mutS homolog 2, colon cancer, nonpolyposis type 1 (E. coli) (MSH2) - 4998 nt intron 01 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.5339
gtgagggccgggacggcgcgtgctggggagggacccggggccttgtggcgcggctccttt  c.211+60

         .         .         .         .         .         .  g.5399
cccgcctcagagagtgggcggtgagcagcctctccagtgcggaggcacgggggcggaacg  c.211+120

         .         .         .         .         .         .  g.5459
ttggtgcttgtgcggattccgccgtccccaggttctgcttggctccggagggacgccccc  c.211+180

         .         .         .         .         .         .  g.5519
ctcagccctgaaacccgtgcctctccagccgccccggatctgaacttgtgatcacggagt  c.211+240

         .         .         .         .         .         .  g.5579
gtttacgtcgtgccaggcattttaatgcattgttctagttcattttccagcagtcgcatt  c.211+300

         .         .         .         .         .         .  g.5639
cctcgccttggccctacatgtagcgctcattacaaacacggccagaatctcttattaaca  c.211+360

         .         .         .         .         .         .  g.5699
aacagcagccaggagtgagatttaaaatagactgggggtttaggagacccttttatgaca  c.211+420

         .         .         .         .         .         .  g.5759
cgtaattctgctcccacgacgctcccatttataccgccggtccagctaagggtctggtaa  c.211+480

         .         .         .         .         .         .  g.5819
tggagcgccgttgaagagcagtatgatgaagtggtcaggaccaacggactctggagctgg  c.211+540

         .         .         .         .         .         .  g.5879
gctgcttgggatcaagtcgctgcccctctgcttattaacgtgtgaccttgggccagtcat  c.211+600

         .         .         .         .         .         .  g.5939
ggacgctatctgcttcagctcagcattcagtgctctccgtcacccgaccccatctatcca  c.211+660

         .         .         .         .         .         .  g.5999
ggattatctctccctggaaagctacaaacgtctcaccctatgtgggccaaatgttctgga  c.211+720

         .         .         .         .         .         .  g.6059
taggcctagttaacctcttctctccctgttttctttgcgctttcttgcagctatgtagtt  c.211+780

         .         .         .         .         .         .  g.6119
atgctaatgaaaagagcatcctagggggagcagagttgtggattctagtcctgactagag  c.211+840

         .         .         .         .         .         .  g.6179
gactagtgcaaatgcgatactcctgatgaaaaatgtttcattcgttagatataaatgtgt  c.211+900

         .         .         .         .         .         .  g.6239
taggcagggttatggacactagatgaaaaaagaaatacctctactttcatagagatcact  c.211+960

         .         .         .         .         .         .  g.6299
attggacagcaaggcagaaataattacaattcaagttggaggcttatggaggtgagcttg  c.211+1020

         .         .         .         .         .         .  g.6359
taagaggttacaagaggcgccaaggcaggatcgccaaagacggaagactttggaagagtc  c.211+1080

         .         .         .         .         .         .  g.6419
tcatacaacggaagaggcgttatatgagacaccaaagtccacgttgagtcttggtggact  c.211+1140

         .         .         .         .         .         .  g.6479
agaagtttgctagggagagggcttgaaacgaggtagattggcgttgctggtgtagaaaag  c.211+1200

         .         .         .         .         .         .  g.6539
gaaggagactggcccaggtgggtggggttagatgaccaaaggcttttagtgtggtgttga  c.211+1260

         .         .         .         .         .         .  g.6599
gctgttgaaattttatgctgtagccaatgaaaagtctgaaatgttttttttttttttttt  c.211+1320

         .         .         .         .         .         .  g.6659
tctgagacggagtcttactgtgtcgcccaggttggagttcagtggtgtaatcctggctca  c.211+1380

         .         .         .         .         .         .  g.6719
ctgcaacctccacctcctgggttcaagcgattctcctgcctcagccaccggagtagctgg  c.211+1440

         .         .         .         .         .         .  g.6779
gattacaggcacgtgccaccacgcctagctaatttttgtatttttagtagagatggggtt  c.211+1500

         .         .         .         .         .         .  g.6839
tcaccatgttggccaggctggtctcaaactcctgacctcaagtgatccacccaccttggc  c.211+1560

         .         .         .         .         .         .  g.6899
ctcccgatgtgctgggattacaggtattagccactgcacctgacctacatagattttaca  c.211+1620

         .         .         .         .         .         .  g.6959
taagactttaaaacagggcgggcgcagtgactcacgcttgtaatcccagcactttgggag  c.211+1680

         .         .         .         .         .         .  g.7019
gctgaggtgggcggatcacaaggtcaggagatcaagaccatcctggctaacatggtgaaa  c.211+1740

         .         .         .         .         .         .  g.7079
ccctgtctacactaaaaatacaaaaatcccagcactttgggaggctgaggtgggcggatc  c.211+1800

         .         .         .         .         .         .  g.7139
acgaggtcaggagatccagaccatcctggttaacactgtgaaaccctgtctctactaaaa  c.211+1860

         .         .         .         .         .         .  g.7199
atacaaaaaattagctgggtgcggtggcaggtgtctgtagtcccagctacttgggaggct  c.211+1920

         .         .         .         .         .         .  g.7259
gaggcaggagaatggtgtgaacccggaaggcagagcttgcagtgagccgagattgtgcca  c.211+1980

         .         .         .         .         .         .  g.7319
ctgcactccagcctgggcaacagagcgagactccatctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  c.211+2040

         .         .         .         .         .         .  g.7379
aaagactttaaaaaaaattataagaaaggacagaccaagtgcagtggttcgttccagcac  c.211+2100

         .         .         .         .         .         .  g.7439
ttagggatgccaaggtgggaggattgcttgatgctaggagttgaagactagcctgtgtaa  c.211+2160

         .         .         .         .         .         .  g.7499
catagcgagacccatctctacaaaaaaattaaaaagttacctttagaacttacgattttt  c.211+2220

         .         .         .         .         .         .  g.7559
atgtgtagactccatataagcagagggtctatgcttattcactatttattaccttccata  c.211+2280

         .         .         .         .         .         .  g.7619
gtccctgcacatataataggtgcttcataaacaatttaatgaatgaataaattactgaga  c.211+2340

         .         .         .         .         .         .  g.7679
aaacactggaagtttttgggttagcattgtgttaggtgcttgatatggtctggctgtgtt  c.211+2400

         .         .         .         .         .         .  g.7739
cccacccttatctcatcttgaattcccatgttttgtgggaggtacctggtgggacataat  c.211+2460

         .         .         .           g.7778
tgaatcatgtgggcaggtttttcctgtgctgttctcctg  c.211+2499

--------------------- middle of intron ---------------------
         g.7779               .         .         .           g.7817
         c.212-2499  gtagtgaataagcctcacaagatctgatggttttaaaaa  c.212-2461

.         .         .         .         .         .           g.7877
tgggagtttccctgcacaggctctctctctttgcctgccgccatccatgtaagatgtaac  c.212-2401

.         .         .         .         .         .           g.7937
ttgctcctccttgccttcctcaatgattgtgaggcctcctcagccatgtggaactggctg  c.212-2341

.         .         .         .         .         .           g.7997
cagagtcattaaacttcgttcttttgtaaattgcccagtctcaggtatgtctttttttat  c.212-2281

.         .         .         .         .         .           g.8057
ttttttttgagacagagtctggctctgtggctaggctggagtgcagtggtgcgatctcga  c.212-2221

.         .         .         .         .         .           g.8117
ctcactgcagcctccgcctcccgggttcaagcgattctcctgcctcagcctcccaagtag  c.212-2161

.         .         .         .         .         .           g.8177
ctgggactataggtgcacgccaccatgcccagctaatttttgtatttttaatagagacgg  c.212-2101

.         .         .         .         .         .           g.8237
agtttcactgtgttggccaggatggtcttgatctcttgacctcgtgatcttcccgcctcc  c.212-2041

.         .         .         .         .         .           g.8297
gccttccaaagagctgggattacctacccagctgggtatgtctttattagcagcgtgaaa  c.212-1981

.         .         .         .         .         .           g.8357
acagactaaaacagtaaactgataccaatagagtgggatgcagctgaaaagatacccgaa  c.212-1921

.         .         .         .         .         .           g.8417
aatatggaagcaactttggagctgggtaacaggcagaggtcagagcagtttagagggctc  c.212-1861

.         .         .         .         .         .           g.8477
agaagaagaccagaaaatgtgggaaagtttggaacttcctagagacttgttcaatggctt  c.212-1801

.         .         .         .         .         .           g.8537
tgaccaaaatcctgataatgatatggacaatgaaatccaggctcatgtggtctcagatgg  c.212-1741

.         .         .         .         .         .           g.8597
agatgaggaacttgttgggaactggagcaaaggtgacacttgttatgttttagtaaagag  c.212-1681

.         .         .         .         .         .           g.8657
actggtggcattttgccctgccctagagatttgtggagctttgaacttgagagaaatgat  c.212-1621

.         .         .         .         .         .           g.8717
tttgggtatctggtgggagaaatttctaagcagcaaagcattcaagaggtgacttgggtg  c.212-1561

.         .         .         .         .         .           g.8777
ctgttaaaggcattcagttttaaaagggaaacagcatgaaagtttggaaaatttgcagcc  c.212-1501

.         .         .         .         .         .           g.8837
tgacaatgtgatagaaaagaaaatcccgttttctgaggagaaattcaagctagctacaga  c.212-1441

.         .         .         .         .         .           g.8897
aatttgcataagtaatgaggatcccaatgttaatccccaagacaatgggaaaaatgtttc  c.212-1381

.         .         .         .         .         .           g.8957
cagggcatgtcagaggccttcatggcagcccctctcatcacaagcctagaggcctaggag  c.212-1321

.         .         .         .         .         .           g.9017
aaaaaagtgatttcatgggccagcccggggtccccatgctgtgtgcagcctagtgacttg  c.212-1261

.         .         .         .         .         .           g.9077
gtgccctgcatcccagctgccccagctgtggctgaaaggggccaacctagagctcaggcc  c.212-1201

.         .         .         .         .         .           g.9137
atggcttcagagggtgcaagcctgaaaccttgacagcttccaggtggtgttgagcctgca  c.212-1141

.         .         .         .         .         .           g.9197
ggtgcacagaaatcaataattgaggtttgagaatctctgcctaggtttcaaagatgtatg  c.212-1081

.         .         .         .         .         .           g.9257
gaaacgcctgcatgtccaggcagaagtttgctgcaggggtggggtgctcattgagttcct  c.212-1021

.         .         .         .         .         .           g.9317
ctgctagggcaatgtagaagggaaatgtagggtcagagcccccccacagagtccctactg  c.212-961

.         .         .         .         .         .           g.9377
gggcaccacctagtggagctgtgaaaagagggctaccattctccagacctcagaatggta  c.212-901

.         .         .         .         .         .           g.9437
gatccacagacagcttgcaccatgtgcctggaaaagctgtagacacttaacgccatctca  c.212-841

.         .         .         .         .         .           g.9497
tgaaagcaaccaggcagtgtgctgtaccctgcaaagccacaggggcagagctgtccaagg  c.212-781

.         .         .         .         .         .           g.9557
ctgtggttgcccagctcttgcatccgcatgacctggacatgagacatagagtcaaaggag  c.212-721

.         .         .         .         .         .           g.9617
atcattttggagctttaagatttgactgccatgctggattttggacttgcatggggcctg  c.212-661

.         .         .         .         .         .           g.9677
tagcccctttgttttggccaatttctcccatttggaatggctgtatttacccaattccta  c.212-601

.         .         .         .         .         .           g.9737
taccccattgtatctgggaagtaactaacttgcttttgatttgacaggctcatatgcgga  c.212-541

.         .         .         .         .         .           g.9797
aaggacttaccttgtcttgaatgagactttggactggaattttgaattaatgctgaaatg  c.212-481

.         .         .         .         .         .           g.9857
agttaaggctttgggggactgttgggaatgcatgattggttttgaaatgtgaggacatga  c.212-421

.         .         .         .         .         .           g.9917
gatttgggaggggtcatggcagaatgatatggtttggctatgtccccacctaaatcccat  c.212-361

.         .         .         .         .         .           g.9977
cttgaattcccatgtattgtgggagggacctggtgggagatagttgaatcatggggatgg  c.212-301

.         .         .         .         .         .           g.10037
atctttcccatgctgttgtgatagtgaataagcctcatgagatctgatggttttaaaaac  c.212-241

.         .         .         .         .         .           g.10097
ggaagtctacctgcacaagctctttctttgcctgctgccatccatgtaagacatgacttg  c.212-181

.         .         .         .         .         .           g.10157
ttcctccttgccttctgccatgattgtgagacctccccagccatgtggaactataagtcc  c.212-121

.         .         .         .         .         .           g.10217
agtaagcctctttttcttcccagtctcgggtatgtctttatcagcagcatgaagtccagc  c.212-61

.         .         .         .         .         .           g.10277
taatacagtgcttgaacatgtaatatctcaaatctgtaatgtactttttttttttttaag  c.212-1


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