doublecortin (DCX) - 8704 nt intron 02 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.7258
gtaatttaaatagtgggtggtggccgttggtgggaggtggcatcattggttatggttaca  c.607+60

         .         .         .         .         .         .  g.7318
ttcttcggttgctttgaaaaaaaattaggcaatgtatttttcaaaacaccgggttgattg  c.607+120

         .         .         .         .         .         .  g.7378
atgctcaaatttctaatgctatagacatcaacagaaccattagcaatcacccttcagtct  c.607+180

         .         .         .         .         .         .  g.7438
ctgctgaggttgaagtgtgaatggtggtgatcatgcattgtgcttatctgccagggtata  c.607+240

         .         .         .         .         .         .  g.7498
aaaaggaaaatcttaattgtagcatttactctagattttgttcataattaactctgagta  c.607+300

         .         .         .         .         .         .  g.7558
gcactattgaggcagagcatgaaatcattaagggtataacgaggaaggacatttggttgg  c.607+360

         .         .         .         .         .         .  g.7618
gttaacagagaaaatattatgcccaaattttctttgaactgctgagaaattatttgtgaa  c.607+420

         .         .         .         .         .         .  g.7678
ttgcaactcattggaaatatgcaccctaagagcaggatttcctggacatattcacagagg  c.607+480

         .         .         .         .         .         .  g.7738
attattcttttaggtaagtggtcgcggctcagctgttgcttctaaaaagcctactttagg  c.607+540

         .         .         .         .         .         .  g.7798
gtgtgtccctaaggctgaggtcattgggagaaataccaaagaaagctgtaggtatgtctg  c.607+600

         .         .         .         .         .         .  g.7858
gtattttaataaagaccattcctattagaataggatttgactcactatacctaaatcccc  c.607+660

         .         .         .         .         .         .  g.7918
ttataacctctatagatttttgtgtggcaactaaattttctgagtagattgccaaaaatc  c.607+720

         .         .         .         .         .         .  g.7978
ccaacaacctgtgtacccacctcaaaatagggaaaatcctacctcttaccagaacttacc  c.607+780

         .         .         .         .         .         .  g.8038
cagccatagagtcttctttgtggtcatttagaaaatagatcttgggtcacatttttaaca  c.607+840

         .         .         .         .         .         .  g.8098
ttctatattatcaaatcaattatactgaggatgcttccctattttaaaattggtggatat  c.607+900

         .         .         .         .         .         .  g.8158
aacacatgtgatcaatttgacctaatacagtgctttaaagaacagcttcaaggagtggtg  c.607+960

         .         .         .         .         .         .  g.8218
ataattaatgtgttcctcctcaagcccctcccccattatccagccctctctcctcactcc  c.607+1020

         .         .         .         .         .         .  g.8278
tttcattccctgagcaaaggtgagtttaaagcaggcagatctctagagtaaccaaattat  c.607+1080

         .         .         .         .         .         .  g.8338
gaaataactaacaaggaaggagaaatagcaccttaaagaatttgatgtgggaaaaacctg  c.607+1140

         .         .         .         .         .         .  g.8398
cctctgcttcactgcttctaagtttcttgtgttcctagacaaaggagaatgagggtttcc  c.607+1200

         .         .         .         .         .         .  g.8458
tttgtacaagacactagttctctcaaatagctgctgttgcccaagttgtcaggcaaagtg  c.607+1260

         .         .         .         .         .         .  g.8518
attgggaccagttacttataaaagacagtgtccatattgttgctgcatctgagtctcaag  c.607+1320

         .         .         .         .         .         .  g.8578
gttcaagttcgacttccttcctttctttctttctttctttctttctttctttctttcttt  c.607+1380

         .         .         .         .         .         .  g.8638
ctttctttctttctttctttctcttttctttctttctttcttcctttctttctttcacag  c.607+1440

         .         .         .         .         .         .  g.8698
agtttcgctcttgttgcccaggctggagtgcaatggcatgatcttggctcaccacaacct  c.607+1500

         .         .         .         .         .         .  g.8758
ctgcctcctgcctcagcctcccaagtagctgagattacaggcatgtgccaccatgcctgg  c.607+1560

         .         .         .         .         .         .  g.8818
ctaattttgtatttttagtagaggtggggtttctccatgttagtcaggctggccttgaac  c.607+1620

         .         .         .         .         .         .  g.8878
tcccgacctcaggatccacccgccttggcctcccaaagtgttgggattacaggtgtgagc  c.607+1680

         .         .         .         .         .         .  g.8938
cactgtgcctggccgagatctttctacatagctgaccttgaaaaccaatgcccaggaagc  c.607+1740

         .         .         .         .         .         .  g.8998
ttagattatttcatcatgtgttcaatggacaggcagtggttaatcctaggcccttcctga  c.607+1800

         .         .         .         .         .         .  g.9058
ccatcaaaggactggccatcctggagcatgtcttaaaataaaggagagtcacggcaactt  c.607+1860

         .         .         .         .         .         .  g.9118
tgaagggtttgaagctaggtcgagggagctgtccaacagagtaattgttagggtgtctgt  c.607+1920

         .         .         .         .         .         .  g.9178
cttttgtcactgtaaaatccacatctcagtcaaatttcagggatttctctgtaacaactt  c.607+1980

         .         .         .         .         .         .  g.9238
tcacagacaaagcaccctgtatcacccaatatgtcctcatttccatgaactgtgatattc  c.607+2040

         .         .         .         .         .         .  g.9298
taaagaccacaatagacattaggaaagagtactgaaccaagtgacattgtattcagacca  c.607+2100

         .         .         .         .         .         .  g.9358
agtattagaatattcttgtctctgatataagagaggcgttatgcacaaaatttccccaaa  c.607+2160

         .         .         .         .         .         .  g.9418
atccattttttacatgttgatttttctccctagatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg  c.607+2220

         .         .         .         .         .         .  g.9478
tgtgtgtgtgtgcgtattgatgtatcacgaggggctggtgataatctctgttcaacatag  c.607+2280

         .         .         .         .         .         .  g.9538
gtaggcaataaatgtaactttgaaaagactgcagctttctattcccttgattacctttga  c.607+2340

         .         .         .         .         .         .  g.9598
gtcatattaggttgaactcctcttatctgtcactcctgggtgcagtagtacttcttggtg  c.607+2400

         .         .         .         .         .         .  g.9658
aattcctggactatgtgaagtgtgaatagggctcagttgcatttgttcacatgtcatgta  c.607+2460

         .         .         .         .         .         .  g.9718
caactacaaggcacagtggacctcaatacccatttagtccttagtactgcctattcagtc  c.607+2520

         .         .         .         .         .         .  g.9778
aagaaaattcagggctatgtctgggatagtgttaagaaatgtgatcaattttcccactgc  c.607+2580

         .         .         .         .         .         .  g.9838
cacagagccaaatgggaaagggcactgggatgaggaggatgaagacaatgtgtctttttc  c.607+2640

         .         .         .         .         .         .  g.9898
tctcctattttatattttagaactgcccatctgggaatggaggacagacttcccggtgtg  c.607+2700

         .         .         .         .         .         .  g.9958
aaatatcagggtcattgggttctagtcttagaggcagcagattataatgaaaacagaagt  c.607+2760

         .         .         .         .         .         .  g.10018
ctttggactcagatttggttgaaattcaggatctgtcagtgctagcctgtaagaccttga  c.607+2820

         .         .         .         .         .         .  g.10078
ggaaaccatctagattccctaagcctcattttgtcatctgtaaagtgggaataatggctt  c.607+2880

         .         .         .         .         .         .  g.10138
tgaggattaaataagacagtagatataaagtgcatattactctgcctggcacacagtagt  c.607+2940

         .         .         .         .         .         .  g.10198
gcttaataaaaggtagttattattgtttgagttatcctagtttatagctggttagctaca  c.607+3000

         .         .         .         .         .         .  g.10258
tgatcataggtttgttcttatcattaatgtgactcatgttaattatttttaaaataactc  c.607+3060

         .         .         .         .         .         .  g.10318
tttaaaaaaacaaacaactgtattaaggtataatttgcataacatgaaatttacccattc  c.607+3120

         .         .         .         .         .         .  g.10378
aagtgtacaatgatttttagaagatttatcaagtggtgcaaccatcatcataacataatt  c.607+3180

         .         .         .         .         .         .  g.10438
ttggaccattttcatttcctcagaaagaaaccctattccaattagttgtcactgcatatt  c.607+3240

         .         .         .         .         .         .  g.10498
ttctccaatctcttcagctctagacaatggttaatctactttctgtctccacatatttgc  c.607+3300

         .         .         .         .         .         .  g.10558
ctattctgcgcacttcatataaattgaatcaaatactatgtggtcttttgtgcttctttg  c.607+3360

         .         .         .         .         .         .  g.10618
acttagaataatgttttcaaattttatctatgttgttccatgtattggcacttctttcct  c.607+3420

         .         .         .         .         .         .  g.10678
ttttgttgaaggatgatatttcatgtatatgtagaccaccacatttgtgtatctcttgtg  c.607+3480

         .         .         .         .         .         .  g.10738
aataatatttttaactgtaaaatgggactagtaacacctgccttctctatccattagggt  c.607+3540

         .         .         .         .         .         .  g.10798
ggttgtaaggttaaacttagataatagatatggaaacatattgacaaggtaaaattatag  c.607+3600

         .         .         .         .         .         .  g.10858
ctacaggtactattattattaatgatgtgaaaatactaataatggaaataataataataa  c.607+3660

         .         .         .         .         .         .  g.10918
tgattatgacaatgattatgttagtaagggattgtaatggtcagtggtttccaaacccgg  c.607+3720

         .         .         .         .         .         .  g.10978
ctgcctttcaaaatctttcagagctttagaaaaatattacattcctgggccacacccaag  c.607+3780

         .         .         .         .         .         .  g.11038
atctattgaatcagaatccccagggctagggccccagtgtttgtgtttttacaaatctcc  c.607+3840

         .         .         .         .         .         .  g.11098
tcacatgacttttatgagcacttagacttgggaagtattagactgggtgatcttgatggt  c.607+3900

         .         .         .         .         .         .  g.11158
tccattcacctaactaaagtggtaggagttttgagacgtgcagaaatctgttttaatttt  c.607+3960

         .         .         .         .         .         .  g.11218
tttctttttacatcttaaaggaataatagagcatagaacacactgtgttttcaaatggcc  c.607+4020

         .         .         .         .         .         .  g.11278
acattattacatttttagcctaaaaataaatgaaatttaaaaataattggttaataatca  c.607+4080

         .         .         .         .         .         .  g.11338
ctctggccttgtgacactcctttgtctagtgcctcttgtctacggttttctgctagatac  c.607+4140

         .         .         .         .         .         .  g.11398
agaaagtatcaagggaagcattttggatcaaaggttattgatgtcagttttcccacagtc  c.607+4200

         .         .         .         .         .         .  g.11458
cttgggtacaccgagggtcttagtgaagccatgtaggatatggtcctcattagctgtatc  c.607+4260

         .         .         .         .         .         .  g.11518
ccaaggaggtcaatgaataaaatccactggtgggttttccttttgtcatgtctttgtttt  c.607+4320

         .         .         .    g.11550
ttttattatttttttattttatttattttttt  c.607+4352

--------------------- middle of intron ---------------------
                g.11551       .         .         .           g.11582
                c.608-4352  tagaatctttctctttccctttatatctggtc  c.608-4321

.         .         .         .         .         .           g.11642
caattctttccccattttcttgtatgtaagtatccagatcaaccttggggatatcattta  c.608-4261

.         .         .         .         .         .           g.11702
tgactagccagcttttctgaacccaaattgagacaagttcaagagttattacacagacca  c.608-4201

.         .         .         .         .         .           g.11762
tgggacagaatatttacaattggaacagtcttagaaaatccgagctgtgtagtcacactg  c.608-4141

.         .         .         .         .         .           g.11822
gctatgatccagttcttttaccatagctcatatgtttcattgagatgaatccaccttctc  c.608-4081

.         .         .         .         .         .           g.11882
actaatttattctctaactactaaagcaagtacattgtcaaacacaagaattttaagata  c.608-4021

.         .         .         .         .         .           g.11942
cctgggagggatgcattgctaatagatatgataatcaaatgtcatttaatattttaatat  c.608-3961

.         .         .         .         .         .           g.12002
aatacagtaaagtgtcatttaatatattccttcttgagtcaggaagccctggagaagagg  c.608-3901

.         .         .         .         .         .           g.12062
agaaaacccaggcagaagcttgcttttgcactgagaagatacaaatatatataaaatgct  c.608-3841

.         .         .         .         .         .           g.12122
tttgaaaatgcagccttcttaaagagaagggaggtagacattagatcatctccagcccac  c.608-3781

.         .         .         .         .         .           g.12182
agcttgtttcatttctgccctttcagctgtgcttccatgatttcattccttatcccctca  c.608-3721

.         .         .         .         .         .           g.12242
ccctaaagcaggtttttagttccagcgaatttgcaccctgcttggctgtgaagccagctt  c.608-3661

.         .         .         .         .         .           g.12302
tccctctaggcccccagctggtaggaaatagcccttggaagctgtggcaggatgggaacc  c.608-3601

.         .         .         .         .         .           g.12362
caactgtgtaaaggtgcgacacacctcatccagctccaagtgccaggcagcaggaagtgc  c.608-3541

.         .         .         .         .         .           g.12422
aggaggcactgagctctggcagcagacattgaaaatgctggcaaaatcaggacaaggaag  c.608-3481

.         .         .         .         .         .           g.12482
tcttagtctagcaaagaagagcatttgatgtctttctagcagaagtgaagagtccttgga  c.608-3421

.         .         .         .         .         .           g.12542
ggtgggcagctattttcttaacatttaattatcctaacagctttgttttctgaagcctgt  c.608-3361

.         .         .         .         .         .           g.12602
ttgagaaggaaaagagaagattcctccctatagactctaggacctagaagggactcaggt  c.608-3301

.         .         .         .         .         .           g.12662
gtcacctagtgcattatctttgctttagagaaggcaaagctgagactcagagacattaag  c.608-3241

.         .         .         .         .         .           g.12722
tgatttccctgaggtcacacagcttttaagtgcctagttgagatttgaatccaggtctgt  c.608-3181

.         .         .         .         .         .           g.12782
gtgactcctaagtcatcactcttgacgacgataaatatcctgctctcagcgggcctctgc  c.608-3121

.         .         .         .         .         .           g.12842
agaggcagcagcagctttactgggtgttagcataaatctcctacatttggcatttgccac  c.608-3061

.         .         .         .         .         .           g.12902
aactggaagcctccttccaaccagcaggaaatcttatccttgaatcacaggcccccagca  c.608-3001

.         .         .         .         .         .           g.12962
gtgctcatgtcatatcataatcacagctcagttcctagatggttgcccttgatactttct  c.608-2941

.         .         .         .         .         .           g.13022
cttttttttcctcttcagcttctattcctctttttagtctctttctctcagcaatttttt  c.608-2881

.         .         .         .         .         .           g.13082
cctcttttcctctttgctctttccttcttgttctcgcttctattccgtaagattaggggc  c.608-2821

.         .         .         .         .         .           g.13142
ttaataataacagaaatttatcaagtgcttactatgttccaggctctgggatcagcattt  c.608-2761

.         .         .         .         .         .           g.13202
tattttattttattttattttattttattttattttattttaagacggaatctcactctc  c.608-2701

.         .         .         .         .         .           g.13262
tccgtcacccagggtagagtgcagtggtgcgatctcagctcactgcaccctctgcctccc  c.608-2641

.         .         .         .         .         .           g.13322
aggttcaagcgattctccttcctcagcctccctagtagctgggattataggcatgtgcca  c.608-2581

.         .         .         .         .         .           g.13382
ccacgcccagctaatttttgtatttttagtagagatggggtttcaccatgttgtccaggc  c.608-2521

.         .         .         .         .         .           g.13442
tgctcttgaacttctgatctcaagcgatccacctgcctcagcctcccaaagtgtcaggat  c.608-2461

.         .         .         .         .         .           g.13502
gacaggcatgagccgtcgcacctggccatgggttgaacactttttatccatcatctgatt  c.608-2401

.         .         .         .         .         .           g.13562
tgtgccccacaacaaccccacaagataggtattcttattatcacccttgctttgcaaaga  c.608-2341

.         .         .         .         .         .           g.13622
agaaactgaagccaagggaggttagagtgcacaactaggaagtgttggggaccccatcct  c.608-2281

.         .         .         .         .         .           g.13682
gactgacatcacatcagctgcgctttttccattactccatattcagcccaacgagagagt  c.608-2221

.         .         .         .         .         .           g.13742
ggagtgactaaaatgtaccactggaaggtgctcaacatagatttggctgaggctgggccc  c.608-2161

.         .         .         .         .         .           g.13802
tctggaaagttcttgggtgctatatgatactatagctgtcagtcatcatgttcattttca  c.608-2101

.         .         .         .         .         .           g.13862
tctggagacggttaatcatactcatactccagaggcttaagaggtttaagagatgggagc  c.608-2041

.         .         .         .         .         .           g.13922
aaaaaagtccaaagtcctaatagggctacacagctgactctccagaggagactggatgag  c.608-1981

.         .         .         .         .         .           g.13982
tgaaatcataaatatatagcttcacacatttccacaccaccatttgtctgacagttttaa  c.608-1921

.         .         .         .         .         .           g.14042
agtacatgacaagttatggaaaacatctgactcaaaggcagtgacctcctgcaaggtgcc  c.608-1861

.         .         .         .         .         .           g.14102
agtgaatctggtgaactgctaagtcaagagaccatttctagggttatgggggttattggc  c.608-1801

.         .         .         .         .         .           g.14162
tgtgaatatatggagacactaaaagggccccttccttcatccttttaagtcaaaaattaa  c.608-1741

.         .         .         .         .         .           g.14222
agaccccagcctataattacttgggttgggttgaattaaccagcaagggagtcaaagaaa  c.608-1681

.         .         .         .         .         .           g.14282
tcagagcttctcttggctgaggtattgaccatctcatcctgggtgtccatgtatgcacca  c.608-1621

.         .         .         .         .         .           g.14342
agtgggtaagggtgcctatcctcacttaaaaccatccctttgtccccctgtcaagataga  c.608-1561

.         .         .         .         .         .           g.14402
actctgggactgagggcagctttggaagtcactttgcttatgttggatgccacttaccct  c.608-1501

.         .         .         .         .         .           g.14462
ccccctccgcacacacacacacacacacacacacacacacacacacaccacgcacacaca  c.608-1441

.         .         .         .         .         .           g.14522
cacacacatacacacacacataaatgtcctcaaaggtacactagagattttgactgaaac  c.608-1381

.         .         .         .         .         .           g.14582
ttctcttagcattactgagaaatttattcattaacatgtcttaaaggatttggtgctatg  c.608-1321

.         .         .         .         .         .           g.14642
gcaaagcaataaatatttgcaaagggagtgaattatcaacctggtgtttctgaatgcagt  c.608-1261

.         .         .         .         .         .           g.14702
tctcctgctgagaccaaaggagagccatcagactataattgtgtttaatgctttctgtgc  c.608-1201

.         .         .         .         .         .           g.14762
actggctagggtttatttatttatttagggttattaccgatgacttaagcctgattaaat  c.608-1141

.         .         .         .         .         .           g.14822
cacactgtttctgcagctcaacctctcaatgaacttctagataccttgaggctaatgtgt  c.608-1081

.         .         .         .         .         .           g.14882
tttactcaacgaattcaaccttttccagtattctcttccccaggctgagcctatctctct  c.608-1021

.         .         .         .         .         .           g.14942
tcctattttcttcagctcatagtcccaggtgtccagtcccctcctcttgcctctgatccc  c.608-961

.         .         .         .         .         .           g.15002
tgcatttcttttgcgatattagtcatttcctctagcccaaggtaaatgtgaaaattacac  c.608-901

.         .         .         .         .         .           g.15062
tagatccttccaatccataaatcaggctgtataatgtattctcacttctttacctcatta  c.608-841

.         .         .         .         .         .           g.15122
cttgtggcagccaagggtgagcactggtgaagatgaccctgaatacacagatcttatgtg  c.608-781

.         .         .         .         .         .           g.15182
catcctttgagaggatggaaagatgaagggtgagtggtagaaacatgagagtatttttca  c.608-721

.         .         .         .         .         .           g.15242
agcaaaagctaaggtgtttatatgtactggttgttatttagacagtttctctacctagtg  c.608-661

.         .         .         .         .         .           g.15302
tagcataaggagtagaggacacacttatacacacatataaacattcaacatatgcacaca  c.608-601

.         .         .         .         .         .           g.15362
catttcacatttcaatattccatacttggccatatactctgtgcaaaggatgacctggtt  c.608-541

.         .         .         .         .         .           g.15422
tcttatcaagtatgtatgtatgcctgatatacaaggttacttggttcattttaacttggc  c.608-481

.         .         .         .         .         .           g.15482
ataaaaatgttttaactttgaaagttttccttggttcataatatcacaaagggatgggac  c.608-421

.         .         .         .         .         .           g.15542
tttgagtccaaaaataggacagggattttaagaaatagaaatgttaaaaattctccagta  c.608-361

.         .         .         .         .         .           g.15602
atgcccctgaaagctaaacatcctagaaactaacataaatgtttaaattccagaaaaaac  c.608-301

.         .         .         .         .         .           g.15662
catatcaagcttggaactccacttgttatattaaatttagatatgctctttgtccttaga  c.608-241

.         .         .         .         .         .           g.15722
acccttagctttacagagttcttcaactaggtgtgtcattatattgaaggatgttttgag  c.608-181

.         .         .         .         .         .           g.15782
aattactcttgaatttggatgagccaagtttttagcccaattaggaattgcacctaaggt  c.608-121

.         .         .         .         .         .           g.15842
tggttagtatcaccatttattgaaaagttctactccagtgtcagtgtgtattagtttggt  c.608-61

.         .         .         .         .         .           g.15902
tagaataatccatatatctgctattaaactaatcacctaatcacttatttcttgccttag  c.608-1


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