MCF.2 cell line derived transforming sequence (MCF2) - downstream reference sequence

         .         .         .         .            .         . g.131472
tgtaattctttttttcaaataaaaattaattcttcaggtt / agataaacttgttctgcctt c.*720

         .         .         .         .         .         .    g.131532
tttcgttccccatcacatactgcttcatgtctgtctgttcctgcaaagctgctgcagcta    c.*780

         .         .         .         .         .         .    g.131592
ccacatttaccagtgaagaaaagagttaattcttcatgttgcagagcaggcagttatgca    c.*840

         .         .         .         .         .         .    g.131652
agtggttttgcaatcaagtttgtaatataattttttaaaacaactttacagtctccaagc    c.*900

         .         .         .         .         .         .    g.131712
aaatatagatccctagcagactgcaggaagagaggctcagaagacctcctgattagaaat    c.*960

         .         .         .         .         .         .    g.131772
ggagatgtcattcagcttctccatgggaatgctgagggtcaatggtaggtgtgtttgcaa    c.*1020

         .         .         .         .         .         .    g.131832
agcctgtgatgatctccagctggggcacatagatagctaatcaaatgttctgctttatct    c.*1080

         .         .         .         .         .         .    g.131892
gtatctttgttatacagtctccaaaagcagaaatatcacagcgatggctttcattttcat    c.*1140

         .         .         .         .         .         .    g.131952
tgcttcagcactgcctataaagctcactgaaaggaacattaacctttggtgagtgaaaaa    c.*1200

         .         .         .         .         .         .    g.132012
tgctttgaacgaatgacatgctatgagtctgcatgttcttttgtagtttacctttggctc    c.*1260

         .         .         .         .         .         .    g.132072
agatgttttagctgatacgtctgggctttgtaatggctacagatcacattccatctggtc    c.*1320

         .         .         .         .         .         .    g.132132
atttaaatcattcattagccacatatttaatgaacgcctactgtgtgccagagaccacac    c.*1380

         .         .         .         .         .         .    g.132192
tttactactttacaacatagctacacttctgtttatcaggtcaaatattgactttctcat    c.*1440

         .         .         .         .         .         .    g.132252
tctacccttatgcctttgactttatatagtactggttgtaaagatggttctgccaaatat    c.*1500

         .         .         .         .         .         .    g.132312
actgtttaggtaggagagaacccaaagcaggaagaaaatattgttcggattgaatgaaac    c.*1560

         .         .         .         .         .         .    g.132372
ttccataattcttttggatattctaaatgtaagatttctgtcttcattgggtcaataact    c.*1620

         .         .         .         .         .         .    g.132432
tgaactgaaatgctacattgactgtgtactctaaccctttaggtggaagagtgtacacag    c.*1680

         .         .         .         .         .         .    g.132492
agaattaaaagttaatgatggatcattaaagtaataattttttctaataaccaaagtcct    c.*1740

         .         .         .         .         .         .    g.132552
ttgtagattacttaaaggactcatgcacagtgtcatgaaggtctttgaacacatgcagta    c.*1800

         .         .         .         .         .         .    g.132612
gccttgtgaaagtttgagctgcaacgtaatgtatttgttttaattcacttagtattacca    c.*1860

         .         .         .         .         .         .    g.132672
ttgttggctactaattcatttattatttaggttggtgaaaaatctaaacagaagaaaaga    c.*1920

         .         .         .         .         .         .    g.132732
aggcctgattctaggaaacagtttacatattttaattggtgaccataggtttcggaatgc    c.*1980

         .         .         .         .         .         .    g.132792
caaagttacaggtacaatatgaataaactgtacacaatttgaagactaaaaatgttaaag    c.*2040

         .         .         .         .         .         .    g.132852
cttcaccaaagaggacattggcatagagtaatgacctctctgcagttagaaataaagcag    c.*2100

         .         .         .         .         .         .    g.132912
caaacacattatgttagctagaatttattttttttctttaatagttttaaatttatgaat    c.*2160

         .         .         .         .         .         .    g.132972
gaaaattttaaaggcacattagacttttccctataaagttgatagtcttgaaagagattg    c.*2220

         .         .         .         .         .         .    g.133032
aagatactatggtgttttgtaagatacccttcagaattaaatactgaggatatgctttta    c.*2280

         .         .         .         .         .         .    g.133092
aggtacctgccttactgcccaagaatactttactagtatgtagttctacactgtcctagg    c.*2340

         .         .         .         .         .         .    g.133152
agcatgttatttctttatggtaggtctctgctacacacacacagacacacatacacaaac    c.*2400

         .         .         .         .         .         .    g.133212
acacttgtgtctatacccaagacttatgtgtgaaggtagtatgaagcattgggagctaat    c.*2460

         .         .         .         .         .         .    g.133272
ctgatgttcatttctattaacttaacccatagtatgtaacatttctgtatataaacccgt    c.*2520

         .         .         .         .         .         .    g.133332
tttcttgtagttttttcctctaagtgacacttagttgtctgttaaaaggtagcacagaaa    c.*2580

         .         .         .         .         .         .    g.133392
aggaaaatcaatgaattgttaaataagatgattcttgcatgcacacacttcctctgaaat    c.*2640

         .         .         .         .         .         .    g.133452
cctagttttggtcttttgtttgttcgaattccaggtaatggtagactgtttaaacacacc    c.*2700