protein kinase, DNA-activated, catalytic polypeptide (PRKDC) - 8964 nt intron 54 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.116089
gtgagtgaacactagccctgctcttgggtcccactggctcataaagcgttaatttattaa  c.7279+60

         .         .         .         .         .         .  g.116149
gacgtctccaactcaagaagaacctgtgggtttccatgatatacacatttgtgaagttgg  c.7279+120

         .         .         .         .         .         .  g.116209
aatctctgaagaaaaggtgaaggcaccataagaataggatatctgctgaggtgggcctgc  c.7279+180

         .         .         .         .         .         .  g.116269
tctctgctcccttggcctggcatcttggggagccacatcccagggcgtgtttttcatcca  c.7279+240

         .         .         .         .         .         .  g.116329
taaatgaaggaggtggcctatggggttaccttggctctcttcagatttaaaatgtatgct  c.7279+300

         .         .         .         .         .         .  g.116389
tttgagttctgtacctattttgccaggtgagagcttctgttaatgtgtttaaattgttca  c.7279+360

         .         .         .         .         .         .  g.116449
tttattttcaaaattgcaacataacataaaagtatatgttaaaagagaaagctgctgatc  c.7279+420

         .         .         .         .         .         .  g.116509
acttacattatattatttccctgtccctgtactcttttccagtcttagtctattagtcca  c.7279+480

         .         .         .         .         .         .  g.116569
tataccttttttttttttttcatttttttcaacttttatttttgaataaggaagtacaag  c.7279+540

         .         .         .         .         .         .  g.116629
tgcaggtttgttacgaaggtatattgcgtaatgctgaggtttggtgtacagatgaatctg  c.7279+600

         .         .         .         .         .         .  g.116689
tcactcaggtagtgaccatagtacctagtagttagtttttcaactcttgcctcatatcct  c.7279+660

         .         .         .         .         .         .  g.116749
cccttccccttcttctgttccccagtgtctgttgttcctgactttatgtctatgtgtact  c.7279+720

         .         .         .         .         .         .  g.116809
cagtgtttagctcccacatatgagtaagtacatgcagtatttgcttttctgtttctgtac  c.7279+780

         .         .         .         .         .         .  g.116869
tagttcacttaggacagtggcctccagctgcatccatgttgctgcaaaggacatttcatt  c.7279+840

         .         .         .         .         .         .  g.116929
cttttttatggctgcctaatattccatggtatatatgtaccattttctttatccagtcca  c.7279+900

         .         .         .         .         .         .  g.116989
ccattgatgggcacctgggttgattccatgtcttagctgttgtaaatggtgctgtagtga  c.7279+960

         .         .         .         .         .         .  g.117049
acatatgggtgcatgtgtctttttggtagaaagatttattttcctttgcgtatataccca  c.7279+1020

         .         .         .         .         .         .  g.117109
gtaatgggattgctggatcaaatgatagttcaactctcacttccttgagaagtctccaaa  c.7279+1080

         .         .         .         .         .         .  g.117169
ctgctttccacagtggctgaactaatttacattcccaccaaccatgtataagtgttcctt  c.7279+1140

         .         .         .         .         .         .  g.117229
tttctctgcagccttgccaatatctgccagatttttaactttttaagaaaaccattctga  c.7279+1200

         .         .         .         .         .         .  g.117289
ctggtgtgagatggtatctcatttgcatttctctgatgatttgtgatgatgacttttata  c.7279+1260

         .         .         .         .         .         .  g.117349
tatatatatatatatatatttgttggccgcttttatgtcttttgagaagtatccatgtct  c.7279+1320

         .         .         .         .         .         .  g.117409
tttgctcattttttaatggggtcactttttacttgttgaattaagttttttatggattct  c.7279+1380

         .         .         .         .         .         .  g.117469
ggatattagaccttcgttaggtgcatagtttgtgactattttgaatattttctcccattc  c.7279+1440

         .         .         .         .         .         .  g.117529
tataggttgtctgtttaccctcttgatagtatctcttgctgcacagaatctctttaattt  c.7279+1500

         .         .         .         .         .         .  g.117589
aactaggtcctgctggtcaatttttgtttttgttgcagtttctttttagaacttagtcat  c.7279+1560

         .         .         .         .         .         .  g.117649
aaattctttgctaaggctgatattgagaagggtatttcctagattttcttctagtatttt  c.7279+1620

         .         .         .         .         .         .  g.117709
tgtaatttgaagtcttacattgaagtctgtaatccatcttaatttttttatgtggtgata  c.7279+1680

         .         .         .         .         .         .  g.117769
ggcagggctctagtttcattcttttgcatatggttagccagttagcaccatttattgaat  c.7279+1740

         .         .         .         .         .         .  g.117829
gaggcatcttttccccacagcttatttttgttgactttgtcaaagatcagatggttcggc  c.7279+1800

         .         .         .         .         .         .  g.117889
tttatttctgggttctccattctgttctattggtctgtgtgtctgtgtttttttgtattt  c.7279+1860

         .         .         .         .         .         .  g.117949
tgttttttcccccgaccagtaccatgctgttttgattattgtatccctgtagtatagtga  c.7279+1920

         .         .         .         .         .         .  g.118009
agttgggtaatacgatgttctggctttgttctttttgcttagaattgttttggctattcg  c.7279+1980

         .         .         .         .         .         .  g.118069
ggctcttttttggtttcatatgaattttagaatagttttttccaattctgtgaaaagtga  c.7279+2040

         .         .         .         .         .         .  g.118129
cataggtagtttgataggaatagcattgaatctgtagattgctttgggcagaatggctat  c.7279+2100

         .         .         .         .         .         .  g.118189
tctaacaatattgattcttctaatccgttttttcatttatttgtatcatctctgatttct  c.7279+2160

         .         .         .         .         .         .  g.118249
ttcagcagtgttttatagtcctccttgtagagatctttcacctccttggttagctgtatt  c.7279+2220

         .         .         .         .         .         .  g.118309
cttaggtgttttattcttttctttgctattgtaaataggcttacattcttgatttggatc  c.7279+2280

         .         .         .         .         .         .  g.118369
tcagctgtaatgttattggtgtatagaaatgttactgatttttgtacattgattttgtat  c.7279+2340

         .         .         .         .         .         .  g.118429
cctagaactttactcaagtcatttatcagttctaggaacgttttgtcagagtctttaggg  c.7279+2400

         .         .         .         .         .         .  g.118489
ttttctgggtatagaatcataccatcagagaagaggaatagtttgatttcttcttttcct  c.7279+2460

         .         .         .         .         .         .  g.118549
atttgaatatgttttatttctttctcttgcttgattgttctgtgtaggactttgagtact  c.7279+2520

         .         .         .         .         .         .  g.118609
gtgttgaataggagtgatgagagtgggcatccttgtcttttccagttttcaaggggaatg  c.7279+2580

         .         .         .         .         .         .  g.118669
cttccagtttttaccatcattcagtatcatgtaggctgtgggtttgtcatagatgattgt  c.7279+2640

         .         .         .         .         .         .  g.118729
tattattttgaggaatattcctttgatgcctggtttgttgagggtttttatcatgcaagg  c.7279+2700

         .         .         .         .         .         .  g.118789
atgttggatttttttctttttcttttttttttttttttgaggcagagtctccctctgtta  c.7279+2760

         .         .         .         .         .         .  g.118849
cccaggctggagtgcagtggcgtgacctcagctcactgcaacctctgcctcccaggttta  c.7279+2820

         .         .         .         .         .         .  g.118909
agcgattctcctgcctcagcctcctgagtaagtgggattacaggcacatgccaccatgcc  c.7279+2880

         .         .         .         .         .         .  g.118969
tggctaatttttgtatttttagtagagacagggttttatcatgttgaccaggctggtctc  c.7279+2940

         .         .         .         .         .         .  g.119029
gaactcctgacctcaaatgatccatccatctcagcttcccaaagtgctaggattataggc  c.7279+3000

         .         .         .         .         .         .  g.119089
gtgagccactgcacctggcccagaatgttggattttattgaaagctttttctccatttat  c.7279+3060

         .         .         .         .         .         .  g.119149
tgaaatgatcatatggcttttgtttttaattctgtttatgtggtgaatcacattattgat  c.7279+3120

         .         .         .         .         .         .  g.119209
ttgtgtatgttgaaccaacctcgcattctaggaataaagcacacttgattgtcacgcatt  c.7279+3180

         .         .         .         .         .         .  g.119269
gacttttagttgtgttgttggattcaatttgctagtatttcgttgaggattttttcatct  c.7279+3240

         .         .         .         .         .         .  g.119329
gtgttcatcagggatttggcctgacgttttcttttttcattgtgtcctgccagattttgg  c.7279+3300

         .         .         .         .         .         .  g.119389
tatcaggatgatgctggcttcagagaatgagtcagggaggagtccttcctccttggtttt  c.7279+3360

         .         .         .         .         .         .  g.119449
gtgaaatagtttcagtaggattcgtaccaattctttgtatgtctggtagaattcagctgt  c.7279+3420

         .         .         .         .         .         .  g.119509
gaatccatctgccctgggttttttgttttctgctttttttttttttgcttggtaagtttt  c.7279+3480

         .         .         .         .         .         .  g.119569
tttcattattgatttaatttaggagctcctgattggtctgttcaggtttttgtttgtttg  c.7279+3540

         .         .         .         .         .         .  g.119629
tttgtttgtttgtttttaatttctggttcaatcttgggaggttgtatgtttccaggaatg  c.7279+3600

         .         .         .         .         .         .  g.119689
tatctatttcctctaggtttcctaatttgcttacgtagagtgttcacaatagtctctgag  c.7279+3660

         .         .         .         .         .         .  g.119749
gatcttttgtattgctgtgggatcaggtatgatgttatctttgtcatttcttattgtgct  c.7279+3720

         .         .         .         .         .         .  g.119809
tatttagatcttctgtctgtctgtctctgtctccctctattgatctagcttgtggtctat  c.7279+3780

         .         .         .         .         .         .  g.119869
ctcgtttattctttcaaataatcaacttttggttttgttgaatctttgtgtagatttttg  c.7279+3840

         .         .         .         .         .         .  g.119929
gatcacaatttcattcaattccactctggattttggttatttcttttcttctgctgtctt  c.7279+3900

         .         .         .         .         .         .  g.119989
tagggttggtttgttttgttttggttggttttaaggtggagtctcaccgtgttgcccagg  c.7279+3960

         .         .         .         .         .         .  g.120049
ctggagtgcagtggtagcgatctcggctcactgcaacctccacctcccgggttcaagcta  c.7279+4020

         .         .         .         .         .         .  g.120109
ttcttttgcctcagcctctttcctgagtagctgggactagaggtgcacaccaccacgcct  c.7279+4080

         .         .         .         .         .         .  g.120169
ggctaatttttttgtattttaagtagagacagggtttcactatgttggtcaggctggtct  c.7279+4140

         .         .         .         .         .         .  g.120229
caaactcctgacctcaaatgatcctcctgcctcaacctcccaaagtgggtacaggcatca  c.7279+4200

         .         .         .         .         .         .  g.120289
gcctctgcacccggacttggtttgttcttatttttctagtttatatgcgatgtttgatta  c.7279+4260

         .         .         .         .         .         .  g.120349
ttgatttgaggtctttccagcattttgatgtaggcatttagtgtccctgttttccttaat  c.7279+4320

         .         .         .         .         .         .  g.120409
tgaaaaaaattttttgattcttgccttaattttgttgttttctcaatagtcatttaggag  c.7279+4380

         .         .         .         .         .         .  g.120469
taggttgtttaatttttatgtaattgtatggttttgagaggtcttggtattgatttctat  c.7279+4440

         .         .         .         .    g.120511
ttttattgtactgtggtctgagtgtgtgcttggtatgatttt  c.7279+4482

--------------------- middle of intron ---------------------
     g.120512       .         .         .         .           g.120553
     c.7280-4482  gaatttttttttaatttattgaggcttgctttatggctgagc  c.7280-4441

.         .         .         .         .         .           g.120613
atgtggttgatcttagagtatgttccatgtgcagatgagaagaatgtatattctggtata  c.7280-4381

.         .         .         .         .         .           g.120673
ttaggtggagtatgctgtagatgtattgggtccgattgttcaagtgttgagtttaagtcc  c.7280-4321

.         .         .         .         .         .           g.120733
agaatttgttagttttctgccttcctgatctatctaacactgtcagtagagtgttagttt  c.7280-4261

.         .         .         .         .         .           g.120793
cccactattattgagtgcctgtgtaagtctcttcatagatctaaaagaacttattttatg  c.7280-4201

.         .         .         .         .         .           g.120853
aatctgggtgctccaaagttaggtacttatatatgtagtatagttaagtcttcttattga  c.7280-4141

.         .         .         .         .         .           g.120913
attgaaccctttggcattatgtaatgtccttttttgtcctttttaactattgttggttta  c.7280-4081

.         .         .         .         .         .           g.120973
aagttattttatctgataaaagaatagtgactgctgcactttttcattttctgtttttgt  c.7280-4021

.         .         .         .         .         .           g.121033
gatagatctttctccatccttttactttgagcctgtgggtgttgttacatgtgagatggg  c.7280-3961

.         .         .         .         .         .           g.121093
tctcttgaagagagaagatagttgagttttatttttttaaatccaacttgccactgcgtg  c.7280-3901

.         .         .         .         .         .           g.121153
gcttttaagaggggcctttagaccatttacattcaaggtttatattgatatgtgaggttt  c.7280-3841

.         .         .         .         .         .           g.121213
tgatcctgttgtcgtgttgttacctggttgttttgtagacttaactgtgtagttgcttta  c.7280-3781

.         .         .         .         .         .           g.121273
tagtatctgtgggctatgtacttaagtatgtttttgtggtagcaggtattgttcttctgt  c.7280-3721

.         .         .         .         .         .           g.121333
ttcatgtttagcactcccttaaggacctcttacaagacaggtctaatagtaacaaattcc  c.7280-3661

.         .         .         .         .         .           g.121393
cttaatgtttccttgtctgaaaaggactttattttttctttccttatgaaacttagtttg  c.7280-3601

.         .         .         .         .         .           g.121453
gcaggatattaaattcttggttggaatttgttttcttcaaggatgctgaaaataggcccc  c.7280-3541

.         .         .         .         .         .           g.121513
agtctcttctggtttttaaggtttctgctgagaggcccgctggtagcctgatggggttct  c.7280-3481

.         .         .         .         .         .           g.121573
ctcagtatgtgagctgacccttatttctagctgcctttaaaattttttctttcacatcga  c.7280-3421

.         .         .         .         .         .           g.121633
ccttggaaaatctgataactatgtgtcttggggatggtcttgtatagtatgtcacagggg  c.7280-3361

.         .         .         .         .         .           g.121693
ttctatgaatttcttgaatttgcatgcccacctacctctagtgagatagggaacattttc  c.7280-3301

.         .         .         .         .         .           g.121753
atggactatatcctcaaatatattttccaagttgtctctttcaggaattccaataagtca  c.7280-3241

.         .         .         .         .         .           g.121813
taggtttggttctttttacatataatggatttttacataatccattattttttagagatt  c.7280-3181

.         .         .         .         .         .           g.121873
ttatttaaaaattcttttttctttatttttttctgactgggttgatttgaaggactggtc  c.7280-3121

.         .         .         .         .         .           g.121933
ttcaagctctgagattctttccttagcttggtctattcttttgttaatgtttccaactgt  c.7280-3061

.         .         .         .         .         .           g.121993
attatgaaattcctgtagtgaatctttcaaaaccggaagttcagtttggttccttttctt  c.7280-3001

.         .         .         .         .         .           g.122053
ttcttttcctttgttttgttttcgacagggtcttgctgtgtaacccaggccgaagtgcag  c.7280-2941

.         .         .         .         .         .           g.122113
tggttgtggccgtgacttactgctgcagcctcgacctctcaagctcaggtgatcctccca  c.7280-2881

.         .         .         .         .         .           g.122173
tctcagtctcctgaggagctgggaccacaggcatgcaccaccatgcccagctaatgattt  c.7280-2821

.         .         .         .         .         .           g.122233
atatttttgcagagatggggtttcatcatgttgcccaggctggtctcaaactccccaact  c.7280-2761

.         .         .         .         .         .           g.122293
gaagcaatctacctgcctcagcttcccaaagtggtggggattacaggtgtgatccaccac  c.7280-2701

.         .         .         .         .         .           g.122353
gcctggcttgttcattcttaaaatggctatgttgccttttgactcttgaatcattttact  c.7280-2641

.         .         .         .         .         .           g.122413
ggatttcttggattgaatttcagccttctcctggatcttgagctttctcgccatccggat  c.7280-2581

.         .         .         .         .         .           g.122473
tctgaattctatttctgtcatttcagccatttcaatctgtctgcaaaccattgctgagag  c.7280-2521

.         .         .         .         .         .           g.122533
gttaggacagttgtttggaggtgagaagatactttgaattgccagagtgtttgcacaaat  c.7280-2461

.         .         .         .         .         .           g.122593
tctttctcatctgagagggctggtgttcctttatctttttggagttgcttctgcttggat  c.7280-2401

.         .         .         .         .         .           g.122653
gggaccttttgttttcttattcatcattttccttgagggtttgactgtggtgtatgctga  c.7280-2341

.         .         .         .         .         .           g.122713
gtatagtcaactggctccctttctgggtgttctcagctggctgaggctctgtataggctc  c.7280-2281

.         .         .         .         .         .           g.122773
tcctgaggctctgtataggatctctcctgtataggatctctctaggttcctgcattgggt  c.7280-2221

.         .         .         .         .         .           g.122833
ttcacaggtgatggatactagaagaattttttttagtgatataattcagactatgatcca  c.7280-2161

.         .         .         .         .         .           g.122893
gtatatggtgcttaaggataagggctagcagatagactcttagattacagtgcgttcagc  c.7280-2101

.         .         .         .         .         .           g.122953
acagtgctctgtgctgggggtaggggaagggagatgaccccctcaccaagttcattccca  c.7280-2041

.         .         .         .         .         .           g.123013
ggccttagaggagccccttccaatcactggcaccatacccacatttcctgaaccccaagg  c.7280-1981

.         .         .         .         .         .           g.123073
ggggccctggtgggctgcactccccatcccttagcagtagcctgagctgaaggttaggtc  c.7280-1921

.         .         .         .         .         .           g.123133
accaggagacctgcagcattccagaggcccactggtcctctgtgcttggcaaagtcagag  c.7280-1861

.         .         .         .         .         .           g.123193
agggttgtggggtatgtctctgggtggtctgttggtatagtaggtcaagggtgggggatc  c.7280-1801

.         .         .         .         .         .           g.123253
tcagggcagggtgatgttgtcgtggttgtgcagctggtgaggtgcccacagcctggggtt  c.7280-1741

.         .         .         .         .         .           g.123313
ttttgcccagcacacagttgtggggactgcccagttcacgttcccttgaccaagtctgct  c.7280-1681

.         .         .         .         .         .           g.123373
ggtgtctgcccttgtagctagcctgaccagccagttttatgccatgctttctgcgcccag  c.7280-1621

.         .         .         .         .         .           g.123433
atcactgggctgttaggtgtttcaggccacagggtccctcaggcagatgcaaagctggca  c.7280-1561

.         .         .         .         .         .           g.123493
aacaggcctcacccttcccagaccagccttgtggaaggggacttacccagcactcatgct  c.7280-1501

.         .         .         .         .         .           g.123553
ggaacacaaacccacgtctcactctactcagtgttctaagcagagcttaagttctggcca  c.7280-1441

.         .         .         .         .         .           g.123613
cagatctcagctctgtattcctgaacgatgtgcttagaccctggggggctgagaccaggc  c.7280-1381

.         .         .         .         .         .           g.123673
ccacagctttgtcctctgtccccttggaatcaagcactgtgctggggttgccgaagtgct  c.7280-1321

.         .         .         .         .         .           g.123733
ccaaggccactggcaaagcactcaggctgggtaatggaggctatgctgtgtgtatgctct  c.7280-1261

.         .         .         .         .         .           g.123793
tgtgggagcagctggggttgggagtgcctgggaagttgacagataggcgtgtagatcagc  c.7280-1201

.         .         .         .         .         .           g.123853
ctctccccagacccacaggaaggacagccctgctctttcccagcccagcattcagcaggg  c.7280-1141

.         .         .         .         .         .           g.123913
gatagagtgactcagagcaaggtgagaacctgggggcatgggtgcctggggttgcatttg  c.7280-1081

.         .         .         .         .         .           g.123973
ctggagctgctccacactgagtgagacctgctgggctccacataggctggtgctctgcct  c.7280-1021

.         .         .         .         .         .           g.124033
gtgccttctctctgacagttccctaccaattcaaatgtctttggggttgtgggatctctt  c.7280-961

.         .         .         .         .         .           g.124093
gtggctagtatcccagagctccacggcgagcgtggattgccccatatagtcactccactc  c.7280-901

.         .         .         .         .         .           g.124153
accccttccttaggacctgattagggccaggtcctggcacccggagactgtgcaggcttc  c.7280-841

.         .         .         .         .         .           g.124213
ccagcttcctccctcttcagcctcagtgtctgtgttgcctctctattgatgctcagtgct  c.7280-781

.         .         .         .         .         .           g.124273
ttctttccaaagatgtcttcgaagcatgttggtttactcattttgctctgttttggtggg  c.7280-721

.         .         .         .         .         .           g.124333
agaggccctcctggctatgtctattcagccatcttgtccccctcctatgtaaatattttt  c.7280-661

.         .         .         .         .         .           g.124393
acacagcaataaacatgcattgtgtcagtaacaaaaaatgtatgtcactgtcctaatatc  c.7280-601

.         .         .         .         .         .           g.124453
cttacattcactgagtatctactgtatgaagcattcagctgggtgctataaggagtcaaa  c.7280-541

.         .         .         .         .         .           g.124513
ataaggaaatagatatttgcctcatttagagctcagattgtacttcactatacaccatgc  c.7280-481

.         .         .         .         .         .           g.124573
caggtagctcttgaagtccttttaaaaaatactttgccattattaggtttttctaaaaat  c.7280-421

.         .         .         .         .         .           g.124633
aaactttttatattgaagtaattttgcatttacagaaaagttgaaagatagtacacataa  c.7280-361

.         .         .         .         .         .           g.124693
tttccatatacaccctttacccaactttcccccttacataatcttggtacatttgtcaaa  c.7280-301

.         .         .         .         .         .           g.124753
agtaagaaattaacattagaacattactatttaccaaactagactttacttccatttcac  c.7280-241

.         .         .         .         .         .           g.124813
caatttccttctaatatcctttttctatttcaggatccagtgtagggtagcacatgaagt  c.7280-181

.         .         .         .         .         .           g.124873
aatttgtcttatatttgataatctagtccatgatcattttaagaatataagttttatata  c.7280-121

.         .         .         .         .         .           g.124933
agtgtagcgttatctattataactaattttgaaacaaagaagaaaaagttgcctgtcata  c.7280-61

.         .         .         .         .         .           g.124993
ctttgaaagtgcaataataaaaatagctaaatttgtgtgtttttaaaatctctcccatag  c.7280-1


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