intraflagellar transport 80 homolog (Chlamydomonas) (IFT80) - 3962 nt intron 03 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.23090
gtaagttttaaataaacattatatgctcgccattgtatttaaaagacttaatagtatgat  c.259+60

         .         .         .         .         .         .  g.23150
ttatgctttgagttgttttacaaaactggtatttgtggatctgcatatttttatccacat  c.259+120

         .         .         .         .         .         .  g.23210
attgtatttcttttctgaatagtcacttggtttgtgtatgggctatgaaattattgtcat  c.259+180

         .         .         .         .         .         .  g.23270
ggaagaaagttagtttaactggcatatactaggattgaatatgggtctttggctttaata  c.259+240

         .         .         .         .         .         .  g.23330
tatatatatatatatatatatatttagagatggggtctcactctgttgcccaggccagag  c.259+300

         .         .         .         .         .         .  g.23390
tgcagtggtgtgatcatagctcactgtagcttcaaactcctgggctcacacaatcttcct  c.259+360

         .         .         .         .         .         .  g.23450
gcctcagcctcttgagtagctgggactacaggcacacactattacatctggttaattaaa  c.259+420

         .         .         .         .         .         .  g.23510
acattttttttgtagagacagggtctcatcttgttgcccaggctagtcttgtactcctgg  c.259+480

         .         .         .         .         .         .  g.23570
cctcaagcaatcttccttccttggcctcccaaagtgctgggattacaggtatgagccacc  c.259+540

         .         .         .         .         .         .  g.23630
atgcccagctggctttacttttttagtactcttatgagttgagttaagctgttatcatag  c.259+600

         .         .         .         .         .         .  g.23690
ttttagttcctaaattcttcaaatttaacttaatataaccacactgaaaagatataccta  c.259+660

         .         .         .         .         .         .  g.23750
ttcatttagtaaggtatctgttaaaatacatactttattttccagtacatgttaattttc  c.259+720

         .         .         .         .         .         .  g.23810
agttacagagttgaagagttttataatttgaccgcagctttcttattggtgaataacaag  c.259+780

         .         .         .         .         .         .  g.23870
tatgattttttttttcactttttaagggtatgtttttatatttgttttcttagaaatacg  c.259+840

         .         .         .         .         .         .  g.23930
tgaactgttttcatctgtgttatactttacctgctgtttcaattaggagtacattgattg  c.259+900

         .         .         .         .         .         .  g.23990
aaagtaacagaaacttatttggctaacttaagcacaaatggagttttttggttcacctag  c.259+960

         .         .         .         .         .         .  g.24050
ctgtaggggtagatcaagcactagttgcatcgggtccctgttctcaccatctcttgggta  c.259+1020

         .         .         .         .         .         .  g.24110
gactctctgcacatggtgaacatgatggtgagtatgacggtggccagtagcccaaggctc  c.259+1080

         .         .         .         .         .         .  g.24170
atcatactttgtaagactgcttcttcctcagtatctcgtgcaggcagcttgcagagggac  c.259+1140

         .         .         .         .         .         .  g.24230
ccttaatgagcttgggtcatatgcccatcactgagtcaatcagtttagtcaagagaaatg  c.259+1200

         .         .         .         .         .         .  g.24290
gactttgggaggctgaggtgggcgcatcatttgaggtcaggagttcgagaccagcctgag  c.259+1260

         .         .         .         .         .         .  g.24350
caacatgatgaaacccccgtctgtactgaaatacaaaaaaattttagctaggcatggtgg  c.259+1320

         .         .         .         .         .         .  g.24410
cacatgcctatagtcccagctacttgggaggctgagataggagaattgcttgaacctgga  c.259+1380

         .         .         .         .         .         .  g.24470
atgcagaggtttcagtgagctgagattgcgccattgcactctatcctgggcacagagcaa  c.259+1440

         .         .         .         .         .         .  g.24530
gactccgtctcaaaaaaaaaaaaaaagaaaaaaagacaatgggacactgattgagcgtat  c.259+1500

         .         .         .         .         .         .  g.24590
ccagcctcaggccatccacatgcaaaggaaaagagaaagagaagagggcttttgtaacct  c.259+1560

         .         .         .         .         .         .  g.24650
gaagatggaaaggatgttaggacaaacagtagtatcagattacaccttatttaccgagag  c.259+1620

         .         .         .         .         .         .  g.24710
acttgtggtagttttttaaaactttgtttttcagaaacttgattaaatgagatacatgtg  c.259+1680

         .         .         .         .         .         .  g.24770
taaaatcacttggtagagtgcctggcacttagaagattggccctgaaccacagctagaat  c.259+1740

         .         .         .         .         .         .  g.24830
ttagtttacctcaggtgataaagggagtgtttgacttaaacaattattttgatataattt  c.259+1800

         .         .         .         .         .         .  g.24890
tgcatttacagaaaagttttaagaattgtacaaacaattcctgcatgtcctttatccaga  c.259+1860

         .         .         .         .         .         .  g.24950
ttcactagtttaacattttgtcccatatatgttgggacaaagtattggctctgtttcttt  c.259+1920

         .         .         .         .         .         .  g.25010
ttacacaaaccctcctcgcccccagcacacaccctttttctgaaagatgtgagagcagtt  c.259+1980

   g.25011
t  c.259+1981

--------------------- middle of intron ---------------------
                                               g.25012        g.25012
                                               c.260-1981  g  c.260-1981

.         .         .         .         .         .           g.25072
cagacatgtacttttaaccatgaatacttcaatgcatttcctaagaataagaattttctg  c.260-1921

.         .         .         .         .         .           g.25132
ttacattgccacaatttgttgataaaaatcaggacatttaacactgatgcaatgctatta  c.260-1861

.         .         .         .         .         .           g.25192
tctaatctatagtttatatttaaattttaacaatcattctaattttccatagaagtttat  c.260-1801

.         .         .         .         .         .           g.25252
ttttgctggtataggataacatattgtttttgttgtgtctctttagcttcctttaatctg  c.260-1741

.         .         .         .         .         .           g.25312
gaacaactcttcagtcttttgtgatcttgacagtgttgaagaatatatgcctgttatttt  c.260-1681

.         .         .         .         .         .           g.25372
atagttcttcaatttgtttttgtctgatgtttcctcatgattagattcaatttatatgtc  c.260-1621

.         .         .         .         .         .           g.25432
cttagcaggaatactcggggcatcagactaggagatttatgatgttggtttgacccatta  c.260-1561

.         .         .         .         .         .           g.25492
ttggtgatgttaaccttaattataagttaataagttcatgttcattaagttaatctctgt  c.260-1501

.         .         .         .         .         .           g.25552
aaagttactatttattccttttaataatttatgaaaagatactttgagactatgtaaaaa  c.260-1441

.         .         .         .         .         .           g.25612
tattatcttcttcatcaaactgcctcccactctcttagcatctattgatgactcttggct  c.260-1381

.         .         .         .         .         .           g.25672
gagtcatttattactaagatagtttgccaaatggtgatttttccaactccgtaatttctt  c.260-1321

.         .         .         .         .         .           g.25732
ccatattgattagttggtattctactccaaggaagagcttcctgtcccatgcccatatat  c.260-1261

.         .         .         .         .         .           g.25792
ttatttgtttttttggggtcagattagacttgtagattctcattttatttcataaatata  c.260-1201

.         .         .         .         .         .           g.25852
ttattattatcatttttaaattttgatgttaaaagtgccctagatttggccagtgggagc  c.260-1141

.         .         .         .         .         .           g.25912
cccatcaagccagctacagtgattttttttttttaaattttatatgtgttctcataattt  c.260-1081

.         .         .         .         .         .           g.25972
tttgagcacttccttgctggcacaagatgttccaggcttatcttgtactttcttagtccc  c.260-1021

.         .         .         .         .         .           g.26032
agcccccaaatcagccattttccacagagacctgttctttttctggtggttgatggtatt  c.260-961

.         .         .         .         .         .           g.26092
taaaaaaacaagataacagtgctagctgtgctcattccaatggggtgtatttgcttcaag  c.260-901

.         .         .         .         .         .           g.26152
gccctttcaatggacagagctaagaactgtgaatataaaaccttgaaacaaataacataa  c.260-841

.         .         .         .         .         .           g.26212
tagacatatgtatatagtgctatgataaatcagaggggcataaaattctgttgtgatgtg  c.260-781

.         .         .         .         .         .           g.26272
gccaagggagggtcaagagaaatgtcaagaaagtcttccatttaagcacaattttgcagt  c.260-721

.         .         .         .         .         .           g.26332
ctttacttttttttttttttataggctataaaaaagctggaaaaggtataaaggagaaga  c.260-661

.         .         .         .         .         .           g.26392
accaaaataataaaatggataatcccaagtttaaaatacttgccttatataattttatac  c.260-601

.         .         .         .         .         .           g.26452
tgtgtcaggcaacaggtagacaaaagcaagccacttagttgcagaagtatgtacatatat  c.260-541

.         .         .         .         .         .           g.26512
tggcaaaaagtaaaaacactgtaaaactttaaaggacataagctaattatataagagatg  c.260-481

.         .         .         .         .         .           g.26572
tcagagagacaagtcaacagtgcaaagaataagtgatacaagaagccaagaaaggatcat  c.260-421

.         .         .         .         .         .           g.26632
tgtggtttacgaatgattattaagtctagtaatatacagctggtaatttaaaacactttc  c.260-361

.         .         .         .         .         .           g.26692
tcatccataggtgtggtatatttattggcacatcgtttctgaagcatagacatataccca  c.260-301

.         .         .         .         .         .           g.26752
gaccataggtatttaaattgtattaactaaatcaaaaggtttatgaatttgggtttttcc  c.260-241

.         .         .         .         .         .           g.26812
ctgttatgaacatgtataattattttgaaccacgtaagcatatgcattttcaatttattt  c.260-181

.         .         .         .         .         .           g.26872
taaaatatttaaataattttgtttttgtgcctattttccaatagatttatatgtgatatt  c.260-121

.         .         .         .         .         .           g.26932
aagaataattataatgttaatatttgcctttatgcctttagtgcctattacttagtctag  c.260-61

.         .         .         .         .         .           g.26992
tagtaggtgctttgttgattgaataaataaaatagatttttcaaatgtaatttctttcag  c.260-1


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