lysyl-tRNA synthetase (KARS) - 5854 nt intron 01 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.5170
gtgagtgtcgctgcgagtctttaaagcctttgcggtaggagagtctgggctgggaagcgc  c.62+60

         .         .         .         .         .         .  g.5230
cgcgaggttcccaccaaggctgctgtgccggggccttcttgccggctctcgtgggtacgc  c.62+120

         .         .         .         .         .         .  g.5290
acatgctgagacgtggtggctgcgccctgcagaccacgtaccccgggataccccgggcac  c.62+180

         .         .         .         .         .         .  g.5350
gccggctccccgttcccagctggcaccggcgggatgctccctatcatactcctagagtta  c.62+240

         .         .         .         .         .         .  g.5410
agagactgtggaggaggaactaggacgagaactaagagttatcagaaaagaaaagcgaaa  c.62+300

         .         .         .         .         .         .  g.5470
cttcctgcttagcttcatcctcctttctgagaaatgcattcttttgttgagccactcagt  c.62+360

         .         .         .         .         .         .  g.5530
aaacgtggaagttggagaaatgttaaataccctagcttttcagaaagaccttcaaaattt  c.62+420

         .         .         .         .         .         .  g.5590
tctgggcctcactaaggtcattctgaacgttatgtattaaaagggatcagttctaaaact  c.62+480

         .         .         .         .         .         .  g.5650
gtcatgcatctacccgtatgggttattcagtagatacctgtgagtattaagtgatcaacg  c.62+540

         .         .         .         .         .         .  g.5710
tctaacagtagagaccatcttaattcagcctgatatctttgttaaccactcccaaatccc  c.62+600

         .         .         .         .         .         .  g.5770
tggagtatgtaggttaacatagataagtcaggattagccaccctttaactggctgtctta  c.62+660

         .         .         .         .         .         .  g.5830
tattctcattagcgttccccatttgaaccacagaacacaggtaattgagtgttttatcat  c.62+720

         .         .         .         .         .         .  g.5890
tgctaggaagatggtacatagtaccattccagaggcatacgagagggcttaatccccgtg  c.62+780

         .         .         .         .         .         .  g.5950
gcgcgcacttgttatcccagctactcgggagactgaggcaggagaatcgctttaacccag  c.62+840

         .         .         .         .         .         .  g.6010
gaggcggaggttgcagtgtgctgaagtcgtgccactgcactccagcctgggagacttgag  c.62+900

         .         .         .         .         .         .  g.6070
gtagtggtccttcagggactgccagaagtgctgcgtgagcgagcccttctccatcgcttt  c.62+960

         .         .         .         .         .         .  g.6130
ccccaaggagttactgagacggagccagaccctgaatgaaaaagaaaagagaaatgatgt  c.62+1020

         .         .         .         .         .         .  g.6190
ttctttttttttttttttaagatggagtctcgctctgtcgccaggctggagtgcagtggc  c.62+1080

         .         .         .         .         .         .  g.6250
gcgatctcagctcactgcaaccttcgctgccagggttcaagcgattctcctgcctcagcc  c.62+1140

         .         .         .         .         .         .  g.6310
tcccgagtagctgggattacaggcgtgtgccaccatggctggccaatttttgtattttta  c.62+1200

         .         .         .         .         .         .  g.6370
gtagagacagggtttcaccatgttgggcaggatggtctcaatctcgttaccttgtgatcc  c.62+1260

         .         .         .         .         .         .  g.6430
gcccaccttggcctcccaaagtgctgggatgacaggcgtgagcctgagccaccacccctg  c.62+1320

         .         .         .         .         .         .  g.6490
gcctgatgtttccttttgtgtccctggctttgtgcttcaaatatcttagaaaaagtataa  c.62+1380

         .         .         .         .         .         .  g.6550
gagaaattgtcgaagtttatagttgggtaggaccttaatatattgtcctttattagagca  c.62+1440

         .         .         .         .         .         .  g.6610
atccgatggacttccataaaagtttggaacctggtctttggactgctaccttagagaaaa  c.62+1500

         .         .         .         .         .         .  g.6670
ttgacttgactttattaagtcaaatttaattgaatgtggtatatctgtgatatacgatcc  c.62+1560

         .         .         .         .         .         .  g.6730
taaagtttagttcattctttcaaaccacctatgataatcaattacattgaattgaacttt  c.62+1620

         .         .         .         .         .         .  g.6790
aggactgtatatcacaggtgaaagcacggtttccagttcagagtgtgtttttaggtaaac  c.62+1680

         .         .         .         .         .         .  g.6850
ggaaaaaactggttaattcctctttactgactttttttttttttttttttttttggaggc  c.62+1740

         .         .         .         .         .         .  g.6910
agagtcgttgttgccccggctggattgcagcggtgcgatttcagcccacggcaacttgca  c.62+1800

         .         .         .         .         .         .  g.6970
actcccgggttcaagcaattctggtgcttcagcctcccaagtacctgggactacaggtgc  c.62+1860

         .         .         .         .         .         .  g.7030
atgccacaacacccggttaaatttttgtgttttagtagagacgggatttgaccttgttgc  c.62+1920

         .         .         .         .         .         .  g.7090
ccaggctggcgtcaaactgctgagctcaggtgatccgtccgcctcaaccccacaaagcgc  c.62+1980

         .         .         .         .         .         .  g.7150
taggattataggcgtgagccaccactccctgcttcactgacttttctaaaattaaataca  c.62+2040

         .         .         .         .         .         .  g.7210
gctactacttttttgaccagcttttctgtgccaggcacaatgctagatctctacaagctt  c.62+2100

         .         .         .         .         .         .  g.7270
tctgtctagtgtcagtaataaccttgcaagaggagttattgtccatttttcaaattaata  c.62+2160

         .         .         .         .         .         .  g.7330
aactgaggtcctagtaattaaatgcactattaaagtgtgcattcctaaaatatagtctag  c.62+2220

         .         .         .         .         .         .  g.7390
cagtgatccagagcactggagcacggatctgaactcaggcctgtgactccacagtccatg  c.62+2280

         .         .         .         .         .         .  g.7450
ctctgtatcctgactgcacagcactactcacgttgtcttacctgtcattgatgtctattc  c.62+2340

         .         .         .         .         .         .  g.7510
ctctcgttaccatgagctaaaataatttttttctgattaacatttccttccgtttattgt  c.62+2400

         .         .         .         .         .         .  g.7570
tctggggaattccttggtctgaaatttttagtaagcaccattttgtgccaggtattgact  c.62+2460

         .         .         .         .         .         .  g.7630
ccaagtttaaaagcagatgtgctccctgcccgagtgaaatagcctcctcaaatttatttg  c.62+2520

         .         .         .         .         .         .  g.7690
aacacggtaaagaaggtgatctctgtaattctgttgccttccagtgttgataatgtataa  c.62+2580

         .         .         .         .         .         .  g.7750
acataacgcagtctaaggaccttcctgaaattctcctttccccttgttcctagagttcca  c.62+2640

         .         .         .         .         .         .  g.7810
aacaagtcttctctttgacacgtatttttgtgtggcttgcatttatctttgtctagagtt  c.62+2700

         .         .         .         .         .         .  g.7870
tgcaattgatagtgacagtttcctcttattttatatgcttcctattgccatcttgtggcc  c.62+2760

         .         .         .         .         .         .  g.7930
aggtatttcctctccaggtgagaaaccacacttcagggcttcagaaagtgcctcacatcc  c.62+2820

         .         .         .         .         .         .  g.7990
tgttcccatattctaggatgttgtgagcaattttacctgtaagctatccattaacttgct  c.62+2880

         .         .         .         .         g.8037
gttggctttaccccagatatgcatgttttttccatagtcaggactaa  c.62+2927

--------------------- middle of intron ---------------------
  g.8038            .         .         .         .           g.8084
  c.63-2927  gaacattgtcagttacagttgtagcacagagagtgttacagggttgc  c.63-2881

.         .         .         .         .         .           g.8144
tatcagttaagacagtcttaagttaaatgggactaaaaggtagtagaagcatggtccccc  c.63-2821

.         .         .         .         .         .           g.8204
tccccaacccataagagagttggttgggtatatgtatactgtctgtcccatctgacacca  c.63-2761

.         .         .         .         .         .           g.8264
catctctgtgtttcccgctaggtggtggtaatcattagttccagggtgctctgccatgtt  c.63-2701

.         .         .         .         .         .           g.8324
gacgcaagctgctgtaaggcttgttagggggtccctgcgcaaaacctcctgggcagagtg  c.63-2641

.         .         .         .         .         .           g.8384
gggtcacagggaactgcgactgggtcaacttgctcctttcacagcgcctcacaaggacaa  c.63-2581

.         .         .         .         .         .           g.8444
gtcattttctgatcaaagaaggttggtgcccattaccttctttattgctctggaagcaaa  c.63-2521

.         .         .         .         .         .           g.8504
aattatttccttacttggttcattttccgttaagcctctggctaagtctttggacttgtt  c.63-2461

.         .         .         .         .         .           g.8564
gctaaggaaacaaggagccctaataccaaaaccaatagtcctttctcattttctctttaa  c.63-2401

.         .         .         .         .         .           g.8624
taaattcaaatcgtctctccttagagtcttgagatgacatgtggatcttattctagaaga  c.63-2341

.         .         .         .         .         .           g.8684
gtgctaagaacaaaacctttgtttgaacaaataatttctaatgccagctatttccctttt  c.63-2281

.         .         .         .         .         .           g.8744
ctgtctttctggagttttgtgtgctcttgagattaatttggtttctagtcttagtgctat  c.63-2221

.         .         .         .         .         .           g.8804
ccctaggacctttttggattatccttaagattgatttgatttaagaggagcacctggttg  c.63-2161

.         .         .         .         .         .           g.8864
agtggaaaacagatttatcttaattctagaagaactagacagcctaatcttagcagtcca  c.63-2101

.         .         .         .         .         .           g.8924
ctgactgaattatagcatgataacaccagcacagtgttttggaaaggttgtctttacaaa  c.63-2041

.         .         .         .         .         .           g.8984
tgttataagacattatatgtagaaaaagctgtcaactttgaaaccattcagaatctgttt  c.63-1981

.         .         .         .         .         .           g.9044
ttcttttttacaagatgaaagattcggccaggcgtggtggctcacgcctgtaatcccagc  c.63-1921

.         .         .         .         .         .           g.9104
actttgggaggccaagacaggcagatcacgaggtcaggagatcaagaccatcctggctaa  c.63-1861

.         .         .         .         .         .           g.9164
cacggtgaaaccccatcttcactaaaaataccaaaaaaattagccgggcatggtggcggg  c.63-1801

.         .         .         .         .         .           g.9224
cacctgtagtcccagctactccggaggctgaggcaggaaaatggtgtgaacccgggaggc  c.63-1741

.         .         .         .         .         .           g.9284
agagcttacagtgatctgagatcgcaccactgcactccagcctgggcaacacagcgagac  c.63-1681

.         .         .         .         .         .           g.9344
tctgtctcaaaaaaaaaaaaaaaaggtgaaagattcaaaacctcaattcattttttaaag  c.63-1621

.         .         .         .         .         .           g.9404
ttattctaaattcatatcgaaaatgaaggatgtgtcctgaagccagaatgtttgcgggca  c.63-1561

.         .         .         .         .         .           g.9464
tgacttgggatcttctgctgtggttcactattgcagaatatttgattatgttcagcggtt  c.63-1501

.         .         .         .         .         .           g.9524
tgaaagaatgatccataaattgtctttgaatagtaaagatatccctccctacaccaatct  c.63-1441

.         .         .         .         .         .           g.9584
gtttagtttctggtttcagatagcaaattcagactataagagacatgaacatatcataca  c.63-1381

.         .         .         .         .         .           g.9644
gaacagctcagagttgtccgcattactttggtttttcaggttcaagtgataagtatcaag  c.63-1321

.         .         .         .         .         .           g.9704
agtttggataccaagtgatttaaccagaaatgtatttaaatctatatgaggcacagagag  c.63-1261

.         .         .         .         .         .           g.9764
taaagggttaagatactaaaagatacctagaaagctcacatttggttagctgaatgccag  c.63-1201

.         .         .         .         .         .           g.9824
ggtcagggtaatccctttatacaaacattatctcattacacaccataacaactggtgggg  c.63-1141

.         .         .         .         .         .           g.9884
gttgtctattattattttcgtttcacaggtgagaagttaattcactcgtccaagtcacat  c.63-1081

.         .         .         .         .         .           g.9944
aattgacaagtgtgttggaatttagtcccaggcagcctgactacaaagatggtatattac  c.63-1021

.         .         .         .         .         .           g.10004
cccctgtactatactgctttgcacaccgttctattttgttgtctaagtcaggctccagtg  c.63-961

.         .         .         .         .         .           g.10064
ggcaaagtgagactaatgctgacagccattcttggagagactgttggtaggggaggtctc  c.63-901

.         .         .         .         .         .           g.10124
cttgagtgctaaagagccggctcttccttactatcatcctaactcactcttaggggaggg  c.63-841

.         .         .         .         .         .           g.10184
atagagagagggggtagcagagggctggagatgttgccttatcatgtattagatctggca  c.63-781

.         .         .         .         .         .           g.10244
ttggaggggtcaggtggctcacacctgtaatcctagcactttgggaggccaaggtgggca  c.63-721

.         .         .         .         .         .           g.10304
gatcacttgaggaaaggagtttgagaccagtctggccaacgtggtgaaacctcgtctcac  c.63-661

.         .         .         .         .         .           g.10364
taaaaatacataaattagttgactgtggtggtacacacctgtaatcccagctactcagga  c.63-601

.         .         .         .         .         .           g.10424
ggctgaggcacgagaatctcttgaaacccgggaggcagagattgcagtaagctgagattg  c.63-541

.         .         .         .         .         .           g.10484
tgactgcactccagcctgggccacagagcaaaactctgtctcataaaaaaaaaaaaaaaa  c.63-481

.         .         .         .         .         .           g.10544
aaaaaaaaaaaaaaaaaagacctggcactgttggaacttcaccttctagggggatactaa  c.63-421

.         .         .         .         .         .           g.10604
acaactaagattcagtcactgtcctcaaggagctccctaacctaattagctcaagaaaag  c.63-361

.         .         .         .         .         .           g.10664
cctattctaattttctagaaaaccttttctcctattcaaaactaatgcataggattttct  c.63-301

.         .         .         .         .         .           g.10724
ttgtcttggtacatcttggttttagttgggacctaatgccaaggacctgagactggcaag  c.63-241

.         .         .         .         .         .           g.10784
cagagactgagagtgatttttcacatctttgttctaagcttatttttccctttgtgtctt  c.63-181

.         .         .         .         .         .           g.10844
tcacataaagagtttagtgacaagctacttgagctgagctgtgggtgtggaattgagggg  c.63-121

.         .         .         .         .         .           g.10904
tatagaactgagcaagagcgtttctcctgggcgattcatgtttttgataagttgctaggg  c.63-61

.         .         .         .         .         .           g.10964
gcagaacatagaggactcttcaggcagctaacacattgaacgctttcatctttccaacag  c.63-1


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