jagged 1 (JAG1) - downstream reference sequence

         .            .         .         .         .         . g.41409
ctggattaatggcc / tgtagtgtcgaggtgaattgtttgtgagcaatcaggggaactggcc c.*1860

         .         .         .         .         .         .    g.41469
acagcactgaaagggttttaaagggtttggaattggtgttgggaaacgagcagggagatt    c.*1920

         .         .         .         .         .         .    g.41529
taatgtctgcctcttttttttccctggctacttagattcatattaatgtcctgttgtaag    c.*1980

         .         .         .         .         .         .    g.41589
ggtgtggtctgaaatgactcttgtgcacatttacccatggggtggtttcctcacggcaca    c.*2040

         .         .         .         .         .         .    g.41649
ggaggtggtagttgcaagcttctggtgttcgggctcatcactcatcaccttgttcccagg    c.*2100

         .         .         .         .         .         .    g.41709
gaatgagtgttctggcctcaccatgcagccttggagtgctggtgttctggtcttctgtga    c.*2160

         .         .         .         .         .         .    g.41769
ggttccagagttgggctgtccccacctgtcacgggcaggagaactctggttctctcactt    c.*2220

         .         .         .         .         .         .    g.41829
gtggctggtggaggccctgcccccgcatcgcgtggtggggtgtgggagaagctttgcctc    c.*2280

         .         .         .         .         .         .    g.41889
tggcacctctgcggaaggaataagctgtggtaacaagcacatggacagcttccagcagcc    c.*2340

         .         .         .         .         .         .    g.41949
gtgcagagtcaccaggactctgcttctggctaggaaagccaaagctcacccttctcagag    c.*2400

         .         .         .         .         .         .    g.42009
ccatcccccagcacttcaacattcaggcctgtccacccacgtccggttttcatacaactg    c.*2460

         .         .         .         .         .         .    g.42069
gcacagcagactttgaatggaggaaaagctgatggggatgtttttctttgttctcgggga    c.*2520

         .         .         .         .         .         .    g.42129
aacattttttcttctaggcttggagttgtgctaaggaacatcttaagaatgaaagatgag    c.*2580

         .         .         .         .         .         .    g.42189
ctttaagtgtcctgggatccttgtgcatgagcagaggccatcgagggatttgggattgtg    c.*2640

         .         .         .         .         .         .    g.42249
acaaccctaagagggccaacactgttttggctcattggggaggtggcctgaaggacccgg    c.*2700

         .         .         .         .         .         .    g.42309
acagcgaagagttgaggtttccatgacatctccctgccctagcgtagctccgctttctca    c.*2760

         .         .         .         .         .         .    g.42369
ccaatgtctgccagtagacagctgggtttccacaaggtggggtcaaagggagggagaaat    c.*2820

         .         .         .         .         .         .    g.42429
ctagatcctactagccaggagacagtcatttcgcagcagtggagtcaaacactatcctga    c.*2880

         .         .         .         .         .         .    g.42489
agcaaaaccttgttctggtggtttgtaaacttggattctgcaggaccccagaattccttg    c.*2940

         .         .         .         .         .         .    g.42549
ggtagctgccagatgcttttgtgccaagaaaaaaaaaaaaaaaagttgaatgagtctctg    c.*3000

         .         .         .         .         .         .    g.42609
caattctttattccaggagggaagggatcttgggattcatgggtgttgtcttaactcacc    c.*3060

         .         .         .         .         .         .    g.42669
ttctgtctgggacacccctggtattgggagggcatagatcagcctcctctggatgtggct    c.*3120

         .         .         .         .         .         .    g.42729
cagtgccaggactttaattgtgaagggtggattttccccttccttcaggaagaaggaagc    c.*3180

         .         .         .         .         .         .    g.42789
aggcaatggtgctctggttatcctggggttaggaaagttgagaggaagggactcagtgcc    c.*3240

         .         .         .         .         .         .    g.42849
tttaccattcattccccaggaacgccctgggctctctttaaaggggccctggaagaaaaa    c.*3300

         .         .         .         .         .         .    g.42909
attttcagtccagaaacttggctaactagaactctagcattagaatatcccatgaaactc    c.*3360

         .         .         .         .         .         .    g.42969
caggaaagaacacttaaagctggtgtttttttaggatgggaagctctgtcctgagattct    c.*3420

         .         .         .         .         .         .    g.43029
atacttccatgatgtagaatttgaatagaaagtggagggggaggatgtatcttaattgac    c.*3480

         .         .         .         .         .         .    g.43089
taaaagccaaaggagactcagtggtgatttgcgagagggtttacagtttgaagatgcaga    c.*3540

         .         .         .         .         .         .    g.43149
tttccaggactggtccatgaccctattagaccagatgcaccagaagtggagcctgggaat    c.*3600

         .         .         .         .         .         .    g.43209
ttgaatttttgacaagctcgctcttcctccccgactcatgcactctaaaaattgggagca    c.*3660

         .         .         .         .         .         .    g.43269
actctgctaaagtgctacagtaccagctcttaactaattataatgtttttcttccttgtt    c.*3720

         .         .         .         .         .         .    g.43329
aaactgaattaaatagcctggaagccagtttgttgctaaattgccacctgacatcatttt    c.*3780

         .         .         .                                  g.43363
taagtaaaatgattacaccgccccttgagcaaga                              c.*3814