collagen, type IX, alpha 1 (COL9A1) - 8850 nt intron 37 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.82212
gtaagtgtgttgtatagctgagaggaggaggtagcgaaattggtagcaagtacacagcct  c.2581+60

         .         .         .         .         .         .  g.82272
gaattgaataaaattttaaaataattgttatttgatcacttaagcatattaattattcag  c.2581+120

         .         .         .         .         .         .  g.82332
aatggctagcatagatttttcaagaccagctttagtaaagaattaaatgatctgtaaatc  c.2581+180

         .         .         .         .         .         .  g.82392
aaatcagaaaataggtatcaggacttgaaatactaatttccttaaatagatgcttcaaga  c.2581+240

         .         .         .         .         .         .  g.82452
aaaatagtgtcaaggtccaggcacaatgcacttgttataaaattctgaataaattggatc  c.2581+300

         .         .         .         .         .         .  g.82512
ctatctatttctaaagcaggtgatagtttcctgtttttttttttaatctaaaatgccaga  c.2581+360

         .         .         .         .         .         .  g.82572
gcagtaggaagattagcctgtttttaatctcttgcacaaggagtaactgaaattttattt  c.2581+420

         .         .         .         .         .         .  g.82632
ttaaagctcccctttcaaacacccagaccctccaaaaccccacatccaaaaagaaagaaa  c.2581+480

         .         .         .         .         .         .  g.82692
gaaagaaaatacaaaactgaacattcctgctcataatcactaagagccacacatcacagc  c.2581+540

         .         .         .         .         .         .  g.82752
tgtgtcaactgaggtgacagggtagcccttgtgtgaagggcccagattctctcactgggc  c.2581+600

         .         .         .         .         .         .  g.82812
cttctgttctctttatacactggctaccctgtcaccagagtccaggctggaacacactta  c.2581+660

         .         .         .         .         .         .  g.82872
tcccttaggaaatgacttacaagcccaagcacagaggcaacatagcagggccaaaagcca  c.2581+720

         .         .         .         .         .         .  g.82932
gttcagtttaagggcatgaatgatgcgcaactttccagcaaacgctctcttattgtgggg  c.2581+780

         .         .         .         .         .         .  g.82992
aggcagtggcttaggaaggctcccaaagccctaggggtctgttgctgaggagagttgaga  c.2581+840

         .         .         .         .         .         .  g.83052
tgatacttgcttccacaatggtttgggaaaacttggcttagggaagtttaggaaaagaaa  c.2581+900

         .         .         .         .         .         .  g.83112
ttacaattttctaattctgccagaggctgatgtatttaatcacagctataattgtagcca  c.2581+960

         .         .         .         .         .         .  g.83172
aaaacatcattgctttccaattatccatttcattgcttctggggattgtgttctcattaa  c.2581+1020

         .         .         .         .         .         .  g.83232
aaaattttttaaaaaaacatgaatgtttggagataactcaaacactgcctttctaaaact  c.2581+1080

         .         .         .         .         .         .  g.83292
gattcatgggctcatcaaaatgttttcacatattgataaatttttataattggaaatgga  c.2581+1140

         .         .         .         .         .         .  g.83352
agatttatgattagtaatgaaaggaaaatctggcttaaatgggatttagagaagatttta  c.2581+1200

         .         .         .         .         .         .  g.83412
atatacggtaaagcttggattcattgatgggtgtgtagaggagaggaaaaggaaatagaa  c.2581+1260

         .         .         .         .         .         .  g.83472
tttactaaaggtgcctgtctccatcaccagtagtaggaataggaagttttgaggctgaca  c.2581+1320

         .         .         .         .         .         .  g.83532
acataccatcatcacaatttacttaattatctatatatttatgagaaagcctaataactc  c.2581+1380

         .         .         .         .         .         .  g.83592
cttcttctctcattttattgacaaatcgcttaacagttcttgaaccaatgacttgcacta  c.2581+1440

         .         .         .         .         .         .  g.83652
ttggcaacattttcctttattgaaaatgtattatggtttatagggattctcactttgaaa  c.2581+1500

         .         .         .         .         .         .  g.83712
ataatctgttggtaagccacaatttaaatgtaaagatgagaagattgagaagatcagctc  c.2581+1560

         .         .         .         .         .         .  g.83772
catgtgtgctgtgtcccagactgtcagaagcacattatctcccacctgcagtaaaccatt  c.2581+1620

         .         .         .         .         .         .  g.83832
ttcaggagccaagttgatggggggcgcaaacggggcacacagtcagtcagaggggcttcc  c.2581+1680

         .         .         .         .         .         .  g.83892
ccgacttgctttttagaacatcagaccatccacgtgtaagtaaattgtgaggcaggacaa  c.2581+1740

         .         .         .         .         .         .  g.83952
gatcatcatttgcagccctccctaggatcgcttacaaacaaaattattaattttagctga  c.2581+1800

         .         .         .         .         .         .  g.84012
tcttggatttaatcttaaatctgaattgttgaaacattttgtggaccccctgatccaggg  c.2581+1860

         .         .         .         .         .         .  g.84072
gactcctaatacctgtcctttctgttttccttttcctttcttcctttggccagtccttgc  c.2581+1920

         .         .         .         .         .         .  g.84132
ccctgctttcctgggatcacctccaaaatcgttgccctcctctgatctctcccctcctct  c.2581+1980

         .         .         .         .         .         .  g.84192
cactttgctctccccatcagctctgattatctcccatccttctcacctcccagctgactc  c.2581+2040

         .         .         .         .         .         .  g.84252
ttctttcttgatttccttgtcctggtttctatgtctcaacctcggtaaccttcctttttt  c.2581+2100

         .         .         .         .         .         .  g.84312
ggacttttgttaccttttaattgagacgatatctgacattatttagtgacaaatctgagt  c.2581+2160

         .         .         .         .         .         .  g.84372
tccagattatttttcaggaatataggctaactttcaaaagcacagatgccagagaagagg  c.2581+2220

         .         .         .         .         .         .  g.84432
ggtctgctggtggatcgttttctgcgctttggcgcggtgtcctcgtgtagtgcgcaggtg  c.2581+2280

         .         .         .         .         .         .  g.84492
aaagcaccagctgagggcttgggtttcgaggtcggcccacattctcttgttgacaccgtg  c.2581+2340

         .         .         .         .         .         .  g.84552
catatgctcaagtcagtcaagttcctgacatgagctttttgggtcattcctcccttaaag  c.2581+2400

         .         .         .         .         .         .  g.84612
ctagtacctggaagtgggctgtttgaagagtggcatctacaattcagacatcctaggttc  c.2581+2460

         .         .         .         .         .         .  g.84672
acgttttgactatgccactaactaactttatgatattgggcattttacttaatttctcta  c.2581+2520

         .         .         .         .         .         .  g.84732
cacctcagttttcccatttataaaacagtgataacaagaacatctctctgatagggtaat  c.2581+2580

         .         .         .         .         .         .  g.84792
tctgagaaataaagaaactcaatccatgtaaattgcttaagacagttcctggctatagta  c.2581+2640

         .         .         .         .         .         .  g.84852
ggcgctcaagaaatgttggttgttcatactattattaatatatcaagtccactttttgct  c.2581+2700

         .         .         .         .         .         .  g.84912
ttttaaggtggatcaaggaaagctgagggcaaagttgggccccagttcagcccctgcagc  c.2581+2760

         .         .         .         .         .         .  g.84972
ttttttctcttgccgttgatcagcagtaatatattactcttctctaaatcagcaccgccc  c.2581+2820

         .         .         .         .         .         .  g.85032
ctgatgcccagaccttccctccatgaaagtctacttcaactccaaatcacaaatgcgaag  c.2581+2880

         .         .         .         .         .         .  g.85092
tactgggtagcagtacatcttttcactggttaattgtccactgaggctatactgcttttt  c.2581+2940

         .         .         .         .         .         .  g.85152
atttcttggtagagcttgaatgtgactaggaatgtgatttctgatctctcaaaaacataa  c.2581+3000

         .         .         .         .         .         .  g.85212
tattaataggactttaaggcctgatgaaacttcaaaaggattctgtgcagtaatttgtct  c.2581+3060

         .         .         .         .         .         .  g.85272
ggaaccgtctagataaaaaaattcttttcttacctaaaataaagaaactgcagaacagca  c.2581+3120

         .         .         .         .         .         .  g.85332
tagtctgcaaccttctttgttgttcctgttgttggatttggggctcaaatcctcctgaat  c.2581+3180

         .         .         .         .         .         .  g.85392
aaaaaaaaaaaagatagttggatcattctttgtgctaaggcatttaacatatttttaacg  c.2581+3240

         .         .         .         .         .         .  g.85452
atgtaactaatatcatcattttctatcggttgttagagttcctgtattctttctggacag  c.2581+3300

         .         .         .         .         .         .  g.85512
ttttagttccctgtctcccctctccaatgctgtatctctgtttgttcagtgttaagtatt  c.2581+3360

         .         .         .         .         .         .  g.85572
acatgccctgcagggacataatgctcattgcttgttatggaacacaggttattattataa  c.2581+3420

         .         .         .         .         .         .  g.85632
cctttacattgatgatcattttggctacagtgctttgttgtttaaaaagtacacatgcac  c.2581+3480

         .         .         .         .         .         .  g.85692
aatctagtttgtttctcacagccaggagtaggctgggtgaatatttaagaagtgcagaca  c.2581+3540

         .         .         .         .         .         .  g.85752
tggagccaggctgccagggcttatgcactattcttttaccttgaagtgcttcagtttcct  c.2581+3600

         .         .         .         .         .         .  g.85812
cttcagtgaatgggaatcactatgcctaccttgtatttagagcatatatgcacatgttaa  c.2581+3660

         .         .         .         .         .         .  g.85872
tacatgtaaagctcttggaacagtgcctggcatatggcaaacagacactctgacattatt  c.2581+3720

         .         .         .         .         .         .  g.85932
tagtgaaatttaactgttattattgttgctccctttttttataatatatttgagaaaata  c.2581+3780

         .         .         .         .         .         .  g.85992
cagactcttaaattcatgtcctgacaaaagtctgtcaggtaataacaagacagatattca  c.2581+3840

         .         .         .         .         .         .  g.86052
tgcttcctgagtctatgttcccaaagtggacagaatgattggctggctgtctaatcatac  c.2581+3900

         .         .         .         .         .         .  g.86112
gattagtttttctttgcaacctagacatgtgaattgagcatgtcccataattgctgagtg  c.2581+3960

         .         .         .         .         .         .  g.86172
tctcgcttctttctctgcctctcttgcagagctacgtggatcacattagcaatccctgga  c.2581+4020

         .         .         .         .         .         .  g.86232
actttagtctcccccgccttcagttttgtgccacaggtcagctagtgttattgcttggtc  c.2581+4080

         .         .         .         .         .         .  g.86292
ggttgtctcaaagactctctctgctgccaccaaacttgcccattgggactagttcctcgt  c.2581+4140

         .         .         .         .         .         .  g.86352
cactctgagaattttaaaggaacatatttattaataataaagagtcctgacttcctcttt  c.2581+4200

         .         .         .         .         .         .  g.86412
gtgcactcactagggcaaaacataaattaaatgacaaatcatttgaatgtgaacactagg  c.2581+4260

         .         .         .         .         .         .  g.86472
aaggtgacttgtgagctaaggtgctttttgcctcttggacatggaagttgtagctggctt  c.2581+4320

         .         .         .         .         .         .  g.86532
tgtgctggactatgctaggttataagagtatttggttttcttgtgcaaagtccacagaaa  c.2581+4380

         .         .         .         .       g.86577
ggtgagctttgcttgagactattgagtggaaaaatacacacgcac  c.2581+4425

--------------------- middle of intron ---------------------
  g.86578           .         .         .         .           g.86622
  c.2582-4425  acattcagttctgggctaagtttttcagtacctaatttttccatt  c.2582-4381

.         .         .         .         .         .           g.86682
tccattgctgcagctgttttatttggttgctgggccttacataaaccagtttataattcc  c.2582-4321

.         .         .         .         .         .           g.86742
ttaaacatatactgctttgtcaaataccacaacattaagctcaagaaatataagaaactc  c.2582-4261

.         .         .         .         .         .           g.86802
ctggtacatacaaaaagtctacataaccagtggattaattatgaaataccctatttaatg  c.2582-4201

.         .         .         .         .         .           g.86862
tgaaaattattcactttttttgttttgactgtatacacagtcccttttacgccacagcat  c.2582-4141

.         .         .         .         .         .           g.86922
gtattaggtgaggggctgcctccagaatgatccagccgagatgggcttccatcagtgtaa  c.2582-4081

.         .         .         .         .         .           g.86982
catgactaccctctagtggttttatagagaatgacatagctattcatttgtttaaaaaaa  c.2582-4021

.         .         .         .         .         .           g.87042
aaacgtttagcaataattttaaatattttattttattttaattgacatataatagttata  c.2582-3961

.         .         .         .         .         .           g.87102
catatttatgggatatgtagtaatgtttcaatagaaatattacataatgaccagattagg  c.2582-3901

.         .         .         .         .         .           g.87162
gtaattagtatatccatcatctcaaacatttatcatttctttgtattgggaatattcaac  c.2582-3841

.         .         .         .         .         .           g.87222
atatttataggtccttgacatttcagaaaaccatgtaatcattaggcagttagtgtaagt  c.2582-3781

.         .         .         .         .         .           g.87282
aatacacacatgaggcaggcagagcagaataacactttagatgcatgttttctctttctg  c.2582-3721

.         .         .         .         .         .           g.87342
aagagttacaaagcagttgatagatattcatgaatgtagctgctgggctaaccatttatg  c.2582-3661

.         .         .         .         .         .           g.87402
cccattttgtgaaccgttattatgagtcagcttcactttttgagtgatgtggactgtgga  c.2582-3601

.         .         .         .         .         .           g.87462
catagtgtcacccaactgaggctcccacatagtttagaacatacatgagagcaaaggccc  c.2582-3541

.         .         .         .         .         .           g.87522
tgggtcagggctttccagagcctgacaatctgctatgttaaggctgtttttttttctctg  c.2582-3481

.         .         .         .         .         .           g.87582
gtatttctacagggcaaaacctcagagaaatatcttagtttcttatgatcattagagctc  c.2582-3421

.         .         .         .         .         .           g.87642
tgcaaaagtcaatactgtgctttgtttttgtacctctgtctacttcctggtcaactcagg  c.2582-3361

.         .         .         .         .         .           g.87702
cccaaggaattaaaaaaaatgaccacacacacacacacacacacacacacaccctgccac  c.2582-3301

.         .         .         .         .         .           g.87762
acccctccacacccttccacagagttaaaaaaatcaataggtaggaaaatacagttagtg  c.2582-3241

.         .         .         .         .         .           g.87822
cagtggttaagggtcctcatttctggctatatgactatggacaattatttgaccttccta  c.2582-3181

.         .         .         .         .         .           g.87882
actctcagtttatgcatgagaaaaatgggctcaataatgagcatagtgtatgcccatgga  c.2582-3121

.         .         .         .         .         .           g.87942
aaagagaaagcattctcattaagcatttgtggtgatgatgatgatgatgatgatgatgat  c.2582-3061

.         .         .         .         .         .           g.88002
gacatcatcaaaagctccaaagggtaaattgctgcatttgccaaaggcagaactggatga  c.2582-3001

.         .         .         .         .         .           g.88062
gatgcatgcttcataaaataaatcaagggtagacaggatggcttcatcgactcttccttc  c.2582-2941

.         .         .         .         .         .           g.88122
agaggataagcagcaatttggaataaactcagcaaggtaaaaaagaaaaagaaaaacttc  c.2582-2881

.         .         .         .         .         .           g.88182
tcctgaagtgtgttgatggggaaccaaatgtgaaaatctaaaaagctatccttctgcttt  c.2582-2821

.         .         .         .         .         .           g.88242
ttaatattgttagtgtattagagaataaattacttaaaacttaaggtttttggctggctc  c.2582-2761

.         .         .         .         .         .           g.88302
tacaaatgttgaaaaaaatttgaattagttgctaacatttaaacattgggagatatttat  c.2582-2701

.         .         .         .         .         .           g.88362
ttaaagactcagcttcctggcctctcttgaaaattatcagaagttctggcaacactggcc  c.2582-2641

.         .         .         .         .         .           g.88422
tgtattccccgatgacagctgttagctggagaagagctgctgcccgcatccactttccag  c.2582-2581

.         .         .         .         .         .           g.88482
ctcaccacaggcctcactcctccctttggtctccccaacacttacgtggaatattagtgg  c.2582-2521

.         .         .         .         .         .           g.88542
ccaaatttcattgcatttgtactttacgttttcatctggtaaaaacagtgggggaatttc  c.2582-2461

.         .         .         .         .         .           g.88602
ttaatccaggcttgtttctttataacatcagggatcagcaaactttatttgtgaaggatc  c.2582-2401

.         .         .         .         .         .           g.88662
agattatttggctatgggcaccatattgcagctatttaactctgccctggtacgccaaag  c.2582-2341

.         .         .         .         .         .           g.88722
cagccacagacaatatgtaaacaaatgaccatggtcgtgttctaataaaactacaaaaac  c.2582-2281

.         .         .         .         .         .           g.88782
aagatttagctcatgagctgaagtttgcccacccctgatctcaatgaccatcccagcccc  c.2582-2221

.         .         .         .         .         .           g.88842
tgtgctcatttggttttctacctcttctttgggcatttccttctcctaaacttgatttga  c.2582-2161

.         .         .         .         .         .           g.88902
ttttaaggcacacctggtatgtctcagtgggaacattcctagtgataaggtgcatgaaaa  c.2582-2101

.         .         .         .         .         .           g.88962
tcggatttagatctggctcatcttttaaaccttaaaaaaatcaacttcacctttaactgc  c.2582-2041

.         .         .         .         .         .           g.89022
atctggtgttaaggatcttaacaggtgctgctaagggcatagttctgctacagctttatc  c.2582-1981

.         .         .         .         .         .           g.89082
tatagatgctgtggattagggagaagctttctcagggacctcatcattaaaagaaaacac  c.2582-1921

.         .         .         .         .         .           g.89142
ataatgatctgcttcatacttactaggtatagttgaatgaaagtatatgggataaattag  c.2582-1861

.         .         .         .         .         .           g.89202
ggaaaattacttatatctctgcttatctatagctttgagatggataaattcaaagataat  c.2582-1801

.         .         .         .         .         .           g.89262
tattctcccttaaaacttattaatatattgccctatgacattgctttgtgtggatcgaag  c.2582-1741

.         .         .         .         .         .           g.89322
tgtatgcaccagaggaagaatgagatgttatgtaaagcaggatctctaacctaccttcct  c.2582-1681

.         .         .         .         .         .           g.89382
tctaaaaatatgtgagatatatatgaataagaccatattactacagtaagaccaacaaaa  c.2582-1621

.         .         .         .         .         .           g.89442
gacatataaaaagacaactgaaatagaaaaagaaaagtaaaaaccacagagaaagaagga  c.2582-1561

.         .         .         .         .         .           g.89502
gagtaaccaaatataagcaaatatgtagttgaacatgtagatttggcttccggctttttg  c.2582-1501

.         .         .         .         .         .           g.89562
gctgaaagaccaggttaagatggctgagatggaatgaggatccctatattattttggcat  c.2582-1441

.         .         .         .         .         .           g.89622
acacaatttgttttacactgacttctcatcaccacttttgcaataattgtgtgaaagtgc  c.2582-1381

.         .         .         .         .         .           g.89682
tgctagtgcactggggtaaacattcagcagaaattcctctttgttatggggtgctgtgcc  c.2582-1321

.         .         .         .         .         .           g.89742
tcagagagtgtgccccattgagggcaacatacaacccttaaacacgacaaaaggaagaca  c.2582-1261

.         .         .         .         .         .           g.89802
agcaagaaatgtcccccagagaacctgctattgcaaagttcatgttggggtcagcccttc  c.2582-1201

.         .         .         .         .         .           g.89862
atgagaaaaatatgaaaatttgtagggcacatggcacagccttctaaaagacattaatca  c.2582-1141

.         .         .         .         .         .           g.89922
ataatatcttaataattgtaataatagcccctatttatcaggtgcttccaattgtagaat  c.2582-1081

.         .         .         .         .         .           g.89982
tattattattattatttttaagacgaagtcttgttctatcgcccaggctggagtgcagtg  c.2582-1021

.         .         .         .         .         .           g.90042
gcgcgatctcggctcactgcaacctctgcctcccgggtgcaagtaattctcctgcctcag  c.2582-961

.         .         .         .         .         .           g.90102
cctcctgagtagctaggactacaggcatacaccaccatacctggctaatttttttgtatt  c.2582-901

.         .         .         .         .         .           g.90162
tttagtagaaatgaggtttcaccattttggccaggctgatctcaaactcctgacctcagg  c.2582-841

.         .         .         .         .         .           g.90222
tgatctgcccaccttggcttcccaaagtgctgggattacaggcatgagccactgcacctg  c.2582-781

.         .         .         .         .         .           g.90282
gcctgaatttaattattaggaagacattatcccatcttgtagatgaagaaactgagagat  c.2582-721

.         .         .         .         .         .           g.90342
tagtgacttgctaatgtcacatttttcataaatgatagggctagaatgtaaagctatttg  c.2582-661

.         .         .         .         .         .           g.90402
tctccaaaacctgtgtttttaaccgctaaactatacttctccctgcccggatgttgctca  c.2582-601

.         .         .         .         .         .           g.90462
actcttagaagtaaggaatactgctacttgcattcaaaagaaatataatgtgagccacaa  c.2582-541

.         .         .         .         .         .           g.90522
atgtgagttgcatgtatgattttaaatcaagtagccacatgaaaaaggtaaaaataatca  c.2582-481

.         .         .         .         .         .           g.90582
agtgacattaattttaataatatagtttacttaacccactgtgtgcaaaagatcatttca  c.2582-421

.         .         .         .         .         .           g.90642
tcatgtaatagacacaaaaattattaatgaactattttacattttttcatatcaagtctt  c.2582-361

.         .         .         .         .         .           g.90702
taaaatccaggtgtgtttgatccttagttcatctccatttggcctcatcacatttcagct  c.2582-301

.         .         .         .         .         .           g.90762
ctcaataggcacctgtggctggaggctaccatggtgcacggtgcagctctactgatggaa  c.2582-241

.         .         .         .         .         .           g.90822
atgggggttagagacactgaggtctctttctgcttttaatttccatgaaaacccaagtcc  c.2582-181

.         .         .         .         .         .           g.90882
aaggaagggatcttattatcatcatcatcatcatcatcaccaatcatcaccagtcatcat  c.2582-121

.         .         .         .         .         .           g.90942
ccatcgcttccaaaagcgtttgttaaaccccttatctgagcgctgctgagccatgccctc  c.2582-61

.         .         .         .         .         .           g.91002
tgccagtttgcatcaatgaggattctcctgttcacatgtgcaatcttctgtgtgtttcag  c.2582-1


Powered by LOVD v.3.0 Build 25b
©2004-2020 Leiden University Medical Center