MCF.2 cell line derived transforming sequence (MCF2) - 6486 nt intron 06 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.87090
gtcagttaaaacatttctttgtataccttttttcattacaccagaggtttttactcctta  c.687+60

         .         .         .         .         .         .  g.87150
atcatgagaaatcctgccttgcaagatgcccatttatacctacaaagaaaaaaaaggagg  c.687+120

         .         .         .         .         .         .  g.87210
caaatgtaaatgaaccttggcttagactgaagaaaatctctactaaaattctgagacttc  c.687+180

         .         .         .         .         .         .  g.87270
tactttttcagcttactcgtttcctttgagaaagtatcaaactgccaatatatatgacag  c.687+240

         .         .         .         .         .         .  g.87330
ggacaaagttactctctactttggggtttgttattcaaatttatcttagatctaaagggt  c.687+300

         .         .         .         .         .         .  g.87390
attcaaggttatgaggtagctttccaagggaataataccaacttccttcttggtttttaa  c.687+360

         .         .         .         .         .         .  g.87450
atcccatgtacctatgctgaccatatttaataagacctaacaagcttttatttctgatcc  c.687+420

         .         .         .         .         .         .  g.87510
aggagtttattcctgtgaaaagcctgagagatgaaattaaataagtttaataaataatta  c.687+480

         .         .         .         .         .         .  g.87570
aaaatacattccaattggaccttcctggaaaatccatcatatatggtcaagatgcataga  c.687+540

         .         .         .         .         .         .  g.87630
tttagtttcttttccttttgcggtcatgttcaaccttatcacagtctctctcacagtata  c.687+600

         .         .         .         .         .         .  g.87690
tacttcaccagaggatccaaggaaaactcacttgttcctcttgcatgtgcccagcttgtt  c.687+660

         .         .         .         .         .         .  g.87750
ttctgcccatgaatggcttacttgctttgtatttcacttgctcatcagagttaggtttcg  c.687+720

         .         .         .         .         .         .  g.87810
gaggagcactgtactctggacgcggggctcagttaccactagcgttttctctcctttgat  c.687+780

         .         .         .         .         .         .  g.87870
tcaaacatcttttgaaatgttctgcatgaaaccttccctaaagaaagaataggtcaggtt  c.687+840

         .         .         .         .         .         .  g.87930
gctcttggtccttctaggtatttgtgtttctccctcgtctccaactgaatacacagaaaa  c.687+900

         .         .         .         .         .         .  g.87990
tagcacttttcctgaacatacccattatgcttatacttacatattaatttgcatgcatac  c.687+960

         .         .         .         .         .         .  g.88050
caaattcttgtcctgtggttatgttctgtttccccaagtcattaattcctgtctttaatc  c.687+1020

         .         .         .         .         .         .  g.88110
aatattgttgtttgtcttagattataatctcactgacatggtgtgtctcatagtgacatg  c.687+1080

         .         .         .         .         .         .  g.88170
tcgacaagttctgtatgtctagaaacatgactttttaaaaaaacacgtagaaacataaac  c.687+1140

         .         .         .         .         .         .  g.88230
ttacagaaaaatggcaaatataagaaaaataaaaatacccatataccttcttcccagatt  c.687+1200

         .         .         .         .         .         .  g.88290
aacttaatgacaatattttactccatttgctctattatttttattccctccctcatatat  c.687+1260

         .         .         .         .         .         .  g.88350
atacagataatatttttttctgatctgacaaataatatattttctgacccatttgagtgt  c.687+1320

         .         .         .         .         .         .  g.88410
aagttgcacacatgatggccctttccccctaaatgcttccattttttctagtaataggga  c.687+1380

         .         .         .         .         .         .  g.88470
tattctgttatataaccatagtacagttatcagattcagtacatttaacaatgcaatact  c.687+1440

         .         .         .         .         .         .  g.88530
tttatattatctaccattggtatttcaattttgtcagttgactcagtcaagtcttttata  c.687+1500

         .         .         .         .         .         .  g.88590
gcatttatttttccttcagaatcggatcctatatagggtccagtcttgcattaagttgtc  c.687+1560

         .         .         .         .         .         .  g.88650
ttgtgtctttagtgcccttgaatctagaacatttccacagcctttctttgtcttttatga  c.687+1620

         .         .         .         .         .         .  g.88710
ctctgacattttgaagaatatagtcctttttttttttttttgagacagttctgtctccca  c.687+1680

         .         .         .         .         .         .  g.88770
ggctggagtacagtgacacaatcatagctactgtagcctcaaactcctgggcttaagcca  c.687+1740

         .         .         .         .         .         .  g.88830
tcctcccccctcagcctcccaagtagctgggactacaggtatgcaccaccatgcctggct  c.687+1800

         .         .         .         .         .         .  g.88890
aactttttaatttttgtggggatggggtctcactgtgttgcccaggctggtctgcaactc  c.687+1860

         .         .         .         .         .         .  g.88950
ctaggctcaaacaatcctcccgcctcagcctcccaaagtgctgggattccaggcatgagc  c.687+1920

         .         .         .         .         .         .  g.89010
tataaggactcatgcccagccatagtcccttttgaaatgcatttttcttcatttggagtt  c.687+1980

         .         .         .         .         .         .  g.89070
tgttggacatcttctcatgattctatttagtatatatgaccagctagaataccacattag  c.687+2040

         .         .         .         .         .         .  g.89130
tgaagtgtccttcttaaggaatcatatctgcaggtgaatgaagcctacctccctcttatt  c.687+2100

         .         .         .         .         .         .  g.89190
gttgatgtggattctgattacctattcagggtgttgttgaatttctccactgtaaagcta  c.687+2160

         .         .         .         .         .         .  g.89250
cttttactccccttctaactagtaggaaatgtgtggggagaaaatttaaggttatgcaaa  c.687+2220

         .         .         .         .         .         .  g.89310
tatcctccttctcataaaaatttccccgtaaatttagcatcaactgatgatgtttgcctg  c.687+2280

         .         .         .         .         .         .  g.89370
gacaaatctttgctgtgatggttgcaaaataatgattattttcaactcccatgtccagtc  c.687+2340

         .         .         .         .         .         .  g.89430
cacatttatcagtccacactaggcattctactgaagcaagagccttcccttctctccatt  c.687+2400

         .         .         .         .         .         .  g.89490
tatttctttatttgattcaaagatttttacttattggtttttaaaactttcaacttttat  c.687+2460

         .         .         .         .         .         .  g.89550
tttagattcagggcatacacatgcacgtttgttacatgggtatactgttacatgggtata  c.687+2520

         .         .         .         .         .         .  g.89610
ctgttacatttgaggtgtgaatgatgccgttactcaggtagtgagcataatatccaatag  c.687+2580

         .         .         .         .         .         .  g.89670
ttagtttttaagcccttgccttcctcctcttcccccttttggtagtctccagcatttatt  c.687+2640

         .         .         .         .         .         .  g.89730
gttctgtctttatgtctatgtgtaaccaatgcttaacttccacttataagtgacaacata  c.687+2700

         .         .         .         .         .         .  g.89790
ctgtgtttggttttcagtctctgtgttagtttgcttaggataatggcctccagctgcatc  c.687+2760

         .         .         .         .         .         .  g.89850
atgttgctgcaaaagacatgattttgttttttttatggctgcatagtattccatgatgta  c.687+2820

         .         .         .         .         .         .  g.89910
tttgtaccacattttctttatccagtccatcattgatgggcacctgggttgattccaagt  c.687+2880

         .         .         .         .         .         .  g.89970
ctttgctattgcgaatagtgctgcagtgaacatacaattgcattgcctttttgatagaat  c.687+2940

         .         .         .         .         .         .  g.90030
gatttattttccattgggtatatactcagtaatgggattgctgggtcaaatggtagttct  c.687+3000

         .         .         .         .         .         .  g.90090
gtcttaagttcttaaatattcaggatgccttccacagtggctgaactaatttactttccc  c.687+3060

         .         .         .         .         .         .  g.90150
accagcagtgtatcagcgttcccttctctccatagcctcaccagcatctgttcctttttg  c.687+3120

         .         .         .         .         .         .  g.90210
tctctttaataatagccattctgactgatgtgatatgttatctcatttgatttgcatttc  c.687+3180

         .         .         .         .         .         .  g.90270
tctgatgattagtgatattgagcattttctcctctttgttggaaatctgtatgtcttctt  c.687+3240

     g.90273
ttg  c.687+3243

--------------------- middle of intron ---------------------
                                             g.90274          g.90276
                                             c.688-3243  aga  c.688-3241

.         .         .         .         .         .           g.90336
agtatctgttcatgtcctctgctcactttttagtggagttattagtttttttttatttta  c.688-3181

.         .         .         .         .         .           g.90396
ttattattatactttaagttttagggtacatgagtacaatgtgcaggttcgttacatatg  c.688-3121

.         .         .         .         .         .           g.90456
tatacatgtgccatgttggtgtgctacacctattaacttgtcatttagcattaggtatat  c.688-3061

.         .         .         .         .         .           g.90516
ctcctaatgctatccctcccctcgccccccaccccacaacaggccccagagtgtgatgtt  c.688-3001

.         .         .         .         .         .           g.90576
cccctttctgtgtccatgtgttctcattgttcaattcccacctatgagtgagaacatgcg  c.688-2941

.         .         .         .         .         .           g.90636
gtgtttggtttttttgtccttgcgatagtttgctgagaatgatggtttctagcttcatcc  c.688-2881

.         .         .         .         .         .           g.90696
atgtccctacaaaggacatgaactcatcatattttatggctgcatagtattccatggtgt  c.688-2821

.         .         .         .         .         .           g.90756
atatgtgccacattttcttaatccactctatcgttgttggacatttggcttggttccaag  c.688-2761

.         .         .         .         .         .           g.90816
tctttgctattgtgaatagtgccacaataaacatacgtgtgcatatgtctttatagcagc  c.688-2701

.         .         .         .         .         .           g.90876
aggatttataatcctttgggtatatacccagtaatgggatggctgggtcaaatggtattt  c.688-2641

.         .         .         .         .         .           g.90936
ctagttctagatccctgaggaatcgccacactgacttccacaatggttgaactagtttac  c.688-2581

.         .         .         .         .         .           g.90996
agtcccaccaataatgtaaaagtgttcctatttctccacatcctctccagcacctgttgt  c.688-2521

.         .         .         .         .         .           g.91056
ttcctgactttttaatgatcgccattctaacttgtgtgagatggtatctcattgtggttt  c.688-2461

.         .         .         .         .         .           g.91116
tgatttgcatttctctgatggccagtgatgatgagcattttttcatgcgttttttggctg  c.688-2401

.         .         .         .         .         .           g.91176
cataaatgtcttcttttgagaagtgtctgttcatatccttcgcccactttttgatggggt  c.688-2341

.         .         .         .         .         .           g.91236
tgtttgtttttttcttgtaaatttgtttgagttcattgtggattctggatattagccctt  c.688-2281

.         .         .         .         .         .           g.91296
tgtcagatgagtaggttgcgaaaattttctcccattctgtaggttgcctgttcactctga  c.688-2221

.         .         .         .         .         .           g.91356
tgatagtttcttttgctgtgcagaagctctttagtttaattagatcccatttgtcaattt  c.688-2161

.         .         .         .         .         .           g.91416
tggcttttgttgccattgctttcggtgttttagacatgaagtccttgcccatgcctatgt  c.688-2101

.         .         .         .         .         .           g.91476
cctgaatggtattgcctaggttttcttctagggtttttatggttttaggtctaacatgta  c.688-2041

.         .         .         .         .         .           g.91536
agtctttaatccatcttgaattagtttttgtataagatgtaaggaagggatccagtttca  c.688-1981

.         .         .         .         .         .           g.91596
gctttctacatatggctagccagttttcccagcaccatttattaaatagggaatcctttc  c.688-1921

.         .         .         .         .         .           g.91656
cccatttcttgtttttgtcaggtttgtcaaagatcagatggttgtagatatgcggcatta  c.688-1861

.         .         .         .         .         .           g.91716
tttctgagtgctctgttctgttccattgatctatatctgtgttttgagagttattagttt  c.688-1801

.         .         .         .         .         .           g.91776
tttgcttgttgaattgtttaagttccttacagattctggatattagatttttgtcagatg  c.688-1741

.         .         .         .         .         .           g.91836
catagtttgtgaatattttctcccattctgtaggttgtctgtttactctgttgatagctt  c.688-1681

.         .         .         .         .         .           g.91896
ctttggttatgcagaagctctttagtttaattaggtcccacgtatcaatttttgtatttg  c.688-1621

.         .         .         .         .         .           g.91956
ttgaaattgcttttgaaattttagtcataaattctttcccaaggccaatgtccagattag  c.688-1561

.         .         .         .         .         .           g.92016
tgtttcctagcttttctcccaagattcttgtatattgaggtcttgcatttagatctttaa  c.688-1501

.         .         .         .         .         .           g.92076
tccatccttagttaattgttatatatggtgaaaggtaggggtccagtttcactcttcttt  c.688-1441

.         .         .         .         .         .           g.92136
atatgattagtcagctatctcagcaccatttgttgaatagggagtcctttcccctttgat  c.688-1381

.         .         .         .         .         .           g.92196
tattttcgttgatttggtaaaagatctgatggttgtagatgcgtggctttatttctgggt  c.688-1321

.         .         .         .         .         .           g.92256
tctctattctgttccattggtctaagtgtctgtttttgtaccaggactatgttgttttgg  c.688-1261

.         .         .         .         .         .           g.92316
tatagtttgatgtcgggtaatatgttatttctgcccttgttctttttgcttatgattgct  c.688-1201

.         .         .         .         .         .           g.92376
ttggctatttgagctcttttgtggttccatatgaattttagaatagtttttctaattctg  c.688-1141

.         .         .         .         .         .           g.92436
tgaaaaaggctgttggtagtttgataggaataacattgaattggcagattattttggaca  c.688-1081

.         .         .         .         .         .           g.92496
gtatggccatttgaatgatagtgattcttcaaatctatgagcatggaatgttttctccat  c.688-1021

.         .         .         .         .         .           g.92556
ttgtttgtgtcatgtatgatctatttcagcagtgttttgtaggtctccttatagagattt  c.688-961

.         .         .         .         .         .           g.92616
ttctcctccttgggctacatgtattactgggtattttattctttttgtggtcattgtaaa  c.688-901

.         .         .         .         .         .           g.92676
tgaaattgcattcttgatttggctttcagcttgaacattattggtgtatagaaatgctac  c.688-841

.         .         .         .         .         .           g.92736
tgatttttgtacattgattttgtatcgtaaaactttcctgaagttgtttatcaattctag  c.688-781

.         .         .         .         .         .           g.92796
gagccttttggtagtctttagtgttttctaggtatagaatcatgttgtcagcaaagaaag  c.688-721

.         .         .         .         .         .           g.92856
atgatttgacttcttttctgattcctagttttttgattgtttataatttattagtgttct  c.688-661

.         .         .         .         .         .           g.92916
tgactattgtggtgtttcaaactgctgctgtgtccttgtgacatactccaacatttaaat  c.688-601

.         .         .         .         .         .           g.92976
aaatcactttcttactttctggcataaaaatatattccaagttcatcttgtacctattct  c.688-541

.         .         .         .         .         .           g.93036
gcctcaaccctggaatcagttatttccttgaggagccctggtttctttttctgggaaatg  c.688-481

.         .         .         .         .         .           g.93096
gtattaaagaccaaggtctgggtgggagatgtgcttattacttctggagggcttttgctt  c.688-421

.         .         .         .         .         .           g.93156
ttaggataattcaccagagagctggggaatgatgaaaaaaacacttagatgaaaattctc  c.688-361

.         .         .         .         .         .           g.93216
aggtaagattttgttttagatatttgctatatatatatacacacacacacacacacacac  c.688-301

.         .         .         .         .         .           g.93276
acacacacaaatgtatatatacctatacatacctcacacgtatacatttatgcaaataca  c.688-241

.         .         .         .         .         .           g.93336
tgtcctcatatacgaacctacacatgtacatggtgatcttttatacatcaagagtacaca  c.688-181

.         .         .         .         .         .           g.93396
ttgatatctatgaggttaaattttaacagattatagctatttctgtgaataaaataacca  c.688-121

.         .         .         .         .         .           g.93456
aattttttatatgtgtaatttctccatgtcaatatttttgtttaaaagcattttgtataa  c.688-61

.         .         .         .         .         .           g.93516
aacttgatcataaggggataaattttatgtttttaaaacctctttgtttcgtatttttag  c.688-1


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