protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22 (lymphoid) (PTPN22) - 4419 nt intron 18 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.47222
gtaaagaagataagagttttgggaaacatgccggaaactttcccttactgaaagtttccc  c.2250+60

         .         .         .         .         .         .  g.47282
cctccccagcattaagatggaaaattagattaaatatctttattaaaactaattgttgat  c.2250+120

         .         .         .         .         .         .  g.47342
attataacagtcaaaattaatagaaggaaacgaaaaagaagaaaaaatacaacttaaaga  c.2250+180

         .         .         .         .         .         .  g.47402
ggcatttgtcagagggagaggaccagaaaaaatacctattgggtactatgcttattacct  c.2250+240

         .         .         .         .         .         .  g.47462
gggtgacaaaattatctgtacagcaaacccttgtgacacacagtttacctacataacaaa  c.2250+300

         .         .         .         .         .         .  g.47522
ctggcacacatacccctgaacctaaaataaaaattaaaaaataaaaataaaaataaatga  c.2250+360

         .         .         .         .         .         .  g.47582
agaaaaaaaaaatccacttctccctaaggttgatttataaatgtaaaagatgcccaagga  c.2250+420

         .         .         .         .         .         .  g.47642
aactaccaacttgtttatttctggaactagataaactgaattcaaagttcacatgggagt  c.2250+480

         .         .         .         .         .         .  g.47702
agggggaagcaggactagtcagaaacctgcaaataaataataaataaaaatagtttagat  c.2250+540

         .         .         .         .         .         .  g.47762
aaatgtctttctaaaataatttttaaaaataaaaataaataaaaagaaaagcaatgaaag  c.2250+600

         .         .         .         .         .         .  g.47822
agagtcaccttagcagatattcgaatatggcaaagcctcaattaaaatggcatgataggc  c.2250+660

         .         .         .         .         .         .  g.47882
ccagcatggtggctcatgcctgtaatcccagcctttgggaggccaaggcgggcagatcac  c.2250+720

         .         .         .         .         .         .  g.47942
ttgagctcaggattcgagaccagcctgggcaacatggcaaaaccccgtctctaccaaaaa  c.2250+780

         .         .         .         .         .         .  g.48002
tacaaaaaattagccgggcatggtgctgtgtgcctgcagtcccagctactcaggaggctg  c.2250+840

         .         .         .         .         .         .  g.48062
aggtgggaggattggtcgagcctggaaggtggagactgcagagattatgccactgtactc  c.2250+900

         .         .         .         .         .         .  g.48122
cagcctgggtgacagagtgagacgtcatctcaaaaatttaaatataaatataaaatggca  c.2250+960

         .         .         .         .         .         .  g.48182
tattagtgtataaaaagaaacatatacgagcagagtaaaagggaaagttctgaaatagat  c.2250+1020

         .         .         .         .         .         .  g.48242
ccaaatatatgtagaaatttagtatacaatgaaggtggtatctcaaaatcaggggataaa  c.2250+1080

         .         .         .         .         .         .  g.48302
gatggatggtttaataactgttgttggatcaaataaccacctgaaaaaaagcagggtcta  c.2250+1140

         .         .         .         .         .         .  g.48362
ttccttacatctatactaggataaattctaagtggctaaatgattaaaatgttaaaaaaa  c.2250+1200

         .         .         .         .         .         .  g.48422
caaaaacaaaaacctcaatccatagaagacctaaagaaacttggaaagagtcttttacaa  c.2250+1260

         .         .         .         .         .         .  g.48482
cctgggagtgtgaatgacctttataacttactcaaaatccggaggccataagaaaagaga  c.2250+1320

         .         .         .         .         .         .  g.48542
tagataaattcagctaaataaaagagaaaatgtatgcatggtaaaacaatcaccttaaaa  c.2250+1380

         .         .         .         .         .         .  g.48602
atcaaaagacaaagaacaaattggaggaaaaaaaatctgcaactggcaccacagccaaag  c.2250+1440

         .         .         .         .         .         .  g.48662
gggttattactctaatagataaagaactgttagaaattcatagaaaataataacccccaa  c.2250+1500

         .         .         .         .         .         .  g.48722
ataaaaatgggcaaaaataggtgatcagatggtttgaagaaaataaatgagcatggtatg  c.2250+1560

         .         .         .         .         .         .  g.48782
ccctttatatatttgatatgttcaatttcattcataatgaaaaaattacaaattaaaacc  c.2250+1620

         .         .         .         .         .         .  g.48842
acagtgacatattgcttttcatccatcagaatggtaaattccaaaagtttgattacactc  c.2250+1680

         .         .         .         .         .         .  g.48902
tctgttagggaggctatggggaaataagcacactcaatgttgttggtgagaatgtcaagt  c.2250+1740

         .         .         .         .         .         .  g.48962
ggtacaacttctttttacaattttttttttaaattagagatggggtcttgctatgttgtc  c.2250+1800

         .         .         .         .         .         .  g.49022
taggatggggtctccctatgttgccaacttctagactcaagcgatcctcctgccttggcc  c.2250+1860

         .         .         .         .         .         .  g.49082
tcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccactagaagtgaaatttatcctacaaatat  c.2250+1920

         .         .         .         .         .         .  g.49142
gcttgcatacacatgaaatgacatgtataccaagtattcattgcagcattatctgtaaga  c.2250+1980

         .         .         .         .         .         .  g.49202
gcagattactggaaacaacataattaatagtgttaattgttaggggaactgattaaataa  c.2250+2040

         .         .         .         .         .         .  g.49262
atcataaatcatgttatatccatacaaatggaatactgtgcagctaaaaaagaattagga  c.2250+2100

         .         .         .         .         .         .  g.49322
ctttctcaatatatttatatataatttattaacttttacttaaaaaaaggaatatgatac  c.2250+2160

         .         .         .         .         .  g.49372
atatgtgtatttacttatatattcataagtaacactggaaggatactaac  c.2250+2210

--------------------- middle of intron ---------------------
         g.49373               .         .         .         .           g.49421
         c.2251-2209  aacagaggataaaaaactaacagtggttatctacaggaggagcattaga  c.2251-2161

.         .         .         .         .         .           g.49481
aactgagtagtagattgaagacaaggatgggagcatttttactaggatttcctgacttgt  c.2251-2101

.         .         .         .         .         .           g.49541
aaataaatcatctattttttaaaaaataactaaaaatgttacaaataaataatgtattaa  c.2251-2041

.         .         .         .         .         .           g.49601
atatctattccatggaagagcacatttctgttaggtgttaggaaaacagaaatgtcataa  c.2251-1981

.         .         .         .         .         .           g.49661
aggataactatttgcccttgaaaatagtatagttaatctgttggaacagaacacctttga  c.2251-1921

.         .         .         .         .         .           g.49721
gaaacatgaaaattatcaagaagaataaaatgcctgaagcagattaaaaacatacatgct  c.2251-1861

.         .         .         .         .         .           g.49781
gaagaaatgtggagtaaagaagaaatttgggtaggttccttgaagagataaattagagac  c.2251-1801

.         .         .         .         .         .           g.49841
tccaggccgggcgcggtggctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggccgaggcggg  c.2251-1741

.         .         .         .         .         .           g.49901
cggatcacgaggtcaggagatcgaggccatcccggctaaaacggtgaaaccccgtctcta  c.2251-1681

.         .         .         .         .         .           g.49961
ctaaaaatacaaaaaattagccgggcgtagtggcgggcgcctgtagtcccagctacttgg  c.2251-1621

.         .         .         .         .         .           g.50021
gaggctgaggcaggagaatggcgtgaacccgggaggcggagcttgcagtgagccgagatc  c.2251-1561

.         .         .         .         .         .           g.50081
ccgccactgcactccagcctgggcgacagagcgagactccgtctcaaaaaaaaaaaaaaa  c.2251-1501

.         .         .         .         .         .           g.50141
aaaaaaaaaaaaattagagactccaccataaaagtagaggaaggaagtatggctaacagt  c.2251-1441

.         .         .         .         .         .           g.50201
ttggaaggtggccttagtaaattgaatacagaatatgactggcaaaaattcttggctaga  c.2251-1381

.         .         .         .         .         .           g.50261
atggaaatggctgtgtatcatggatatattcagaagccattgtggattctgaaatggtcc  c.2251-1321

.         .         .         .         .         .           g.50321
taataaaggagggaagtgggaatttcatcccctctacccctctgagtcccttcccttccc  c.2251-1261

.         .         .         .         .         .           g.50381
ttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccccttctcccttcacttcccttcctct  c.2251-1201

.         .         .         .         .         .           g.50441
gtctctctctttctctttctttcttttttagacagggtcttgctctgttgcccatgctag  c.2251-1141

.         .         .         .         .         .           g.50501
agtgcagtggcataaatatggctgactgcagccttgacctcctggactcaagtgatcctc  c.2251-1081

.         .         .         .         .         .           g.50561
ctgcatcagcctttcgagtggctgggaacacaggtctgcaccaccatgcctggcttttta  c.2251-1021

.         .         .         .         .         .           g.50621
aaatttttggtagggatggggtctcaccatgttgcccagtctggtcttgaactccctggc  c.2251-961

.         .         .         .         .         .           g.50681
ctcaagggaacctcccacttgagcctcccaaagtgctggaattacaggcatgagccacct  c.2251-901

.         .         .         .         .         .           g.50741
tgccagcactccactgctccccgtcaatattctgatagcataattaaaaaaaaatttatt  c.2251-841

.         .         .         .         .         .           g.50801
ggctggccacggtggctcacgcctgtaatcccagcactttggaaggccaaggcaggtagg  c.2251-781

.         .         .         .         .         .           g.50861
tcacaaggtcaggagtttgagaccagcctggccaatatggtgaaaccctgtctctactaa  c.2251-721

.         .         .         .         .         .           g.50921
aaatacaaaaaattagccaggcatggtagcaggtgcctgtagtcccagctactcaggagg  c.2251-661

.         .         .         .         .         .           g.50981
ctgaggcagaaggatcgcttgaacccgggaggcagaggttgcagtgagctgagatcacgc  c.2251-601

.         .         .         .         .         .           g.51041
cactgcactctagcctgggcgacacagcgagactccatctcaacaacaacaacaacaaca  c.2251-541

.         .         .         .         .         .           g.51101
acaacaacatttattaatcttttttaaaagacatgttctcactctgtcgcccaggctgga  c.2251-481

.         .         .         .         .         .           g.51161
atgcagtggtgggatcagagctcactgtagccttgaactcctgggatcaagcagacctcc  c.2251-421

.         .         .         .         .         .           g.51221
cgcctcagcctccctagtagctgctaccacattcagctaatattttttttactttttgta  c.2251-361

.         .         .         .         .         .           g.51281
gggacaggggtcttgctatgttgcctaagatggtcctgaactcctgagctcaaacaatcc  c.2251-301

.         .         .         .         .         .           g.51341
tcctgccttggcctctcaaagtgccgggattacaggtgtgagccactgtgctcagcctct  c.2251-241

.         .         .         .         .         .           g.51401
gatactattatttcaaaatatgtagtgtgatacttgcatgggtgatataaatagcaagat  c.2251-181

.         .         .         .         .         .           g.51461
aaaatcaagtagaggttttgcactgaattaaaaatggcaagatggaaaaacaactttgta  c.2251-121

.         .         .         .         .         .           g.51521
cattttcatggctatttttaaggaaattaaattcttttcacttaagtctatatttctatt  c.2251-61

.         .         .         .         .         .           g.51581
tgattaaagtatttcaagtttcacaggaaaaaaaactaacatttttcctttcttttgtag  c.2251-1


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