patched 1 (PTCH1) - 5117 nt intron 15 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.54910
gtaagacggcgtgggaggctctcgtcctttcggtcttttgcgtgttcagcttcaacaggt  c.2560+60

         .         .         .         .         .         .  g.54970
tcctttgtcatgattatgagagcgttagattagaatgtaacactgacgtgtttcatggac  c.2560+120

         .         .         .         .         .         .  g.55030
ttttaagagttgctcaagattcttacatgaactgtttctgcagcagcctcccagatctgg  c.2560+180

         .         .         .         .         .         .  g.55090
cttttacctataaaatgatgcagataattcagatgagcttctgtgagaatgtacaagtgc  c.2560+240

         .         .         .         .         .         .  g.55150
acgtcaggaaaaggggagcatgttgtaacaggtggagccgaggcttctggtgctctttcc  c.2560+300

         .         .         .         .         .         .  g.55210
tcttggatagacggtggctagtttggtgaccacataaaatcaaagtgcggctgggatttc  c.2560+360

         .         .         .         .         .         .  g.55270
cagactgattgccaaattatagcttactgcaccaggagatgctagataagcagtggacat  c.2560+420

         .         .         .         .         .         .  g.55330
agtcttacactccatattttgaccatctctttaaaaattatctatttctaattgactttg  c.2560+480

         .         .         .         .         .         .  g.55390
tttttagagcagttttaggttcccaggaaaattgagcagaaggtgctgagatggcccata  c.2560+540

         .         .         .         .         .         .  g.55450
tcccccttcctcacccacacacagccccctcgactgtaaacatcccgcaccagagggatg  c.2560+600

         .         .         .         .         .         .  g.55510
catttgttacagctgatgaacctgcacattattacccaggctccatagtttacggttggg  c.2560+660

         .         .         .         .         .         .  g.55570
ttcattttgaccattttttgatttggtacttgaagtaaagttataaatgcttagtaacat  c.2560+720

         .         .         .         .         .         .  g.55630
ttcacattattttataaataattaaattctgttttaaaatgcctttcttggtggggcaca  c.2560+780

         .         .         .         .         .         .  g.55690
gtggctcacgcctgtaatcccagcactttgggatgccaaggcgggcagatcacctgaggt  c.2560+840

         .         .         .         .         .         .  g.55750
caggagttcgagaccagcctggcctactagtgaaaccagctctctactaaaaatacaaaa  c.2560+900

         .         .         .         .         .         .  g.55810
attagctgggcgtgctggtgggtgcctgtaattccagctactcaggaaactgaggcagga  c.2560+960

         .         .         .         .         .         .  g.55870
gaatcgcttgaacctgggaggtggaggttgcggtgagcctagattgtgccattgcattcc  c.2560+1020

         .         .         .         .         .         .  g.55930
agcctgggcgacaagagcgagactccatctccaaaaataataaataaataacagtgcctt  c.2560+1080

         .         .         .         .         .         .  g.55990
tattggcttcttcactcttagaaatgtttctaggaaatattcatcagctggaggggaaaa  c.2560+1140

         .         .         .         .         .         .  g.56050
aaaagtctaaattttctcctgaccgactgcacgtaaatgtatgcagtgattccaggaaca  c.2560+1200

         .         .         .         .         .         .  g.56110
tctgttcatttattctgcattgacacatgcaaagccaagtagagaatcaggataattatc  c.2560+1260

         .         .         .         .         .         .  g.56170
cacccaattcaagcaaaacacttttactggagtaccaaatcattatggcccccaacattt  c.2560+1320

         .         .         .         .         .         .  g.56230
tttggcttggattatccaaatgattgtcttaatttcccacttaattaggcttgtttaaac  c.2560+1380

         .         .         .         .         .         .  g.56290
acagatgtaagtgccttttttggtctgaagtcaatacacttgtatgtaaagactcagcag  c.2560+1440

         .         .         .         .         .         .  g.56350
ccagtttccctgagagtttgcaggaaatggtcaacaacttgaggttggtagaggatggtt  c.2560+1500

         .         .         .         .         .         .  g.56410
ccatacagcttctggccttgacttgtgtttaccagaactttgtgtctacatgtacaccca  c.2560+1560

         .         .         .         .         .         .  g.56470
atttgactttccttttggaggaaggtacagagaacatgccatgattattatttattaaca  c.2560+1620

         .         .         .         .         .         .  g.56530
ccctcctgagacgaacgtgaatttgttccaagttttatttttcacatttagtttagaaag  c.2560+1680

         .         .         .         .         .         .  g.56590
caatggtttttgggataatgagttaaaagagagacagtggagagagtccctgctttcatt  c.2560+1740

         .         .         .         .         .         .  g.56650
ttccccccattgaccaaagacatataaataacttgccacaaatgacaaagagatctgctg  c.2560+1800

         .         .         .         .         .         .  g.56710
tgccctgccagtctgtgagcagagaagggttattgtagagtgtatttcagtgtctttggc  c.2560+1860

         .         .         .         .         .         .  g.56770
cattgctctggaggctcaatgtggcatgttaggcagggattgggaagggggtaaaggggg  c.2560+1920

         .         .         .         .         .         .  g.56830
attgtctcgaggcagtgcaaagggttaacctttttatagagcattgtagatcatctctat  c.2560+1980

         .         .         .         .         .         .  g.56890
acgtttcttcctttatagatgtaaatcagctggagttgagtttttttttttaaggtgcat  c.2560+2040

         .         .         .         .         .         .  g.56950
ttgaatcatgttttgattgctgtgtgaacagcatacacctagaccaagtgagatccattg  c.2560+2100

         .         .         .         .         .         .  g.57010
gtgctaagcaatcagggtcccaggcagccctgggactccatgactgactcttacagggtc  c.2560+2160

         .         .         .         .         .         .  g.57070
cgctagagcactcaacacagaatgaccagacactggagccctttgctgcctacacgtttt  c.2560+2220

         .         .         .         .         .         .  g.57130
tcaggcctgttgaatggttgatgtggtgtttgaacattttctacaaggaaacaattatcc  c.2560+2280

         .         .         .         .         .         .  g.57190
ttgagtcagctttccttgctgacatttttgtgtggcttttaaatggtgggagcctcattg  c.2560+2340

         .         .         .         .         .         .  g.57250
gtttttaatggaattcccattaaaactatgtcatctcattggtctttatcgacattacaa  c.2560+2400

         .         .         .         .         .         .  g.57310
tagtttgtctttgattttttttactcctaaaactatataatggttaatttcaaaactatc  c.2560+2460

         .         .         .         .         .         .  g.57370
ccacatgtcacatcttaaaacatacatgcaaataaggcagagtcagataaaaaccatgcc  c.2560+2520

         .         .         .           g.57409
tcgagtcatgtacaaatgtgttcatttttatttcacact  c.2560+2559

--------------------- middle of intron ---------------------
         g.57410              .         .         .           g.57447
         c.2561-2558  ggattatgcaaacaaaattttgattaacattttacttc  c.2561-2521

.         .         .         .         .         .           g.57507
tagggtcccatagctgaaggaaaatgggcaattggggttattcctttggcctagaacttt  c.2561-2461

.         .         .         .         .         .           g.57567
acattagaaaataattattgacacaaaatattcataagaggagaacttctagctaagata  c.2561-2401

.         .         .         .         .         .           g.57627
ttaaggtttgctgtaaaataagtaaaaagtcacaattttctagagtgtgcatgcattgga  c.2561-2341

.         .         .         .         .         .           g.57687
atatgaagcactggctaaagggcagtggaaacccaaccttatcccttgttttgtatccag  c.2561-2281

.         .         .         .         .         .           g.57747
ggtcgtaccttgtacatgtgcttaggccagccccttgttacttgagctttttggtgatta  c.2561-2221

.         .         .         .         .         .           g.57807
gtcagaaaatactgtagtaatggggaaagaacttaactgttccagaaagtcgatgactgt  c.2561-2161

.         .         .         .         .         .           g.57867
ttcgtattcatctttgaacccccagtagagtgaatggcacctaagtgaccagcagtgtgg  c.2561-2101

.         .         .         .         .         .           g.57927
attctgagttgaatcgagtttccagcaaggctgacctccccagataggatctttcttcct  c.2561-2041

.         .         .         .         .         .           g.57987
ttgtttcaccctcgggtgtcccagaagtctttgtgtgtgaatatcataaaaccgccccca  c.2561-1981

.         .         .         .         .         .           g.58047
gattttggggaccccgtttgccaccagatgttattgatgctggagttgaacctgcttgtc  c.2561-1921

.         .         .         .         .         .           g.58107
ttactcctgcctttgacacatccttgggtaccacggtgtgtccccgcactgtaggccagt  c.2561-1861

.         .         .         .         .         .           g.58167
gagtggctccagctgcctctggtgacttgctgcctgggtttgagctccatccaacactca  c.2561-1801

.         .         .         .         .         .           g.58227
cctgctgggtggccccctccagtctcccctttccaagactcagttcctccatctgtgaag  c.2561-1741

.         .         .         .         .         .           g.58287
ccggagtgattaactctaacggggctgtcccttggttgccgtgggatgcccagcgccacc  c.2561-1681

.         .         .         .         .         .           g.58347
ccacactcaccaagtgtgagcctctcttcaggattagctggttaagggagaggggcttaa  c.2561-1621

.         .         .         .         .         .           g.58407
agcccaggacacgtcatgacatcatgaaaattgttacagcgaggaaaacagacgaggcct  c.2561-1561

.         .         .         .         .         .           g.58467
ccctttttgaggggaaaggaggcgcagtaatttttcttctgctgtttattgtttttcaaa  c.2561-1501

.         .         .         .         .         .           g.58527
aacagaaagaaagggctttcagtaataaaataacatctgctcagtaccctgtgtgtgcat  c.2561-1441

.         .         .         .         .         .           g.58587
gcctccctatgaaaacccgtctgtctgagaggtgcacggcccacccggtggtctcctgtc  c.2561-1381

.         .         .         .         .         .           g.58647
ccgtctcccctccacgctcaccctgacacagactcctttcaccaccgagcccactgtcat  c.2561-1321

.         .         .         .         .         .           g.58707
ccccaaattgttcctctagccagtagtgtcagaaggagggtttcgcttcttagagagaca  c.2561-1261

.         .         .         .         .         .           g.58767
gaagggggcctgtgctccccctccctccccacacttcagaccccaagagcttaaccattc  c.2561-1201

.         .         .         .         .         .           g.58827
tgagcactaacgcaaccagattttttttgaagcctttgaaatcatccaaggcatgtcccg  c.2561-1141

.         .         .         .         .         .           g.58887
aaatgaaataaacgcttctcccttcttactagccgtgtccaacccatacatgtacagctt  c.2561-1081

.         .         .         .         .         .           g.58947
gttcaaaagctgtggtttcctgagctgctggggcttgggagctctacttgggaggtggct  c.2561-1021

.         .         .         .         .         .           g.59007
gggaggggcaagggtgggtggggggaggggggtgtcccggagagcgtgcgcaccagccag  c.2561-961

.         .         .         .         .         .           g.59067
cgctcagaccctaaggccgggtcaccggggccctgttttctcttccaacatgcttatctc  c.2561-901

.         .         .         .         .         .           g.59127
tttacagctgcagccaaaccgtcaggtctgtaatgatggttttgattactgaggccaagc  c.2561-841

.         .         .         .         .         .           g.59187
gcagctgtgtgtggtgtgctggcgggctcgcccatcccccaggcccagaaagctctttcc  c.2561-781

.         .         .         .         .         .           g.59247
tccccctccccggcttgtggtttgtcatctgttctcacagagcctccttgtattggcctg  c.2561-721

.         .         .         .         .         .           g.59307
tggcttcctgttctcaatcggatccaaatttaccctgtgaggtatttccctgcgtgcaca  c.2561-661

.         .         .         .         .         .           g.59367
cgagcgccttcccttccttctcctccaccccctctcctgaggaagggtggcagagaggaa  c.2561-601

.         .         .         .         .         .           g.59427
gagagcagtcgagagtgaataggtgttggctgtgatctttacacaacctggcagcggatc  c.2561-541

.         .         .         .         .         .           g.59487
ccacagcttgtgttagctccacaagtcgaacagatggaacaaattgacagaatcgtgttc  c.2561-481

.         .         .         .         .         .           g.59547
gctcaccctgggctccagaagcagctgagctgctgtttgaagttgggggagtttgaatgt  c.2561-421

.         .         .         .         .         .           g.59607
gctttttcccctctgtgtggaatttctggttgtattgaagaactcatgacttagcacccc  c.2561-361

.         .         .         .         .         .           g.59667
gagtggcacgaaacggttaatgaccctggtgcgtgtctttccgtcgcactcttgccttct  c.2561-301

.         .         .         .         .         .           g.59727
tttgtaattgtcatggggcgaaaggaggagagtggtttttcttaagataaaatatgagta  c.2561-241

.         .         .         .         .         .           g.59787
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.         .         .         .         .         .           g.59847
gcagttcattcatgaaagatccagtgctttcagtcaaagtggatgtgggacacagagggt  c.2561-121

.         .         .         .         .         .           g.59907
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.         .         .         .         .         .           g.59967
taggaccagggtccttctggctgcgagttataatgtgttacaatcatttgccatttctag  c.2561-1


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