MCF.2 cell line derived transforming sequence (MCF2) - 4542 nt intron 10 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.98402
gtaaaatgtcttactttctctgtctctttttttcttgctattgtttatattgttactctt  c.1363+60

         .         .         .         .         .         .  g.98462
gatgtaaatactgagtttattcttcaatgcggatagatgaaaatttcactttagcatctt  c.1363+120

         .         .         .         .         .         .  g.98522
tggtcatatttatattgtgcaaggcaagagtcagattgaggttattgtacagtactaaaa  c.1363+180

         .         .         .         .         .         .  g.98582
catagtagtgatatagtacagtacaaggaattgtgaacgtctcagtactgagtactccag  c.1363+240

         .         .         .         .         .         .  g.98642
ccttgaaaatgagtatgaaaattttaccagcatcaaacttgcatttttttccagcaggtg  c.1363+300

         .         .         .         .         .         .  g.98702
aaggaaagtatatgaagctagtatacacatgtgtgcatgcacacacacacacacacacac  c.1363+360

         .         .         .         .         .         .  g.98762
acacacacacacatatttactgctactctagataagcaatgatttggttcctttttattt  c.1363+420

         .         .         .         .         .         .  g.98822
gtataaatgtgggagtacaagtacatagagttttgttacatgaatatattgcatagtggt  c.1363+480

         .         .         .         .         .         .  g.98882
gaaatatgacttggttcttataagcttctagtaagtgaatggcttagataataaaatgga  c.1363+540

         .         .         .         .         .         .  g.98942
ttgccttttctaaataaatgctgttaaatagaataattttgttggtaatttactattaca  c.1363+600

         .         .         .         .         .         .  g.99002
gagttcattttctagttttaatctcctagttttatccatgtaagatctattttctttcta  c.1363+660

         .         .         .         .         .         .  g.99062
agttctatggaaataataattgtccttataatgtgttgaactactctggatatggatggc  c.1363+720

         .         .         .         .         .         .  g.99122
tcaggggttcccttgagctgcctttggggcttcttagaggagagtaatttggtctttagg  c.1363+780

         .         .         .         .         .         .  g.99182
gccctaagtaagtggaatgggtgaagatgggagtaaatttggtctgtctgatctaaatag  c.1363+840

         .         .         .         .         .         .  g.99242
agtcagaagcttcattagtgtaggagaactgctttggaattcagagaaggcttgagccaa  c.1363+900

         .         .         .         .         .         .  g.99302
ggataatgagcataaaaataatagcttatatctagcatggatcagattttcaaaaggtga  c.1363+960

         .         .         .         .         .         .  g.99362
tgaaagcaggtaactaggctaagattatgaaagttacatgtttaatacttatgaaatata  c.1363+1020

         .         .         .         .         .         .  g.99422
taaatatatttacaaataaaactataagcaatgtcttaaatacaatatcaaagatatagc  c.1363+1080

         .         .         .         .         .         .  g.99482
aaagatacagggaatattaaaactactggaaaaagagtaaagataacaaaataaaaaaca  c.1363+1140

         .         .         .         .         .         .  g.99542
gtaaggggataaaacccgatagctatgagaataaaactgaaataggttgatattcttgag  c.1363+1200

         .         .         .         .         .         .  g.99602
cagaagacagacctcggttagatttctggctccatgtactggctgtgtgtccttgaacag  c.1363+1260

         .         .         .         .         .         .  g.99662
ttcacttagcctctttagcctcagtttccttacctggacaataaggacgataatacctat  c.1363+1320

         .         .         .         .         .         .  g.99722
tgactccaacaggttattgtaaagatagggtgaaaaaaattgaagactataaaaaaatac  c.1363+1380

         .         .         .         .         .         .  g.99782
ttgataaactggactagtcctttcctctggttaaagctgcttgcttaattgtcctctaaa  c.1363+1440

         .         .         .         .         .         .  g.99842
atctcaactctttctagaggttcttaaagtggtacaccttgggttgaggaacggagtttt  c.1363+1500

         .         .         .         .         .         .  g.99902
gaggagactgttacagatccatgcaagtcattagtcactcattagcacattttgttttgt  c.1363+1560

         .         .         .         .         .         .  g.99962
attgtttcatttttttctgatattcttatttaatggcgttacaatttccttctgcagtgg  c.1363+1620

         .         .         .         .         .         .  g.100022
gagttggatactctttctttcaagcatgtaaacttttttcaaaaggtacccatctttatt  c.1363+1680

         .         .         .         .         .         .  g.100082
atattacttttgccaatacatttttctgagtttgtgtacatgtgaaaaaccagtttggca  c.1363+1740

         .         .         .         .         .         .  g.100142
tctaaaaacagcagcagttcattgttgcattctacctgcaagtaactttttcctgttttt  c.1363+1800

         .         .         .         .         .         .  g.100202
cataataaccatccattattctctttgtattatgcttatgttggaaaatgactatataaa  c.1363+1860

         .         .         .         .         .         .  g.100262
atgtagattatggttctaaattcaatgtctttcataaagtgaccccgcaaaaagaataaa  c.1363+1920

         .         .         .         .         .         .  g.100322
gaaaaacaattggcgatgctaaaatgaatcaggccttcttttgtttaagatacttcatga  c.1363+1980

         .         .         .         .         .         .  g.100382
tccaactttttgttaggagtagcttggatttgcttcagtttgagactgcctaatgtatgt  c.1363+2040

         .         .         .         .         .         .  g.100442
atgaggatgaaggcagcttaataaataagtgacatggatggataaatgtttttatctatt  c.1363+2100

         .         .         .         .         .         .  g.100502
atacatcatgctttgtaaattaaatcaaaacattatgtatgctacaaaccttgttcattt  c.1363+2160

         .         .         .         .         .         .  g.100562
acctaattgctctgttagtaatagggattataacaatccattccaaacaatttcttaaga  c.1363+2220

         .         .         .         .         .   g.100613
cttttaatcgctaagccaaatatataaaatttggtcaactcaaaacataag  c.1363+2271

--------------------- middle of intron ---------------------
          .         .         .         .         .           g.100664
         tattaatttctcataaaaatgagtcaaactgtttttttgttctttggtttt  c.1364-2221

.         .         .         .         .         .           g.100724
attttagtttttttttttctttttgcattaaatataattctgcacctagcacagggcctg  c.1364-2161

.         .         .         .         .         .           g.100784
gcacttagcaagatgtaataaatatttgtagaattaacattgaatatagagtgtagttat  c.1364-2101

.         .         .         .         .         .           g.100844
tgagaatgggagatattgacagcgaggaataaaatgtaaaatgtgacttgagctcctaaa  c.1364-2041

.         .         .         .         .         .           g.100904
tctggatctttagcctagatctttcttctaagctttggatctctgtttataatttgcctt  c.1364-1981

.         .         .         .         .         .           g.100964
tttgaatttcccataggcaactcagactcaacatacctcagattaactcatctctcctgc  c.1364-1921

.         .         .         .         .         .           g.101024
aatctttctactcttcatcttggtgaatggcactatgatttccccagttgcccaagcctg  c.1364-1861

.         .         .         .         .         .           g.101084
ggaccttggttcctcctcacttatgccctacctctaattgatcaaaaattctatatcctg  c.1364-1801

.         .         .         .         .         .           g.101144
tggatttgtgcctactaagtatctctctcgaatccattcacttttttttttcatccccac  c.1364-1741

.         .         .         .         .         .           g.101204
tgctatccttactgccactttcctaatccgagctaacatcatcctggccttggcaactgt  c.1364-1681

.         .         .         .         .         .           g.101264
gacagtctttctgtctcttccacttaccctgcccacttcttcttccctttcctaggtgtc  c.1364-1621

.         .         .         .         .         .           g.101324
ttactttgtggacattacacacactgttctctctctggaacactatttcctttcctctcc  c.1364-1561

.         .         .         .         .         .           g.101384
ctttcccacatgttagcttctactcctctatcagatttcctatttctaggccacttcctt  c.1364-1501

.         .         .         .         .         .           g.101444
caggtaagcttttcctccccagatctcctccttccctgcacccctgtttgcttaggtgtt  c.1364-1441

.         .         .         .         .         .           g.101504
catgctgtgtgataacaagtacccccaaatttcttcttggctttagtagaattgtctgtt  c.1364-1381

.         .         .         .         .         .           g.101564
ttctgtctctcttgctaaactaagctctgtaagggcagaaactgtgtgcagttcatcttt  c.1364-1321

.         .         .         .         .         .           g.101624
gtatccctaaacacagagcttagcatatggtgtaggtgctcaatcattttgtatgtattt  c.1364-1261

.         .         .         .         .         .           g.101684
atattgttaaaaatgaatacatctaccttgctttgaagaataagatgtgtttctcataag  c.1364-1201

.         .         .         .         .         .           g.101744
ttgtgcacatatttattttgtatctcttaacgtatttgcaaagaattaattggcaaaact  c.1364-1141

.         .         .         .         .         .           g.101804
aacaattgcctcttaagttacctttaaaaataagtttggatctctgtagaacaggtttct  c.1364-1081

.         .         .         .         .         .           g.101864
ttgaagtggagcatattagtattcattgagaaattaattttgtataattcccactgttta  c.1364-1021

.         .         .         .         .         .           g.101924
atatatatttacatatatgatgatataaacttgaagtttaggtagaaaatatattttaat  c.1364-961

.         .         .         .         .         .           g.101984
aagtgaaagtgaagtatggagtctagagaacatagcagcccttcgttttcctgagtgtgc  c.1364-901

.         .         .         .         .         .           g.102044
ctgtcactggctcctgctgaggagggaaggacaaaaggtttgttcctttcctggagagag  c.1364-841

.         .         .         .         .         .           g.102104
gagtctcatgcagcctgtgtgagtaacagccttttcagcagccctgagaattaggatcta  c.1364-781

.         .         .         .         .         .           g.102164
aacaatctagtctttggttggaccatgccttcggctttgtaggaacgtctggattccttg  c.1364-721

.         .         .         .         .         .           g.102224
cttaataatacagtggctcaccctttttaaactaaacatttaaaaaataaagatgaaagt  c.1364-661

.         .         .         .         .         .           g.102284
tttgaattttgatgacatgtttaacattttatcatgctttggaaatgtttatatggtggt  c.1364-601

.         .         .         .         .         .           g.102344
tagaaacattctgagagtagattatatgaatttgaataccacctctgcttcttggacaag  c.1364-541

.         .         .         .         .         .           g.102404
atattaaccttaattccttatctagaagatagggatagaagttgttacctacctcttagg  c.1364-481

.         .         .         .         .         .           g.102464
atgattttgggtattaaaaaagaagatatatgcatagctcttagaacagtgctcaatatg  c.1364-421

.         .         .         .         .         .           g.102524
tagaaagtgccaaacaagtgtagatgctctaattagtagattaaacttagattgttttca  c.1364-361

.         .         .         .         .         .           g.102584
aaattctttttgattgagttaatcaatgagctacaatttgattaaatgtttttgtgtcag  c.1364-301

.         .         .         .         .         .           g.102644
aatgaatactaaatctgcaaataattatgagcactaacacctacctcaatgcttggcaag  c.1364-241

.         .         .         .         .         .           g.102704
taagtgaatgtttgatgaatgagagaatgggtgaatacatagcaaaatcatgctcagtaa  c.1364-181

.         .         .         .         .         .           g.102764
gaagctgaaatcatgtgagtaagtccaaccaaacattatcttctatagtgtgattttaaa  c.1364-121

.         .         .         .         .         .           g.102824
atactaatataaacatattggaatattaactcaagttatttaataaatatatatgtattt  c.1364-61

.         .         .         .         .         .           g.102884
ctattaaaagtgctgactttaattctggtttgaaattcttctttcacatttctctaccag  c.1364-1


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