggtcaagtattttaaatgcagcattttaaatgtggtattttaagtgcattg  c.2113-841

.         .         .         .         .         .           g.72363
atttagtttagtaattcctggatatacctggcatcttcacattctctaaaaaaaaaagtt  c.2113-781

.         .         .         .         .         .           g.72423
gtaagggctaaataacttatgttcttggaaatatctttattttatgcttgctgcatttgt  c.2113-721

.         .         .         .         .         .           g.72483
gatatgcaaagtaacatattttgtaggaatgcaggggcttttatgtagccagaaaatgtt  c.2113-661

.         .         .         .         .         .           g.72543
aacaagcttattgaaaactaagttcctcttagagagtggcttaaagtatgaagaatgtag  c.2113-601

.         .         .         .         .         .           g.72603
tttttaaaaaatgtagtattccaataaacgttttgcaagaataactatccccgaaagaaa  c.2113-541

.         .         .         .         .         .           g.72663
gattattattattattattataatttttgagacggagtcttactatgttgcccaggctgg  c.2113-481

.         .         .         .         .         .           g.72723
agtacagtggcacgatctccgcttactgcaacctccacctcctgggttcaagcgattctc  c.2113-421

.         .         .         .         .         .           g.72783
ctgcctcagcttcccaagtaggtgggacaacaggcatgcaccaccatgcctggctaattt  c.2113-361

.         .         .         .         .         .           g.72843
ttgtatttttagtagagacagggtttcaccatattggccagcctggtctcaaactcttga  c.2113-301

.         .         .         .         .         .           g.72903
cctcatgatccacccacatgggcctcctacaagcgctgggattataggtgtaagccacca  c.2113-241

.         .         .         .         .         .           g.72963
cacccagccaaaagaaagatatattgaaagttaacttgaactagatttctaaaagatggg  c.2113-181

.         .         .         .         .         .           g.73023
taagttgtgtagcattatgtgtcttcaccttgcagtgaaggttttgtaacctctgaaaga  c.2113-121

.         .         .         .         .         .           g.73083
acacctgttaggatgcagagtgcaggaaaccgcaaatttcatataagtgtttatatgagt  c.2113-61

.         .         .         .         .         .           g.73143
atgaagcaggcacattctttatgcttagccctggtttgatagtgtgcaattgtgttccag  c.2113-1


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