intraflagellar transport 80 homolog (Chlamydomonas) (IFT80) - 8464 nt intron 06 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.38550
gtacttctcagtcatttgtaaattgttatcagggtctgcctgactgctaaactagagggc  c.549+60

         .         .         .         .         .         .  g.38610
acttgcttaggagtctctttcttctgggtggtctttttacagtctggtctttaagtacat  c.549+120

         .         .         .         .         .         .  g.38670
ggtttaatcagcctttattacagaacaaggaatatctttatatttccaacaaggtttgtt  c.549+180

         .         .         .         .         .         .  g.38730
ttccccttattccaactcattttgataatgatacagcatagttttgctaataagaacaca  c.549+240

         .         .         .         .         .         .  g.38790
ggctttggagttagctacttgggttcaaatcttcactcacttacctatacatgaccttag  c.549+300

         .         .         .         .         .         .  g.38850
gcaagttataaaatattgttgaatgtcagccttcaatatctcaactaagagatgagaaca  c.549+360

         .         .         .         .         .         .  g.38910
tctcttagttagtgacactaatatcagcttaacaggattgctgtaaggattaaatgagtt  c.549+420

         .         .         .         .         .         .  g.38970
aaaattgcaaagtgcaaaggacaattccgggcatacagtaagcactcaatatacagtacc  c.549+480

         .         .         .         .         .         .  g.39030
tgttattatctgtattattatgctattataagttgctgtgccatctctaccttttagtca  c.549+540

         .         .         .         .         .         .  g.39090
accaaggagaccaggaaaacattgtaaaatgactaggtcttgagtaagagatttgttggt  c.549+600

         .         .         .         .         .         .  g.39150
agacattgacaggctacagcaggcatagaagtgttttcacagttgagtagatgtagattt  c.549+660

         .         .         .         .         .         .  g.39210
tagggaataaggacatagagatgactttgaggttccatattataacatctgtacagatta  c.549+720

         .         .         .         .         .         .  g.39270
tgctatatgtattttacacagccaaaatgcatttacatttttatggtgtgcagaacactc  c.549+780

         .         .         .         .         .         .  g.39330
tgctaggaactatagggacatgcaagaatagaacatacaagcccctgtccttaggcacct  c.549+840

         .         .         .         .         .         .  g.39390
aaggtaaagaatttgggcaaagggaagaagctgggaaagaggactagttttgatggctct  c.549+900

         .         .         .         .         .         .  g.39450
tagtcaaagtccttccatgccaattacctacgctgaaaatctgctatgaaatttatacag  c.549+960

         .         .         .         .         .         .  g.39510
caaaaacagacaagttgaatcttttagtttatacctttagtttatagttatgtgaatttg  c.549+1020

         .         .         .         .         .         .  g.39570
tttttttttcttttttttttaattatactttaagttctagggtacatgtgcacaatgtgc  c.549+1080

         .         .         .         .         .         .  g.39630
aggtttgttacataggtatacatgtgccatgtaggtttgctgcacccattaactcatcat  c.549+1140

         .         .         .         .         .         .  g.39690
ttatattaggtatttctcctaatgctatccctcccccagccccccaccttacgacaggcc  c.549+1200

         .         .         .         .         .         .  g.39750
ctggtgtgtgatgttccctgtcctgtgtacaagtgttcttattgttcagttcccacctat  c.549+1260

         .         .         .         .         .         .  g.39810
gagtgagaacatgcggtgtttggttttctgtccttgtgatagtttgctgagaataatgat  c.549+1320

         .         .         .         .         .         .  g.39870
ttccagcttcatccatgtccctgcaaaggacatgaactcatcctgtattatggctgcata  c.549+1380

         .         .         .         .         .         .  g.39930
gtattccatggtgtatatgtgccacattttcttaatccagtccatcactgatggacattt  c.549+1440

         .         .         .         .         .         .  g.39990
gtattggttccaagtctttgctattgtgaatagtgccaccataaatatatgtatgcatgt  c.549+1500

         .         .         .         .         .         .  g.40050
gtctttatagtagcatggtttataatcctttgggtatatacccagtaatgggatggctgg  c.549+1560

         .         .         .         .         .         .  g.40110
gtcaaatggtatttctagttctacatccttgaggaattgccaccctgtcttccacagtgg  c.549+1620

         .         .         .         .         .         .  g.40170
ttgaactagtttacactcccaccaacagtgtaaaaggattcctgtttctccatatcttct  c.549+1680

         .         .         .         .         .         .  g.40230
ccagcactgttgtttcctgattttttaatgatcaccattctaactggtgtgagatggtat  c.549+1740

         .         .         .         .         .         .  g.40290
ctcattgtggttttgatttacatttctctgatgaccagtgttgatgagcattttttcatg  c.549+1800

         .         .         .         .         .         .  g.40350
tatctgttggctgcataaatgtcttcttttgagaagcgtctgttcatatcctttgcccac  c.549+1860

         .         .         .         .         .         .  g.40410
tttttgatggggttgtttttttcttataaatttgtttaagttctttgtagattctggata  c.549+1920

         .         .         .         .         .         .  g.40470
ttagccctttgtcagatgggtagattgcaaaaattttctcccattctgtaggttgcctgt  c.549+1980

         .         .         .         .         .         .  g.40530
tcactctgatggtagtttcttttgttgtgcagaagctctagtttaattagatcccatttg  c.549+2040

         .         .         .         .         .         .  g.40590
tctattttggcttttgttgccattgcttttggtgtattagtcatgaagtccttgccaatg  c.549+2100

         .         .         .         .         .         .  g.40650
ccaatgtcctgaatggtattgcctagattttcttctaggatttttatggttttaggtcta  c.549+2160

         .         .         .         .         .         .  g.40710
acatttaagactttaacccatcttgaattaatttttgtataaggtgtaaggaagggaacc  c.549+2220

         .         .         .         .         .         .  g.40770
agtttcagctttctatatatggctaaccagttttcccagtaccatttattaaatagggaa  c.549+2280

         .         .         .         .         .         .  g.40830
tcctttccccatttcttgtttttgtcaggtttgtcaaagatcagatggttgtaaatgtat  c.549+2340

         .         .         .         .         .         .  g.40890
ggtgttatttctgagggctctgttctgttccattgctgtgtatctctgttttggtaccag  c.549+2400

         .         .         .         .         .         .  g.40950
taccatgctgttgtggtagccttgtagtatagtttgaagtcaggtagcgtgatgcctcca  c.549+2460

         .         .         .         .         .         .  g.41010
gctttgttctttttgcttaggattgtcttggcaatgcaggctctttttggttccgtatga  c.549+2520

         .         .         .         .         .         .  g.41070
actttaaagtagttttttccagttctgtgaagaaagtgattggtagtttgatggggatgg  c.549+2580

         .         .         .         .         .         .  g.41130
cattgaatctataaattactttgggcagtatggccattttcacgatactgattcctcgta  c.549+2640

         .         .         .         .         .         .  g.41190
tctataagcatggaatgttcttccatttgtttgtgtcctcctttattttgtcgagcagtg  c.549+2700

         .         .         .         .         .         .  g.41250
gtttgtagttctcctttaagaggtccctcacatccgttgtaagttggattcctaggtatt  c.549+2760

         .         .         .         .         .         .  g.41310
ttagtatctgtgtagcaattgtgaatgggagttcactcattatttggctctctgtttgtc  c.549+2820

         .         .         .         .         .         .  g.41370
attggtgtatagaaatggttgtgatttttgcatactgattttgtatcctgagactttgct  c.549+2880

         .         .         .         .         .         .  g.41430
gaagttggttatcagcttaaggagattttgggctgagataatggggttttctaaatatac  c.549+2940

         .         .         .         .         .         .  g.41490
gattgtgtcatctgcaaacagggacaatttgacttcctcttttcctaattgaataccctt  c.549+3000

         .         .         .         .         .         .  g.41550
tatttccttctcttgcctgattgcccgggccagaacttccaacactatgttgaataggaa  c.549+3060

         .         .         .         .         .         .  g.41610
tggtgagagagggcatccctgtcttgtgccagttttcaaagggaatgcttccagtttttg  c.549+3120

         .         .         .         .         .         .  g.41670
cccattcagtatgatattggctgtgggtttgtcataagtagctcttattattttgagata  c.549+3180

         .         .         .         .         .         .  g.41730
tgttccatcaatacctagtttatggagagtttttagcatgaagggctgttgaattttgtc  c.549+3240

         .         .         .         .         .         .  g.41790
gaaggccttttctgcatctattgagataatcatgtggttttgtcgttggttctgtttatg  c.549+3300

         .         .         .         .         .         .  g.41850
tgatggattacgtttctttatttgcgtatgttgaatcccttgcatcccagggatgaagcc  c.549+3360

         .         .         .         .         .         .  g.41910
aacttgatcatggtggataagctttttgatgtgctgctggattcagtttgccagtacttt  c.549+3420

         .         .         .         .         .         .  g.41970
ttttgaggatttttgcatcggtgttcatcagggatattggtctaaaattctcttctttgg  c.549+3480

         .         .         .         .         .         .  g.42030
ttgtgtctctgccaggctttcgtatcagcatgatgctggcctcataaaatgagttaggaa  c.549+3540

         .         .         .         .         .         .  g.42090
ggattccctcgttttctattgattggaataatttcagaaggaatggttccagctcctctt  c.549+3600

         .         .         .         .         .         .  g.42150
tgtacctctggtagaattcggctgtgaatctgtctggtcctggactttttttggttggta  c.549+3660

         .         .         .         .         .         .  g.42210
ggttattaattattgcctcaatttcagagcctgttatcagtctattcaacttcttcctgg  c.549+3720

         .         .         .         .         .         .  g.42270
tttagtcttgggagggcatatgtgtccaggagttaatcgatttcttctagattttctatt  c.549+3780

         .         .         .         .         .         .  g.42330
ttatttgcgtagaggtgttgattgtattctctgatggtagtttgtatttctgtgaaatca  c.549+3840

         .         .         .         .         .         .  g.42390
gtggcgatatcccctttatcattttttattgtatctatttgattcttctctcttctcctt  c.549+3900

         .         .         .         .         .         .  g.42450
ttattagtcttgctagtggtctatcaattttgtggatcttttcaaaaaaccagctcctgg  c.549+3960

         .         .         .         .         .         .  g.42510
attcattgatttttttgaagagttttttgtgtctctatctccttcagttctgctctgatc  c.549+4020

         .         .         .         .         .         .  g.42570
ttagttatttcttgccttctgttagcttttgaatgtgttttctcttgtttctctagttct  c.549+4080

         .         .         .         .         .         .  g.42630
tttaattgtgatgttagggtgtcaattttagatctttcctgctttctcttgtgggcattt  c.549+4140

         .         .         .         .         .         .  g.42690
agtgctataaatttccctctacacactgctttaaatgtgtcccaaagattctggtacatt  c.549+4200

         .         .         .    g.42722
gtgtctttgttctcattggtttcaaagaacat  c.549+4232

--------------------- middle of intron ---------------------
                g.42723       .         .         .           g.42754
                c.550-4232  ctttatttctgccttcatttcgttatgtaccc  c.550-4201

.         .         .         .         .         .           g.42814
agtagtcattcaggagcaggttgttcagtttccatgtagttgagtggttttgagtgagtt  c.550-4141

.         .         .         .         .         .           g.42874
tcttaatcctgagttctaatttgattgcactgtggtctgagagacagtttgttgtgattt  c.550-4081

.         .         .         .         .         .           g.42934
ctgttcttttacatttgctgaggagtgctttacttcctgctatgcggtcaattttggaat  c.550-4021

.         .         .         .         .         .           g.42994
aagtgtggtgtggtgctgagaataatgtgtattctgttgatttggggtggagagttctgt  c.550-3961

.         .         .         .         .         .           g.43054
agatgtctattgggtctgcttggtgcagagctgagttcaagtcctggatatccttgttaa  c.550-3901

.         .         .         .         .         .           g.43114
ccttctgtcttgttgatctgtctaatattgacagtagggtgttaaagtctcccattatta  c.550-3841

.         .         .         .         .         .           g.43174
ttgtgtgggagtccaagtttctttttaggtctctaaggacttgctttatgaatctgggtg  c.550-3781

.         .         .         .         .         .           g.43234
ctcctgtattgggtgcatatgtatttaggatagttagctcttcttgttgaattgatccct  c.550-3721

.         .         .         .         .         .           g.43294
ttaccattaggtaatggccttctttgtcccttttgatctttgttggtttaaagtctgttt  c.550-3661

.         .         .         .         .         .           g.43354
aacagagactaggattgcaacccctgctttttttgctttccatttgcctggtagatcttc  c.550-3601

.         .         .         .         .         .           g.43414
ctccatccctttattttgagcctatgtgtgtctctgcatgtgagatggttctcctgaata  c.550-3541

.         .         .         .         .         .           g.43474
cagcacactgatggatcttgattcttcatccaatttgccagtctgtgtcttttaattggg  c.550-3481

.         .         .         .         .         .           g.43534
gcatttagcccatttacatttaaggttaatattgttatgtgtgaatttgatcctgacgtg  c.550-3421

.         .         .         .         .         .           g.43594
atgttagctggttattttgcccattagttgggttattttgcccattagttgcccatagat  c.550-3361

.         .         .         .         .         .           g.43654
gcttcctagcatcaatggtctttacaattcggcatgtttttgcagtggctggtactggtt  c.550-3301

.         .         .         .         .         .           g.43714
gttcctttccatgtttagtgcttccttcaggagctcttgtaaggcaggcctggtggtgac  c.550-3241

.         .         .         .         .         .           g.43774
aaaatctctcagcatttgcttgtctgtaaaggattttatttctccttcacttatgaagct  c.550-3181

.         .         .         .         .         .           g.43834
tagtttggtcagatatgaaattcagggttgaaaattctttcctttaagaatgttgaatat  c.550-3121

.         .         .         .         .         .           g.43894
tggcccccaatctcccttctggcttgtagagtttctgctgagagatctgctgttagtctg  c.550-3061

.         .         .         .         .         .           g.43954
atgggattccctttgtgggtaacccgatctttctttctggctgccgttaacattttttcc  c.550-3001

.         .         .         .         .         .           g.44014
ttcatttctaccttggtgaatctgacaattatgtgtcttggggttgctcttcttgaggag  c.550-2941

.         .         .         .         .         .           g.44074
tatctttgttgtgttctctgtatttcctgaattttaatgttggcctgccttgctaggttg  c.550-2881

.         .         .         .         .         .           g.44134
gggaagttctcttggataatatcctgaagagtgttttccaacttcgttccattctcccta  c.550-2821

.         .         .         .         .         .           g.44194
tcactttcaggtacaccaatcaaatgtagatttggtcttttcacatagtcccatatttct  c.550-2761

.         .         .         .         .         .           g.44254
tggaggctttgttcgtctctttttactcttttttgtctaaacttctcttctcactttatt  c.550-2701

.         .         .         .         .         .           g.44314
tcattaatttgatcttcaatcactgataccctttcttccacttgatcgaatcagctactg  c.550-2641

.         .         .         .         .         .           g.44374
aagcttgtgcatgtgtcaagtagttctcatcccatggttttcagttccatcaggtcattt  c.550-2581

.         .         .         .         .         .           g.44434
aaggtcttctctacgctgtttattctagttagccattcatctaatcttttttcaaggttt  c.550-2521

.         .         .         .         .         .           g.44494
ttagcttccttgtgatggcttaggacatgctcctttagcttggggaagtttgttattact  c.550-2461

.         .         .         .         .         .           g.44554
gaccttctgaagcctagttatgtcaactcatcaaagtcattctctgtccagctttgttcc  c.550-2401

.         .         .         .         .         .           g.44614
attgctggcgaggagctgcgatcctttggaggagaaggggtgttctggtttttagaattt  c.550-2341

.         .         .         .         .         .           g.44674
tcagcttttctactctggtttctccccatctttgtggttttatctacctttggtctttga  c.550-2281

.         .         .         .         .         .           g.44734
tgttggtgacctacagatggtgttttggtgtggatgtcctttttgttgatgttgatgcta  c.550-2221

.         .         .         .         .         .           g.44794
ttcctttctgtttgttagttttccttctaacagtcaggaccctcaactgcaggtctgttg  c.550-2161

.         .         .         .         .         .           g.44854
gagtttgctggaggtccacttcaggccgtttgcctgggtatcaccagcagaggctgcaga  c.550-2101

.         .         .         .         .         .           g.44914
atagcaaatattgcagaacagcaaatattgctgcctgatccttcctctggaagcttagtc  c.550-2041

.         .         .         .         .         .           g.44974
ccagaggtgtcaatctgcctgtatgaggtgtcaatcggcccctaactgtctcccagttag  c.550-1981

.         .         .         .         .         .           g.45034
gctacacgggggtcaaggacccacttgaggaggcagtctgtccattctcagagctcaaac  c.550-1921

.         .         .         .         .         .           g.45094
gccgtgctgggagaaccactgctctcttcagagctcagttgaaaatgcagaaatcacccg  c.550-1861

.         .         .         .         .         .           g.45154
tcttctgtgtcgatcacactgggagctgcagaccagagctattcctattcagccatcttg  c.550-1801

.         .         .         .         .         .           g.45214
gaatggtgtccctgtaaatttgtttagatacctgtaattaggcttatagaaatgaaactc  c.550-1741

.         .         .         .         .         .           g.45274
aggaagctggttatatcacaattggtcaagttaaatatggcttagtggttcagtagaacc  c.550-1681

.         .         .         .         .         .           g.45334
tctgggccaggaggtagtagagtgaatcaaagtatccattgccaaaattagctagagaga  c.550-1621

.         .         .         .         .         .           g.45394
aacaggacttaaagtataattagtaacttcatgcaaattatctattccttttgggagact  c.550-1561

.         .         .         .         .         .           g.45454
aaagcagctgcaattcttcttgagcataaaaacatattcaaattaggattgtccacaaaa  c.550-1501

.         .         .         .         .         .           g.45514
aagtgtgcttaattaattcttgcttgtggaatgcagttcagaagtatatacctcatgtct  c.550-1441

.         .         .         .         .         .           g.45574
tttaaggccttctcaacacttcgaacttggtcttatagtgaggaaatttttatttattcg  c.550-1381

.         .         .         .         .         .           g.45634
ttgaataaaaatgtaatgcatacctgttatataccaggcactgtggtaggtatgagatag  c.550-1321

.         .         .         .         .         .           g.45694
tcaaaatgaaacagaacatagtttctgccttcaaggagcttcttgttcaaaggaatttta  c.550-1261

.         .         .         .         .         .           g.45754
caaaatgcctaatacattaataaataaataaaaattattatatgtttaacaatatgcaaa  c.550-1201

.         .         .         .         .         .           g.45814
tatttgtaatatatgttgataccctaaattacagtgtaaggaaaatttaaatcatatttt  c.550-1141

.         .         .         .         .         .           g.45874
attcataaatcttgaatacgcaatatttattttgttcctttaaaatgaaactcttaagaa  c.550-1081

.         .         .         .         .         .           g.45934
tccatggctgggcacggtggctcatgcctgtaatcccagcactttgggaggccaaggcag  c.550-1021

.         .         .         .         .         .           g.45994
aacttaacgattttcatatcaatgggaggtactggaaccaatcccccacagataccaaag  c.550-961

.         .         .         .         .         .           g.46054
aatgactgtataccaaagaatgaatgtatagaatatatacttatctatggaaaacatctt  c.550-901

.         .         .         .         .         .           g.46114
tttgttacatggtaaatacagcagaagtttctcagagtagtccagttgtaaaccagacac  c.550-841

.         .         .         .         .         .           g.46174
atgaagataaagtgaatgaaacttagaagaatatgacgaacagaatgaaatgaagagggt  c.550-781

.         .         .         .         .         .           g.46234
agtaaagatgtttgtgcagaagtttaaaaaaaaaatggttgaggggggctgaacatggtg  c.550-721

.         .         .         .         .         .           g.46294
gctcacgcctgtaatccccgcacattgggaggccaaggcaggaggattacttgagcccag  c.550-661

.         .         .         .         .         .           g.46354
gagcttgagactagcctaggcaatatagcaagagttatctaccaaaaatgaaaaaaaaaa  c.550-601

.         .         .         .         .         .           g.46414
aaaagtagctgggtgtggtggcatgtccctgtagtcccagctacttgggaggctgaggca  c.550-541

.         .         .         .         .         .           g.46474
ggaggattgcttgaatgtgggaggtcgagactgcagttgccctgatcacatcattgaact  c.550-481

.         .         .         .         .         .           g.46534
ccaacctgcgtgacagtgagaccctgtctcaaaaataaataaataaataaataaaataaa  c.550-421

.         .         .         .         .         .           g.46594
taagtaaacaagcatgaaggcagtatcagtaatggaatctgctatatgaaggagaaagca  c.550-361

.         .         .         .         .         .           g.46654
agatttggattcagttgacatttttggaatacataacatattcattcagtgttattgtac  c.550-301

.         .         .         .         .         .           g.46714
aaatgtccggcttgaaatagttcagcagcaagtcattttccatctggagtccaggcaact  c.550-241

.         .         .         .         .         .           g.46774
gaggaaattcataaggtttgaggctatatagtggatgtcttaggtgctaggtgcttacat  c.550-181

.         .         .         .         .         .           g.46834
tagtataaattacaaatgaaacaagcaaatgaggtattgtacattggctataaaaggaag  c.550-121

.         .         .         .         .         .           g.46894
ataggaatccctgagaagatgacaaaggagtcattagaaagaggcaaaatatatttctta  c.550-61

.         .         .         .         .         .           g.46954
cagaaaaaaacttaagtgcttttaaacttataattaatatcttattcttttttctcacag  c.550-1


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