collagen, type IX, alpha 1 (COL9A1) - 6573 nt intron 36 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.75561
gtaagtcatcttgcccatgtggaaccaaagaacacaacctttttcagatgtataatctgt  c.2503+60

         .         .         .         .         .         .  g.75621
atcaagctcgaggaatttatgttttaccaatttctgaatatccagtgagataagatgtat  c.2503+120

         .         .         .         .         .         .  g.75681
tattctcttttcaatagtgacggtgaagattcaaaaactgttatataatattcccttgac  c.2503+180

         .         .         .         .         .         .  g.75741
cctgctctaccacaacagtagaccaaatactagaattaaagtcccgtgtcttttaggact  c.2503+240

         .         .         .         .         .         .  g.75801
gatctttttctattatactctacctcaatcatggttcaaaacaaagataatgggatctgg  c.2503+300

         .         .         .         .         .         .  g.75861
taaacgatcattcagctattttttatttatttatttattttttgagaccctaaagtcatt  c.2503+360

         .         .         .         .         .         .  g.75921
gttgagttcctctaacatggcaaccatccttaggatatttgtatttgttatttaaactaa  c.2503+420

         .         .         .         .         .         .  g.75981
taaaatttgttaacaggatgtaagaaaaatatgcattagagctgcctccctcttttaaaa  c.2503+480

         .         .         .         .         .         .  g.76041
catgacattggatatttagttttgatggatttttttttcagctctgaagtacaatctaat  c.2503+540

         .         .         .         .         .         .  g.76101
tccttctttagtatgtaagatagcttgtttcttccacttttatttaaagcaagttaagcc  c.2503+600

         .         .         .         .         .         .  g.76161
cttgcatccaggattttgcagaaaaatggggctatgagtgtgttaggtactcagcaggac  c.2503+660

         .         .         .         .         .         .  g.76221
tggtggaagaactggctgtctcatttggagtttgctagttgaggggagtaagtatatcag  c.2503+720

         .         .         .         .         .         .  g.76281
cttggggtgtatgtgccctggataatttacagagaggactaaataaagtgagtagtttct  c.2503+780

         .         .         .         .         .         .  g.76341
atgtcatgatgagtgactgacagctttctggagaacttcagaaagacgtggcatcagaaa  c.2503+840

         .         .         .         .         .         .  g.76401
caagagagggttgttttttttttttttaagtactgcggtgctccaattagggataaatac  c.2503+900

         .         .         .         .         .         .  g.76461
tgtggtatgaatggtcagatggcaagcaagctgcctttttggatctataaatgaactgct  c.2503+960

         .         .         .         .         .         .  g.76521
gatgcagttggctaactagaccttcagctggaacaatttatttaattacatttttttttg  c.2503+1020

         .         .         .         .         .         .  g.76581
gcgtgttcagagcttcatgttaaaaaaatggggtctaactgagacctcttataaggctgg  c.2503+1080

         .         .         .         .         .         .  g.76641
catgaattcaaagctttgggaggctagacaaaatcaaatagagtacagactgagggtaga  c.2503+1140

         .         .         .         .         .         .  g.76701
gtttttcttaaagagaactgaacattttctttgaaagagtcacatacctattcatctttg  c.2503+1200

         .         .         .         .         .         .  g.76761
tccagctttactagttcaggagctcatgccttaggtgctctctctatggttagtctcaat  c.2503+1260

         .         .         .         .         .         .  g.76821
tcactctgtaaataatttctaagaaactctacagccttaggtagattgttgacttcattg  c.2503+1320

         .         .         .         .         .         .  g.76881
gatctgttgtgcaaaagcgggtggatcatgacgacctggccttttctgagttcactttag  c.2503+1380

         .         .         .         .         .         .  g.76941
ggagtggttctgagagagcagtccccggagcagcggagtcaccagggaccttgttaggaa  c.2503+1440

         .         .         .         .         .         .  g.77001
tgcaaattcgctggtccacactgagtccactgaatcagaaactctggggtcgaggtctag  c.2503+1500

         .         .         .         .         .         .  g.77061
ctgtctagtttaacaggccctcctggtggttctgctgcacctggtgtggagcaatcgccc  c.2503+1560

         .         .         .         .         .         .  g.77121
attttcctactgaaagggaatgacttatagggcctatagacatcacagccctattttctt  c.2503+1620

         .         .         .         .         .         .  g.77181
tggttaacaggaagtctccttggggcagagcttaactttgtttgagctagtaacagaact  c.2503+1680

         .         .         .         .         .         .  g.77241
cttctttaaaaaatgaaagctaagctaggacagtctaaagctgcctttgtcagccttgcc  c.2503+1740

         .         .         .         .         .         .  g.77301
tgcacactggaattgcctgaggagcttaaaaccactgatatctggatcccattctcagag  c.2503+1800

         .         .         .         .         .         .  g.77361
attctgattttattggcttgggcattgggattttaaaatattctccaggtgattttaatg  c.2503+1860

         .         .         .         .         .         .  g.77421
tgcagccagggttgagaaccactggaaacaatggtgaatagtttggggaagctttagcaa  c.2503+1920

         .         .         .         .         .         .  g.77481
cagtgaattgtggctaggctgggttgggttggctctagcagatgaacctcagtttgaaag  c.2503+1980

         .         .         .         .         .         .  g.77541
aaacaaaagtaaatttctatatttggaacctgggaaatggctctagcactaagttcgttt  c.2503+2040

         .         .         .         .         .         .  g.77601
gtcaagtatagcttgatcatgtgaggtatttcctcttaatttttcttcagtattcatgac  c.2503+2100

         .         .         .         .         .         .  g.77661
ataatctataacatgaagtgatacaattcttttcccttttccaaaggattttttttctcc  c.2503+2160

         .         .         .         .         .         .  g.77721
ctaccctcctccatccctttctcgttatcagattcctttaaagctgtatcttctcttagt  c.2503+2220

         .         .         .         .         .         .  g.77781
ttaacttctgagaatttggggtggaggtagggagcggtaattaaatttttaaaatcaatt  c.2503+2280

         .         .         .         .         .         .  g.77841
aacactgtcatacttttggaaatgtatgattttaggtagctggatttgattcttcttgtc  c.2503+2340

         .         .         .         .         .         .  g.77901
ccaccacatacattaacaggagtatttattagaaaacatatagctttgtaatatccaagg  c.2503+2400

         .         .         .         .         .         .  g.77961
ggttacagctgaaatttccctgagcataaacattccaccaatttgaaacttaaattttca  c.2503+2460

         .         .         .         .         .         .  g.78021
gtcaattagaggagagatatatttcagtattgcttgctggcttttttccccatccctggt  c.2503+2520

         .         .         .         .         .         .  g.78081
aaagaagggatggtatgaatcttgctctaccatatggtcactttgagagcctttttccag  c.2503+2580

         .         .         .         .         .         .  g.78141
agaaactgctgcataaataacaaacaagttttattatgaatgcttgaacagttcagccta  c.2503+2640

         .         .         .         .         .         .  g.78201
tgtcttagtcactgtttttctcctagaaaatactctgaagaacacagtagaacattttca  c.2503+2700

         .         .         .         .         .         .  g.78261
ataggaactagtagaaatatgcctcaaatcatagtcaaagcttaggttatatctataatt  c.2503+2760

         .         .         .         .         .         .  g.78321
tttctgtttttcactgacatgctttacacaatattatacaaaatgttagggcccaggctt  c.2503+2820

         .         .         .         .         .         .  g.78381
aaaacctgagagatatctaactggccttatattcactttgcttggtattacattggtctt  c.2503+2880

         .         .         .         .         .         .  g.78441
ttgtgtcataaatattagttttaaatattcacagtttggattaattttaagtccctttga  c.2503+2940

         .         .         .         .         .         .  g.78501
gtaaggctgtatatttttagatattttagtgtgaatcaaacagacactgcaatatgtaaa  c.2503+3000

         .         .         .         .         .         .  g.78561
tgaaggtttgagaaaacacacatgtcataattatgactaacacctttctcagtgataatc  c.2503+3060

         .         .         .         .         .         .  g.78621
tgtttacatggagatagagcatcaattatagctcatgaataaatgaaataaatagcaact  c.2503+3120

         .         .         .         .         .         .  g.78681
atagagcaatgagaatttccactcgttcataatgagctgtttttctgctgaagctgtgta  c.2503+3180

         .         .         .         .         .         .  g.78741
tttttctttataccttacctaaagcttattttacaagctctttatgcatattttttgact  c.2503+3240

         .         .         .         .         g.78788
gaggaggctaacaaagctggacctttagttccctaagctggtttttg  c.2503+3287

--------------------- middle of intron ---------------------
 g.78789            .         .         .         .           g.78834
 c.2504-3286  tacatctcaaaataagacatgatcagggtttgaagtaatagattaa  c.2504-3241

.         .         .         .         .         .           g.78894
ccttgtcgatagaaccaacctgtatacatggtttgctgtggagtagcagtttgcagaata  c.2504-3181

.         .         .         .         .         .           g.78954
ggctctgttttggagctcatcttaaaacttgtttttctctgactgataaccaaaagacag  c.2504-3121

.         .         .         .         .         .           g.79014
tatcacaacaaagacactggtcttagtcctcgaagcaacattaaaagttggtgtggcttc  c.2504-3061

.         .         .         .         .         .           g.79074
atgctagaatgtacaaacaagtttagcttttactatcagtgtaaaagccacactttaatt  c.2504-3001

.         .         .         .         .         .           g.79134
tataatcttcatctcatatcttcagaaatgtggcacatttagacagtctgttctcattgc  c.2504-2941

.         .         .         .         .         .           g.79194
cagcctccagaattatagtgatatgacacttaaattaccaagttaacaagaatgcttatg  c.2504-2881

.         .         .         .         .         .           g.79254
ccattagtttataagatgttaattgtcgtatcttcctaatatagtaaggccatattgatg  c.2504-2821

.         .         .         .         .         .           g.79314
atgaatgttaaaaaaactagcttatgtaaatatgagttcaacctgagttcaatccgtcat  c.2504-2761

.         .         .         .         .         .           g.79374
agtatttatataaatttaaattgttttgaaatgtgatgaaatgtagtttatcataaaaac  c.2504-2701

.         .         .         .         .         .           g.79434
attcacatgaagacattcacaactaaaatcaaagtatggtgactaaatattcacttcaga  c.2504-2641

.         .         .         .         .         .           g.79494
attagagatctttgactatctgagtgcagatggttatacagatattttttctgtttttgt  c.2504-2581

.         .         .         .         .         .           g.79554
tgtgtacatgactttgtttttaaaattataacaaatatgacttaatattgaatgaggcta  c.2504-2521

.         .         .         .         .         .           g.79614
agctgaaacaaatgtttggaaaaaaaatggtatgtatagaatttattgcaaggtgccatt  c.2504-2461

.         .         .         .         .         .           g.79674
gcattttctaacagcatagtagaataatgatatactactgtactaccggaataatgggat  c.2504-2401

.         .         .         .         .         .           g.79734
aatgccttcaacaaagagcagcagacatcatttaggaccagttaactaaggaattaatgc  c.2504-2341

.         .         .         .         .         .           g.79794
cttttgttaatgaggtcaagttgctgggtttggtatcttcaggggctgggataattaatg  c.2504-2281

.         .         .         .         .         .           g.79854
caactttgttctgtggctgctaaatccccaatttcaatcaactgtcttgtaaatgtcttg  c.2504-2221

.         .         .         .         .         .           g.79914
caaatccacatggttggttgcaatccaaagtatgttccctataaacaatgagtcagtagt  c.2504-2161

.         .         .         .         .         .           g.79974
gaaatgtagacactgtaacaacacactttatgtttttaagattgattaatttatatttca  c.2504-2101

.         .         .         .         .         .           g.80034
taatactaaatttatacagttccaaaaattaacaatgtataaaaaagatatttagtgaag  c.2504-2041

.         .         .         .         .         .           g.80094
tttctctcctatccctgtctcccatctgcctaatttcctttctccttcccactaggtaat  c.2504-1981

.         .         .         .         .         .           g.80154
caatactattcttttcttacatatccttacaagcaattctatataaggatacatgaatat  c.2504-1921

.         .         .         .         .         .           g.80214
gtattttttctacatccttttaaaaatgaatcatattgtcctttagcaagtgttctggaa  c.2504-1861

.         .         .         .         .         .           g.80274
cttgcctttttcactgagcagtatgccatggagaccattccaaagagcttcctggctatt  c.2504-1801

.         .         .         .         .         .           g.80334
cttcacagctgcatagtgttctattctgtggaaattctgtaatgtctttaaccttttaat  c.2504-1741

.         .         .         .         .         .           g.80394
ggacatagattgtttccaaccttctgctattatggcaaggctgcagtgaacaacattgta  c.2504-1681

.         .         .         .         .         .           g.80454
catatttcatttttgtattaaaaagcagcatacactccatctttatctctatgataaatt  c.2504-1621

.         .         .         .         .         .           g.80514
cctagaagtagaactgctgggtaaaaattttgatagctattgtcaaattagcctccaatg  c.2504-1561

.         .         .         .         .         .           g.80574
ggattgtacaaatttatactcttatcagcaattcataatagtgcatattccacagacttg  c.2504-1501

.         .         .         .         .         .           g.80634
ctagtatatctttaattgaactttggaatttttgccgatcttataggttaaaatagcatc  c.2504-1441

.         .         .         .         .         .           g.80694
cttttttttttttttttttttttttacaatttgcatttattttgttatgagagtgaagtc  c.2504-1381

.         .         .         .         .         .           g.80754
agggaatttttcatatatttaagagccatttttacttccttttagtggcctgcctgctca  c.2504-1321

.         .         .         .         .         .           g.80814
tgtattttggtcatttttttgctgttgtgttgttggcctttttgtattgattttaggaac  c.2504-1261

.         .         .         .         .         .           g.80874
ccttcatattttgaatcttaataaaaaggccaatctgaggtcataattctcccttgtttt  c.2504-1201

.         .         .         .         .         .           g.80934
cttttgattcttaacttacagtaaaatacttgatccatttgtattttatcctggaatagg  c.2504-1141

.         .         .         .         .         .           g.80994
gtgtgaggtatagatctaacttttcttttccagttgactacccacttcttccaataccat  c.2504-1081

.         .         .         .         .         .           g.81054
ttactgaattgttcaactttttcccactttaagacaccaccttcattataaacccaaatc  c.2504-1021

.         .         .         .         .         .           g.81114
ctgtatgtatttgggcctactttttgggctttctattctgtttcactggtctgagtattc  c.2504-961

.         .         .         .         .         .           g.81174
agggagcaacaccacacattttagttgatttaatatctggtcaacttaattcccttcatg  c.2504-901

.         .         .         .         .         .           g.81234
ttgcttttctttatggagtttttgtggcttactctggcttatgtgtttttctatacaaac  c.2504-841

.         .         .         .         .         .           g.81294
ttcaggatcttcttttctgataaaaaatgggtttgtatttttattaagatcatgatgaaa  c.2504-781

.         .         .         .         .         .           g.81354
attcagcttggggagaactggcaatattttatgatgatatcatttctatttaagaatgat  c.2504-721

.         .         .         .         .         .           g.81414
tttcaagtcttctggtgtcctttagaaatgttaaactttttgtcatgttggacttgccta  c.2504-661

.         .         .         .         .         .           g.81474
tttctgattagttttattcctcgttatttaatattttaattgttattataaatggtatct  c.2504-601

.         .         .         .         .         .           g.81534
tttttactatgtcttattactggttgtgttaatatatataaaattttaatttccatatat  c.2504-541

.         .         .         .         .         .           g.81594
taattttgtaccctgctagttgactgaatgccactgtttgtaatagtttttgagttaact  c.2504-481

.         .         .         .         .         .           g.81654
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.         .         .         .         .         .           g.81714
aaaccaaaagttatatattagtgataaagtaggcgtctttatattgttctgattgtagtg  c.2504-361

.         .         .         .         .         .           g.81774
gaactaattcttgtgtttcccattaagcataatgctagcttttgggttgagatagatata  c.2504-301

.         .         .         .         .         .           g.81834
tttttcgtgtttaggaagtggccattggttcttattttattgaatgttttatcaagaatg  c.2504-241

.         .         .         .         .         .           g.81894
catgttcaattttgtcaaatgtcattccagtatctatgaatataataatttgattttccc  c.2504-181

.         .         .         .         .         .           g.81954
cccttagatctattaatagatgaacttgatttttgccttgctacatactcactacaatct  c.2504-121

.         .         .         .         .         .           g.82014
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