fragile X mental retardation 1 (FMR1) - 9702 nt intron 01 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.5340
gtacttggctctagggcaggccccatcttcgcccttccttccctcccttttcttcttggt  c.51+60

         .         .         .         .         .         .  g.5400
gtcggcgggaggcaggcccggggccctcttcccgagcaccgcgcctgggtgccagggcac  c.51+120

         .         .         .         .         .         .  g.5460
gctcggcgggatgttgttgggagggaaggactggacttggggcctgttggaagcccctct  c.51+180

         .         .         .         .         .         .  g.5520
ccgactccgagaggccctagcgcctatcgaaatgagagaccagcgaggagagggttctct  c.51+240

         .         .         .         .         .         .  g.5580
ttcggcgccgagccccgccggggtgagctggggatgggcgagggccggcggcaggtacta  c.51+300

         .         .         .         .         .         .  g.5640
gagccgggcgggaagggccgaaatcggcgctaagtgacggcgatggcttattcccccttt  c.51+360

         .         .         .         .         .         .  g.5700
cctaaacatcatctcccagcgggatccgggcctgtcgtgtgggtagttgtggaggagcgg  c.51+420

         .         .         .         .         .         .  g.5760
ggggcgcttcagccgggccgcctcctgcagcgccaagagggcttcaggtctcctttggct  c.51+480

         .         .         .         .         .         .  g.5820
tctcttttccggtctagcattgggacttcggagagctccactgttctgggcgagggctgt  c.51+540

         .         .         .         .         .         .  g.5880
gaagaaagagtagtaagaagcggtagtcggcaccaaatcacaatggcaactgatttttag  c.51+600

         .         .         .         .         .         .  g.5940
tggcttctctttgtggatttcggaggagattttagatccaaaagtttcaggaagacccta  c.51+660

         .         .         .         .         .         .  g.6000
acatggcccagcagtgcattgaagaagttgatcatcgtgaatattcgcgtcccccttttt  c.51+720

         .         .         .         .         .         .  g.6060
gttaaacggggtaaattcaggaatgcacatgcttcagcgtctaaaaccattagcagcgct  c.51+780

         .         .         .         .         .         .  g.6120
gctacttaaaaattgtgtgtgtgtgtttaagtttccaaagacctaaatatatgccatgaa  c.51+840

         .         .         .         .         .         .  g.6180
acttcaggtaattaactgagagtatattattactagggcattttttttttaactgagcga  c.51+900

         .         .         .         .         .         .  g.6240
aaatatttttgtgcccctaagaacttgaccacatttcctttgaatttgtggtgttgcagt  c.51+960

         .         .         .         .         .         .  g.6300
ggactgaattgttgaggctttatataggcattcatgggtttactgtgctttttaaagtta  c.51+1020

         .         .         .         .         .         .  g.6360
caccattgcagatcaactaacacctttcagttttaaaaggaagatttacaaatttgatgt  c.51+1080

         .         .         .         .         .         .  g.6420
agcagtagtgcgtttgttggtatgtaggtgctgtataaattcatctataaattctcattt  c.51+1140

         .         .         .         .         .         .  g.6480
ccttttgaatgtctataacctctttcaataatatcccaccttactacagtattttggcaa  c.51+1200

         .         .         .         .         .         .  g.6540
tagaaggtgcgtgtggaaggaaggctggaaaatagctattagcagtgtccaacacaattc  c.51+1260

         .         .         .         .         .         .  g.6600
ttaaatgtattgtagaatggcttgaatgtttcagacaggacacgtttggctataggaaaa  c.51+1320

         .         .         .         .         .         .  g.6660
taaacaattgactttattctgtgtttaccaattttatgaagacatttggagatcagtata  c.51+1380

         .         .         .         .         .         .  g.6720
tttcataaatgagtaaagtatgtaaactgttccatactttgagcacaaagataaagcctt  c.51+1440

         .         .         .         .         .         .  g.6780
ttgctgtaaaaggaggcaaaaggtaaccccgcgtttatgttcttaacagtctcatgaata  c.51+1500

         .         .         .         .         .         .  g.6840
tgaaattgtttcagttgactctgcagtcaaaattttaatttcattgattttattgatcca  c.51+1560

         .         .         .         .         .         .  g.6900
taatttcttctggtgagtttgcgtagaatcgttcacggtcctagattagtggttttggtc  c.51+1620

         .         .         .         .         .         .  g.6960
actagatttctggcactaataactataatacatatacatatatatgtgtgagtaacggct  c.51+1680

         .         .         .         .         .         .  g.7020
aatggttaggcaagattttgattgacctgtgatataaacttagattggatgccactaaag  c.51+1740

         .         .         .         .         .         .  g.7080
tttgcttatcacagagggcaagtagcacattatggccttgaagtacttattgttctcttc  c.51+1800

         .         .         .         .         .         .  g.7140
cagcaacttatgatttgctccagtgattttgcttgcacactgactggaatataagaaatg  c.51+1860

         .         .         .         .         .         .  g.7200
ccttctatttttgctattaattccctccttttttgttttgttttgtaacgaagttgttta  c.51+1920

         .         .         .         .         .         .  g.7260
acttgaaggtgaatgaagaataggttggttgccccttagttccctgaggagaaatgttaa  c.51+1980

         .         .         .         .         .         .  g.7320
tacttgaacaagtgtgtgtcagacaaattgctgttatgtttatttaattaagtttgattt  c.51+2040

         .         .         .         .         .         .  g.7380
ctaagaaaatctcaaatggtctgcactgatggaagaacagtttctgtaacaaaaaagctt  c.51+2100

         .         .         .         .         .         .  g.7440
gaaatttttatatgacttataatactgctgtgagttttaaaagtaaagcaaaagtaaact  c.51+2160

         .         .         .         .         .         .  g.7500
gagttgcttgtccagtgggatggacaggaaagatgtgaaataaaaaccaatgaaaaatga  c.51+2220

         .         .         .         .         .         .  g.7560
actgctgtggagaagtgttacatttatggaaaaagaaataggaaccttgttcatcaaatt  c.51+2280

         .         .         .         .         .         .  g.7620
gatagaaaagcttttaaaactaaacaaatcaaacaacttgagtataatggaattcagact  c.51+2340

         .         .         .         .         .         .  g.7680
ttgatttgcctaacataaccaccatatttgcaaggacagctctctatcttctggtgttta  c.51+2400

         .         .         .         .         .         .  g.7740
ttcttaaaaacttaaaagttagatttagcgatcaccagagccactacttttatgcttagg  c.51+2460

         .         .         .         .         .         .  g.7800
tatttgtttgacttagaaaaaattggtcacgtgtaccactttatagtgccctgcaggtgt  c.51+2520

         .         .         .         .         .         .  g.7860
taagatatgaaggcactttgacttacacctcataaaatctttacaaagtattttctaaat  c.51+2580

         .         .         .         .         .         .  g.7920
gaataatgatgaaataaagtctttattctaggtgcatctgccccacataatttgttttct  c.51+2640

         .         .         .         .         .         .  g.7980
ttggactagaagttttgatgtgttgagaatggtaatgaattaactccattttaaatgtag  c.51+2700

         .         .         .         .         .         .  g.8040
aatgcgtatcactccaatatgaatgccctaatgaatcctaagatttgtaggttttgtgta  c.51+2760

         .         .         .         .         .         .  g.8100
ctagtatgaaaattactaaagatggaaaaatcacatgttggagacataagatacaaacct  c.51+2820

         .         .         .         .         .         .  g.8160
ttttgttttctgaaaatacaacctctgatttctgattccttgttgtaatatggtgtaatt  c.51+2880

         .         .         .         .         .         .  g.8220
atactagattgtaattttgttgttagattatacttttttaagttcagtgtttgaggacag  c.51+2940

         .         .         .         .         .         .  g.8280
actttcatttggttagtagtattatggcagctagcagctaaatatgataaagtgtacaat  c.51+3000

         .         .         .         .         .         .  g.8340
caaaaggatatttttaatgaagatattagtggtctaacatgtcatttcagatacatagct  c.51+3060

         .         .         .         .         .         .  g.8400
gaaatgtagtaaaatcagttttactacaaataaacttgcataaggtttataaatttataa  c.51+3120

         .         .         .         .         .         .  g.8460
gtttataaatcaacttgggtaaagtgtaaataaacttgcactcgtggtttctctgaagtc  c.51+3180

         .         .         .         .         .         .  g.8520
tcctgagctaactttgcataaaggtgttattctgtacttcgaggaagtgaattattgggg  c.51+3240

         .         .         .         .         .         .  g.8580
tcaaccacattttttttccttcctacagtctgattgccctttttagtttttaggatcttt  c.51+3300

         .         .         .         .         .         .  g.8640
gtggctgcatcatttttccccttttgaactgtgcattttctaaccccatacttaaatatt  c.51+3360

         .         .         .         .         .         .  g.8700
ctcataacctccaaattattaattagatgcaacattcagtggtatattactggagtttct  c.51+3420

         .         .         .         .         .         .  g.8760
gatttctgcccactataggaatgtgcttcctgagaagattgggatcgtgattataataat  c.51+3480

         .         .         .         .         .         .  g.8820
agttaacaggggatgagtactttctaggtgccaggcactgttctctctgatactttattt  c.51+3540

         .         .         .         .         .         .  g.8880
gatgtattgttgttattcccattctttaaatgatgcacagagaggttaggtaagtgactt  c.51+3600

         .         .         .         .         .         .  g.8940
actaccaagtgtcagggccattaagggtcaggattctgaattcctgaaatgatgaaattt  c.51+3660

         .         .         .         .         .         .  g.9000
agcttgaagaaattggtttgatttcctgcttagttttcaatttcatggtggtctttgatt  c.51+3720

         .         .         .         .         .         .  g.9060
gtattttgtgctataacactgccttagcatcctataactatagttacagtgttatattac  c.51+3780

         .         .         .         .         .         .  g.9120
cattttttattgttaatacaaagccatcatgaaataattcagtttatgtgccagcttttt  c.51+3840

         .         .         .         .         .         .  g.9180
ttgttactaattcttgaaccttggcgctgtacttcttcatgtggatgcctgttaaggaaa  c.51+3900

         .         .         .         .         .         .  g.9240
gataaagttagaaatctttgaccctgctaggaaatttgtctttgttatattgggagctca  c.51+3960

         .         .         .         .         .         .  g.9300
taaaactgaagtattcaaaagttagaatacatacacacaagaaaaattagtaactaattt  c.51+4020

         .         .         .         .         .         .  g.9360
aataatgttttctttgcacatgtctctgttgtcttttggtcagagtgaagctaaatgtgt  c.51+4080

         .         .         .         .         .         .  g.9420
ttttcacataatttgtagcctatatgaagtcctggacatgtggtatggttggaaggactg  c.51+4140

         .         .         .         .         .         .  g.9480
ttgatgaggtttattgtctctctttattcttttatgttgttagtgtccccatacaacggg  c.51+4200

         .         .         .         .         .         .  g.9540
gcggggggagtggggacaaaatgataacttgctttatatatgaagccttgggtttgaatc  c.51+4260

         .         .         .         .         .         .  g.9600
atactgttatcacatttcctatgtccctatcctgtctcctgcaggttttctttcttggtt  c.51+4320

         .         .         .         .         .         .  g.9660
ttcttttttggttttctttcttcctttcttcctttcttttcctttctttcctttcttcct  c.51+4380

         .         .         .         .         .         .  g.9720
tttttctttccttttcttttttcctttctttccttcatttctctcctttgctcctttagt  c.51+4440

         .         .         .         .         .         .  g.9780
ttgtttctttgtttctttggtttgtttctttgtttctttggtttgtttctttgtttcttt  c.51+4500

         .         .         .         .         .         .  g.9840
agtttgtttctttgtttctttgtttctttcaacaggtctcactgtcgcccaggttggagt  c.51+4560

         .         .         .         .         .         .  g.9900
gcagtggtgggatctcagctcactgcaacctccacctctcgggttcaagccagtctcatg  c.51+4620

         .         .         .         .         .         .  g.9960
cttcagccttccgggtagctgagattacaggcatgtgccaccattcctggctattttttg  c.51+4680

         .         .         .         .         .         .  g.10020
catttttagtagagatgaggtttcgccatgttggccaggctgatctcaagttatctgcct  c.51+4740

         .         .         .         .         .         .  g.10080
gcctcagccctccaaagtgctggaattacaggcatgagacaccgggtccagcttccagca  c.51+4800

         .         .         .         .         .   g.10131
ggttttctttaggagggatattttacaatgctgtaagtttttcctaacgag  c.51+4851

--------------------- middle of intron ---------------------
       g.10132     .         .         .         .         .           g.10182
       c.52-4851  aattatcatagcactacatgttctgtcttcagtaagtgatacaagcttact  c.52-4801

.         .         .         .         .         .           g.10242
gatgatgttgtagttatgttcattggtggtcgggtgtacattgaaactttaacacataat  c.52-4741

.         .         .         .         .         .           g.10302
agcctctcctgtgagcagtggttcctgttggtaagatactttactaagggaaggaatgtg  c.52-4681

.         .         .         .         .         .           g.10362
aggtgtcgctggggagagtttacccaaataaggatggactttctgtctttgtttcatcag  c.52-4621

.         .         .         .         .         .           g.10422
tcctggtaatagaatgtttgaatagatagctctaggcattacatactttcataaatatga  c.52-4561

.         .         .         .         .         .           g.10482
ttattgtaattacctctttggcccagttgctagtaaattagggaccccttaatgatttat  c.52-4501

.         .         .         .         .         .           g.10542
ttcctgtttattcaccctgatgaagaacttgtatctcttttaaactgtactttatcgcct  c.52-4441

.         .         .         .         .         .           g.10602
ttctcaaattccaagattctcatcacattttttttcttcccaaactctaaataacctttt  c.52-4381

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aatattaagtatctttgtggaaacattgttttctttttctatcccaatttttaaagcttt  c.52-4321

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tttaaaaaaaagagtgcttttgttgggatgtacattttccaaatgcaaaaacatttatga  c.52-4261

.         .         .         .         .         .           g.10782
ttctgtgtctcttataaaatatgacactctctacttttctctcatttatttagtgccacc  c.52-4201

.         .         .         .         .         .           g.10842
tatgtgtgtaatttcattacccacagcagtcttaggaggctggtcgagttccttatttgc  c.52-4141

.         .         .         .         .         .           g.10902
agatgaggaatctgaggtccagagatcacttcttggtgagagtctcacagctattaagta  c.52-4081

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ttagagccaagattttgaacgtaggtctgattcacagcaaaaccgttaaccactaagtac  c.52-4021

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actgactccagtaagagccctagtcctcacccaatacactttaattcccctgtgcattca  c.52-3961

.         .         .         .         .         .           g.11082
ttcaaattcattgaatttgctgcctttggaaacctctcaggaacctcctcaacctctctt  c.52-3901

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ctctacagacatcagctttgcctgataggtagggatcatagcaaaacacagttttccaag  c.52-3841

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gtggtgataggtggagtgatagtgctctggagatggccaaagaaggaaggtatgagtgta  c.52-3781

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tctgtgggtgggtgagtggtggataaggggaaggacagagccaaaagcgacggctattgg  c.52-3721

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aaaaactatgatgagaaacaggaagatggaaccttgttggaattagtgaaagaccttaga  c.52-3661

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attcacaggaggtatttgtccttcacgcgagtgtagaccaaacgtaacctatgagtttct  c.52-3601

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tttattccacttattaaagcagcaaccaaaggtattatataccttctgtattcacttaaa  c.52-3541

.         .         .         .         .         .           g.11502
atgactgattttgaaaaagtcatgcaaacatccatttacagataagcctcattaactcaa  c.52-3481

.         .         .         .         .         .           g.11562
aggcagtggccctgttgggctctgatgattactcaaaccatttctgacactctgacacta  c.52-3421

.         .         .         .         .         .           g.11622
catccggaaatcatccggaaatgcattcagagcctgcaaaagcttttttttttttttttt  c.52-3361

.         .         .         .         .         .           g.11682
ttttttttgaatagctacagcacttgcagatcttcctcctttgagagaatatttgatttt  c.52-3301

.         .         .         .         .         .           g.11742
aggaaataagcaaatgtagataagtatgattcaactgggcaataacttttaggcaaagag  c.52-3241

.         .         .         .         .         .           g.11802
aaaaaaacaaaatatagcaatgtagtaataaggctgatattatagtgcttttatgatgag  c.52-3181

.         .         .         .         .         .           g.11862
tctgaaaacagtctccaacatttgtaaatgttttaaatcgggtctgtctactacagtagc  c.52-3121

.         .         .         .         .         .           g.11922
ccttaagccatatgtagctattgagcacttgacatgttgcaagagtgaattggagactga  c.52-3061

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ttttaattttatttaattttaatgtaagtagtcgcacatgacccgtggctactatggtag  c.52-3001

.         .         .         .         .         .           g.12042
atggcatagttttagacaagggcagtagtcttgggtagatacttgatttacttagaacat  c.52-2941

.         .         .         .         .         .           g.12102
ttctttacctagctgtaacaaggttctaatagctgattaaaggacaacatttttagcatg  c.52-2881

.         .         .         .         .         .           g.12162
taatatacagtaaggaactaatgttaattactgccaagatgtataaacattatgaaacct  c.52-2821

.         .         .         .         .         .           g.12222
taaacaaggatgaacacagaagcagtggcccttctttgtaaataaggggtcagttacttc  c.52-2761

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ctaataggtgtcttagttttagttaataatctaatagcacccccaaaaagcaaactgtta  c.52-2701

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atttgttattagccatcctgtaaagacaagggagaaatcggggccaggagagtcctcttt  c.52-2641

.         .         .         .         .         .           g.12402
cccattctccataatttttacgacctatagaaataagagcctaagagtgaccagttcctg  c.52-2581

.         .         .         .         .         .           g.12462
caacctaactcaaaattaggcctctctgttgaagtaatagtgaggcaaacaatcccttga  c.52-2521

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agcactggggcatgcacccttatgaaatctaataattctaaaatatcattggcagtatta  c.52-2461

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aataagcaagatcaaaatgataagaaaatgttgatttctccccttttgaaccagtaacta  c.52-2341

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gcacaacatatggatgccattatagtccaccttgatcttacaaggaagctttcttttagc  c.52-2221

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gtagctttacttttatttaagcattattgaagaagcttggtatctctgtttaagttgctt  c.52-2161

.         .         .         .         .         .           g.12882
ctgtatcagtgttttccagggccctgtctcagcttccatagttttccttaagagcagcta  c.52-2101

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attaatgcttcactccatatgctttaatttgatattttgggaagtttcattttttaaaat  c.52-2041

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aatctttttatatcataggcctttgaagacatatttgtttacaaagacatctgcattgaa  c.52-1981

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ccatttgtttttaaaaacatgtatcgggcatgtcctatataccagaaactatgccattta  c.52-1921

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ctgaggacaccgaagttagagaatggtcttaatccgaactagttattgtctcactatcca  c.52-1861

.         .         .         .         .         .           g.13182
atatggatatcaaacattcagcgtcatgaggatttactactgtgttttctcccaagagtt  c.52-1801

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ttataattttagctcttatatttaggtctttgatgcatattcattgatttttttttgtat  c.52-1741

.         .         .         .         .         .           g.13302
gcagtatgaggtaaaggttgaaacgtattctttttgcatgtgggtgtccacttgtcccag  c.52-1681

.         .         .         .         .         .           g.13362
cttcattttttgaaaacactatactttccccattgaattgtcttggcttctttgttgaca  c.52-1621

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aaggatttattatttctgccacaacccagctgtttctcactgtctaaacctttatgcctg  c.52-1561

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ctgccccgtaggcttagtggaatgcctctccatcctccactctcttttgtttagctagta  c.52-1501

.         .         .         .         .         .           g.13542
cttccttatcctttaaggggtcagtaggaacctcaccttcttcagtatgttttcctttgt  c.52-1441

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cttatcaacctaccaccatcacccacacacataccttttccctaaggctgggataggaac  c.52-1381

.         .         .         .         .         .           g.13662
ctcttaggcaatgatctatttgataagtactcactgagttcatactagacactctgcagt  c.52-1321

.         .         .         .         .         .           g.13722
atatccgtaaatgaagtaaaacctgacaccaccctcagaaaacttactgttagtgagaaa  c.52-1261

.         .         .         .         .         .           g.13782
atgggctataataatagagtggggtaagtttattgtagggataagcataggatgctatga  c.52-1201

.         .         .         .         .         .           g.13842
gaatgcagaggacaggaatttaacctagacttctcagttctcccgttgaagttgacatct  c.52-1141

.         .         .         .         .         .           g.13902
gaactgaaatctggaagaccagtaagagatagctatgtaaaaagaggggaaggacaatag  c.52-1081

.         .         .         .         .         .           g.13962
gaaagaaggaatggagagaggcccagaaactacagagtatggcacaagtagtttagcatt  c.52-1021

.         .         .         .         .         .           g.14022
gttgggtcacaaattctaaggatatgaaagataaagttgaagaagtggtggggctgggga  c.52-961

.         .         .         .         .         .           g.14082
ggacagctcctgtagagccttttacagcgggagaaggagtttggctatggtcctgcaggc  c.52-901

.         .         .         .         .         .           g.14142
agggagaaaccactgaaggggagaaacatacagaataaatttgagtaagaagcttaaatc  c.52-841

.         .         .         .         .         .           g.14202
tccccaagcccttttaaaataaattaagatataaagcctttgggtttctttatgctttgt  c.52-781

.         .         .         .         .         .           g.14262
cctattcttctaattgtccaaaacaaaacaaaaaccttccttttctgtacctattaaaag  c.52-721

.         .         .         .         .         .           g.14322
gttaattttataaagttacagacagcatgctgattaaagaattcttgataattagctatt  c.52-661

.         .         .         .         .         .           g.14382
ttgtctgtctttgtgtagattactaacaattgtgtcatcagatttaaaagatctaaacct  c.52-601

.         .         .         .         .         .           g.14442
ctggactttatatattttttctacaagtactgtgagattgagaacttaattcaactctag  c.52-541

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taactggactttttagtgttgtttgcagcatatgattgttaaagaaagtttagtatattt  c.52-481

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gtgtgtgcgtatatatatatatatagatagatagatagatttgaggttatatttaatcat  c.52-421

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tgactattggtattctaagattttaaggagagaaaggtaggttacaatatatggctgata  c.52-361

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tatggttctggaacaattttcttagttttcagtaattctacctaaaatgtacgtccagct  c.52-301

.         .         .         .         .         .           g.14742
ttgcactcactaccacattgtaatttccagtatacttgtctatttttcgagatgttgaaa  c.52-241

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tctgtggagaattttttctcatgtttagtgttttagctatgtttatctctagggtatagc  c.52-181

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acatacaaggtggcaatatagatgtgcttaatgaataaaatgatcttcaaaaactgacct  c.52-121

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tcatttgaagttctattttattcataaacacataaaacgtttggtatcactgtaaaattt  c.52-61

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