protein kinase, DNA-activated, catalytic polypeptide (PRKDC) - 5051 nt intron 74 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.170953
gtaggtaatattacagaaggaataggttgatcaaatactataggttataaaaatgtggtt  c.10669+60

         .         .         .         .         .         .  g.171013
aaagcacacacgtggacactacatttgttttcaaattaattagagttgtcattgaagaat  c.10669+120

         .         .         .         .         .         .  g.171073
aatcttagccgtcgctttgttgaatatatctattctgggtatgttacttgttataggatg  c.10669+180

         .         .         .         .         .         .  g.171133
tatctcctttaaatactttcatcttacactgctaacaaaacattctgctcatatggtcat  c.10669+240

         .         .         .         .         .         .  g.171193
gattgcttgggatagactagatgagatgatttttgaaatcagctcctgaaattgtcctgt  c.10669+300

         .         .         .         .         .         .  g.171253
aatttaaaatacacagaacgactcttccttttaattaggactcagtagatggcctcaagt  c.10669+360

         .         .         .         .         .         .  g.171313
gtcatcctgtccactcttaaacggatttatgagttgagaccgatgatgagtgagcagtag  c.10669+420

         .         .         .         .         .         .  g.171373
tgcgcaactatttcaaggatgctttgtacacaaactgtgtagtgttgtagtgacattctc  c.10669+480

         .         .         .         .         .         .  g.171433
catcatgaggttttggggttttttgtttgtttttaattatgagcagatctgcctcattat  c.10669+540

         .         .         .         .         .         .  g.171493
tttgaatgtattgatttcaacaagatgaagaaaagcgctggcatcttttttttttttttt  c.10669+600

         .         .         .         .         .         .  g.171553
ttttttagtttttttaaattaatttatttttatttttatttctttattttttattttttt  c.10669+660

         .         .         .         .         .         .  g.171613
tttgagacagagtattgtgctgtcacctagtgcagtgcaatctcggctgcaacctccacc  c.10669+720

         .         .         .         .         .         .  g.171673
tcccaggtttaagcagttctccctgcctcagcctcctgagtagctgggattacaagcgtg  c.10669+780

         .         .         .         .         .         .  g.171733
tgccaccatgcccagctaatttttgtatttttagtagcgacagggttttgccaccttggc  c.10669+840

         .         .         .         .         .         .  g.171793
caggctggtctcgaactcctgacctcaggtgacctcaggtgatccgcccaccttggcctc  c.10669+900

         .         .         .         .         .         .  g.171853
ccaaagtgctaggattacaggcgtgagccaccatgcccagctgaggcccagcttctgttg  c.10669+960

         .         .         .         .         .         .  g.171913
cagttaatgggtggcttatctgtgaacacacccctgccctactgaggccctgcccaccat  c.10669+1020

         .         .         .         .         .         .  g.171973
actgtttctctgaacagacagctattgtcttgaaaaatgaaagaagagaaaaagatgtga  c.10669+1080

         .         .         .         .         .         .  g.172033
gagacagtgtgtcaagaaagtgaccttgctgggcatgatggtctgtgcctataataccaa  c.10669+1140

         .         .         .         .         .         .  g.172093
ctacttgggaggccgaggtggaagaatcgcttgaggccaagagttcatgaccagccttgg  c.10669+1200

         .         .         .         .         .         .  g.172153
caacatagtgagatctcatctctaaaatagtaaaataaaaataagctaagcatggtggtg  c.10669+1260

         .         .         .         .         .         .  g.172213
cgtgactgtacttccaactacttaggaggctgaggtgggagaattgcttgagtacaggaa  c.10669+1320

         .         .         .         .         .         .  g.172273
ttcaaggctgcagtgagctatgactgaacttgtgagttgccactgcagtccaacctggac  c.10669+1380

         .         .         .         .         .         .  g.172333
atcatagtgagaacctgttttttaaaaagtgaccttttctttcataatgtaacttcagaa  c.10669+1440

         .         .         .         .         .         .  g.172393
actatatatcgcgttatatacgtcaaaacgtcaacatcagttgcaagatttgcttttatc  c.10669+1500

         .         .         .         .         .         .  g.172453
taagagcagctctttttttattttaatttttaatttttatgggtacatagtaggtgtcta  c.10669+1560

         .         .         .         .         .         .  g.172513
tgtttatggggtacatgggatattttgatacaggcatacagtgtgtaacaatcacatcag  c.10669+1620

         .         .         .         .         .         .  g.172573
ggtaagtggagtatccatcacttcaaggatttatcatttctttgtgttataaacattcca  c.10669+1680

         .         .         .         .         .         .  g.172633
gttatactcttttagttatttttaaatgtacaataaaaatttactgtagtcaggccgggt  c.10669+1740

         .         .         .         .         .         .  g.172693
gcggtggctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggctgaagtgggcggatcaggagg  c.10669+1800

         .         .         .         .         .         .  g.172753
tcaggagatcgagaccatcctggctaatgcggtgaaaccccatctctactaaaaatacaa  c.10669+1860

         .         .         .         .         .         .  g.172813
aaaattagccgggcatggtggcaggtgcctatagtcccagctacttgggaggctgaggca  c.10669+1920

         .         .         .         .         .         .  g.172873
ggagaatggcgtgaacccgggaggcggagcttgcagtgagccgagatcaagccactgcac  c.10669+1980

         .         .         .         .         .         .  g.172933
tccagcctgggtgacagagcaaaactctgtctcaacaaaaaaaaaaaaaaaaaaatttta  c.10669+2040

         .         .         .         .         .         .  g.172993
ctgtggtcaccctgttgtgccactaaatactagatcctgtttttcctaactatatttttg  c.10669+2100

         .         .         .         .         .         .  g.173053
tgcccattaaccatccccgctttccacctcccctccccacgagttcagttgttttaattt  c.10669+2160

         .         .         .         .         .         .  g.173113
ttagcttccacaaatgagtaagaacatgtgaagtttttctgtgcctgacttatttcacat  c.10669+2220

         .         .         .         .         .         .  g.173173
aatgtccttcagttccatccatgttgtttcaagtgacaggatctcattcttttttatggc  c.10669+2280

         .         .         .         .         .         .  g.173233
taaatagtactctattgcatgtatgtactgcattttcttcattcatttgtctgttgatgg  c.10669+2340

         .         .         .         .         .         .  g.173293
acacttaggttgcttccaaattttggccgttgtgaatagtgctgcaataaacatgggagt  c.10669+2400

         .         .         .         .         .         .  g.173353
gcagatatcatactgatatcctttcttttgggtatatatccagtagtgggatttctggat  c.10669+2460

         .         .         .         .         .         .  g.173413
tatatggtacttctagttgtagtttttttaggaatctccatagtgttcttcatagtggtt  c.10669+2520

        g.173419
gtatga  c.10669+2526

--------------------- middle of intron ---------------------
                                         g.173420             g.173424
                                         c.10670-2525  gttta  c.10670-2521

.         .         .         .         .         .           g.173484
cattcccaccaatagtatacaagggttcctctctctacatccttaccagcattcgttatt  c.10670-2461

.         .         .         .         .         .           g.173544
gctgggggtgagatgatacctcgttgtggttttgatttgcatttctctgatgttcattga  c.10670-2401

.         .         .         .         .         .           g.173604
tgttgagcatgtttttatatacctgtttaccatttgtatgttttcttttgagaaatgtct  c.10670-2341

.         .         .         .         .         .           g.173664
attcagatcctttgccccattttaaaatgagattggatttttttttcctgttgagttgtt  c.10670-2281

.         .         .         .         .         .           g.173724
tgagcttgttatgtattttggttgttttttgtttgtttgtttttgaggcggtgtattgct  c.10670-2221

.         .         .         .         .         .           g.173784
ctgttgcccagggtagagtgcagtggcgcaatctctgctcactgcaacctgcgcctcccg  c.10670-2161

.         .         .         .         .         .           g.173844
ggttcaagcgattctcctgcctcagcctcctgagtagctgggattacaggcaggcgccac  c.10670-2101

.         .         .         .         .         .           g.173904
catgccccgctaatttttgtatttttagtagggacagggtttcaccatgttggccaggct  c.10670-2041

.         .         .         .         .         .           g.173964
ggtctcgaacgcctgacctcgtgatctgcccaccttggcctcccatagtgctgggattac  c.10670-1981

.         .         .         .         .         .           g.174024
agacatgagccactgcgcccggccatattttgcttattaattccttgtcagatgggtagt  c.10670-1921

.         .         .         .         .         .           g.174084
ttgcaaatgttttctcccattctgtgggttgtcccttcactttattgtttcctttgctgt  c.10670-1861

.         .         .         .         .         .           g.174144
gcagaagctttttgacttgatgtgatcctcctgtttgtccattttaaatttggttgcatg  c.10670-1801

.         .         .         .         .         .           g.174204
tgcctgtggggtattactgaagaaatctttgtgcccagaccagtgtcctggagagtttcc  c.10670-1741

.         .         .         .         .         .           g.174264
tgtttttgtttttgtttttgtagttttattggttgagatcttaggtttaagtctttaatc  c.10670-1681

.         .         .         .         .         .           g.174324
tatttggatttgatttttgtatgtggtgagagataggggtctagtttcattattctgcat  c.10670-1621

.         .         .         .         .         .           g.174384
atggatacccagttttcccaggaccatttattggagactgtcctttccctgatgtatgtt  c.10670-1561

.         .         .         .         .         .           g.174444
cttggcacatttgtgaaaaaatggattcactgcaggtgtgtgaatttatttctgggttct  c.10670-1501

.         .         .         .         .         .           g.174504
ctattctgttccattggcttatgtgtctgtgtttatgccagtgtcatgctgtttgggtta  c.10670-1441

.         .         .         .         .         .           g.174564
ctatagctctgtaatataatttgaagttagataatgtgattgtgccagttttattctttt  c.10670-1381

.         .         .         .         .         .           g.174624
tgctcagggtggctttggctttttgctctgggtcttttgtggttccatacaaattttagg  c.10670-1321

.         .         .         .         .         .           g.174684
attatttttcctatgtctgtgaagaatgtcattggtattttgataaggattgtgttgact  c.10670-1261

.         .         .         .         .         .           g.174744
ctgtagattgctttgggtagtgtggacagatttaacagtattgattcttcccatccatga  c.10670-1201

.         .         .         .         .         .           g.174804
acatgaagtaactttgcatttctttgagtcctcttcaatttctttcatccatgttttaca  c.10670-1141

.         .         .         .         .         .           g.174864
gttttcattgtagagatctttcatttctttggcgaagtttattcctaagtattttctttt  c.10670-1081

.         .         .         .         .         .           g.174924
atttgtggctattgtaaatagaattacttctatgatttctgtttcagattgttcactgtt  c.10670-1021

.         .         .         .         .         .           g.174984
ggcatatagaaatgctactgatttttgtatgttgatttttgtatctgcagctttactgaa  c.10670-961

.         .         .         .         .         .           g.175044
tttatcagttctgatggttttgtggtggagtctttaggtgcctccaaatataagatcgta  c.10670-901

.         .         .         .         .         .           g.175104
tcatctgcaagcaaggataatttgacttcttcctttctaatatagataccctttatttct  c.10670-841

.         .         .         .         .         .           g.175164
ttctcttgtcagcttgctctagctaagactcccagtagtatgtggaataacagtgggcat  c.10670-781

.         .         .         .         .         .           g.175224
ccttaacatgttcaagatcttagagaaaggttttcagtttttcagtgttcagtatgacac  c.10670-721

.         .         .         .         .         .           g.175284
tagctgtgagtgtgttgtacatggcttttattgtgttgagatatgttccttctataccta  c.10670-661

.         .         .         .         .         .           g.175344
attttttgagagttttttttatcatgaagggatgttgaattttatcaaatgctttttcaa  c.10670-601

.         .         .         .         .         .           g.175404
catccgttaaaatgatcagtggtttttgtcctttattctgttgtgtagatatgattgatt  c.10670-541

.         .         .         .         .         .           g.175464
tgtgtatttgatctatccttgattgatttgatctatccttgcatctctagaataggtccc  c.10670-481

.         .         .         .         .         .           g.175524
acttggtcatgatgaataatctttttaatgtgctgttgaatttggtttgcaagtattttg  c.10670-421

.         .         .         .         .         .           g.175584
ttgaggatttttgcattaatgttcatcagggatattggcctgtagttttccttttatttg  c.10670-361

.         .         .         .         .         .           g.175644
atacgtctttacctggttttggtatcaggataatactggccttgtagaatgagtttggac  c.10670-301

.         .         .         .         .         .           g.175704
gtattccctcctcccttgtgttttggaatagtttgagtaggatcggtattaattcttttt  c.10670-241

.         .         .         .         .         .           g.175764
taagaacctcatctcttgatagaatagatgcttcttgcttcatttaacattgggtggaat  c.10670-181

.         .         .         .         .         .           g.175824
tttaaattactatgtagttggttatatatatatgatatgtataaattatacttagttata  c.10670-121

.         .         .         .         .         .           g.175884
tataacatacattattttatatatgtataatatataacttatatatgtatggtatataaa  c.10670-61

.         .         .         .         .         .           g.175944
atatatattgatttttggaagatatttgattgcctaaactttgtaaatttttttaaatag  c.10670-1


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