protocadherin 19 (PCDH19) - 8570 nt intron 04 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.64688
gtatgttggtttgcttgcttattgctgcaactaagcttgatttaacattaaaaagcaaaa  c.2675+60

         .         .         .         .         .         .  g.64748
cagattaaaatttttaaaacgtatttttttgggggattttaaaatgaatgtccaacctac  c.2675+120

         .         .         .         .         .         .  g.64808
tatttgtagaaagtttggaaaattgagaaaagcataaaaaagtaaataaacatcactggt  c.2675+180

         .         .         .         .         .         .  g.64868
aatttcatcaaccaaaggtaatcactgttgacattttacatttcttggtatgaaaatgta  c.2675+240

         .         .         .         .         .         .  g.64928
cgtataaacactcaacaataaaattggaattatattaaaatatagttttatctagtgaca  c.2675+300

         .         .         .         .         .         .  g.64988
gaaatctgatattacaaatattcactatttctaatatttctaatttctaatattatttct  c.2675+360

         .         .         .         .         .         .  g.65048
aatatttctaatgtgatattagaaatatacaatagaaaactttcacaatcatgttgatac  c.2675+420

         .         .         .         .         .         .  g.65108
caaaattcttgttgctcttcactttaaataaaggaaagccttaaaaatgtttttcatgta  c.2675+480

         .         .         .         .         .         .  g.65168
gaacttcccatgagttttgagattgatgctatttcaacaactttgaaatcattttaaaga  c.2675+540

         .         .         .         .         .         .  g.65228
tattttaatgacagagaagccaatcctttcctttctagatgagagagaaaaagaaatttg  c.2675+600

         .         .         .         .         .         .  g.65288
cctgattcttcttaaaatttttagaagtgtttcagaggaaacattcaaagttgagattta  c.2675+660

         .         .         .         .         .         .  g.65348
tgtgattggttgatcataatttagtatccaaggagccataatggatgtgagtacagagct  c.2675+720

         .         .         .         .         .         .  g.65408
gaatcctgccaagaaagatcccatctggtgcagtgggctgcacccaatgggagaaggaca  c.2675+780

         .         .         .         .         .         .  g.65468
aggggtttgggaagccctctaaaaggtggaaactgagcaaagaagagaacctcttgcaca  c.2675+840

         .         .         .         .         .         .  g.65528
gaaagaccagtcctaacctttcaaatgatgcctgtattgctgtttcatgtaaatatcact  c.2675+900

         .         .         .         .         .         .  g.65588
taaatggtccagtggttattctgcagctaaaattgaactctgagtatgtttgttaaaata  c.2675+960

         .         .         .         .         .         .  g.65648
atagaaatgaaacagagaggccagcagggtatgttagagctgtagcagagaaggcttgca  c.2675+1020

         .         .         .         .         .         .  g.65708
aattgtattattttgctggctctaatcccataaatttacatcaccagaagagtagaattc  c.2675+1080

         .         .         .         .         .         .  g.65768
aaggaataaacaagcttcaagtaacttgcattcatgtctgatttaattcatgaggcttca  c.2675+1140

         .         .         .         .         .         .  g.65828
gtaacccctaaaacatgctaagtttatctgtattggtctggaattgcttgtgaccttaag  c.2675+1200

         .         .         .         .         .         .  g.65888
tgatgatcattagttgtctgaaaatgggtagcccttgtattatcagtgaaagcacagttg  c.2675+1260

         .         .         .         .         .         .  g.65948
agaattttttttgaggggttgggaggaatccatttagaatattttcctgggtcacagaat  c.2675+1320

         .         .         .         .         .         .  g.66008
aaaagcaagaggtgaggaattcaaaattatctgacgaatttgttttagaaagaaaaaaat  c.2675+1380

         .         .         .         .         .         .  g.66068
aaccctcttatgtgcactgattagagtgcctttgtagcagaaatctgctttgtttctgct  c.2675+1440

         .         .         .         .         .         .  g.66128
tccgaattgttattttcaaagctccattttaaaactttgataaaaacagtgacttgcctt  c.2675+1500

         .         .         .         .         .         .  g.66188
accctcacaggtccctcgggctaactcagggtacctgggaattctatagccaggttaaac  c.2675+1560

         .         .         .         .         .         .  g.66248
agataacatgatgctgggcgcagtggctcatgcctgtaatcctggtgctttgggaagctg  c.2675+1620

         .         .         .         .         .         .  g.66308
atggtggagaactgcttgaggccaggagttggagaccagcctgggcaaaatagtgcaacc  c.2675+1680

         .         .         .         .         .         .  g.66368
cctcccccccaccccccaccatctctaccaaaaagaaaaataaataaataaaataaaaaa  c.2675+1740

         .         .         .         .         .         .  g.66428
acctgatagtatgagtctgattgtcacagcctggaagaaagctaagactcccagggaccc  c.2675+1800

         .         .         .         .         .         .  g.66488
ttgcatcttacatcagtcctgactatccaatttacaaggtagactgatagataaaaactt  c.2675+1860

         .         .         .         .         .         .  g.66548
atgtttgaacatttatctttggggatacatgtatttccacagcagcgttgagacttactg  c.2675+1920

         .         .         .         .         .         .  g.66608
ggaacctctgattttggttaattactttatatgttttttgtttatagacacatacacaca  c.2675+1980

         .         .         .         .         .         .  g.66668
aaaggcacaacctagacttaatgggctcttggtgaaaaagtctcctgattttgcatgaaa  c.2675+2040

         .         .         .         .         .         .  g.66728
tcaaagatagctttttcttcttttttttaaataaaaccagggaccaccttgatgaagagg  c.2675+2100

         .         .         .         .         .         .  g.66788
aaacatctgaaaactcagggacacatgcatttttgccagggttctgtttacagagccatg  c.2675+2160

         .         .         .         .         .         .  g.66848
agagctttgggaaactctgaaggccttgaatttgtgtggtcaattgagtttagatgaagc  c.2675+2220

         .         .         .         .         .         .  g.66908
ataatacctagaaaaatacagggaatcttgtgtgctatgctgttctggggaccaactgtg  c.2675+2280

         .         .         .         .         .         .  g.66968
ttaaatgtaaaatgtgtggaaaatgttgagagtggtggctaacaccaggtgataaagtca  c.2675+2340

         .         .         .         .         .         .  g.67028
tgcgaagcctgttcaaatagctcacaacagtgtttgaaaagggttttgctgtatgtggtt  c.2675+2400

         .         .         .         .         .         .  g.67088
tcttgaagatccatttacatgcatggtaaacgctcttggccaggaaattctgaatctgat  c.2675+2460

         .         .         .         .         .         .  g.67148
tatcagttttaattttactatcaagtccctgtttctttgaatgccaatacaatacaattt  c.2675+2520

         .         .         .         .         .         .  g.67208
caggctaactttgagaacttctttttctttctttctttcttttttttttttttttttttt  c.2675+2580

         .         .         .         .         .         .  g.67268
gagacggaatcttgctctgtcacctaggctggagtgcagtggtgtgatcttggctcactg  c.2675+2640

         .         .         .         .         .         .  g.67328
caacctccacctcccgggttcaagtgattttcctgccttagcctcctgagtagctgggat  c.2675+2700

         .         .         .         .         .         .  g.67388
tacaggcatgcgccaccgtgcctggctaattttttttttatttttagtagagatggggtt  c.2675+2760

         .         .         .         .         .         .  g.67448
tcgccatgttagccaggctggtcttgaactcctgacctcaaatgatccacccaccttggc  c.2675+2820

         .         .         .         .         .         .  g.67508
ctcccaaagtgctgagattacaggtgtgagccaccgtgcctggctgagaacttatttttc  c.2675+2880

         .         .         .         .         .         .  g.67568
tatccatgttctcttcttctattcactttctacttatccaaggatgtttcttggaccctt  c.2675+2940

         .         .         .         .         .         .  g.67628
cttttcggcattctctagcagttgttagcattcttagccagactgtttacatacaggcat  c.2675+3000

         .         .         .         .         .         .  g.67688
cttttcctcttttacatctatctaccttgagtagttgaacagcagctaccactgtccacc  c.2675+3060

         .         .         .         .         .         .  g.67748
tctggttctttccttcatcagtcagggttcctacatgaaatagttggcacgcctaaattg  c.2675+3120

         .         .         .         .         .         .  g.67808
gaatggcttgaggaaagtttatttacaaagaggaccatttacaaaggcttgggcacggtt  c.2675+3180

         .         .         .         .         .         .  g.67868
agtgaacctcaagggatactgcagtattatggcactggaggagctaaaaatacttcagac  c.2675+3240

         .         .         .         .         .         .  g.67928
aggaccagggaagagagcatgtagggaacattgacttgagagtaacagtgacttctggtt  c.2675+3300

         .         .         .         .         .         .  g.67988
ggccaagggatccagtcatcatgaagtgaccctggaggaagggagcagagacaatcaata  c.2675+3360

         .         .         .         .         .         .  g.68048
tcctgatatcactgtcctcccctgctctgatctcccgctgatgtcttcctttggctaaac  c.2675+3420

         .         .         .         .         .         .  g.68108
ccaacagaaagccagagggcaagggggttctcataggcacaaatcaaggttgagaaggat  c.2675+3480

         .         .         .         .         .         .  g.68168
ctcaactgtgggaaaaggaagtgatatggcaggctccccataattttatgcaccaaggaa  c.2675+3540

         .         .         .         .         .         .  g.68228
tctagcattatatttctgtagttttttttttttccagactgtcacttgcaacccgcaggt  c.2675+3600

         .         .         .         .         .         .  g.68288
gtacccaaggaggcttatgtgagggccccagattaacaaatcatggcagtgcagagtttc  c.2675+3660

         .         .         .         .         .         .  g.68348
ttctgaatggacttccttcctgctctgtttgtttcttgctgtcttctcagagcaaggaaa  c.2675+3720

         .         .         .         .         .         .  g.68408
gccagcagtggtactttgtcgctgctgcagcactctttcctcatgcctgttttgtgggct  c.2675+3780

         .         .         .         .         .         .  g.68468
gctgtctgatatccactcctacagtgctttgggaacaatatcaagcagggcataaggctg  c.2675+3840

         .         .         .         .         .         .  g.68528
tggcccaaagaaaatgaaataggaaatgaacaaagcactgactcagcgtggaaaggatta  c.2675+3900

         .         .         .         .         .         .  g.68588
ggagctttggctccctaaatcatgcacaatgctttctttttccacccaaattgtcctggg  c.2675+3960

         .         .         .         .         .         .  g.68648
gtttttccagcacttcgtatggtgccttgtatataataaatgcttggtacatgtttattg  c.2675+4020

         .         .         .         .         .         .  g.68708
aatgaatgcatgagagaaatggaagaaaatcttagcatttttctattaaagactagcact  c.2675+4080

         .         .         .         .         .         .  g.68768
agatttctctttaagccagtgatttctggattttaatgtgcattggaaacacctggaagg  c.2675+4140

         .         .         .         .         .         .  g.68828
cttgttaaacgcaggtatgctagctccatccctagagaacctccagttgtaacaggttcc  c.2675+4200

         .         .         .         .         .         .  g.68888
caaggtgattgtgatacaggtggtccagaaaccactctaggattttccttgtattactta  c.2675+4260

         .         .       g.68913
aatacagttataataatcttcattc  c.2675+4285

--------------------- middle of intron ---------------------
                      g.68914           .         .           g.68938
                      c.2676-4285  tcactccttgctcattcttagcctc  c.2676-4261

.         .         .         .         .         .           g.68998
agatatcattccctgggtatgtagtatcacctactagtaagatataacctgtttccattc  c.2676-4201

.         .         .         .         .         .           g.69058
tgagtcttatgtcttttggaaaagagttctaatatttcagatggtaaatatgggtcagaa  c.2676-4141

.         .         .         .         .         .           g.69118
tttgtgtgatgttcattcgtcatgcatctgctgagtaactcttctgtgcagaaccctgtt  c.2676-4081

.         .         .         .         .         .           g.69178
ctaggtgttttcaaacatatctgtctttttgttggccaccagagcagtaatagaaacatg  c.2676-4021

.         .         .         .         .         .           g.69238
ggcatttacaataccattggaaacaggaacccctaatttattgtcccacaaaagttgttt  c.2676-3961

.         .         .         .         .         .           g.69298
tacaagtccttcatctcccaagaggtatgcaggtaataaagcaagtgaaatcagcatttt  c.2676-3901

.         .         .         .         .         .           g.69358
tatgcctggcataaattgttatttgttttgggtgagtagccatttaccaggctattttac  c.2676-3841

.         .         .         .         .         .           g.69418
aatatgtggcatcttgctcactgggtcttaaactgccttacacaaatccattcattaaac  c.2676-3781

.         .         .         .         .         .           g.69478
cactaaatgctcttacaagatcagtgtaagtggtgcttagtttgtcagatgggcaaacta  c.2676-3721

.         .         .         .         .         .           g.69538
atctttaaatgagttaactattccaaggtttgggggagttgttataccttgctttttgtt  c.2676-3661

.         .         .         .         .         .           g.69598
ctgagaatacacaacttctcgtgctcacactaccagtcccttacatcctagtagctaatc  c.2676-3601

.         .         .         .         .         .           g.69658
cttcactgttttattatttccataatttctattcaaaaagcaaaatctctgaggttgttt  c.2676-3541

.         .         .         .         .         .           g.69718
gtaacattcagatgcctatgaaaaagatgatcaattttttaaaaggcagatccaaaacca  c.2676-3481

.         .         .         .         .         .           g.69778
attaggagaagtaaggtagacatccctggcatccagggaggtaactgactgcaattaaac  c.2676-3421

.         .         .         .         .         .           g.69838
attacatttatgttgaagtttttgagaagtgaagacaaagcagtaagtacaccaagtgat  c.2676-3361

.         .         .         .         .         .           g.69898
atagttttaattattcattaaaggaaggatggccatttgacaggagaactattattttct  c.2676-3301

.         .         .         .         .         .           g.69958
gttctttaatgttagaagaaattaacacacacacacataatagtgtgtgactattgttta  c.2676-3241

.         .         .         .         .         .           g.70018
cagaagatatagaagtgttctttaaatataaattttctgtaccaatcctataaaaactat  c.2676-3181

.         .         .         .         .         .           g.70078
ggacataatatttaattgtaactcagtgaaaacattactacacagaataatgatggtatt  c.2676-3121

.         .         .         .         .         .           g.70138
aaacaataaccatttatggagcatctatgtgtatctggtacttcatgtacagagtctctt  c.2676-3061

.         .         .         .         .         .           g.70198
tgagtcttctaaatggccttgtgaagggggttttagcaaacacattttacagataaagaa  c.2676-3001

.         .         .         .         .         .           g.70258
actgagattcaaagacatcagatatcaggtccagggtcacacagatgaagtggcagatta  c.2676-2941

.         .         .         .         .         .           g.70318
tagattattacttgtcctaatgactccaagttcagtgctctttactacagtctgctatag  c.2676-2881

.         .         .         .         .         .           g.70378
aaataaagaacctagagcagttgttctcaactgtggggtgatttggcaatgtctctttgg  c.2676-2821

.         .         .         .         .         .           g.70438
agacacttttggtttttttcctttaagtgggggtcactactggcatccagtagataaagg  c.2676-2761

.         .         .         .         .         .           g.70498
gcagggatgttgctaaacaccttataatgcacaggacggccacaacaaaggattttgtag  c.2676-2701

.         .         .         .         .         .           g.70558
ccccaaatgtcaatattgccaaggttgggaagccctgctccaagggctggttaattacat  c.2676-2641

.         .         .         .         .         .           g.70618
tgcccccatactagatccctcaccatcatatgtttcaagcaagtttcaacagctgctgaa  c.2676-2581

.         .         .         .         .         .           g.70678
ttcagagttgaattctctggcttaaagtgacaactttgtgttgtggattaaggacatttt  c.2676-2521

.         .         .         .         .         .           g.70738
cagataccagaaaatatacaggttggaaagttaagtatttgttataaaaatggacctgaa  c.2676-2461

.         .         .         .         .         .           g.70798
tatcatccaggcaggtcatttcctttctccagaggtacaggggtgcttgtaggcaggcac  c.2676-2401

.         .         .         .         .         .           g.70858
tcacctcacgtgacagagaataatttctaaaaaacaaactttacatctatttaaactgtg  c.2676-2341

.         .         .         .         .         .           g.70918
ggattataatagtatttacagaaaactccgtaatatgtgccataaagctagaaatggtga  c.2676-2281

.         .         .         .         .         .           g.70978
aacactttaaatcatgtgtttccaattggccatcatggccataaaagaactgtaagataa  c.2676-2221

.         .         .         .         .         .           g.71038
tttgcttgtttgtttgttttttaaagaacggcatcctggtgggtccataaggctgagtta  c.2676-2161

.         .         .         .         .         .           g.71098
gctgtgtgacataaattgaaggagctgagtgagctggcctattgagtaattttaatttta  c.2676-2101

.         .         .         .         .         .           g.71158
gtgcagttgatgctcagttattctttctgaaaataattagctaacaggtcaatgcttcac  c.2676-2041

.         .         .         .         .         .           g.71218
tctctcctgctcttcattttcttataattatggctttccagttactggcctcctggtctt  c.2676-1981

.         .         .         .         .         .           g.71278
tcctttttatattcaggtcagcaagcattctacatctaggttggtcatatgttaaaaatc  c.2676-1921

.         .         .         .         .         .           g.71338
tgctgtgattcttcttgactaagtgtggagggtgacaatgtatccattgtgtccatggca  c.2676-1861

.         .         .         .         .         .           g.71398
tagctcttcattatatgtgctgaatcttcttatcagtctcagagagccaggcctgtgaat  c.2676-1801

.         .         .         .         .         .           g.71458
gtccaaggttgagcagatcaagtgagtttgcggtgtcatttccacagggctcttttctca  c.2676-1741

.         .         .         .         .         .           g.71518
gaggcataggtctattagggtttgtgttaattcacaaacatgccattcttccttgttgag  c.2676-1681

.         .         .         .         .         .           g.71578
gcaacaacacattttcttgagtgtgcctttgctgcttcctcaccgactagggaatggatt  c.2676-1621

.         .         .         .         .         .           g.71638
caccatctactaggtatttcagatgcataatttatggttcatggtgtagcaaagctgggg  c.2676-1561

.         .         .         .         .         .           g.71698
attctgtcaggacatacaaagtattagaaatagtaggtgggtgccctatagctgtacctt  c.2676-1501

.         .         .         .         .         .           g.71758
atgcattattctccatttcatgagaaatggtgtgaagttcttggattgcatgcatagtgc  c.2676-1441

.         .         .         .         .         .           g.71818
attgtatggtagattgatttaataaatgcaagaatcattttacctatcaacacttgagct  c.2676-1381

.         .         .         .         .         .           g.71878
gaaagttttcatgttcttagtataactatactcagagttgcattagtgctcactctctgg  c.2676-1321

.         .         .         .         .         .           g.71938
ctctcacttttgtcttgccttctatattagtcagggttctgcagagaaacagaaccaata  c.2676-1261

.         .         .         .         .         .           g.71998
ggcatatctaaatctataaatatgtagaaagagttttattgtaaggtatgggcttatgtg  c.2676-1201

.         .         .         .         .         .           g.72058
attatgggggctgaggaatctcataatctgccatctgcaaggtggagaaccagggaagat  c.2676-1141

.         .         .         .         .         .           g.72118
ggaagtgtagtttgaaggcctgagaaccagagagccaatagtgtagattcaagtctgggt  c.2676-1081

.         .         .         .         .         .           g.72178
ttgaagtcttgagaaccaggagcgctgaaggcgggagatgattaatgtcccagttcaagc  c.2676-1021

.         .         .         .         .         .           g.72238
agtaaggcagagaacaaactcaacttctttcttaatttttgttttattcagtccttcaat  c.2676-961

.         .         .         .         .         .           g.72298
ggattggatgatgcccacccacattggagagaattgtctgttttactgagtctgccagtt  c.2676-901

.         .         .         .         .         .           g.72358
caaatgctaatttcttctggaaacaccttcatagacacacccagaaataatgtttaacca  c.2676-841

.         .         .         .         .         .           g.72418
gctatctgggcattccatggtgcagtcaagttgactcacaaaattaaacatcacaccttc  c.2676-781

.         .         .         .         .         .           g.72478
cacgctcagctactgactctcctctttttctttgaatatgttcatctatttttctcagat  c.2676-721

.         .         .         .         .         .           g.72538
aaaactgacttactgggttctctgatcctgataatccttcctattttagttgcactactt  c.2676-661

.         .         .         .         .         .           g.72598
caatttctgctacctttgctttttacagttggttagtagacatcttttaagaatcagtgt  c.2676-601

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acatagtggttaaatttctaggcaggctctggagctagactacctgttttcagtcttagg  c.2676-541

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tctgctatattttttaccagctgtgtgaccttgggcgagttatctcacttccatgtacct  c.2676-481

.         .         .         .         .         .           g.72778
ctgttttttttcatctgcaaatgagaatattagtagcacctttctcttacagagttgtga  c.2676-421

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tgatttcaacagttaattaatgtcaaacacttaaaacagtgcctcacgaatagtaattgc  c.2676-361

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tcagtaaacactagctattattattttactttgattttataggaagagaaaagtcttctg  c.2676-301

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aaatgatgacattctttagaggcagttttagaattgtagcttcttccaccttgtctgtag  c.2676-241

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tgatgcattgaagataagtgaacgaaaatattagctgtatcagcatccaatagtgggaac  c.2676-181

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ctctgtgcaatgttaagttttattatctttaagcacaaatttctcttccccttattccta  c.2676-121

.         .         .         .         .         .           g.73138
ccctattggacagtctagccactgtttgcctcattacagagccgacatcatcctggctca  c.2676-61

.         .         .         .         .         .           g.73198
gaaagatttttaaaatcagatctgtcacggtcgtaaattatcattctgtcttcaacccag  c.2676-1


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