MCF.2 cell line derived transforming sequence (MCF2) - 6621 nt intron 19 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.116734
gtaagacaatttgtatcgggtaatgtagtattgtttcgtgtgtgtgtgtctcccagtttg  c.2277+60

         .         .         .         .         .         .  g.116794
tacattttttttgtttcaaatgagtaggttttatactttcgctgcacatctttgtttttt  c.2277+120

         .         .         .         .         .         .  g.116854
ttaaaaaatcttaagtcttatgtagaagtcagatgaatcataacttctctgcttgaagtg  c.2277+180

         .         .         .         .         .         .  g.116914
aaggtgaggtaattcagagctttgattcctccctttcttctcactacgatcctaggtatt  c.2277+240

         .         .         .         .         .         .  g.116974
ccccaagggggctccctagcgtcctgaagagcacagtttgaaatgataaggagtgtccca  c.2277+300

         .         .         .         .         .         .  g.117034
gcctcctcataagcactctctttcgagtgacactgggtggagttcttggtcttgttagaa  c.2277+360

         .         .         .         .         .         .  g.117094
aggagccttatgctacaggagagacagggaggaaagagtttcctccttttcctcaatgca  c.2277+420

         .         .         .         .         .         .  g.117154
atttaaaaatgggtaacttttgtgtttagcatgtccccaccttcctttctgtgttcctcc  c.2277+480

         .         .         .         .         .         .  g.117214
tccactccctagctccaccctacctgggtgttcaaagccacctatagctgaatcctttcc  c.2277+540

         .         .         .         .         .         .  g.117274
ttatctgtcctgttccgtctttcaaaattactttattctctcctataaacaaaatcccca  c.2277+600

         .         .         .         .         .         .  g.117334
ttttgtcctaatattagtttgttattaaaaagagaacagtattgtttggggaagttattg  c.2277+660

         .         .         .         .         .         .  g.117394
acaacccaatgatacttacagctggtttctccaatagagaagaagaacttccaattcaca  c.2277+720

         .         .         .         .         .         .  g.117454
tgagacccataattgacaaatttgaatttttttacatctaatgcatttcatcttttgaat  c.2277+780

         .         .         .         .         .         .  g.117514
tttaaatttttttttattttttatttttttattttattattattatactttaagttttag  c.2277+840

         .         .         .         .         .         .  g.117574
ggtacatgtgcacaatgtgcaggttagttacatatgtatacatgtgccacgctggtgtgc  c.2277+900

         .         .         .         .         .         .  g.117634
tgcacccattaactcatcatttagcattaggtatatctcctaaagctatccctcccccct  c.2277+960

         .         .         .         .         .         .  g.117694
ccccccaccccacaacagtccccggagtgtgatgttccccttcctgtgtccatgtgttct  c.2277+1020

         .         .         .         .         .         .  g.117754
cattgttcaattcccacctatgagtgagaagatgtggtgtttggttttttgttcttgcga  c.2277+1080

         .         .         .         .         .         .  g.117814
tagtttactgagaatgatgatttccaatttcatccatgtccctacaaaggacatgaactc  c.2277+1140

         .         .         .         .         .         .  g.117874
atcatattttatggctgcatagtattccatggtgtatatgtgccacattttcttaatcca  c.2277+1200

         .         .         .         .         .         .  g.117934
gtctatcattgttggacatttgggttgattccaagtctttgctattgtgaatagtgctgc  c.2277+1260

         .         .         .         .         .         .  g.117994
aataaatacatgtgtgcatgtgtctttatagcagcatgatttatagtcctttgggtatat  c.2277+1320

         .         .         .         .         .         .  g.118054
acccagtaatgggatggctgggtcaaatggtatttctagttctagatccctgaggaatcg  c.2277+1380

         .         .         .         .         .         .  g.118114
ccacactgacttccacaatggttgaactagtttacagtcccactaacagtgtaaaagtgt  c.2277+1440

         .         .         .         .         .         .  g.118174
tcctatttctccacatcctctccagcacctgttgtttcctgactttttaatgattgccat  c.2277+1500

         .         .         .         .         .         .  g.118234
tctaactggtgtgagatgatatctcattgtggttttgatttgcatttctctgatggccag  c.2277+1560

         .         .         .         .         .         .  g.118294
tgatggtgagcattttgtcatgtgttttttggctgcataaatgtcttcttttgagaagtg  c.2277+1620

         .         .         .         .         .         .  g.118354
tctgttcatgtccttcgcccactttttgatggggttatttgtttttttcttgtaaatttg  c.2277+1680

         .         .         .         .         .         .  g.118414
tttgaattcattgtagattctggatattagccctttgtcaggtgagtaggttgcgaaaat  c.2277+1740

         .         .         .         .         .         .  g.118474
tttctcccattctgtaggttgcctgttcactctgatggtagtttcttttgctgtgcagaa  c.2277+1800

         .         .         .         .         .         .  g.118534
gctctttagtttaattagatcccatttgtcaattttggcttttgttgccattgcttttgg  c.2277+1860

         .         .         .         .         .         .  g.118594
tgttttagacatgaagtccttgcccatgcctatgtcctgaatggtaatgcctaggttttc  c.2277+1920

         .         .         .         .         .         .  g.118654
ttctaggatttttatagttttaggtctaacatttaagtcttcaatccatcttgaattaat  c.2277+1980

         .         .         .         .         .         .  g.118714
ttttgtataaggtgtaaggaagggatccagtttcagctttctacatatggctagccagtt  c.2277+2040

         .         .         .         .         .         .  g.118774
ttcccagcaccatttattaaatagggaatcctttccccattgcttgtttttgtcaggttt  c.2277+2100

         .         .         .         .         .         .  g.118834
gtcaaagatcagatagttgtagatatgcggcattatttctgagtgctctgttctgttcca  c.2277+2160

         .         .         .         .         .         .  g.118894
ttgatctatatctctgttttggcaccagtaccatgctgttttggttagtgtagccttgta  c.2277+2220

         .         .         .         .         .         .  g.118954
gtatagtttgaagtcaggtagcgtgatgcctccagctttgttcttttggcttaggattga  c.2277+2280

         .         .         .         .         .         .  g.119014
cttggcggtgcgggctcttttttggttccatatgaactttaaagtagttttttccaattc  c.2277+2340

         .         .         .         .         .         .  g.119074
tgtgaagaaagtcattggtagcttgatggggatggcattgaatctataaattaccttggg  c.2277+2400

         .         .         .         .         .         .  g.119134
cagtatggccattttcacgatattgattcttcctacccatgagcatggaatgttcttcca  c.2277+2460

         .         .         .         .         .         .  g.119194
tttctttatatcctcttttatttcattgagcagtggtttgtagttctccttgaagaggtc  c.2277+2520

         .         .         .         .         .         .  g.119254
cttcatgtcccttgtaagttggattcctaggtattttattctctttgtagcaattgtgaa  c.2277+2580

         .         .         .         .         .         .  g.119314
tgggagttcattcatgatttggctctctgtttgtctgttattggtgtataagaatgcttg  c.2277+2640

         .         .         .         .         .         .  g.119374
tgatttttgtacattgattttgtatcctgagactttgctgaagttgcttatcagcttaag  c.2277+2700

         .         .         .         .         .         .  g.119434
gagattttgggctgagacaatggggttttctagatataatatttctattgagataatcat  c.2277+2760

         .         .         .         .         .         .  g.119494
gtggtttttgtgtttggttctgtttatatgctggattacatttatcgatttgcgtatatt  c.2277+2820

         .         .         .         .         .         .  g.119554
gaaccagccttgcatcccagggatgaagcccgcttgatcatggtggataagctttttgat  c.2277+2880

         .         .         .         .         .         .  g.119614
gtgctgctggattcggtttgccagtattttattgaagatttttgcatcaatgttcatcaa  c.2277+2940

         .         .         .         .         .         .  g.119674
ggatattggtctaaaattctcttttttggttgtgtctctgcccggctttggtatcaggat  c.2277+3000

         .         .         .         .         .         .  g.119734
gatgctggcctcataaaatgagttagggaggattccttctttttctattgattggaatag  c.2277+3060

         .         .         .         .         .         .  g.119794
tttcagaaggaatggtaccagttcctccttgtacctctggtagaattcggctgtgaatcc  c.2277+3120

         .         .         .         .         .         .  g.119854
atctggtcctgggctctttttggttggtaagctattgattattgccccaatttcagagcc  c.2277+3180

         .         .         .         .         .         .  g.119914
tgttattggtctattcagagattcaggagctggttttttgaaaggatcaacaaaattgat  c.2277+3240

         .         .         .         .         .         .  g.119974
aaactgctagcaagactaataaagaagaaaagagagaagaatcaaatagacgcaataaaa  c.2277+3300

         .   g.119985
aatgataaagg  c.2277+3311

--------------------- middle of intron ---------------------
                                     g.119986     .           g.119995
                                     c.2278-3310  ggatatcact  c.2278-3301

.         .         .         .         .         .           g.120055
accaatcccacagaaatacaaactaccatcagagaatactataaacacctctatgcaaat  c.2278-3241

.         .         .         .         .         .           g.120115
aaactagaaaatctagaagaaatggataaattccttgaattttaaattctaaaaccaata  c.2278-3181

.         .         .         .         .         .           g.120175
taacatttgtcacaaaaaatttcaaaaatagagaaaacgattgtccttaattccccaacc  c.2278-3121

.         .         .         .         .         .           g.120235
actatcatgttagttacttttcatgagcatgttctttcatagttctcatcaccagtatat  c.2278-3061

.         .         .         .         .         .           g.120295
ttgacaattgatgaaattttcagtagcagttataaagaggacaggcaatatgttttgaga  c.2278-3001

.         .         .         .         .         .           g.120355
caggcatgaggtatttgtattaggagactacctgtaagcaggccttgcttttgattcttc  c.2278-2941

.         .         .         .         .         .           g.120415
ccataggatcagcagcccctagttgttcccaacaaggttcctgcccagggtcgggtcaaa  c.2278-2881

.         .         .         .         .         .           g.120475
aagaagtagttcttcctattgtgtattttccctgcttcactctgaacccacagcagcttc  c.2278-2821

.         .         .         .         .         .           g.120535
tttaaaactcttggtttcgtcacaaagggccagttgctcctttgattttagcagtccacc  c.2278-2761

.         .         .         .         .         .           g.120595
tctaagcccccaaatctcaaagggccttctaagtaattaataaacatagattgagaacca  c.2278-2701

.         .         .         .         .         .           g.120655
taaatttgtaatccatgtcagagagggttcaaatctcttgctgtctgtatacctattcct  c.2278-2641

.         .         .         .         .         .           g.120715
tgggaaggtactttaccttcataggcatatttgacccaaatgcatttgatgtacatttta  c.2278-2581

.         .         .         .         .         .           g.120775
tcatgaggtgacctaatttctacctaatatagtatttctatttcatattaattttctatt  c.2278-2521

.         .         .         .         .         .           g.120835
ttacctttaatttgttacaatgatggacatgccaacaaaatgtttcttgagtacattaaa  c.2278-2461

.         .         .         .         .         .           g.120895
gtaagggggatattaggtgattaagtcatgaaaactgaaactgcaataggtaccatggaa  c.2278-2401

.         .         .         .         .         .           g.120955
acagagaaggtgggatagattcaagaaacatttcaatagaaggtagacagatgggcttga  c.2278-2341

.         .         .         .         .         .           g.121015
tgacttactagctacaaaaattaaataatacctgacattgaaggaagaaaatctttctga  c.2278-2281

.         .         .         .         .         .           g.121075
ttcttctttggttccccagtaatgccaagtatccttaataaacaatattagccagtgatg  c.2278-2221

.         .         .         .         .         .           g.121135
cctacaaggctttagaccaggattacttggaaaatggtgataccactaaaaattaggata  c.2278-2161

.         .         .         .         .         .           g.121195
tttcttagggttcactacgctcacttctgcttgcctgcttatcatgagattccagcatta  c.2278-2101

.         .         .         .         .         .           g.121255
agcaattgctagcattcctagtcaatgtgttatttaagaatctgggttattagtttcaca  c.2278-2041

.         .         .         .         .         .           g.121315
gtcttacccttggtagagaggatcattgcagatattccactgctgaaccttctctctcac  c.2278-1981

.         .         .         .         .         .           g.121375
ttttttttttaacttttattttagattcagggggtacatctgcaggtttgttacctggct  c.2278-1921

.         .         .         .         .         .           g.121435
gtattgcatgatgtttaggtttggggcacaaatatcccatcacccaggtactgagcattg  c.2278-1861

.         .         .         .         .         .           g.121495
tccccaagagttagttttccaacccttgtccctctccctccgtccctcctctggtagtcc  c.2278-1801

.         .         .         .         .         .           g.121555
ccagtgtctgttgttgcctttgtctatgtctctcactttaaatgaactcttgttttgact  c.2278-1741

.         .         .         .         .         .           g.121615
gcaccatacaaagctgggatcccatggcctgaccatgtactttctaattatttatatgtt  c.2278-1681

.         .         .         .         .         .           g.121675
atattttaagttggctgcttatatgcaaggaaaggccctatctaaagtcaaagttgacca  c.2278-1621

.         .         .         .         .         .           g.121735
gatggggagattcgagtccttcagattccttagttcatgtgtttattatcatcgattttt  c.2278-1561

.         .         .         .         .         .           g.121795
aaaaattttacaaattgcacatagtccttactatgtgcaacacataatggttagatttcc  c.2278-1501

.         .         .         .         .         .           g.121855
agggcaacttagaaaagttcacttaattgataatgatgtactatatgtttgcaataaaaa  c.2278-1441

.         .         .         .         .         .           g.121915
aataacaaaacaattgcaacttaaataggggaaagagtagaaagcaaactcacactttag  c.2278-1381

.         .         .         .         .         .           g.121975
aaagctcattataggatctaagcatttactccatgctatttagtccttatatcaacccta  c.2278-1321

.         .         .         .         .         .           g.122035
tgaaataggtgttctttctattttatagttgaggaaactgaagtttagaaaagttaagca  c.2278-1261

.         .         .         .         .         .           g.122095
acttgcaccaagacacatagctagtgaatggtagagatgtattccaatccagacctctct  c.2278-1201

.         .         .         .         .         .           g.122155
aacttcaaagcctgtgggccttccagcttatcatgttattaagacaaaaccatgtaatga  c.2278-1141

.         .         .         .         .         .           g.122215
aacaaaattaatttttaaaaatattgaatatgagattactattcatcttaaattgtgata  c.2278-1081

.         .         .         .         .         .           g.122275
tttgagcagaagtaggttagttggaatgatggagtgagaatataaagatagtttgggaca  c.2278-1021

.         .         .         .         .         .           g.122335
ttgtgaaaataacttcttactacgttcagggtggatgttacaggttctttcattaatatg  c.2278-961

.         .         .         .         .         .           g.122395
ttatgttaaattacatttctaagcataagtgcttttcttctccttggtatggcgatctcc  c.2278-901

.         .         .         .         .         .           g.122455
ctagcactatctttaatgcttattagctctaataagggccatttggggggctcataacta  c.2278-841

.         .         .         .         .         .           g.122515
gaacagagagtgagatactcctttagataattaggttaagaattgaaagaaaagaggaag  c.2278-781

.         .         .         .         .         .           g.122575
gcagaaaggaactaaaagaatgtttgtgcaaaggagtgagattgcccaaaatgcaattag  c.2278-721

.         .         .         .         .         .           g.122635
ccaagctgttagcagaaaatgatgaaagaaaatggaagagtttatgacttgcacaatcac  c.2278-661

.         .         .         .         .         .           g.122695
gctgaggaaaagaaaaaattgtggtaaggaataaggaagagatattgtgtacagaagttt  c.2278-601

.         .         .         .         .         .           g.122755
cactgggtacaaaaagacaacaatgtcccattacatattattattattatttttttttta  c.2278-541

.         .         .         .         .         .           g.122815
gaaaggccaagggattggtggaaaatagagagatccttgtgtacctggctggttctctcc  c.2278-481

.         .         .         .         .         .           g.122875
tgtcccatgaattagatgtttataacttgtaggacttctatcaaaataaattataatttg  c.2278-421

.         .         .         .         .         .           g.122935
taggattaagtggtctgtcaaatgattattctaaataactatttaaattaattttcagtg  c.2278-361

.         .         .         .         .         .           g.122995
gcttttctttattgatgtttaatgacttctgtgtttgactcaataatttgttttaatagt  c.2278-301

.         .         .         .         .         .           g.123055
gtactattaatttataacataattagatcttagatgggctacttggatgttcagatttat  c.2278-241

.         .         .         .         .         .           g.123115
aacatttgtgtcaaccactgaaatgaagcgtgcaatctgaactataaagtgcatagttca  c.2278-181

.         .         .         .         .         .           g.123175
atgaaaacatttaaatactctcgtctatgattgtaattactatttcatattcatttaata  c.2278-121

.         .         .         .         .         .           g.123235
taacatgtatttttctgcccaagagaaattctgtttcacttagaatatgatagggtagat  c.2278-61

.         .         .         .         .         .           g.123295
ttaatgtaatttcatattcaaaataaaatgctcatgaaaattttgacttatttattatag  c.2278-1


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